MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 5749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	CAA	2	6	1491	1496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018528	CTA	4	12	1509	1520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018528	AGG	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018528	TAA	2	6	8787	8792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018528	AGG	2	6	8933	8938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018528	ATT	2	6	10110	10115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018528	TGA	2	6	10151	10156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018528	GGA	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018528	TAA	2	6	10222	10227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018528	CTA	2	6	10238	10243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018528	TAA	2	6	10674	10679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018528	GGA	2	6	14859	14864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018528	GCA	2	6	16894	16899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018528	ATC	2	6	18053	18058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018528	AAC	2	6	18071	18076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018528	TGA	2	6	18363	18368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018528	CAT	2	6	18495	18500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018528	TGG	2	6	18506	18511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018528	AAG	2	6	18562	18567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018528	CTC	2	6	18583	18588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018528	AAT	2	6	19079	19084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018528	AGT	2	6	19140	19145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018528	ATT	2	6	20714	20719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018528	TTA	2	6	20926	20931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018528	GAT	2	6	20953	20958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018528	TAA	2	6	23427	23432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018528	TGT	2	6	23437	23442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018528	ATG	2	6	23501	23506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018528	TGG	2	6	23698	23703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018528	TAT	2	6	23781	23786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018528	TTC	2	6	25066	25071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018528	TAA	3	9	25207	25215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018528	TAT	2	6	25219	25224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018528	TAT	2	6	25243	25248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018528	ACT	2	6	25262	25267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018528	ATT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018528	AAT	2	6	25429	25434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018528	TGG	2	6	25551	25556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018528	TTA	2	6	25595	25600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018528	GAT	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018528	TAA	2	6	25686	25691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018528	AAT	2	6	26030	26035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018528	CTG	2	6	26814	26819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018528	CTA	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018528	TGT	3	9	27037	27045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018528	AAT	2	6	27097	27102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018528	GCC	2	6	27113	27118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_018528	AAT	2	6	27235	27240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018528	ATT	2	6	27275	27280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018528	TGG	2	6	27300	27305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018528	ATT	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018528	ATT	2	6	27484	27489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018528	ATT	2	6	27623	27628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018528	GTG	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018528	AAT	2	6	27661	27666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018528	TAC	2	6	27705	27710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018528	ATT	2	6	27722	27727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018528	ATA	2	6	27734	27739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018528	ATT	2	6	27745	27750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018528	TAG	2	6	27787	27792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018528	AGG	2	6	27832	27837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018528	CTG	2	6	27879	27884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018528	AAG	2	6	27949	27954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018528	GTT	2	6	28128	28133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018528	TTC	2	6	28167	28172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018528	ATA	2	6	28261	28266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018528	GTA	2	6	28332	28337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018528	TGA	2	6	28393	28398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018528	TAT	2	6	29079	29084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018528	TAA	3	9	29114	29122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018528	ATA	2	6	29198	29203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018528	TAT	2	6	30954	30959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018528	AAT	2	6	31017	31022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018528	CAA	2	6	31049	31054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018528	TAA	2	6	31159	31164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018528	CTT	2	6	32062	32067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018528	TCA	2	6	32319	32324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018528	TTA	2	6	33080	33085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018528	TCG	2	6	33134	33139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018528	TAT	2	6	33183	33188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018528	TGG	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018528	AAC	2	6	33502	33507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018528	AGT	2	6	33573	33578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018528	CTT	2	6	33581	33586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018528	GGC	2	6	33670	33675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018528	TAT	2	6	33826	33831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018528	ATT	2	6	33920	33925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018528	ATG	2	6	33935	33940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018528	GTG	2	6	33955	33960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018528	AGA	2	6	34045	34050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018528	ACA	2	6	34090	34095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018528	TTA	2	6	34187	34192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018528	AAG	2	6	34479	34484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018528	CAA	2	6	35751	35756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018528	CTT	2	6	35830	35835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018528	ACA	2	6	35923	35928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018528	CCT	2	6	37402	37407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018528	CTA	2	6	37437	37442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018528	TAG	2	6	37468	37473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018528	TTG	3	9	39987	39995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018528	ACA	2	6	40065	40070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018528	GAA	2	6	40139	40144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018528	GAT	2	6	40177	40182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018528	CAC	2	6	40194	40199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018528	ACT	2	6	40259	40264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018528	ATT	2	6	40332	40337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018528	TAT	2	6	40509	40514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018528	GAA	2	6	40515	40520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018528	AAG	2	6	40750	40755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018528	TGA	2	6	42114	42119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018528	ATT	2	6	42194	42199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018528	AAT	2	6	42628	42633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018528	AGA	2	6	42679	42684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018528	AAG	2	6	42685	42690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018528	TAA	2	6	42704	42709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018528	TAG	2	6	42717	42722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018528	TGT	2	6	44029	44034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018528	AGG	2	6	44090	44095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018528	GAA	2	6	44924	44929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018528	TGA	2	6	44950	44955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018528	TCC	2	6	44986	44991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018528	AGG	2	6	45032	45037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018528	ATG	2	6	45151	45156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018528	AAT	2	6	45172	45177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018528	TTC	2	6	45266	45271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018528	ACT	2	6	46285	46290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018528	ATT	2	6	47035	47040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018528	TAT	2	6	48572	48577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018528	ATT	2	6	53177	53182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018528	CAT	2	6	53197	53202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018528	ATT	2	6	55254	55259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018528	ATT	2	6	55274	55279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018528	GAT	2	6	55315	55320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018528	ATT	2	6	55407	55412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018528	TTG	2	6	55804	55809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018528	TAT	2	6	55841	55846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018528	TAA	2	6	55922	55927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018528	AAC	2	6	58823	58828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018528	TAC	2	6	58857	58862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018528	CTT	2	6	59726	59731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018528	AAT	2	6	59753	59758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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