MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 6361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	TCTT	2	8	207	214	0 %	75 %	0 %	25 %	403514033
2	NC_018528	AAAT	2	8	429	436	75 %	25 %	0 %	0 %	403514033
3	NC_018528	ATGC	2	8	1306	1313	25 %	25 %	25 %	25 %	403514033
4	NC_018528	AAAG	2	8	1845	1852	75 %	0 %	25 %	0 %	403514034
5	NC_018528	GGAA	2	8	2516	2523	50 %	0 %	50 %	0 %	403514034
6	NC_018528	TTTA	2	8	2818	2825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018528	ATTT	2	8	3270	3277	25 %	75 %	0 %	0 %	403514036
8	NC_018528	AGTA	2	8	3594	3601	50 %	25 %	25 %	0 %	403514036
9	NC_018528	GTAT	2	8	4393	4400	25 %	50 %	25 %	0 %	403514037
10	NC_018528	ACTT	2	8	4931	4938	25 %	50 %	0 %	25 %	403514037
11	NC_018528	CTAT	2	8	5050	5057	25 %	50 %	0 %	25 %	403514037
12	NC_018528	CCAA	2	8	5719	5726	50 %	0 %	0 %	50 %	403514037
13	NC_018528	TTCT	2	8	6312	6319	0 %	75 %	0 %	25 %	403514038
14	NC_018528	ATTT	2	8	6508	6515	25 %	75 %	0 %	0 %	403514038
15	NC_018528	CAAC	2	8	6791	6798	50 %	0 %	0 %	50 %	403514038
16	NC_018528	AAAG	2	8	7956	7963	75 %	0 %	25 %	0 %	403514038
17	NC_018528	TTGG	2	8	9498	9505	0 %	50 %	50 %	0 %	403514040
18	NC_018528	AAAG	2	8	9819	9826	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018528	TAAA	2	8	10253	10260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018528	TCAT	2	8	10660	10667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018528	AGGA	2	8	10715	10722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018528	CTTT	2	8	10812	10819	0 %	75 %	0 %	25 %	403514043
23	NC_018528	GCTG	2	8	12257	12264	0 %	25 %	50 %	25 %	403514043
24	NC_018528	GTTT	2	8	13029	13036	0 %	75 %	25 %	0 %	403514044
25	NC_018528	CAAG	2	8	13047	13054	50 %	0 %	25 %	25 %	403514044
26	NC_018528	TGAT	2	8	13241	13248	25 %	50 %	25 %	0 %	403514045
27	NC_018528	TTAC	2	8	13548	13555	25 %	50 %	0 %	25 %	403514045
28	NC_018528	AGTT	2	8	13980	13987	25 %	50 %	25 %	0 %	403514045
29	NC_018528	AGCT	2	8	14283	14290	25 %	25 %	25 %	25 %	403514045
30	NC_018528	TAAT	2	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018528	TCAT	2	8	14842	14849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018528	GCAA	2	8	15014	15021	50 %	0 %	25 %	25 %	403514046
33	NC_018528	CAAA	2	8	15692	15699	75 %	0 %	0 %	25 %	403514046
34	NC_018528	TGAT	2	8	16015	16022	25 %	50 %	25 %	0 %	403514047
35	NC_018528	CATG	2	8	16328	16335	25 %	25 %	25 %	25 %	403514047
36	NC_018528	GTAA	2	8	16823	16830	50 %	25 %	25 %	0 %	403514047
37	NC_018528	GTGG	2	8	17644	17651	0 %	25 %	75 %	0 %	403514048
38	NC_018528	TGAA	2	8	17735	17742	50 %	25 %	25 %	0 %	403514048
39	NC_018528	AAGA	2	8	17868	17875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018528	AAGG	2	8	18002	18009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018528	AAAC	2	8	18485	18492	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018528	AGAA	2	8	18656	18663	75 %	0 %	25 %	0 %	403514049
43	NC_018528	GTTT	2	8	19831	19838	0 %	75 %	25 %	0 %	403514051
44	NC_018528	AAGA	2	8	19949	19956	75 %	0 %	25 %	0 %	403514051
45	NC_018528	TGAC	2	8	20106	20113	25 %	25 %	25 %	25 %	403514051
46	NC_018528	TGAT	2	8	20142	20149	25 %	50 %	25 %	0 %	403514051
47	NC_018528	AAGA	2	8	20476	20483	75 %	0 %	25 %	0 %	403514051
48	NC_018528	AAAT	2	8	20577	20584	75 %	25 %	0 %	0 %	403514051
49	NC_018528	GAAA	2	8	20942	20949	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018528	TGGC	2	8	21125	21132	0 %	25 %	50 %	25 %	403514053
51	NC_018528	CCAT	2	8	21145	21152	25 %	25 %	0 %	50 %	403514053
52	NC_018528	TCAT	2	8	21184	21191	25 %	50 %	0 %	25 %	403514053
53	NC_018528	AAGT	2	8	21709	21716	50 %	25 %	25 %	0 %	403514054
54	NC_018528	TAAA	2	8	22409	22416	75 %	25 %	0 %	0 %	403514054
55	NC_018528	AGAA	2	8	22912	22919	75 %	0 %	25 %	0 %	403514055
56	NC_018528	ATTT	2	8	23333	23340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018528	ATTA	2	8	23536	23543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018528	TAAA	2	8	23749	23756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018528	GATT	2	8	23855	23862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018528	TTTA	2	8	23871	23878	25 %	75 %	0 %	0 %	403514056
61	NC_018528	GAAA	2	8	24376	24383	75 %	0 %	25 %	0 %	403514057
62	NC_018528	GTAG	2	8	24558	24565	25 %	25 %	50 %	0 %	403514057
63	NC_018528	CCAG	2	8	24900	24907	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018528	CAGT	2	8	24941	24948	25 %	25 %	25 %	25 %	403514058
65	NC_018528	TTGA	2	8	25014	25021	25 %	50 %	25 %	0 %	403514058
66	NC_018528	TCAT	2	8	25051	25058	25 %	50 %	0 %	25 %	403514058
67	NC_018528	AATT	2	8	25140	25147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018528	TCAT	2	8	25155	25162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018528	GTAA	2	8	25202	25209	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018528	ATTA	2	8	25404	25411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018528	AGAT	2	8	25524	25531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018528	TTTA	2	8	26020	26027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018528	AATA	2	8	26446	26453	75 %	25 %	0 %	0 %	403514060
74	NC_018528	TAAA	2	8	26782	26789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018528	AATT	2	8	26794	26801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018528	TTTG	2	8	27088	27095	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018528	ATAA	2	8	27404	27411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018528	ATGG	2	8	27517	27524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018528	TGTA	2	8	27538	27545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018528	AAAT	2	8	27580	27587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018528	AAAG	2	8	27598	27605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018528	TAAA	2	8	28348	28355	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018528	TTTA	2	8	28356	28363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018528	TAAA	2	8	28593	28600	75 %	25 %	0 %	0 %	403514061
85	NC_018528	TAAG	2	8	28615	28622	50 %	25 %	25 %	0 %	403514061
86	NC_018528	AATT	2	8	28647	28654	50 %	50 %	0 %	0 %	403514061
87	NC_018528	TTGG	2	8	28868	28875	0 %	50 %	50 %	0 %	403514061
88	NC_018528	TGAT	2	8	28961	28968	25 %	50 %	25 %	0 %	403514061
89	NC_018528	CTTT	2	8	29086	29093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018528	AATC	2	8	29267	29274	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018528	TTAA	2	8	29298	29305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018528	TTTC	2	8	30090	30097	0 %	75 %	0 %	25 %	403514063
93	NC_018528	TTAT	2	8	30786	30793	25 %	75 %	0 %	0 %	403514063
94	NC_018528	ATTT	2	8	30929	30936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018528	ATTT	2	8	30975	30982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018528	TGAT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018528	TTAA	2	8	31613	31620	50 %	50 %	0 %	0 %	403514064
98	NC_018528	AAAT	2	8	31786	31793	75 %	25 %	0 %	0 %	403514064
99	NC_018528	TTTA	2	8	32597	32604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018528	ATAG	2	8	33005	33012	50 %	25 %	25 %	0 %	403514066
101	NC_018528	TAAA	2	8	33105	33112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018528	ACTT	2	8	33998	34005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_018528	AAAG	2	8	34212	34219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018528	GTAA	2	8	35093	35100	50 %	25 %	25 %	0 %	403514068
105	NC_018528	TTGA	2	8	35123	35130	25 %	50 %	25 %	0 %	403514068
106	NC_018528	ACTC	2	8	35610	35617	25 %	25 %	0 %	50 %	403514068
107	NC_018528	ACAA	2	8	35735	35742	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_018528	TTAA	2	8	35808	35815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018528	CTTT	2	8	36070	36077	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018528	ATTA	2	8	36102	36109	50 %	50 %	0 %	0 %	403514069
111	NC_018528	ATTT	2	8	38241	38248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018528	TTGG	2	8	38467	38474	0 %	50 %	50 %	0 %	403514072
113	NC_018528	GTTT	2	8	38627	38634	0 %	75 %	25 %	0 %	403514072
114	NC_018528	AAGC	2	8	38680	38687	50 %	0 %	25 %	25 %	403514072
115	NC_018528	GTTA	2	8	39581	39588	25 %	50 %	25 %	0 %	403514073
116	NC_018528	GTAT	2	8	39934	39941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018528	TTCT	2	8	40652	40659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018528	ATTG	2	8	40718	40725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018528	ATTT	2	8	40883	40890	25 %	75 %	0 %	0 %	403514074
120	NC_018528	TTTG	2	8	41151	41158	0 %	75 %	25 %	0 %	403514074
121	NC_018528	CTAA	2	8	41272	41279	50 %	25 %	0 %	25 %	403514074
122	NC_018528	TCAA	2	8	41817	41824	50 %	25 %	0 %	25 %	403514074
123	NC_018528	AAAG	2	8	42047	42054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018528	TTAA	2	8	42085	42092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018528	GAAA	2	8	42870	42877	75 %	0 %	25 %	0 %	403514076
126	NC_018528	AATA	2	8	43064	43071	75 %	25 %	0 %	0 %	403514076
127	NC_018528	TCTT	2	8	43360	43367	0 %	75 %	0 %	25 %	403514076
128	NC_018528	AAGA	2	8	43529	43536	75 %	0 %	25 %	0 %	403514076
129	NC_018528	ATTA	2	8	43597	43604	50 %	50 %	0 %	0 %	403514076
130	NC_018528	ATGC	2	8	43611	43618	25 %	25 %	25 %	25 %	403514076
131	NC_018528	TGGA	2	8	43801	43808	25 %	25 %	50 %	0 %	403514076
132	NC_018528	ATTA	2	8	44040	44047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018528	ATCA	2	8	44242	44249	50 %	25 %	0 %	25 %	403514077
134	NC_018528	TTCT	2	8	44992	44999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018528	TTTG	2	8	45127	45134	0 %	75 %	25 %	0 %	403514078
136	NC_018528	TTCA	2	8	45358	45365	25 %	50 %	0 %	25 %	403514079
137	NC_018528	ACTA	2	8	45872	45879	50 %	25 %	0 %	25 %	403514080
138	NC_018528	GCTT	2	8	47295	47302	0 %	50 %	25 %	25 %	403514082
139	NC_018528	TGAA	2	8	47738	47745	50 %	25 %	25 %	0 %	403514082
140	NC_018528	AAGA	2	8	48286	48293	75 %	0 %	25 %	0 %	403514082
141	NC_018528	GATA	2	8	48547	48554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018528	TGGC	2	8	48666	48673	0 %	25 %	50 %	25 %	403514083
143	NC_018528	TCAA	2	8	48694	48701	50 %	25 %	0 %	25 %	403514083
144	NC_018528	CTTT	2	8	48726	48733	0 %	75 %	0 %	25 %	403514083
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146	NC_018528	ATCA	2	8	49153	49160	50 %	25 %	0 %	25 %	403514083
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