MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 5200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018533	ATT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018533	AGG	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018533	TAT	2	6	3750	3755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018533	ATT	2	6	7819	7824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018533	ACA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018533	CTT	2	6	8743	8748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018533	TTA	2	6	8784	8789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018533	AAT	2	6	8948	8953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018533	CAA	2	6	8966	8971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018533	AGA	2	6	8983	8988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018533	GAG	2	6	9007	9012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018533	GAA	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018533	CTT	2	6	9138	9143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018533	AAT	2	6	9190	9195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018533	AAG	2	6	9260	9265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018533	TTC	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018533	AAG	2	6	9475	9480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018533	TAA	2	6	9583	9588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018533	GTT	2	6	9665	9670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018533	AGG	2	6	9699	9704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018533	TTA	2	6	9745	9750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018533	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018533	CTG	2	6	12086	12091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018533	TAA	2	6	12182	12187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018533	ATG	2	6	12247	12252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018533	CAT	2	6	12290	12295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018533	TGA	2	6	13805	13810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018533	AAT	2	6	15371	15376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018533	GAG	2	6	15430	15435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018533	GTT	2	6	15441	15446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018533	CTT	2	6	15557	15562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018533	GTC	2	6	15571	15576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018533	TCA	2	6	15604	15609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018533	GTT	2	6	15727	15732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018533	TAA	2	6	15744	15749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018533	TGT	2	6	15757	15762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018533	ATT	2	6	15782	15787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018533	TGG	2	6	15801	15806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018533	GTA	2	6	15847	15852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018533	TTG	2	6	15855	15860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018533	TTG	2	6	15962	15967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018533	ATC	2	6	16031	16036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018533	ACA	2	6	16170	16175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018533	GAT	2	6	16301	16306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018533	ACC	2	6	16893	16898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018533	GAA	2	6	16969	16974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018533	GAA	2	6	16998	17003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018533	TGT	2	6	17032	17037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018533	ATA	2	6	17128	17133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018533	GCT	2	6	17232	17237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018533	GTT	2	6	17371	17376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018533	TGT	2	6	17408	17413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018533	TGG	2	6	17498	17503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018533	ATT	2	6	17557	17562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018533	ATA	2	6	17691	17696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018533	CAA	2	6	17911	17916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018533	TGA	2	6	18028	18033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018533	TGT	2	6	18047	18052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018533	TAA	2	6	18095	18100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018533	GGT	2	6	18164	18169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018533	TGA	2	6	18192	18197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018533	TTG	2	6	18202	18207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018533	TTA	2	6	18230	18235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018533	AAG	2	6	18243	18248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018533	TGT	2	6	18871	18876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018533	AAG	2	6	20205	20210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018533	AAT	2	6	20217	20222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018533	TAA	2	6	20244	20249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018533	AAT	2	6	20278	20283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018533	AGT	2	6	20493	20498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018533	ACA	2	6	20582	20587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018533	ACA	2	6	20642	20647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018533	CAT	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018533	TGT	2	6	20724	20729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018533	TAC	2	6	20764	20769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018533	GCT	2	6	20810	20815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018533	TTG	2	6	20966	20971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018533	AGG	2	6	21003	21008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018533	TTG	2	6	21215	21220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018533	GAT	2	6	21274	21279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018533	TTA	2	6	21313	21318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018533	TCT	2	6	21380	21385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018533	ACC	2	6	21388	21393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018533	TTG	2	6	21515	21520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018533	TAG	2	6	21542	21547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018533	TAA	2	6	21550	21555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018533	AAT	2	6	21569	21574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018533	AGC	2	6	21695	21700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018533	TAT	2	6	21711	21716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018533	AGC	2	6	25022	25027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018533	ATT	2	6	32186	32191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018533	ATT	2	6	32195	32200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018533	CAT	2	6	32294	32299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018533	ATC	2	6	32309	32314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018533	ATT	2	6	32343	32348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018533	TAC	2	6	32502	32507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018533	TCA	2	6	32594	32599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018533	TTA	2	6	32754	32759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018533	CAA	2	6	32770	32775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018533	GAA	2	6	32838	32843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018533	ATC	2	6	32905	32910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018533	AAC	2	6	32916	32921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018533	CAA	2	6	32942	32947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018533	GCT	2	6	32952	32957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018533	AAG	2	6	32989	32994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018533	ATA	2	6	33104	33109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018533	GAA	2	6	33142	33147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018533	CAT	2	6	33187	33192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018533	GAA	2	6	33208	33213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018533	CAT	2	6	33227	33232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018533	AAC	2	6	33243	33248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018533	TTC	2	6	33308	33313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018533	CAA	2	6	33643	33648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018533	TGC	2	6	33725	33730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018533	ACC	2	6	33803	33808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018533	GTC	2	6	33887	33892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018533	ATA	2	6	35450	35455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018533	TTC	2	6	39821	39826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018533	AAT	2	6	39859	39864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018533	CTT	2	6	39900	39905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018533	TCT	2	6	39953	39958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018533	AAT	2	6	41075	41080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018533	TAT	2	6	43351	43356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018533	TAA	2	6	43543	43548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018533	TGA	2	6	43624	43629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018533	AAT	2	6	43726	43731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018533	ATT	2	6	43886	43891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018533	CAA	2	6	44008	44013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018533	TAA	2	6	44036	44041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018533	CTT	3	9	44062	44070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018533	ACA	2	6	44078	44083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018533	TCT	2	6	44248	44253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018533	AAT	2	6	44259	44264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018533	CAG	3	9	44267	44275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018533	ATA	2	6	44358	44363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018533	AAC	2	6	44379	44384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018533	AAC	2	6	44459	44464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018533	TAA	2	6	44469	44474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018533	GTT	2	6	44622	44627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018533	GAG	2	6	44696	44701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018533	ATA	2	6	44758	44763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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