MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia pseudomallei BPC006 chromosome II

Total Repeats: 3361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018529	TGCGC	2	10	45	54	0 %	20 %	40 %	40 %	403521295
2	NC_018529	TGGCT	2	10	1289	1298	0 %	40 %	40 %	20 %	403521296
3	NC_018529	GTGCG	2	10	1500	1509	0 %	20 %	60 %	20 %	403521296
4	NC_018529	GCGCC	2	10	1839	1848	0 %	0 %	40 %	60 %	403521296
5	NC_018529	CGGCA	2	10	2527	2536	20 %	0 %	40 %	40 %	403521297
6	NC_018529	CGGGC	2	10	4972	4981	0 %	0 %	60 %	40 %	403521300
7	NC_018529	CGCAT	2	10	6064	6073	20 %	20 %	20 %	40 %	403521301
8	NC_018529	TCGAA	2	10	7219	7228	40 %	20 %	20 %	20 %	403521303
9	NC_018529	ACGCG	2	10	7616	7625	20 %	0 %	40 %	40 %	403521303
10	NC_018529	CGACG	2	10	10157	10166	20 %	0 %	40 %	40 %	403521306
11	NC_018529	GTGCC	2	10	10383	10392	0 %	20 %	40 %	40 %	403521306
12	NC_018529	GCACG	2	10	10532	10541	20 %	0 %	40 %	40 %	403521306
13	NC_018529	CAGCG	2	10	14541	14550	20 %	0 %	40 %	40 %	403521312
14	NC_018529	CGGCG	2	10	14584	14593	0 %	0 %	60 %	40 %	403521312
15	NC_018529	CGCGG	2	10	15491	15500	0 %	0 %	60 %	40 %	403521313
16	NC_018529	TGCGA	2	10	19519	19528	20 %	20 %	40 %	20 %	403521320
17	NC_018529	GCGCG	2	10	19536	19545	0 %	0 %	60 %	40 %	403521320
18	NC_018529	CGCGC	2	10	20124	20133	0 %	0 %	40 %	60 %	403521321
19	NC_018529	CGATT	2	10	23127	23136	20 %	40 %	20 %	20 %	403521323
20	NC_018529	GCCGC	2	10	23731	23740	0 %	0 %	40 %	60 %	403521325
21	NC_018529	CGCGG	2	10	24768	24777	0 %	0 %	60 %	40 %	403521327
22	NC_018529	CGCAA	2	10	25027	25036	40 %	0 %	20 %	40 %	403521327
23	NC_018529	GCCGC	2	10	27345	27354	0 %	0 %	40 %	60 %	403521328
24	NC_018529	CGCGC	2	10	28788	28797	0 %	0 %	40 %	60 %	403521330
25	NC_018529	GCCGA	2	10	29804	29813	20 %	0 %	40 %	40 %	403521331
26	NC_018529	CGAGC	2	10	30554	30563	20 %	0 %	40 %	40 %	403521332
27	NC_018529	TCGCC	2	10	31419	31428	0 %	20 %	20 %	60 %	403521333
28	NC_018529	GCGTG	2	10	31634	31643	0 %	20 %	60 %	20 %	403521333
29	NC_018529	AGGCG	2	10	32339	32348	20 %	0 %	60 %	20 %	403521335
30	NC_018529	GCGCC	2	10	34443	34452	0 %	0 %	40 %	60 %	403521337
31	NC_018529	GCGAC	2	10	35736	35745	20 %	0 %	40 %	40 %	403521339
32	NC_018529	GCGCG	2	10	36278	36287	0 %	0 %	60 %	40 %	403521341
33	NC_018529	CACGG	2	10	38063	38072	20 %	0 %	40 %	40 %	403521344
34	NC_018529	CGCGA	2	10	39291	39300	20 %	0 %	40 %	40 %	403521345
35	NC_018529	GCCGC	2	10	40664	40673	0 %	0 %	40 %	60 %	403521347
36	NC_018529	GTGCG	2	10	40937	40946	0 %	20 %	60 %	20 %	403521347
37	NC_018529	CGGAT	2	10	41753	41762	20 %	20 %	40 %	20 %	403521348
38	NC_018529	AGGCG	2	10	42941	42950	20 %	0 %	60 %	20 %	403521349
39	NC_018529	CGACG	2	10	44103	44112	20 %	0 %	40 %	40 %	403521350
40	NC_018529	CGCAC	2	10	44699	44708	20 %	0 %	20 %	60 %	403521352
41	NC_018529	CGACG	2	10	45351	45360	20 %	0 %	40 %	40 %	403521352
42	NC_018529	GCGCG	2	10	45686	45695	0 %	0 %	60 %	40 %	403521353
43	NC_018529	GCGCA	2	10	46786	46795	20 %	0 %	40 %	40 %	403521354
44	NC_018529	CGATC	2	10	48641	48650	20 %	20 %	20 %	40 %	403521356
45	NC_018529	CGGGC	2	10	49318	49327	0 %	0 %	60 %	40 %	403521357
46	NC_018529	GAGCG	2	10	51102	51111	20 %	0 %	60 %	20 %	403521359
47	NC_018529	ATCGT	2	10	53162	53171	20 %	40 %	20 %	20 %	403521361
48	NC_018529	GAGCC	2	10	54467	54476	20 %	0 %	40 %	40 %	403521363
49	NC_018529	GCCGC	2	10	54898	54907	0 %	0 %	40 %	60 %	403521363
50	NC_018529	GCGTC	2	10	56394	56403	0 %	20 %	40 %	40 %	403521365
51	NC_018529	TGCGT	2	10	58341	58350	0 %	40 %	40 %	20 %	403521368
52	NC_018529	GGCGC	2	10	59580	59589	0 %	0 %	60 %	40 %	403521369
53	NC_018529	CGTCG	2	10	59592	59601	0 %	20 %	40 %	40 %	403521369
54	NC_018529	TCGAA	2	10	60170	60179	40 %	20 %	20 %	20 %	403521369
55	NC_018529	CCCGG	2	10	60799	60808	0 %	0 %	40 %	60 %	403521369
56	NC_018529	GCGCA	2	10	64543	64552	20 %	0 %	40 %	40 %	403521369
57	NC_018529	CGCGG	2	10	64595	64604	0 %	0 %	60 %	40 %	403521369
58	NC_018529	CTGCA	2	10	65243	65252	20 %	20 %	20 %	40 %	403521370
59	NC_018529	GGCTT	2	10	65932	65941	0 %	40 %	40 %	20 %	403521372
60	NC_018529	GCGCA	2	10	66048	66057	20 %	0 %	40 %	40 %	403521372
61	NC_018529	CGGCG	2	10	68873	68882	0 %	0 %	60 %	40 %	403521377
62	NC_018529	GGCGT	2	10	70255	70264	0 %	20 %	60 %	20 %	403521379
63	NC_018529	CGGGA	2	10	72082	72091	20 %	0 %	60 %	20 %	403521380
64	NC_018529	GATTC	2	10	72711	72720	20 %	40 %	20 %	20 %	403521380
65	NC_018529	TCGCG	2	10	72723	72732	0 %	20 %	40 %	40 %	403521380
66	NC_018529	GGCAT	2	10	72852	72861	20 %	20 %	40 %	20 %	403521380
67	NC_018529	TCGAT	2	10	77011	77020	20 %	40 %	20 %	20 %	403521385
68	NC_018529	GCACG	2	10	77695	77704	20 %	0 %	40 %	40 %	403521386
69	NC_018529	CGGCT	2	10	77795	77804	0 %	20 %	40 %	40 %	403521386
70	NC_018529	TGCGC	2	10	79755	79764	0 %	20 %	40 %	40 %	403521388
71	NC_018529	TACGC	2	10	88376	88385	20 %	20 %	20 %	40 %	403521396
72	NC_018529	GGGCA	2	10	90630	90639	20 %	0 %	60 %	20 %	403521396
73	NC_018529	ATGGA	2	10	91898	91907	40 %	20 %	40 %	0 %	403521397
74	NC_018529	GGCCG	2	10	92182	92191	0 %	0 %	60 %	40 %	403521397
75	NC_018529	GCTCG	2	10	92943	92952	0 %	20 %	40 %	40 %	403521397
76	NC_018529	CAAAC	2	10	94504	94513	60 %	0 %	0 %	40 %	403521398
77	NC_018529	ACGGC	2	10	95000	95009	20 %	0 %	40 %	40 %	403521398
78	NC_018529	GCGTG	2	10	95082	95091	0 %	20 %	60 %	20 %	403521399
79	NC_018529	CTCGT	2	10	95308	95317	0 %	40 %	20 %	40 %	403521399
80	NC_018529	CGTGA	2	10	98405	98414	20 %	20 %	40 %	20 %	403521406
81	NC_018529	GCCGC	2	10	99334	99343	0 %	0 %	40 %	60 %	403521407
82	NC_018529	GGGCC	2	10	104601	104610	0 %	0 %	60 %	40 %	403521412
83	NC_018529	CGGCG	2	10	106440	106449	0 %	0 %	60 %	40 %	403521414
84	NC_018529	CGCGC	2	10	107022	107031	0 %	0 %	40 %	60 %	403521414
85	NC_018529	AAAAG	2	10	107812	107821	80 %	0 %	20 %	0 %	403521415
86	NC_018529	TCGGC	2	10	110847	110856	0 %	20 %	40 %	40 %	403521419
87	NC_018529	TTGCG	2	10	113116	113125	0 %	40 %	40 %	20 %	403521419
88	NC_018529	GGCGC	2	10	113216	113225	0 %	0 %	60 %	40 %	403521420
89	NC_018529	CGAAC	2	10	114935	114944	40 %	0 %	20 %	40 %	403521422
90	NC_018529	CGGAG	2	10	115586	115595	20 %	0 %	60 %	20 %	403521422
91	NC_018529	GGCCG	2	10	120653	120662	0 %	0 %	60 %	40 %	403521428
92	NC_018529	GATCG	2	10	121444	121453	20 %	20 %	40 %	20 %	403521429
93	NC_018529	CGCTG	2	10	122000	122009	0 %	20 %	40 %	40 %	403521429
94	NC_018529	GCGGA	2	10	122012	122021	20 %	0 %	60 %	20 %	403521429
95	NC_018529	CGAGC	2	10	124796	124805	20 %	0 %	40 %	40 %	403521430
96	NC_018529	CGGCG	2	10	125444	125453	0 %	0 %	60 %	40 %	403521430
97	NC_018529	CTGCG	2	10	127738	127747	0 %	20 %	40 %	40 %	403521433
98	NC_018529	CGGCC	2	10	128188	128197	0 %	0 %	40 %	60 %	403521433
99	NC_018529	GCGAC	2	10	128912	128921	20 %	0 %	40 %	40 %	403521433
100	NC_018529	GCGCG	2	10	131358	131367	0 %	0 %	60 %	40 %	403521435
101	NC_018529	CTTGC	2	10	136141	136150	0 %	40 %	20 %	40 %	403521436
102	NC_018529	GCGCG	2	10	137526	137535	0 %	0 %	60 %	40 %	403521437
103	NC_018529	GCGAT	2	10	138216	138225	20 %	20 %	40 %	20 %	403521437
104	NC_018529	AGCTG	2	10	138836	138845	20 %	20 %	40 %	20 %	403521438
105	NC_018529	TTCCG	2	10	139080	139089	0 %	40 %	20 %	40 %	403521438
106	NC_018529	TTCGC	2	10	142266	142275	0 %	40 %	20 %	40 %	403521441
107	NC_018529	GGGCC	2	10	146492	146501	0 %	0 %	60 %	40 %	403521445
108	NC_018529	GAATG	2	10	147429	147438	40 %	20 %	40 %	0 %	403521445
109	NC_018529	GCATT	2	10	147938	147947	20 %	40 %	20 %	20 %	403521445
110	NC_018529	AGCGC	2	10	148154	148163	20 %	0 %	40 %	40 %	403521445
111	NC_018529	CGTCG	2	10	148476	148485	0 %	20 %	40 %	40 %	403521445
112	NC_018529	CGGTG	2	10	152263	152272	0 %	20 %	60 %	20 %	403521451
113	NC_018529	TGCCG	2	10	152569	152578	0 %	20 %	40 %	40 %	403521451
114	NC_018529	TGAAA	2	10	158534	158543	60 %	20 %	20 %	0 %	403521455
115	NC_018529	ATGCG	2	10	159109	159118	20 %	20 %	40 %	20 %	403521455
116	NC_018529	GACGC	2	10	161544	161553	20 %	0 %	40 %	40 %	403521458
117	NC_018529	CGGCG	2	10	162477	162486	0 %	0 %	60 %	40 %	403521459
118	NC_018529	CGAAA	2	10	163054	163063	60 %	0 %	20 %	20 %	403521460
119	NC_018529	CGGCG	2	10	164145	164154	0 %	0 %	60 %	40 %	403521460
120	NC_018529	CGACC	2	10	164751	164760	20 %	0 %	20 %	60 %	403521461
121	NC_018529	CGGCG	2	10	165579	165588	0 %	0 %	60 %	40 %	403521461
122	NC_018529	CGCGA	2	10	165838	165847	20 %	0 %	40 %	40 %	403521461
123	NC_018529	CGTGC	2	10	167353	167362	0 %	20 %	40 %	40 %	403521464
124	NC_018529	GGCGC	2	10	167922	167931	0 %	0 %	60 %	40 %	403521464
125	NC_018529	AGGCG	2	10	168202	168211	20 %	0 %	60 %	20 %	403521464
126	NC_018529	CGCAT	2	10	171432	171441	20 %	20 %	20 %	40 %	403521467
127	NC_018529	CGTCG	2	10	172843	172852	0 %	20 %	40 %	40 %	403521469
128	NC_018529	CGCGC	2	10	173581	173590	0 %	0 %	40 %	60 %	403521469
129	NC_018529	CCGCG	2	10	174293	174302	0 %	0 %	40 %	60 %	403521471
130	NC_018529	CGATT	2	10	175726	175735	20 %	40 %	20 %	20 %	403521472
131	NC_018529	GCGCC	2	10	181728	181737	0 %	0 %	40 %	60 %	403521480
132	NC_018529	TCGCG	2	10	182208	182217	0 %	20 %	40 %	40 %	403521481
133	NC_018529	CGCGG	2	10	182998	183007	0 %	0 %	60 %	40 %	403521481
134	NC_018529	CGCGC	2	10	184355	184364	0 %	0 %	40 %	60 %	403521482
135	NC_018529	CGGCG	2	10	184408	184417	0 %	0 %	60 %	40 %	403521482
136	NC_018529	GCTTC	2	10	184435	184444	0 %	40 %	20 %	40 %	403521482
137	NC_018529	GCGCT	2	10	185217	185226	0 %	20 %	40 %	40 %	403521483
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149	NC_018529	GCGGT	2	10	197752	197761	0 %	20 %	60 %	20 %	403521495
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250	NC_018529	CGCGC	2	10	276641	276650	0 %	0 %	40 %	60 %	403521565
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255	NC_018529	CGACG	2	10	288317	288326	20 %	0 %	40 %	40 %	403521578
256	NC_018529	TGCGC	2	10	289145	289154	0 %	20 %	40 %	40 %	403521578
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261	NC_018529	GCCGT	2	10	292948	292957	0 %	20 %	40 %	40 %	403521581
262	NC_018529	TCGGC	2	10	293995	294004	0 %	20 %	40 %	40 %	403521582
263	NC_018529	CGGCC	3	15	294770	294784	0 %	0 %	40 %	60 %	403521583
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