MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 24987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018528	TGC	2	6	447	452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514033
2	NC_018528	ATT	2	6	492	497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514033
3	NC_018528	TGG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514033
4	NC_018528	AGT	2	6	582	587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514033
5	NC_018528	TTA	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514033
6	NC_018528	TGC	2	6	683	688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514033
7	NC_018528	TGA	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514033
8	NC_018528	GAA	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514033
9	NC_018528	GAA	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514033
10	NC_018528	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514033
11	NC_018528	AAG	2	6	1133	1138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514033
12	NC_018528	TCG	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514033
13	NC_018528	ATT	2	6	1148	1153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514033
14	NC_018528	CTG	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514033
15	NC_018528	GTA	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514033
16	NC_018528	GGC	2	6	1282	1287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514033
17	NC_018528	TAC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514033
18	NC_018528	AAT	2	6	1605	1610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514034
19	NC_018528	TTC	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514034
20	NC_018528	AAT	2	6	1911	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514034
21	NC_018528	TGC	2	6	1946	1951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514034
22	NC_018528	TTC	2	6	2049	2054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514034
23	NC_018528	ATT	2	6	2154	2159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514034
24	NC_018528	ATT	2	6	2190	2195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514034
25	NC_018528	ATT	2	6	2243	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514034
26	NC_018528	ACT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514034
27	NC_018528	GTA	2	6	2415	2420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514034
28	NC_018528	GAA	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514034
29	NC_018528	TCA	3	9	2626	2634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514034
30	NC_018528	GAT	2	6	2646	2651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514034
31	NC_018528	CAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514035
32	NC_018528	TTG	2	6	2945	2950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514035
33	NC_018528	AGA	2	6	2982	2987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514035
34	NC_018528	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514035
35	NC_018528	ATC	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514035
36	NC_018528	CGG	2	6	3130	3135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514035
37	NC_018528	GAA	2	6	3185	3190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514036
38	NC_018528	TGG	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514036
39	NC_018528	AGA	2	6	3497	3502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514036
40	NC_018528	AAT	2	6	3624	3629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514036
41	NC_018528	TAT	2	6	3682	3687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514036
42	NC_018528	GTG	2	6	3793	3798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514036
43	NC_018528	ACC	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514036
44	NC_018528	CTA	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514036
45	NC_018528	GAT	2	6	3846	3851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514036
46	NC_018528	TAA	2	6	3896	3901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514036
47	NC_018528	TAC	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514036
48	NC_018528	GAT	2	6	3948	3953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514036
49	NC_018528	TCA	2	6	4055	4060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514036
50	NC_018528	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514036
51	NC_018528	GTT	3	9	4079	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514036
52	NC_018528	GAT	2	6	4092	4097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514036
53	NC_018528	TGA	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514036
54	NC_018528	TAC	2	6	4172	4177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514036
55	NC_018528	AAG	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514036
56	NC_018528	GGC	2	6	4362	4367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514037
57	NC_018528	CAC	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514037
58	NC_018528	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514037
59	NC_018528	TGA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514037
60	NC_018528	GAT	2	6	4536	4541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514037
61	NC_018528	GTC	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514037
62	NC_018528	GGT	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514037
63	NC_018528	CGG	2	6	4631	4636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403514037
64	NC_018528	GGT	2	6	4656	4661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514037
65	NC_018528	TGT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514037
66	NC_018528	CCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514037
67	NC_018528	ACT	3	9	4860	4868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514037
68	NC_018528	GGT	2	6	4989	4994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514037
69	NC_018528	TAT	2	6	5035	5040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514037
70	NC_018528	TGA	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514037
71	NC_018528	ACT	2	6	5121	5126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514037
72	NC_018528	CAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514037
73	NC_018528	GAT	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514037
74	NC_018528	GTT	3	9	5292	5300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514037
75	NC_018528	CAG	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514037
76	NC_018528	CTT	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514037
77	NC_018528	GCT	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514037
78	NC_018528	ATA	2	6	5557	5562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514037
79	NC_018528	ATT	2	6	5588	5593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514037
80	NC_018528	GGT	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514037
81	NC_018528	ATT	2	6	5808	5813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514037
82	NC_018528	TGA	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514037
83	NC_018528	TGT	2	6	6023	6028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514037
84	NC_018528	ACT	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514037
85	NC_018528	ATG	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
86	NC_018528	AAG	2	6	6445	6450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514038
87	NC_018528	TTG	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
88	NC_018528	TCA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514038
89	NC_018528	CAA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514038
90	NC_018528	ATG	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
91	NC_018528	AGT	2	6	6723	6728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
92	NC_018528	TTG	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
93	NC_018528	TGA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
94	NC_018528	ACT	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514038
95	NC_018528	TGA	2	6	6878	6883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
96	NC_018528	TGG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514038
97	NC_018528	TAT	2	6	6918	6923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514038
98	NC_018528	GTT	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
99	NC_018528	CAA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514038
100	NC_018528	GTT	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
101	NC_018528	AAT	2	6	7204	7209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514038
102	NC_018528	TTG	2	6	7262	7267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
103	NC_018528	ACT	2	6	7280	7285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514038
104	NC_018528	TAC	2	6	7309	7314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514038
105	NC_018528	TGT	2	6	7332	7337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
106	NC_018528	ATA	2	6	7415	7420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514038
107	NC_018528	TGA	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
108	NC_018528	ATT	2	6	7665	7670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514038
109	NC_018528	GTT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514038
110	NC_018528	GTG	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514038
111	NC_018528	GAT	2	6	8077	8082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
112	NC_018528	TTC	2	6	8092	8097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514038
113	NC_018528	TAC	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514038
114	NC_018528	ATG	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
115	NC_018528	CTG	2	6	8303	8308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514038
116	NC_018528	GAC	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514038
117	NC_018528	GTG	2	6	8450	8455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514038
118	NC_018528	CAT	2	6	8535	8540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514038
119	NC_018528	TAT	2	6	8559	8564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514038
120	NC_018528	GAT	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
121	NC_018528	TGA	3	9	8697	8705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
122	NC_018528	ATG	2	6	8714	8719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514038
123	NC_018528	TGA	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514039
124	NC_018528	AAG	2	6	9009	9014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514039
125	NC_018528	GGT	2	6	9054	9059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514039
126	NC_018528	CGT	2	6	9090	9095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514039
127	NC_018528	CTG	2	6	9151	9156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514039
128	NC_018528	ACA	2	6	9202	9207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514039
129	NC_018528	TTG	2	6	9310	9315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514040
130	NC_018528	TAC	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514040
131	NC_018528	GGA	2	6	9451	9456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403514040
132	NC_018528	GGT	2	6	9636	9641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514040
133	NC_018528	AAC	2	6	9681	9686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514040
134	NC_018528	TGG	2	6	9698	9703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514040
135	NC_018528	AAT	2	6	9711	9716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514040
136	NC_018528	AAT	3	9	9723	9731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514040
137	NC_018528	TGA	3	9	9788	9796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514040
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142	NC_018528	CGT	2	6	9973	9978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514041
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146	NC_018528	ATT	2	6	10391	10396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514042
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148	NC_018528	ATC	2	6	10438	10443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514042
149	NC_018528	AGA	2	6	10556	10561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514042
150	NC_018528	GAA	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514042
151	NC_018528	TTA	2	6	10765	10770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514043
152	NC_018528	GTA	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514043
153	NC_018528	ATC	2	6	10800	10805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514043
154	NC_018528	ATT	2	6	10830	10835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514043
155	NC_018528	GAT	2	6	10838	10843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514043
156	NC_018528	ATT	2	6	10853	10858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514043
157	NC_018528	AAG	2	6	10984	10989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514043
158	NC_018528	TAG	2	6	11089	11094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514043
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160	NC_018528	GAT	2	6	11217	11222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514043
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162	NC_018528	AAG	2	6	11406	11411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514043
163	NC_018528	CAA	2	6	11537	11542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514043
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169	NC_018528	GTG	2	6	12112	12117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514043
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252	NC_018528	ATT	2	6	19216	19221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514050
253	NC_018528	AAT	2	6	19231	19236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514050
254	NC_018528	TGA	2	6	19292	19297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514050
255	NC_018528	CAG	2	6	19298	19303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514050
256	NC_018528	AGA	2	6	19308	19313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514050
257	NC_018528	GAA	2	6	19365	19370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514050
258	NC_018528	AGA	2	6	19420	19425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514050
259	NC_018528	CAG	3	9	19646	19654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514051
260	NC_018528	AAG	2	6	19742	19747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514051
261	NC_018528	ATT	2	6	19784	19789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514051
262	NC_018528	ATC	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514051
263	NC_018528	TGA	2	6	19960	19965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514051
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267	NC_018528	GCT	2	6	20268	20273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514051
268	NC_018528	AGA	2	6	20332	20337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514051
269	NC_018528	GAA	2	6	20444	20449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514051
270	NC_018528	TCA	2	6	20506	20511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514051
271	NC_018528	CAG	2	6	20532	20537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514051
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275	NC_018528	ATA	2	6	20998	21003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514053
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277	NC_018528	ATA	2	6	21163	21168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514053
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281	NC_018528	TAA	2	6	21475	21480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514054
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283	NC_018528	CGC	2	6	21640	21645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403514054
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288	NC_018528	TAA	2	6	21946	21951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514054
289	NC_018528	CAA	2	6	21973	21978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514054
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