MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 1701

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	TGGAA	2	10	246	255	40 %	20 %	40 %	0 %	403514033
2	NC_018528	TATTT	2	10	3482	3491	20 %	80 %	0 %	0 %	403514036
3	NC_018528	ATGAA	2	10	4774	4783	60 %	20 %	20 %	0 %	403514037
4	NC_018528	AGAAT	2	10	4888	4897	60 %	20 %	20 %	0 %	403514037
5	NC_018528	AGGAA	2	10	9271	9280	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018528	TGGCT	2	10	12859	12868	0 %	40 %	40 %	20 %	403514044
7	NC_018528	CAAAT	2	10	13383	13392	60 %	20 %	0 %	20 %	403514045
8	NC_018528	TATAA	2	10	14762	14771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018528	AGCCA	2	10	15038	15047	40 %	0 %	20 %	40 %	403514046
10	NC_018528	CATTG	2	10	15808	15817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018528	ATATC	2	10	15956	15965	40 %	40 %	0 %	20 %	403514047
12	NC_018528	CAATT	2	10	18539	18548	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018528	AAGGT	2	10	20799	20808	40 %	20 %	40 %	0 %	403514052
14	NC_018528	TTGAT	2	10	23354	23363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018528	CATGA	2	10	24294	24303	40 %	20 %	20 %	20 %	403514057
16	NC_018528	AATCA	2	10	24693	24702	60 %	20 %	0 %	20 %	403514057
17	NC_018528	TTTCA	2	10	27447	27456	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018528	ATTTT	2	10	28177	28186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018528	GCAAA	2	10	29530	29539	60 %	0 %	20 %	20 %	403514062
20	NC_018528	CAATA	2	10	31602	31611	60 %	20 %	0 %	20 %	403514064
21	NC_018528	TTTTA	2	10	32522	32531	20 %	80 %	0 %	0 %	403514065
22	NC_018528	AAAAT	2	10	32927	32936	80 %	20 %	0 %	0 %	403514066
23	NC_018528	AATTT	2	10	38653	38662	40 %	60 %	0 %	0 %	403514072
24	NC_018528	AATTT	2	10	38806	38815	40 %	60 %	0 %	0 %	403514072
25	NC_018528	TTCTT	2	10	40567	40576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018528	ATATT	2	10	42805	42814	40 %	60 %	0 %	0 %	403514076
27	NC_018528	TGAAA	2	10	45674	45683	60 %	20 %	20 %	0 %	403514079
28	NC_018528	AAATT	2	10	46907	46916	60 %	40 %	0 %	0 %	403514081
29	NC_018528	GTTTT	2	10	46975	46984	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018528	ATATG	2	10	47124	47133	40 %	40 %	20 %	0 %	403514082
31	NC_018528	ACTAA	2	10	48319	48328	60 %	20 %	0 %	20 %	403514082
32	NC_018528	AAATA	2	10	48511	48520	80 %	20 %	0 %	0 %	403514082
33	NC_018528	AAGAT	2	10	49860	49869	60 %	20 %	20 %	0 %	403514084
34	NC_018528	CAATG	2	10	50238	50247	40 %	20 %	20 %	20 %	403514085
35	NC_018528	ACGCA	2	10	53754	53763	40 %	0 %	20 %	40 %	403514088
36	NC_018528	TAATT	2	10	54981	54990	40 %	60 %	0 %	0 %	403514089
37	NC_018528	AAAGG	2	10	57561	57570	60 %	0 %	40 %	0 %	403514093
38	NC_018528	AAAAC	2	10	58720	58729	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018528	GTTAA	2	10	59679	59688	40 %	40 %	20 %	0 %	403514095
40	NC_018528	ATTTA	2	10	60448	60457	40 %	60 %	0 %	0 %	403514096
41	NC_018528	TTTCA	2	10	63301	63310	20 %	60 %	0 %	20 %	403514100
42	NC_018528	GTGAA	2	10	63361	63370	40 %	20 %	40 %	0 %	403514100
43	NC_018528	AAATG	2	10	64284	64293	60 %	20 %	20 %	0 %	403514101
44	NC_018528	AAAAG	2	10	64701	64710	80 %	0 %	20 %	0 %	403514101
45	NC_018528	TTAAA	2	10	66152	66161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018528	AAGAT	2	10	68825	68834	60 %	20 %	20 %	0 %	403514103
47	NC_018528	GCTCT	2	10	70781	70790	0 %	40 %	20 %	40 %	403514104
48	NC_018528	TTCAG	2	10	71294	71303	20 %	40 %	20 %	20 %	403514104
49	NC_018528	TTTTG	2	10	71792	71801	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018528	AAGCA	2	10	71977	71986	60 %	0 %	20 %	20 %	403514105
51	NC_018528	GGTAA	2	10	72947	72956	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018528	TCGTG	2	10	73763	73772	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018528	GGCAG	2	10	74161	74170	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018528	GAGAA	2	10	74416	74425	60 %	0 %	40 %	0 %	403514106
55	NC_018528	AAGGC	2	10	75814	75823	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018528	TTGAA	2	10	76324	76333	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018528	GCCAG	2	10	76656	76665	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018528	AGGAA	2	10	77510	77519	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018528	TCTGA	2	10	79833	79842	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018528	AGTTA	2	10	80877	80886	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018528	TTTGC	2	10	81297	81306	0 %	60 %	20 %	20 %	403514110
62	NC_018528	AGCAT	2	10	81701	81710	40 %	20 %	20 %	20 %	403514110
63	NC_018528	TTTTC	2	10	81953	81962	0 %	80 %	0 %	20 %	403514111
64	NC_018528	AAAGA	2	10	82119	82128	80 %	0 %	20 %	0 %	403514111
65	NC_018528	ATTGA	2	10	83740	83749	40 %	40 %	20 %	0 %	403514112
66	NC_018528	ATTTA	2	10	87854	87863	40 %	60 %	0 %	0 %	403514118
67	NC_018528	AAAAG	2	10	95255	95264	80 %	0 %	20 %	0 %	403514124
68	NC_018528	CAATA	2	10	96412	96421	60 %	20 %	0 %	20 %	403514125
69	NC_018528	TTTTA	2	10	97333	97342	20 %	80 %	0 %	0 %	403514127
70	NC_018528	ACAAA	2	10	98929	98938	80 %	0 %	0 %	20 %	403514129
71	NC_018528	TAAAG	2	10	101808	101817	60 %	20 %	20 %	0 %	403514132
72	NC_018528	ACGGC	2	10	102260	102269	20 %	0 %	40 %	40 %	403514132
73	NC_018528	TTTGT	2	10	103008	103017	0 %	80 %	20 %	0 %	403514133
74	NC_018528	TTTAA	2	10	103925	103934	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018528	ACAAA	2	10	104224	104233	80 %	0 %	0 %	20 %	403514134
76	NC_018528	ATGCC	2	10	105300	105309	20 %	20 %	20 %	40 %	403514135
77	NC_018528	AACTT	2	10	105838	105847	40 %	40 %	0 %	20 %	403514136
78	NC_018528	AACCA	2	10	111782	111791	60 %	0 %	0 %	40 %	403514144
79	NC_018528	GAAAA	2	10	112976	112985	80 %	0 %	20 %	0 %	403514146
80	NC_018528	ATTTT	2	10	113230	113239	20 %	80 %	0 %	0 %	403514147
81	NC_018528	ATGCC	2	10	113417	113426	20 %	20 %	20 %	40 %	403514147
82	NC_018528	TAATT	2	10	113967	113976	40 %	60 %	0 %	0 %	403514147
83	NC_018528	AAGCA	2	10	115202	115211	60 %	0 %	20 %	20 %	403514148
84	NC_018528	ATTAA	2	10	116804	116813	60 %	40 %	0 %	0 %	403514150
85	NC_018528	CAATA	2	10	119554	119563	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018528	TTTTC	2	10	120387	120396	0 %	80 %	0 %	20 %	403514153
87	NC_018528	TTAAT	2	10	121147	121156	40 %	60 %	0 %	0 %	403514155
88	NC_018528	AATTT	2	10	121455	121464	40 %	60 %	0 %	0 %	403514155
89	NC_018528	TCTGA	2	10	122712	122721	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_018528	TTAGG	2	10	123713	123722	20 %	40 %	40 %	0 %	403514160
91	NC_018528	TTTCA	2	10	126410	126419	20 %	60 %	0 %	20 %	403514163
92	NC_018528	CAAAA	2	10	126500	126509	80 %	0 %	0 %	20 %	403514163
93	NC_018528	TGATT	2	10	128021	128030	20 %	60 %	20 %	0 %	403514165
94	NC_018528	TTCAT	2	10	128227	128236	20 %	60 %	0 %	20 %	403514165
95	NC_018528	TGCTT	2	10	129004	129013	0 %	60 %	20 %	20 %	403514166
96	NC_018528	ATGGA	2	10	132905	132914	40 %	20 %	40 %	0 %	403514171
97	NC_018528	GCAAC	2	10	133172	133181	40 %	0 %	20 %	40 %	403514171
98	NC_018528	ATTTT	2	10	136874	136883	20 %	80 %	0 %	0 %	403514174
99	NC_018528	TAATT	2	10	138352	138361	40 %	60 %	0 %	0 %	403514175
100	NC_018528	TCAAA	2	10	139604	139613	60 %	20 %	0 %	20 %	403514176
101	NC_018528	GAAAT	2	10	140758	140767	60 %	20 %	20 %	0 %	403514177
102	NC_018528	CAATT	2	10	142587	142596	40 %	40 %	0 %	20 %	403514179
103	NC_018528	TGATC	2	10	144029	144038	20 %	40 %	20 %	20 %	403514181
104	NC_018528	AGCTT	2	10	145175	145184	20 %	40 %	20 %	20 %	403514181
105	NC_018528	GAAGT	2	10	147516	147525	40 %	20 %	40 %	0 %	403514183
106	NC_018528	TTGGT	2	10	152692	152701	0 %	60 %	40 %	0 %	403514189
107	NC_018528	ATTTA	2	10	153369	153378	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018528	ATTTT	2	10	153539	153548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018528	CAAGA	2	10	153665	153674	60 %	0 %	20 %	20 %	403514190
110	NC_018528	TAATT	2	10	157588	157597	40 %	60 %	0 %	0 %	403514192
111	NC_018528	TATGG	2	10	157689	157698	20 %	40 %	40 %	0 %	403514193
112	NC_018528	GATAA	2	10	162562	162571	60 %	20 %	20 %	0 %	403514196
113	NC_018528	ATTTC	2	10	163825	163834	20 %	60 %	0 %	20 %	403514197
114	NC_018528	TTGGA	2	10	164149	164158	20 %	40 %	40 %	0 %	403514198
115	NC_018528	CATTA	2	10	164968	164977	40 %	40 %	0 %	20 %	403514198
116	NC_018528	ACTTT	2	10	165732	165741	20 %	60 %	0 %	20 %	403514199
117	NC_018528	CATAA	2	10	170889	170898	60 %	20 %	0 %	20 %	403514202
118	NC_018528	TTCTT	2	10	171668	171677	0 %	80 %	0 %	20 %	403514203
119	NC_018528	TCAAA	2	10	172807	172816	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018528	GCAAT	2	10	174620	174629	40 %	20 %	20 %	20 %	403514207
121	NC_018528	GGCAA	2	10	175004	175013	40 %	0 %	40 %	20 %	403514207
122	NC_018528	CTGTT	2	10	175872	175881	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018528	ATTAG	2	10	176077	176086	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018528	GCTTG	2	10	177704	177713	0 %	40 %	40 %	20 %	403514211
125	NC_018528	ATCTA	2	10	179855	179864	40 %	40 %	0 %	20 %	403514213
126	NC_018528	AAAAG	2	10	181124	181133	80 %	0 %	20 %	0 %	403514213
127	NC_018528	AAAAG	2	10	181909	181918	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018528	CTTTT	2	10	182633	182642	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018528	GGTTG	2	10	186772	186781	0 %	40 %	60 %	0 %	403514221
130	NC_018528	TAATT	2	10	187399	187408	40 %	60 %	0 %	0 %	403514221
131	NC_018528	GCCAA	2	10	188127	188136	40 %	0 %	20 %	40 %	403514222
132	NC_018528	AATTG	2	10	190396	190405	40 %	40 %	20 %	0 %	403514224
133	NC_018528	CAAAG	2	10	190708	190717	60 %	0 %	20 %	20 %	403514225
134	NC_018528	ATATG	2	10	195236	195245	40 %	40 %	20 %	0 %	403514227
135	NC_018528	ATGGA	2	10	195598	195607	40 %	20 %	40 %	0 %	403514228
136	NC_018528	TTCAC	2	10	197173	197182	20 %	40 %	0 %	40 %	403514229
137	NC_018528	TACTT	2	10	197843	197852	20 %	60 %	0 %	20 %	403514229
138	NC_018528	TTATT	2	10	198450	198459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018528	TGAAT	2	10	199350	199359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018528	TTGTT	2	10	200162	200171	0 %	80 %	20 %	0 %	403514230
141	NC_018528	TTCAA	2	10	202399	202408	40 %	40 %	0 %	20 %	403514232
142	NC_018528	GCTTG	2	10	203049	203058	0 %	40 %	40 %	20 %	403514232
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148	NC_018528	GCATA	2	10	211245	211254	40 %	20 %	20 %	20 %	403514239
149	NC_018528	AAAGT	2	10	211445	211454	60 %	20 %	20 %	0 %	403514239
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152	NC_018528	AAATA	2	10	214566	214575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018528	TAAAA	2	10	214591	214600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_018528	AAATA	2	10	233285	233294	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018528	CTCAA	2	10	233549	233558	40 %	20 %	0 %	40 %	403514260
166	NC_018528	AAATC	2	10	236597	236606	60 %	20 %	0 %	20 %	403514263
167	NC_018528	TAATT	2	10	237223	237232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_018528	ATAAA	2	10	241538	241547	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018528	TAGTG	2	10	243547	243556	20 %	40 %	40 %	0 %	403514270
174	NC_018528	TGGAT	2	10	244573	244582	20 %	40 %	40 %	0 %	403514271
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178	NC_018528	CTTTT	2	10	254995	255004	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_018528	ATTTT	2	10	255161	255170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_018528	TGATT	2	10	315835	315844	20 %	60 %	20 %	0 %	403514343
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221	NC_018528	TAGTA	2	10	316721	316730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_018528	TTTAC	2	10	339536	339545	20 %	60 %	0 %	20 %	403514369
238	NC_018528	CAATT	2	10	340014	340023	40 %	40 %	0 %	20 %	403514370
239	NC_018528	CAAGC	2	10	343625	343634	40 %	0 %	20 %	40 %	403514373
240	NC_018528	TCCTT	2	10	343917	343926	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
241	NC_018528	GAAAT	2	10	344283	344292	60 %	20 %	20 %	0 %	403514375
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247	NC_018528	TTGCT	2	10	351884	351893	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
248	NC_018528	TTTAA	2	10	351960	351969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_018528	TTTGA	2	10	352573	352582	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
250	NC_018528	TTGAA	2	10	353808	353817	40 %	40 %	20 %	0 %	403514386
251	NC_018528	ATTGA	2	10	354876	354885	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
252	NC_018528	TGCTT	2	10	356773	356782	0 %	60 %	20 %	20 %	403514389
253	NC_018528	AACTC	2	10	358932	358941	40 %	20 %	0 %	40 %	403514391
254	NC_018528	AAAAT	2	10	359115	359124	80 %	20 %	0 %	0 %	403514392
255	NC_018528	TTTGT	2	10	360373	360382	0 %	80 %	20 %	0 %	403514393
256	NC_018528	GTTAA	2	10	361113	361122	40 %	40 %	20 %	0 %	403514394
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259	NC_018528	AAGGA	2	10	365695	365704	60 %	0 %	40 %	0 %	403514401
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261	NC_018528	GAAAT	2	10	367026	367035	60 %	20 %	20 %	0 %	403514403
262	NC_018528	AAGGT	2	10	369159	369168	40 %	20 %	40 %	0 %	403514405
263	NC_018528	ATTGC	2	10	371378	371387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_018528	ATTCA	2	10	375147	375156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_018528	AGTCT	2	10	375772	375781	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_018528	CATTT	2	10	377417	377426	20 %	60 %	0 %	20 %	403514412
267	NC_018528	TATGA	2	10	379762	379771	40 %	40 %	20 %	0 %	403514413
268	NC_018528	ATTGG	2	10	380890	380899	20 %	40 %	40 %	0 %	403514415
269	NC_018528	TAATT	2	10	381890	381899	40 %	60 %	0 %	0 %	403514416
270	NC_018528	TAATT	2	10	382242	382251	40 %	60 %	0 %	0 %	403514416
271	NC_018528	AATTC	2	10	382446	382455	40 %	40 %	0 %	20 %	403514417
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281	NC_018528	ATCAG	2	10	392920	392929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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373	NC_018528	CAAAA	2	10	496073	496082	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
374	NC_018528	ATTAA	2	10	497500	497509	60 %	40 %	0 %	0 %	403514515
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385	NC_018528	CTTTT	2	10	514100	514109	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
386	NC_018528	TTGTA	2	10	514949	514958	20 %	60 %	20 %	0 %	403514535
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390	NC_018528	TGATT	2	10	516395	516404	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
391	NC_018528	TCATG	2	10	516800	516809	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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396	NC_018528	AAAGA	2	10	520391	520400	80 %	0 %	20 %	0 %	403514542
397	NC_018528	AAAAG	2	10	520794	520803	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
398	NC_018528	CTATC	2	10	522602	522611	20 %	40 %	0 %	40 %	403514544
399	NC_018528	CATGA	2	10	523392	523401	40 %	20 %	20 %	20 %	403514545
400	NC_018528	CAATC	2	10	524191	524200	40 %	20 %	0 %	40 %	403514546
401	NC_018528	GAAGC	2	10	524420	524429	40 %	0 %	40 %	20 %	403514547
402	NC_018528	TGGTT	2	10	526502	526511	0 %	60 %	40 %	0 %	403514551
403	NC_018528	AAAGA	2	10	527166	527175	80 %	0 %	20 %	0 %	403514551
404	NC_018528	GAATA	2	10	529243	529252	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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