MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid p232

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018532	TGAAG	2	10	1236	1245	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018532	TCGCC	2	10	1683	1692	0 %	20 %	20 %	60 %	403529510
3	NC_018532	AGGGG	2	10	3819	3828	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018532	AGGCG	2	10	4640	4649	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_018532	CATGG	2	10	10885	10894	20 %	20 %	40 %	20 %	403529520
6	NC_018532	GGCTG	2	10	11744	11753	0 %	20 %	60 %	20 %	403529521
7	NC_018532	GCACA	2	10	15145	15154	40 %	0 %	20 %	40 %	403529523
8	NC_018532	CCCGG	2	10	16694	16703	0 %	0 %	40 %	60 %	403529525
9	NC_018532	TAGGG	2	10	17363	17372	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018532	CAGTG	2	10	17439	17448	20 %	20 %	40 %	20 %	403529526
11	NC_018532	TCCGG	2	10	18194	18203	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018532	CAGGC	2	10	20439	20448	20 %	0 %	40 %	40 %	403529530
13	NC_018532	CGGCG	2	10	21399	21408	0 %	0 %	60 %	40 %	403529531
14	NC_018532	CACGG	2	10	23160	23169	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018532	GGCCC	2	10	26771	26780	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_018532	GGCCG	2	10	29627	29636	0 %	0 %	60 %	40 %	403529540
17	NC_018532	CCGTG	2	10	29888	29897	0 %	20 %	40 %	40 %	403529540
18	NC_018532	CTGGG	2	10	30174	30183	0 %	20 %	60 %	20 %	403529540
19	NC_018532	TCCTG	2	10	30232	30241	0 %	40 %	20 %	40 %	403529540
20	NC_018532	TCCCC	2	10	30675	30684	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_018532	CCGAA	2	10	35931	35940	40 %	0 %	20 %	40 %	403529545
22	NC_018532	GGCCG	2	10	37105	37114	0 %	0 %	60 %	40 %	403529545
23	NC_018532	TGATC	2	10	40336	40345	20 %	40 %	20 %	20 %	403529547
24	NC_018532	CCCGG	2	10	41204	41213	0 %	0 %	40 %	60 %	403529548
25	NC_018532	CGAGG	2	10	42790	42799	20 %	0 %	60 %	20 %	403529550
26	NC_018532	GCGCG	2	10	44033	44042	0 %	0 %	60 %	40 %	403529552
27	NC_018532	AGGCC	2	10	44886	44895	20 %	0 %	40 %	40 %	403529552
28	NC_018532	GGCCC	2	10	45792	45801	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
29	NC_018532	CGGGC	2	10	46293	46302	0 %	0 %	60 %	40 %	403529553
30	NC_018532	CCTGG	2	10	47228	47237	0 %	20 %	40 %	40 %	403529554
31	NC_018532	CCCTG	2	10	50652	50661	0 %	20 %	20 %	60 %	403529557
32	NC_018532	GGACG	2	10	57092	57101	20 %	0 %	60 %	20 %	403529563
33	NC_018532	CAGGT	2	10	57650	57659	20 %	20 %	40 %	20 %	403529564
34	NC_018532	TTCGG	2	10	57860	57869	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018532	CCCGG	2	10	57965	57974	0 %	0 %	40 %	60 %	403529565
36	NC_018532	GCCGA	2	10	58251	58260	20 %	0 %	40 %	40 %	403529565
37	NC_018532	GACCA	2	10	60935	60944	40 %	0 %	20 %	40 %	403529567
38	NC_018532	CTGTC	2	10	63691	63700	0 %	40 %	20 %	40 %	403529570
39	NC_018532	GCTTT	2	10	66644	66653	0 %	60 %	20 %	20 %	403529574
40	NC_018532	TTGCC	2	10	68233	68242	0 %	40 %	20 %	40 %	403529575
41	NC_018532	CGTCC	2	10	71774	71783	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_018532	CGCCC	2	10	72439	72448	0 %	0 %	20 %	80 %	403529580
43	NC_018532	TCACC	2	10	74567	74576	20 %	20 %	0 %	60 %	403529583
44	NC_018532	CGGAC	2	10	78210	78219	20 %	0 %	40 %	40 %	403529585
45	NC_018532	CGGGT	2	10	81219	81228	0 %	20 %	60 %	20 %	403529588
46	NC_018532	TGATC	2	10	83123	83132	20 %	40 %	20 %	20 %	403529592
47	NC_018532	TCCGC	2	10	83613	83622	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_018532	CCGGG	2	10	84250	84259	0 %	0 %	60 %	40 %	403529594
49	NC_018532	ACTGG	2	10	85760	85769	20 %	20 %	40 %	20 %	403529596
50	NC_018532	TCCGC	2	10	86468	86477	0 %	20 %	20 %	60 %	403529598
51	NC_018532	GAAAG	2	10	87684	87693	60 %	0 %	40 %	0 %	403529599
52	NC_018532	GGCCT	2	10	89193	89202	0 %	20 %	40 %	40 %	403529601
53	NC_018532	CCGGG	2	10	90220	90229	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018532	TCCAC	2	10	90417	90426	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_018532	CCGCG	2	10	91005	91014	0 %	0 %	40 %	60 %	403529604
56	NC_018532	CCGGG	2	10	91675	91684	0 %	0 %	60 %	40 %	403529606
57	NC_018532	GTCCC	2	10	94884	94893	0 %	20 %	20 %	60 %	403529609
58	NC_018532	GTCCC	2	10	95034	95043	0 %	20 %	20 %	60 %	403529609
59	NC_018532	GAAGG	2	10	96704	96713	40 %	0 %	60 %	0 %	403529610
60	NC_018532	CCAAC	2	10	97877	97886	40 %	0 %	0 %	60 %	403529612
61	NC_018532	CGGTG	2	10	101192	101201	0 %	20 %	60 %	20 %	403529617
62	NC_018532	CCGGC	2	10	104195	104204	0 %	0 %	40 %	60 %	403529620
63	NC_018532	CCGGA	2	10	106348	106357	20 %	0 %	40 %	40 %	403529620
64	NC_018532	CTCGG	2	10	106856	106865	0 %	20 %	40 %	40 %	403529620
65	NC_018532	CGCAG	2	10	107451	107460	20 %	0 %	40 %	40 %	403529620
66	NC_018532	CCCTT	2	10	108092	108101	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_018532	GGACC	2	10	110128	110137	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_018532	GCGCC	2	10	113478	113487	0 %	0 %	40 %	60 %	403529626
69	NC_018532	TCCTG	2	10	115158	115167	0 %	40 %	20 %	40 %	403529627
70	NC_018532	CTGAC	2	10	117025	117034	20 %	20 %	20 %	40 %	403529629
71	NC_018532	GACCA	2	10	117972	117981	40 %	0 %	20 %	40 %	403529630
72	NC_018532	AGGCC	2	10	121475	121484	20 %	0 %	40 %	40 %	403529634
73	NC_018532	TCCGG	2	10	121671	121680	0 %	20 %	40 %	40 %	403529634
74	NC_018532	GCGCT	2	10	122649	122658	0 %	20 %	40 %	40 %	403529635
75	NC_018532	CACTT	2	10	124590	124599	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_018532	CAGTG	2	10	128166	128175	20 %	20 %	40 %	20 %	403529640
77	NC_018532	GTGGA	2	10	132504	132513	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018532	CTGGC	2	10	134382	134391	0 %	20 %	40 %	40 %	403529648
79	NC_018532	TGAGC	2	10	134435	134444	20 %	20 %	40 %	20 %	403529648
80	NC_018532	CTTAA	2	10	135356	135365	40 %	40 %	0 %	20 %	403529648
81	NC_018532	CTGGT	2	10	135684	135693	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018532	ATCAG	2	10	143643	143652	40 %	20 %	20 %	20 %	403529658
83	NC_018532	TCCGG	2	10	143991	144000	0 %	20 %	40 %	40 %	403529659
84	NC_018532	CGTTG	2	10	144557	144566	0 %	40 %	40 %	20 %	403529659
85	NC_018532	TGCCG	2	10	148884	148893	0 %	20 %	40 %	40 %	403529663
86	NC_018532	CCCGA	2	10	151524	151533	20 %	0 %	20 %	60 %	403529664
87	NC_018532	GGTGC	2	10	151571	151580	0 %	20 %	60 %	20 %	403529664
88	NC_018532	CCTGC	2	10	152129	152138	0 %	20 %	20 %	60 %	403529665
89	NC_018532	CTGCG	2	10	152715	152724	0 %	20 %	40 %	40 %	403529665
90	NC_018532	ATGCC	2	10	153470	153479	20 %	20 %	20 %	40 %	403529666
91	NC_018532	GACCT	2	10	154389	154398	20 %	20 %	20 %	40 %	403529667
92	NC_018532	GCAAA	2	10	154813	154822	60 %	0 %	20 %	20 %	403529667
93	NC_018532	TCTGC	2	10	155092	155101	0 %	40 %	20 %	40 %	403529668
94	NC_018532	GCGGA	2	10	159870	159879	20 %	0 %	60 %	20 %	403529670
95	NC_018532	TCCGG	2	10	160601	160610	0 %	20 %	40 %	40 %	403529670
96	NC_018532	ATGCC	2	10	160882	160891	20 %	20 %	20 %	40 %	403529670
97	NC_018532	GCTTG	2	10	163127	163136	0 %	40 %	40 %	20 %	403529672
98	NC_018532	GCCCC	2	10	163167	163176	0 %	0 %	20 %	80 %	403529672
99	NC_018532	AACCG	2	10	163879	163888	40 %	0 %	20 %	40 %	403529673
100	NC_018532	TCCGC	2	10	168606	168615	0 %	20 %	20 %	60 %	403529676
101	NC_018532	TGATT	2	10	170801	170810	20 %	60 %	20 %	0 %	403529678
102	NC_018532	AGGAC	2	10	170852	170861	40 %	0 %	40 %	20 %	403529678
103	NC_018532	CGATT	2	10	176167	176176	20 %	40 %	20 %	20 %	403529682
104	NC_018532	GTGCG	2	10	176695	176704	0 %	20 %	60 %	20 %	403529682
105	NC_018532	GCTGC	2	10	177125	177134	0 %	20 %	40 %	40 %	403529683
106	NC_018532	CTGTT	2	10	177234	177243	0 %	60 %	20 %	20 %	403529683
107	NC_018532	CGGGG	2	10	178145	178154	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018532	GGCCG	2	10	178994	179003	0 %	0 %	60 %	40 %	403529684
109	NC_018532	TTCTC	2	10	179837	179846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_018532	TCGTG	2	10	180586	180595	0 %	40 %	40 %	20 %	403529686
111	NC_018532	CGGCA	2	10	182463	182472	20 %	0 %	40 %	40 %	403529688
112	NC_018532	TCCGC	2	10	185545	185554	0 %	20 %	20 %	60 %	403529691
113	NC_018532	GGCAC	2	10	191198	191207	20 %	0 %	40 %	40 %	403529697
114	NC_018532	CGCTT	2	10	191474	191483	0 %	40 %	20 %	40 %	403529697
115	NC_018532	CGAAT	2	10	192848	192857	40 %	20 %	20 %	20 %	403529697
116	NC_018532	ACCTT	2	10	193680	193689	20 %	40 %	0 %	40 %	403529697
117	NC_018532	GGTAC	2	10	197009	197018	20 %	20 %	40 %	20 %	403529698
118	NC_018532	CTGGC	2	10	198455	198464	0 %	20 %	40 %	40 %	403529699
119	NC_018532	GACAT	2	10	202848	202857	40 %	20 %	20 %	20 %	403529702
120	NC_018532	AGGCA	2	10	206104	206113	40 %	0 %	40 %	20 %	403529705
121	NC_018532	CACAG	2	10	206572	206581	40 %	0 %	20 %	40 %	403529705
122	NC_018532	TTCGC	2	10	206815	206824	0 %	40 %	20 %	40 %	403529705
123	NC_018532	CCCAA	2	10	209397	209406	40 %	0 %	0 %	60 %	403529707
124	NC_018532	AGGGC	2	10	209760	209769	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018532	TGACC	2	10	209863	209872	20 %	20 %	20 %	40 %	403529708
126	NC_018532	CCCGG	2	10	210786	210795	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_018532	CTCCC	2	10	210808	210817	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
128	NC_018532	CGCAG	2	10	211816	211825	20 %	0 %	40 %	40 %	403529709
129	NC_018532	CTGCC	2	10	213265	213274	0 %	20 %	20 %	60 %	403529710
130	NC_018532	GCCGC	2	10	214654	214663	0 %	0 %	40 %	60 %	403529711
131	NC_018532	CCGGG	2	10	214719	214728	0 %	0 %	60 %	40 %	403529711
132	NC_018532	CCGAC	2	10	215438	215447	20 %	0 %	20 %	60 %	403529712
133	NC_018532	ACCGG	2	10	216236	216245	20 %	0 %	40 %	40 %	403529712
134	NC_018532	CGGGG	2	10	217307	217316	0 %	0 %	80 %	20 %	403529713
135	NC_018532	GCGGA	2	10	217551	217560	20 %	0 %	60 %	20 %	403529713
136	NC_018532	GGTGC	2	10	217661	217670	0 %	20 %	60 %	20 %	403529713
137	NC_018532	CAAAG	2	10	219597	219606	60 %	0 %	20 %	20 %	403529714
138	NC_018532	CTGCT	2	10	221699	221708	0 %	40 %	20 %	40 %	403529717
139	NC_018532	CTTCT	2	10	222533	222542	0 %	60 %	0 %	40 %	403529717
140	NC_018532	CCGGC	2	10	224002	224011	0 %	0 %	40 %	60 %	403529719
141	NC_018532	ACCCG	2	10	226664	226673	20 %	0 %	20 %	60 %	403529721
142	NC_018532	CACAC	2	10	227876	227885	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.