MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	GCAGAA	2	12	919	930	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403514033
2	NC_018528	GATGCA	2	12	6135	6146	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514037
3	NC_018528	GCAAGG	2	12	8522	8533	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403514038
4	NC_018528	GATCAA	2	12	8683	8694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514038
5	NC_018528	TAATTT	2	12	9243	9254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514039
6	NC_018528	AGCTGA	2	12	12946	12957	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514044
7	NC_018528	TGAAGT	2	12	14515	14526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514045
8	NC_018528	TTCATC	2	12	14960	14971	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403514046
9	NC_018528	TCAAAT	2	12	26073	26084	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514060
10	NC_018528	CCAATC	2	12	30718	30729	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403514063
11	NC_018528	AGCAAT	2	12	36677	36688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514069
12	NC_018528	CATCCC	2	12	38011	38022	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	403514071
13	NC_018528	ATGGTG	2	12	42022	42033	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403514074
14	NC_018528	TTTGAA	2	12	43562	43573	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403514076
15	NC_018528	AGATGA	2	12	48348	48359	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514082
16	NC_018528	TAAAGT	2	12	50364	50375	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514085
17	NC_018528	GGAATA	2	12	50413	50424	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514085
18	NC_018528	TCATGA	2	12	54222	54233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514088
19	NC_018528	AAAAAG	2	12	55145	55156	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403514090
20	NC_018528	GAATAT	2	12	57729	57740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514094
21	NC_018528	CAGCTG	2	12	60833	60844	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403514096
22	NC_018528	TGGCGA	2	12	62022	62033	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403514097
23	NC_018528	CTTCGT	2	12	63183	63194	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403514100
24	NC_018528	TTACAA	2	12	63282	63293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514100
25	NC_018528	ATAAAA	2	12	68558	68569	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403514103
26	NC_018528	AACGTT	2	12	83618	83629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514112
27	NC_018528	GATTCA	2	12	88739	88750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514119
28	NC_018528	AAATTC	2	12	90436	90447	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514119
29	NC_018528	TAAGGA	2	12	95423	95434	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514124
30	NC_018528	TCAACA	2	12	97686	97697	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403514128
31	NC_018528	GCTATG	2	12	97947	97958	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403514128
32	NC_018528	AATGTA	2	12	98611	98622	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514129
33	NC_018528	AAAGCA	2	12	102322	102333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403514132
34	NC_018528	AAGACA	2	12	105197	105208	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403514135
35	NC_018528	AAATTC	2	12	108722	108733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514139
36	NC_018528	TCCAAA	2	12	114866	114877	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403514148
37	NC_018528	AACTTG	2	12	117941	117952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514152
38	NC_018528	ATAAAT	2	12	120257	120268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514153
39	NC_018528	GCTTCA	2	12	120357	120368	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514153
40	NC_018528	TTCCGA	2	12	121486	121497	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514155
41	NC_018528	CATAAT	2	12	122209	122220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403514156
42	NC_018528	CTTAAG	2	12	122731	122742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514158
43	NC_018528	TTATTT	2	12	124184	124195	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	403514161
44	NC_018528	ATAAAT	2	12	124795	124806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514162
45	NC_018528	GTTTTG	2	12	130016	130027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514167
46	NC_018528	TGGCAA	2	12	131104	131115	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514169
47	NC_018528	TGTTGA	2	12	133242	133253	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	403514171
48	NC_018528	CTAAGG	2	12	135022	135033	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514172
49	NC_018528	TTCTGG	2	12	136071	136082	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	403514173
50	NC_018528	TAAAGA	2	12	141159	141170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514177
51	NC_018528	AATTTT	2	12	141359	141370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514178
52	NC_018528	TTGCAG	2	12	141589	141600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403514178
53	NC_018528	GAATAA	2	12	142614	142625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514179
54	NC_018528	AACGCA	2	12	143606	143617	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403514181
55	NC_018528	CAATTT	2	12	143855	143866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403514181
56	NC_018528	ATTGCC	2	12	144441	144452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514181
57	NC_018528	TAACTT	2	12	148915	148926	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403514185
58	NC_018528	TAAAGA	2	12	154578	154589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514191
59	NC_018528	GTCATC	2	12	155315	155326	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514191
60	NC_018528	TATTGA	2	12	162327	162338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403514196
61	NC_018528	CTGAAG	2	12	165960	165971	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514199
62	NC_018528	GTGGTT	2	12	169241	169252	0 %	50 %	50 %	0 %	403514202
63	NC_018528	CAATAG	2	12	169904	169915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514202
64	NC_018528	GTAACA	2	12	170620	170631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514202
65	NC_018528	AGCATC	2	12	172316	172327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403514204
66	NC_018528	GATGAA	2	12	172338	172349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514204
67	NC_018528	TATCCT	2	12	172372	172383	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403514204
68	NC_018528	CTAGAA	2	12	172395	172406	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514204
69	NC_018528	GCGCCA	2	12	172539	172550	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	403514204
70	NC_018528	TGCTAC	2	12	173983	173994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514207
71	NC_018528	ATATAG	2	12	176335	176346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514209
72	NC_018528	TTGAAA	2	12	176380	176391	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514209
73	NC_018528	CATACC	2	12	179171	179182	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403514212
74	NC_018528	TTGATT	2	12	179902	179913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403514213
75	NC_018528	TTTCTT	2	12	183676	183687	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403514215
76	NC_018528	ATCAAC	2	12	185958	185969	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403514220
77	NC_018528	CGTTGC	2	12	191973	191984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514226
78	NC_018528	ATTCTT	2	12	193058	193069	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403514227
79	NC_018528	GTAATT	2	12	193794	193805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403514227
80	NC_018528	AATAGT	2	12	201594	201605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514232
81	NC_018528	CAAGCA	2	12	204315	204326	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	403514233
82	NC_018528	ATCGGT	2	12	208103	208114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403514236
83	NC_018528	TATTGC	2	12	208801	208812	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514237
84	NC_018528	GATAAG	2	12	215385	215396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514244
85	NC_018528	AAGATG	2	12	215521	215532	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514244
86	NC_018528	ATGACG	2	12	216180	216191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514246
87	NC_018528	TCCGGT	2	12	217721	217732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514247
88	NC_018528	TTGCCA	2	12	220669	220680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514248
89	NC_018528	GTCTAA	2	12	220728	220739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514248
90	NC_018528	CCTGTT	2	12	220954	220965	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403514248
91	NC_018528	GGCTAA	2	12	221397	221408	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514248
92	NC_018528	GAAGCT	2	12	225879	225890	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514252
93	NC_018528	AAAGAT	2	12	228238	228249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514254
94	NC_018528	TTAGTT	2	12	229200	229211	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403514256
95	NC_018528	TTCTTT	2	12	230392	230403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403514258
96	NC_018528	TCAAGT	2	12	232931	232942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514259
97	NC_018528	AAAAGA	2	12	235475	235486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403514261
98	NC_018528	GAAACT	2	12	237366	237377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514264
99	NC_018528	CGTCAC	2	12	239812	239823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403514266
100	NC_018528	GTATTC	2	12	240932	240943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514267
101	NC_018528	TTGATC	2	12	242885	242896	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514270
102	NC_018528	ACCCAT	2	12	245011	245022	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403514272
103	NC_018528	CAGGTC	2	12	251610	251621	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	403514277
104	NC_018528	ACTACA	2	12	255977	255988	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403514281
105	NC_018528	CGTTAT	2	12	259933	259944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514284
106	NC_018528	TCGCCA	2	12	260043	260054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403514284
107	NC_018528	AAGCTA	2	12	261975	261986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514286
108	NC_018528	ACTGGT	2	12	262790	262801	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403514287
109	NC_018528	TGGACG	2	12	263989	264000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403514287
110	NC_018528	TTTTGG	2	12	264840	264851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514289
111	NC_018528	TGGAAT	2	12	265258	265269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514289
112	NC_018528	TTGAAC	2	12	265323	265334	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514289
113	NC_018528	TTAAAG	2	12	265886	265897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514290
114	NC_018528	ATATTA	2	12	266300	266311	50 %	50 %	0 %	0 %	403514290
115	NC_018528	AGACAA	2	12	268583	268594	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403514293
116	NC_018528	ATTAGA	2	12	268770	268781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403514293
117	NC_018528	GAAAAT	2	12	269197	269208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403514294
118	NC_018528	TGCACC	2	12	269772	269783	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403514294
119	NC_018528	ATCAAA	2	12	274836	274847	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	403514298
120	NC_018528	TCTGCT	2	12	277313	277324	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403514300
121	NC_018528	CTAAGA	2	12	279389	279400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514302
122	NC_018528	TTTTGA	2	12	282292	282303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403514304
123	NC_018528	GCAATA	2	12	282950	282961	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514305
124	NC_018528	GTGAAG	2	12	290369	290380	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	403514307
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127	NC_018528	AACGCT	2	12	297733	297744	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403514311
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129	NC_018528	GCATTA	2	12	301982	301993	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514316
130	NC_018528	GCAGAT	2	12	302519	302530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403514317
131	NC_018528	AGGTGT	2	12	304028	304039	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403514320
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135	NC_018528	TTTAAA	2	12	315028	315039	50 %	50 %	0 %	0 %	403514342
136	NC_018528	AACTGA	2	12	317420	317431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514346
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145	NC_018528	GCCTTT	2	12	343149	343160	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	403514373
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221	NC_018528	AGATGA	2	12	563110	563121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403514589
222	NC_018528	TTGACT	2	12	569791	569802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514595
223	NC_018528	TGGCGA	2	12	571392	571403	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	403514596
224	NC_018528	GGAGAA	2	12	575526	575537	50 %	0 %	50 %	0 %	403514598
225	NC_018528	ATTGAT	2	12	584444	584455	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403514605
226	NC_018528	ATTGAT	2	12	586492	586503	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403514606
227	NC_018528	GAAAAA	2	12	587667	587678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403514607
228	NC_018528	TGCAAA	2	12	589720	589731	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514610
229	NC_018528	TGACCT	2	12	591543	591554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403514611
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231	NC_018528	ATTTTT	2	12	592914	592925	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	403514612
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342	NC_018528	AAAAAG	2	12	905923	905934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403514895
343	NC_018528	TTCAGA	2	12	910093	910104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403514899
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444	NC_018528	ATCAAC	2	12	1219302	1219313	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403515184
445	NC_018528	ATCTTC	2	12	1219452	1219463	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403515184
446	NC_018528	ACTAAT	2	12	1223484	1223495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403515189
447	NC_018528	AACATT	2	12	1226406	1226417	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403515192
448	NC_018528	TAACAT	2	12	1229610	1229621	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403515194
449	NC_018528	CAGTTT	2	12	1240926	1240937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403515202
450	NC_018528	AGTACC	2	12	1242978	1242989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403515203
451	NC_018528	CTTAAG	2	12	1246018	1246029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403515206
452	NC_018528	GTATCA	2	12	1247055	1247066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403515208
453	NC_018528	GTGAAT	2	12	1247102	1247113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515208
454	NC_018528	AGCCTT	2	12	1247687	1247698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403515208
455	NC_018528	ATTACC	2	12	1253707	1253718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515214
456	NC_018528	TTTTCA	2	12	1262218	1262229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403515220
457	NC_018528	AAAGTC	2	12	1282841	1282852	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403515240
458	NC_018528	TAAATC	2	12	1283321	1283332	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403515241
459	NC_018528	CTTTTT	2	12	1289940	1289951	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403515247
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461	NC_018528	ACAGTA	2	12	1301910	1301921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403515257
462	NC_018528	TGACTA	2	12	1307981	1307992	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403515262
463	NC_018528	ATCAAA	2	12	1310832	1310843	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	403515265
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468	NC_018528	TTTTTA	2	12	1313811	1313822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	403515267
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482	NC_018528	CTAAAA	2	12	1345389	1345400	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	403515297
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