MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gordonia sp. KTR9 plasmid pGKT2

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018580	GC	3	6	1048	1053	0 %	0 %	50 %	50 %	404212379
2	NC_018580	AG	3	6	1218	1223	50 %	0 %	50 %	0 %	404212379
3	NC_018580	CG	3	6	1534	1539	0 %	0 %	50 %	50 %	404212380
4	NC_018580	CG	3	6	1588	1593	0 %	0 %	50 %	50 %	404212380
5	NC_018580	CA	3	6	1903	1908	50 %	0 %	0 %	50 %	404212381
6	NC_018580	GC	3	6	3334	3339	0 %	0 %	50 %	50 %	404212382
7	NC_018580	GC	3	6	3359	3364	0 %	0 %	50 %	50 %	404212382
8	NC_018580	GC	3	6	3427	3432	0 %	0 %	50 %	50 %	404212382
9	NC_018580	GC	3	6	4207	4212	0 %	0 %	50 %	50 %	404212382
10	NC_018580	TG	3	6	4225	4230	0 %	50 %	50 %	0 %	404212382
11	NC_018580	GC	3	6	4331	4336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_018580	GC	3	6	4757	4762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018580	CA	3	6	5526	5531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018580	CA	3	6	6329	6334	50 %	0 %	0 %	50 %	404212384
15	NC_018580	GC	4	8	8411	8418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018580	GT	4	8	8603	8610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018580	CA	3	6	9134	9139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018580	AG	3	6	10780	10785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018580	CT	3	6	11216	11221	0 %	50 %	0 %	50 %	404212393
20	NC_018580	CG	3	6	11412	11417	0 %	0 %	50 %	50 %	404212394
21	NC_018580	GC	3	6	11522	11527	0 %	0 %	50 %	50 %	404212394
22	NC_018580	GC	4	8	11747	11754	0 %	0 %	50 %	50 %	404212395
23	NC_018580	GC	3	6	12707	12712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018580	GC	3	6	12725	12730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018580	CG	3	6	12807	12812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018580	CG	3	6	13398	13403	0 %	0 %	50 %	50 %	404212397
27	NC_018580	GA	3	6	13505	13510	50 %	0 %	50 %	0 %	404212397
28	NC_018580	GT	3	6	14867	14872	0 %	50 %	50 %	0 %	404212398
29	NC_018580	GT	3	6	15047	15052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018580	AT	3	6	15384	15389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018580	TG	3	6	15538	15543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018580	CG	3	6	15878	15883	0 %	0 %	50 %	50 %	404212399
33	NC_018580	GC	3	6	16624	16629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018580	AC	3	6	17728	17733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018580	CT	3	6	18012	18017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018580	CG	3	6	18250	18255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018580	GA	3	6	18298	18303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018580	CA	3	6	18583	18588	50 %	0 %	0 %	50 %	404212402
39	NC_018580	CT	3	6	18655	18660	0 %	50 %	0 %	50 %	404212402
40	NC_018580	GT	3	6	19763	19768	0 %	50 %	50 %	0 %	404212403
41	NC_018580	GC	5	10	19850	19859	0 %	0 %	50 %	50 %	404212404
42	NC_018580	GT	3	6	20148	20153	0 %	50 %	50 %	0 %	404212404
43	NC_018580	CG	3	6	20690	20695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018580	GC	3	6	21304	21309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018580	TG	3	6	21685	21690	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018580	TA	3	6	21755	21760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018580	GC	3	6	22022	22027	0 %	0 %	50 %	50 %	404212407
48	NC_018580	AC	4	8	22698	22705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018580	GC	3	6	23896	23901	0 %	0 %	50 %	50 %	404212408
50	NC_018580	GC	3	6	24447	24452	0 %	0 %	50 %	50 %	404212409
51	NC_018580	TG	4	8	25030	25037	0 %	50 %	50 %	0 %	404212410
52	NC_018580	TC	3	6	25868	25873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018580	TC	3	6	27090	27095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018580	CT	3	6	28627	28632	0 %	50 %	0 %	50 %	404212415
55	NC_018580	TG	3	6	29359	29364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018580	GC	3	6	29522	29527	0 %	0 %	50 %	50 %	404212416
57	NC_018580	GA	3	6	29893	29898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018580	GC	4	8	30581	30588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018580	AC	3	6	31948	31953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018580	AG	3	6	33403	33408	50 %	0 %	50 %	0 %	404212420
61	NC_018580	GT	3	6	33545	33550	0 %	50 %	50 %	0 %	404212420
62	NC_018580	AC	3	6	33847	33852	50 %	0 %	0 %	50 %	404212420
63	NC_018580	CG	4	8	34109	34116	0 %	0 %	50 %	50 %	404212420
64	NC_018580	AG	3	6	34118	34123	50 %	0 %	50 %	0 %	404212420
65	NC_018580	GC	3	6	34372	34377	0 %	0 %	50 %	50 %	404212420
66	NC_018580	GA	3	6	34448	34453	50 %	0 %	50 %	0 %	404212420
67	NC_018580	CA	4	8	35086	35093	50 %	0 %	0 %	50 %	404212421
68	NC_018580	GC	3	6	36051	36056	0 %	0 %	50 %	50 %	404212422
69	NC_018580	GA	3	6	36062	36067	50 %	0 %	50 %	0 %	404212422
70	NC_018580	AG	3	6	36361	36366	50 %	0 %	50 %	0 %	404212423
71	NC_018580	CA	3	6	36802	36807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018580	CG	3	6	37117	37122	0 %	0 %	50 %	50 %	404212424
73	NC_018580	GC	3	6	40255	40260	0 %	0 %	50 %	50 %	404212427
74	NC_018580	GC	3	6	40676	40681	0 %	0 %	50 %	50 %	404212427
75	NC_018580	CG	3	6	40883	40888	0 %	0 %	50 %	50 %	404212427
76	NC_018580	GC	3	6	41526	41531	0 %	0 %	50 %	50 %	404212427
77	NC_018580	GC	3	6	41672	41677	0 %	0 %	50 %	50 %	404212427
78	NC_018580	TC	3	6	43480	43485	0 %	50 %	0 %	50 %	404212428
79	NC_018580	CA	3	6	45104	45109	50 %	0 %	0 %	50 %	404212428
80	NC_018580	GC	3	6	45813	45818	0 %	0 %	50 %	50 %	404212428
81	NC_018580	CG	3	6	46472	46477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018580	CA	3	6	46505	46510	50 %	0 %	0 %	50 %	404212429
83	NC_018580	CG	3	6	46770	46775	0 %	0 %	50 %	50 %	404212429
84	NC_018580	GC	3	6	47633	47638	0 %	0 %	50 %	50 %	404212430
85	NC_018580	CG	3	6	48294	48299	0 %	0 %	50 %	50 %	404212430
86	NC_018580	GC	3	6	48658	48663	0 %	0 %	50 %	50 %	404212431
87	NC_018580	CG	4	8	48728	48735	0 %	0 %	50 %	50 %	404212431
88	NC_018580	CG	3	6	50520	50525	0 %	0 %	50 %	50 %	404212432
89	NC_018580	GC	4	8	51695	51702	0 %	0 %	50 %	50 %	404212433
90	NC_018580	GA	3	6	52209	52214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018580	TC	3	6	53551	53556	0 %	50 %	0 %	50 %	404212435
92	NC_018580	CA	3	6	53702	53707	50 %	0 %	0 %	50 %	404212435
93	NC_018580	CG	4	8	53877	53884	0 %	0 %	50 %	50 %	404212435
94	NC_018580	TC	4	8	54054	54061	0 %	50 %	0 %	50 %	404212435
95	NC_018580	CG	4	8	54292	54299	0 %	0 %	50 %	50 %	404212435
96	NC_018580	CG	3	6	54744	54749	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
97	NC_018580	CG	3	6	54751	54756	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
98	NC_018580	GC	3	6	54768	54773	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
99	NC_018580	GC	3	6	55042	55047	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
100	NC_018580	TC	3	6	55329	55334	0 %	50 %	0 %	50 %	404212436
101	NC_018580	CG	3	6	55597	55602	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
102	NC_018580	CT	3	6	55696	55701	0 %	50 %	0 %	50 %	404212436
103	NC_018580	GC	3	6	56136	56141	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
104	NC_018580	CG	3	6	56595	56600	0 %	0 %	50 %	50 %	404212436
105	NC_018580	GC	4	8	57837	57844	0 %	0 %	50 %	50 %	404212437
106	NC_018580	AC	3	6	58081	58086	50 %	0 %	0 %	50 %	404212437
107	NC_018580	GA	3	6	60774	60779	50 %	0 %	50 %	0 %	404212440
108	NC_018580	CA	3	6	60920	60925	50 %	0 %	0 %	50 %	404212440
109	NC_018580	CG	3	6	61709	61714	0 %	0 %	50 %	50 %	404212441
110	NC_018580	GC	3	6	62387	62392	0 %	0 %	50 %	50 %	404212441
111	NC_018580	GA	3	6	62515	62520	50 %	0 %	50 %	0 %	404212441
112	NC_018580	GC	3	6	63386	63391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018580	GC	3	6	65092	65097	0 %	0 %	50 %	50 %	404212442
114	NC_018580	CT	3	6	65637	65642	0 %	50 %	0 %	50 %	404212443
115	NC_018580	GC	3	6	65774	65779	0 %	0 %	50 %	50 %	404212443
116	NC_018580	GC	3	6	66940	66945	0 %	0 %	50 %	50 %	404212443
117	NC_018580	GC	3	6	67036	67041	0 %	0 %	50 %	50 %	404212443
118	NC_018580	GC	3	6	67693	67698	0 %	0 %	50 %	50 %	404212444
119	NC_018580	AC	3	6	68417	68422	50 %	0 %	0 %	50 %	404212444
120	NC_018580	GC	3	6	68997	69002	0 %	0 %	50 %	50 %	404212444
121	NC_018580	CG	3	6	69228	69233	0 %	0 %	50 %	50 %	404212444
122	NC_018580	GC	3	6	70763	70768	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
123	NC_018580	GT	3	6	71141	71146	0 %	50 %	50 %	0 %	404212445
124	NC_018580	GC	3	6	71313	71318	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
125	NC_018580	GC	3	6	71435	71440	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
126	NC_018580	TG	3	6	71496	71501	0 %	50 %	50 %	0 %	404212445
127	NC_018580	GC	3	6	71586	71591	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
128	NC_018580	GC	3	6	71940	71945	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
129	NC_018580	CG	3	6	73671	73676	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
130	NC_018580	GC	3	6	73731	73736	0 %	0 %	50 %	50 %	404212445
131	NC_018580	TC	3	6	74183	74188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018580	GC	3	6	74461	74466	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
133	NC_018580	GA	4	8	75043	75050	50 %	0 %	50 %	0 %	404212446
134	NC_018580	GC	3	6	77402	77407	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
135	NC_018580	GC	3	6	78110	78115	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
136	NC_018580	GC	4	8	78669	78676	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
137	NC_018580	CG	3	6	78853	78858	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
138	NC_018580	CG	3	6	79026	79031	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
139	NC_018580	CG	3	6	79657	79662	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
140	NC_018580	CG	3	6	79915	79920	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
141	NC_018580	GC	3	6	80047	80052	0 %	0 %	50 %	50 %	404212446
142	NC_018580	CG	4	8	80437	80444	0 %	0 %	50 %	50 %	404212447
143	NC_018580	AC	3	6	80448	80453	50 %	0 %	0 %	50 %	404212447
144	NC_018580	CG	3	6	80493	80498	0 %	0 %	50 %	50 %	404212447
145	NC_018580	AC	3	6	80813	80818	50 %	0 %	0 %	50 %	404212448
146	NC_018580	GC	3	6	80851	80856	0 %	0 %	50 %	50 %	404212448
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.