MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a chromosome

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018531	GATCTG	2	12	17912	17923	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018531	TCGGCG	2	12	18283	18294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018531	TGTACT	2	12	35734	35745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018531	GGACCA	2	12	74377	74388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018531	GAAGTT	2	12	94263	94274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018531	CACCTG	2	12	137334	137345	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018531	CCGCCA	2	12	137348	137359	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018531	TTGTCG	2	12	150441	150452	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018531	CCGGTT	2	12	150614	150625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018531	GTTCTG	2	12	153394	153405	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_018531	CCCACC	2	12	156297	156308	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
12	NC_018531	GTTCTG	2	12	160660	160671	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_018531	CCCACC	2	12	163562	163573	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
14	NC_018531	GCTGGA	2	12	196046	196057	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018531	AGTTTT	2	12	208943	208954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018531	CCGTTC	2	12	294900	294911	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018531	CTTGCG	2	12	321917	321928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018531	ATCCGA	2	12	399275	399286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018531	GCATCC	2	12	431330	431341	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018531	CTAAGC	2	12	474182	474193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018531	GCTTGA	2	12	477790	477801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_018531	GGAGAG	2	12	484143	484154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018531	GTCAAG	2	12	503078	503089	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018531	GAAGGC	2	12	588019	588030	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_018531	GGCTCG	2	12	590697	590708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018531	CGCCGA	2	12	743883	743894	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018531	TATATT	2	12	827879	827890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018531	TTGCTA	2	12	834388	834399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018531	CCGCGA	2	12	903165	903176	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018531	GTTCTG	2	12	920805	920816	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018531	CCCACC	2	12	923707	923718	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_018531	AACCAC	2	12	952232	952243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018531	TCCTTG	2	12	952611	952622	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018531	CTTCCA	2	12	971633	971644	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018531	GCCAAG	2	12	1029034	1029045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018531	ATCCGA	2	12	1034865	1034876	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018531	ACAGCC	2	12	1099013	1099024	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018531	CTGCGA	2	12	1154741	1154752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018531	GGTGCT	2	12	1181087	1181098	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_018531	GAAAGC	2	12	1233397	1233408	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018531	CAGGAG	2	12	1428595	1428606	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018531	GGGTGG	2	12	1428915	1428926	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018531	CTCCCC	2	12	1436838	1436849	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_018531	CCCAGC	2	12	1439335	1439346	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_018531	AAGCCA	2	12	1443140	1443151	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018531	AGCCGG	2	12	1446969	1446980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018531	CAGCGC	2	12	1454342	1454353	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018531	GAGCGG	2	12	1508877	1508888	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018531	GTCCGG	2	12	1523265	1523276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018531	CCGGGG	2	12	1605265	1605276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018531	GGGGCA	2	12	1663462	1663473	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018531	CCGGTT	2	12	1694779	1694790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018531	GTTCTG	2	12	1697560	1697571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_018531	CCCACC	2	12	1700463	1700474	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_018531	TTGCCC	2	12	1732980	1732991	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018531	GTACTT	2	12	1734496	1734507	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018531	TGCTCG	2	12	1928909	1928920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018531	GTCGAC	2	12	2069676	2069687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018531	CGGCGA	2	12	2069769	2069780	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018531	TCGAGA	2	12	2074629	2074640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018531	GACCCC	2	12	2079858	2079869	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_018531	TCGATG	2	12	2080582	2080593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018531	GGATCC	2	12	2092754	2092765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018531	TCCTTT	2	12	2094461	2094472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018531	GGGCCC	2	12	2114228	2114239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018531	ATCCGG	2	12	2129140	2129151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018531	AACGGG	2	12	2181058	2181069	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018531	AGTTCG	2	12	2181137	2181148	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_018531	ACTGGG	2	12	2185259	2185270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_018531	CTGAAC	2	12	2185560	2185571	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018531	GCGCAG	2	12	2193997	2194008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018531	GCGAAA	2	12	2263760	2263771	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_018531	GTTCCG	2	12	2281140	2281151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018531	TTGGGG	2	12	2316770	2316781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018531	CGCGTA	2	12	2382820	2382831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018531	GCCGGG	2	12	2386980	2386991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018531	ACCCCC	2	12	2538686	2538697	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
78	NC_018531	TCGGAA	2	12	2612872	2612883	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018531	CACCTC	2	12	2667566	2667577	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018531	TGTTGC	2	12	2780411	2780422	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_018531	TGCCGG	2	12	2793477	2793488	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018531	GCCTCC	2	12	2820784	2820795	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_018531	CCTCCG	2	12	2820802	2820813	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018531	CGGCTT	2	12	2883762	2883773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018531	GTCATT	2	12	2941557	2941568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_018531	AGAATC	2	12	3019152	3019163	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018531	GGACCC	2	12	3070623	3070634	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018531	TGCCCG	2	12	3095472	3095483	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018531	ATGACC	2	12	3137625	3137636	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018531	CTCGGG	2	12	3271486	3271497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018531	GACAAT	2	12	3271614	3271625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018531	GTTCCG	2	12	3419877	3419888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018531	CTAAAA	2	12	3423067	3423078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018531	ACGCCG	2	12	3513450	3513461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018531	GCTGGT	6	36	3518446	3518481	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018531	TCAGCA	2	12	3546334	3546345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018531	GCGCTG	2	12	3625509	3625520	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018531	CCACGC	2	12	3650422	3650433	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018531	CCGGCC	2	12	3664705	3664716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018531	GCACCC	2	12	3712089	3712100	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_018531	ATTGTC	2	12	3766881	3766892	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018531	ATGCAT	2	12	3771843	3771854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018531	AGCGGC	2	12	3853694	3853705	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018531	GTCGGG	2	12	3899120	3899131	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018531	GTCGGG	2	12	3899166	3899177	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018531	GGTCGG	2	12	3899189	3899200	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018531	CCGTCG	2	12	3899224	3899235	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018531	CCGTCG	2	12	3899266	3899277	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018531	CCGTCG	2	12	3899284	3899295	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018531	CCGTCG	3	18	3899326	3899343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018531	CCGAGC	2	12	3951293	3951304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018531	CCCCAA	2	12	3977890	3977901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_018531	CCCACC	2	12	3999343	3999354	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
114	NC_018531	GACAGC	2	12	4114103	4114114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018531	ACACCC	2	12	4191886	4191897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018531	TTACGG	2	12	4260341	4260352	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_018531	CAGAAC	2	12	4260423	4260434	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018531	TTACGG	2	12	4269289	4269300	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_018531	CAGAAC	2	12	4269371	4269382	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018531	CCTGCT	2	12	4464402	4464413	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018531	TGCCCA	2	12	4478077	4478088	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018531	CGTGTT	2	12	4505575	4505586	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018531	CGGGAA	2	12	4524485	4524496	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018531	CTCGCG	2	12	4560579	4560590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018531	TGGGAT	2	12	4612307	4612318	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018531	ACCCCC	2	12	4685202	4685213	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_018531	AGTATC	2	12	4711597	4711608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018531	CGCGTG	2	12	4726291	4726302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018531	CACTCT	2	12	4732831	4732842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.