MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid p232

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018532	TCGACC	2	12	207	218	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403529508
2	NC_018532	GGAACC	2	12	4890	4901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529514
3	NC_018532	CGCCGG	2	12	11974	11985	0 %	0 %	50 %	50 %	403529521
4	NC_018532	CTGGTC	2	12	13965	13976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529521
5	NC_018532	ACCTGG	2	12	14116	14127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529521
6	NC_018532	CTGCCC	2	12	15377	15388	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	403529523
7	NC_018532	CCTGGC	2	12	16444	16455	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529525
8	NC_018532	GACGCC	2	12	17090	17101	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529525
9	NC_018532	TGTCCA	2	12	23269	23280	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403529532
10	NC_018532	CGGTGA	2	12	23935	23946	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529533
11	NC_018532	TTCGGT	2	12	24776	24787	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403529535
12	NC_018532	ACCGTC	2	12	26210	26221	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403529538
13	NC_018532	AGCTGC	2	12	28002	28013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529539
14	NC_018532	CATGGG	2	12	28336	28347	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529539
15	NC_018532	GTCCGG	2	12	28622	28633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529539
16	NC_018532	CCTGGC	3	18	29804	29821	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529540
17	NC_018532	CCATGA	2	12	32847	32858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403529543
18	NC_018532	GCCGGG	2	12	33045	33056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403529544
19	NC_018532	TGCCGC	2	12	33269	33280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529544
20	NC_018532	TGCCGG	2	12	34231	34242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529545
21	NC_018532	TGACGG	2	12	34791	34802	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529545
22	NC_018532	TGTACG	2	12	37176	37187	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403529545
23	NC_018532	CGGTGA	2	12	37284	37295	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529545
24	NC_018532	GCCGTC	2	12	37474	37485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529545
25	NC_018532	ACGGTG	2	12	40566	40577	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529547
26	NC_018532	CGGATA	2	12	40797	40808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403529547
27	NC_018532	ACGGCA	2	12	41462	41473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529548
28	NC_018532	TGGTCG	2	12	43193	43204	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403529550
29	NC_018532	CGAGGA	2	12	44325	44336	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403529552
30	NC_018532	AAGGTC	2	12	45206	45217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403529552
31	NC_018532	TGTGCG	2	12	46195	46206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403529553
32	NC_018532	CAGGGT	2	12	52315	52326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529558
33	NC_018532	AAAGCC	2	12	53018	53029	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403529559
34	NC_018532	GGCGAG	2	12	53993	54004	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	403529560
35	NC_018532	GCCCAG	2	12	54014	54025	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529560
36	NC_018532	GCCCAG	2	12	54320	54331	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529561
37	NC_018532	CTGCCG	2	12	54793	54804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529561
38	NC_018532	GCCGAT	2	12	58289	58300	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529565
39	NC_018532	GATCTG	2	12	58886	58897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403529565
40	NC_018532	GACCAA	2	12	68922	68933	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403529576
41	NC_018532	GCCTGG	2	12	69510	69521	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529577
42	NC_018532	GAAGTC	2	12	70471	70482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403529578
43	NC_018532	CCTCGC	2	12	70911	70922	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	403529578
44	NC_018532	CAATGA	2	12	85543	85554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403529596
45	NC_018532	CAGCGC	2	12	85646	85657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529596
46	NC_018532	CACCGG	2	12	89246	89257	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529601
47	NC_018532	CATCGG	2	12	92885	92896	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529607
48	NC_018532	ACGCGA	2	12	98317	98328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529612
49	NC_018532	CCTCGC	2	12	101724	101735	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	403529618
50	NC_018532	TCGGCT	2	12	102358	102369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529619
51	NC_018532	GCAGAA	2	12	105193	105204	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403529620
52	NC_018532	GTCTTT	2	12	109128	109139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	403529622
53	NC_018532	CCTCGG	2	12	113492	113503	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529626
54	NC_018532	CCACCC	2	12	114074	114085	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	403529626
55	NC_018532	CTCGGC	2	12	116412	116423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529629
56	NC_018532	CACCGC	2	12	117158	117169	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	403529629
57	NC_018532	CTGCGG	2	12	118773	118784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529630
58	NC_018532	TGTCAC	2	12	121160	121171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403529634
59	NC_018532	TTGGCT	2	12	122391	122402	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403529635
60	NC_018532	AACGGG	2	12	134515	134526	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403529648
61	NC_018532	GTCAGA	2	12	152593	152604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403529665
62	NC_018532	GCGTTG	2	12	155330	155341	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403529668
63	NC_018532	TTGGCT	2	12	157459	157470	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403529669
64	NC_018532	CCGGGA	2	12	160217	160228	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403529670
65	NC_018532	TTGGCG	2	12	162423	162434	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403529672
66	NC_018532	ACCATC	2	12	167725	167736	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403529675
67	NC_018532	TCCAAC	2	12	169430	169441	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403529676
68	NC_018532	CGCCAG	2	12	169594	169605	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529676
69	NC_018532	GTTGGT	2	12	172492	172503	0 %	50 %	50 %	0 %	403529679
70	NC_018532	ACCAGC	3	18	172775	172792	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403529679
71	NC_018532	GTCTTT	2	12	178391	178402	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	403529684
72	NC_018532	AGGATG	2	12	180398	180409	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	403529686
73	NC_018532	CGCAGG	2	12	181272	181283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403529686
74	NC_018532	ACCGAA	2	12	185076	185087	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403529691
75	NC_018532	GCCAAC	2	12	185244	185255	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403529691
76	NC_018532	GGACCG	2	12	185378	185389	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403529691
77	NC_018532	CCTGGG	2	12	185939	185950	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529691
78	NC_018532	GCGTTC	2	12	188386	188397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529696
79	NC_018532	GGGAGG	2	12	192938	192949	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	403529697
80	NC_018532	CGTCAG	2	12	205944	205955	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529705
81	NC_018532	GGCGAC	2	12	210122	210133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403529708
82	NC_018532	GCGCCG	2	12	210413	210424	0 %	0 %	50 %	50 %	403529708
83	NC_018532	GACTTC	2	12	211505	211516	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403529709
84	NC_018532	CAAGAC	2	12	212088	212099	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403529709
85	NC_018532	CGCCGT	2	12	213433	213444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529710
86	NC_018532	ACCCGG	2	12	216470	216481	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529712
87	NC_018532	CGCGGC	2	12	219101	219112	0 %	0 %	50 %	50 %	403529714
88	NC_018532	CTCAGA	2	12	229342	229353	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403529722

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.