MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a chromosome

Total Repeats: 2057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_018531	GGGAAT	2	12	4636067	4636078	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	403529263
2002	NC_018531	CCAGCA	2	12	4639941	4639952	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403529269
2003	NC_018531	CATGCC	2	12	4644755	4644766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403529275
2004	NC_018531	TCCATC	2	12	4650942	4650953	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	403529279
2005	NC_018531	GCTCAC	2	12	4655116	4655127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403529283
2006	NC_018531	CGGCAA	2	12	4657293	4657304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529284
2007	NC_018531	CGCGGC	2	12	4657407	4657418	0 %	0 %	50 %	50 %	403529284
2008	NC_018531	TGGGCC	2	12	4658918	4658929	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529286
2009	NC_018531	CGCTGA	2	12	4659200	4659211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529286
2010	NC_018531	CGGCGC	2	12	4659543	4659554	0 %	0 %	50 %	50 %	403529286
2011	NC_018531	AAGGTG	2	12	4660460	4660471	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	403529287
2012	NC_018531	GCCCTG	2	12	4660617	4660628	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529288
2013	NC_018531	GGCCTG	2	12	4662967	4662978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529291
2014	NC_018531	ACCAGC	2	12	4668500	4668511	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403529298
2015	NC_018531	TGAACC	2	12	4668565	4668576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403529298
2016	NC_018531	CGAACG	2	12	4669644	4669655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403529299
2017	NC_018531	ATCCTC	2	12	4669891	4669902	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	403529299
2018	NC_018531	ATCGCC	2	12	4673505	4673516	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403529302
2019	NC_018531	TGACCG	2	12	4675696	4675707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529306
2020	NC_018531	CCGCTG	2	12	4677544	4677555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529308
2021	NC_018531	ACGCCG	2	12	4677625	4677636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403529308
2022	NC_018531	ATCAAG	2	12	4677905	4677916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403529308
2023	NC_018531	GCCTGG	2	12	4682979	4682990	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529315
2024	NC_018531	GACGGC	2	12	4684376	4684387	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	403529318
2025	NC_018531	ACCCCC	2	12	4685202	4685213	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2026	NC_018531	AGGAAC	2	12	4685929	4685940	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403529321
2027	NC_018531	CGGCCG	2	12	4686005	4686016	0 %	0 %	50 %	50 %	403529321
2028	NC_018531	GCGAGA	2	12	4686068	4686079	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403529321
2029	NC_018531	GAACTC	2	12	4686555	4686566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403529321
2030	NC_018531	GGCGAT	2	12	4686939	4686950	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529321
2031	NC_018531	GCTTGA	2	12	4688249	4688260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403529322
2032	NC_018531	GTTCTC	2	12	4688923	4688934	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403529323
2033	NC_018531	TGACCA	2	12	4691964	4691975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403529326
2034	NC_018531	TTGCCC	2	12	4692673	4692684	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	403529327
2035	NC_018531	TTGAGG	2	12	4697114	4697125	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403529330
2036	NC_018531	CCGTGG	2	12	4697340	4697351	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	403529330
2037	NC_018531	AGGAGC	2	12	4698937	4698948	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403529331
2038	NC_018531	CGGTAT	2	12	4700724	4700735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403529332
2039	NC_018531	TGTCAG	2	12	4704031	4704042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403529334
2040	NC_018531	CCCTTG	2	12	4704098	4704109	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	403529334
2041	NC_018531	TGCCTG	2	12	4704990	4705001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403529334
2042	NC_018531	AGCCGT	2	12	4706043	4706054	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529334
2043	NC_018531	CGTTCA	2	12	4708565	4708576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403529336
2044	NC_018531	CTCATG	2	12	4710115	4710126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403529337
2045	NC_018531	AGTATC	2	12	4711597	4711608	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2046	NC_018531	GCTCCC	2	12	4712137	4712148	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	403529340
2047	NC_018531	GCCGTA	2	12	4717116	4717127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529344
2048	NC_018531	CTGCCG	2	12	4721646	4721657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529347
2049	NC_018531	CGCTGC	2	12	4721677	4721688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529347
2050	NC_018531	CGCGTG	2	12	4726291	4726302	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_018531	GATGAA	2	12	4732159	4732170	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403529355
2052	NC_018531	CACTCT	2	12	4732831	4732842	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2053	NC_018531	ATGGCG	2	12	4733369	4733380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403529356
2054	NC_018531	CTCGGA	2	12	4733611	4733622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403529357
2055	NC_018531	ATGTCG	2	12	4733948	4733959	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403529357
2056	NC_018531	GCCCTG	2	12	4734684	4734695	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	403529358
2057	NC_018531	GAGAAT	2	12	4735423	4735434	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403529359

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.