MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia pseudomallei BPC006 chromosome I

Total Repeats: 4752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018527	GCGCG	2	10	772	781	0 %	0 %	60 %	40 %	403516669
2	NC_018527	TCGCG	2	10	1166	1175	0 %	20 %	40 %	40 %	403516670
3	NC_018527	CCGTT	2	10	2621	2630	0 %	40 %	20 %	40 %	403516671
4	NC_018527	TCGCG	2	10	4307	4316	0 %	20 %	40 %	40 %	403516672
5	NC_018527	GCGCG	2	10	4365	4374	0 %	0 %	60 %	40 %	403516672
6	NC_018527	TGCGC	2	10	5304	5313	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018527	GCCGT	2	10	5390	5399	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018527	AACCT	2	10	5464	5473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018527	CTTGC	2	10	5993	6002	0 %	40 %	20 %	40 %	403516674
10	NC_018527	CGCGC	2	10	7046	7055	0 %	0 %	40 %	60 %	403516674
11	NC_018527	ATGCG	2	10	7407	7416	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018527	GCTTT	2	10	8406	8415	0 %	60 %	20 %	20 %	403516676
13	NC_018527	CGACG	2	10	9055	9064	20 %	0 %	40 %	40 %	403516676
14	NC_018527	GCGCG	2	10	9596	9605	0 %	0 %	60 %	40 %	403516676
15	NC_018527	GCGCG	2	10	12307	12316	0 %	0 %	60 %	40 %	403516678
16	NC_018527	AAGCG	2	10	13416	13425	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018527	GCCGC	2	10	13628	13637	0 %	0 %	40 %	60 %	403516679
18	NC_018527	CGCGC	2	10	13952	13961	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_018527	GATCC	2	10	14278	14287	20 %	20 %	20 %	40 %	403516680
20	NC_018527	AGCGC	2	10	14761	14770	20 %	0 %	40 %	40 %	403516681
21	NC_018527	CCGCC	2	10	15107	15116	0 %	0 %	20 %	80 %	403516682
22	NC_018527	TCGCC	2	10	16237	16246	0 %	20 %	20 %	60 %	403516684
23	NC_018527	ACGTC	2	10	17326	17335	20 %	20 %	20 %	40 %	403516684
24	NC_018527	GCGCG	2	10	18188	18197	0 %	0 %	60 %	40 %	403516685
25	NC_018527	GCATC	2	10	18757	18766	20 %	20 %	20 %	40 %	403516685
26	NC_018527	CGCAC	2	10	18959	18968	20 %	0 %	20 %	60 %	403516686
27	NC_018527	GCGCG	2	10	19803	19812	0 %	0 %	60 %	40 %	403516687
28	NC_018527	GCTCG	2	10	20004	20013	0 %	20 %	40 %	40 %	403516687
29	NC_018527	GCGCG	2	10	21010	21019	0 %	0 %	60 %	40 %	403516688
30	NC_018527	GCGTC	2	10	21511	21520	0 %	20 %	40 %	40 %	403516688
31	NC_018527	CGGCG	2	10	22265	22274	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_018527	GCGCG	2	10	23121	23130	0 %	0 %	60 %	40 %	403516690
33	NC_018527	CGCGG	2	10	23133	23142	0 %	0 %	60 %	40 %	403516690
34	NC_018527	GGGCC	2	10	24986	24995	0 %	0 %	60 %	40 %	403516691
35	NC_018527	CGGCC	2	10	25020	25029	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_018527	CGTCG	2	10	25458	25467	0 %	20 %	40 %	40 %	403516692
37	NC_018527	GCAGC	2	10	27068	27077	20 %	0 %	40 %	40 %	403516694
38	NC_018527	CGCGC	2	10	27134	27143	0 %	0 %	40 %	60 %	403516694
39	NC_018527	CGTCG	2	10	27730	27739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_018527	GGCGC	2	10	27761	27770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_018527	GCCTC	2	10	28036	28045	0 %	20 %	20 %	60 %	403516695
42	NC_018527	GCGCC	2	10	28372	28381	0 %	0 %	40 %	60 %	403516696
43	NC_018527	GCCGC	2	10	29834	29843	0 %	0 %	40 %	60 %	403516698
44	NC_018527	CGGCG	2	10	30571	30580	0 %	0 %	60 %	40 %	403516699
45	NC_018527	TTCGT	2	10	30906	30915	0 %	60 %	20 %	20 %	403516700
46	NC_018527	CGCGC	2	10	30916	30925	0 %	0 %	40 %	60 %	403516700
47	NC_018527	GCGCG	3	15	30982	30996	0 %	0 %	60 %	40 %	403516700
48	NC_018527	GCGTC	2	10	32057	32066	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018527	CGGCG	2	10	32385	32394	0 %	0 %	60 %	40 %	403516702
50	NC_018527	CGGCG	2	10	32670	32679	0 %	0 %	60 %	40 %	403516702
51	NC_018527	CGCGC	2	10	32761	32770	0 %	0 %	40 %	60 %	403516702
52	NC_018527	CGGCG	2	10	33054	33063	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018527	CGCGC	3	15	33146	33160	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_018527	GCCGC	2	10	34259	34268	0 %	0 %	40 %	60 %	403516704
55	NC_018527	GGCTG	2	10	34839	34848	0 %	20 %	60 %	20 %	403516705
56	NC_018527	CGTTG	2	10	36485	36494	0 %	40 %	40 %	20 %	403516707
57	NC_018527	GCTCG	2	10	37631	37640	0 %	20 %	40 %	40 %	403516708
58	NC_018527	CGTTT	2	10	38111	38120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018527	CGGCC	2	10	38452	38461	0 %	0 %	40 %	60 %	403516709
60	NC_018527	GCAGC	2	10	38992	39001	20 %	0 %	40 %	40 %	403516709
61	NC_018527	TCGCG	2	10	39379	39388	0 %	20 %	40 %	40 %	403516709
62	NC_018527	CGCGA	2	10	39947	39956	20 %	0 %	40 %	40 %	403516710
63	NC_018527	GCCGT	2	10	40319	40328	0 %	20 %	40 %	40 %	403516711
64	NC_018527	CCCCG	2	10	41720	41729	0 %	0 %	20 %	80 %	403516714
65	NC_018527	CGGCC	2	10	41999	42008	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_018527	GCCGC	2	10	42074	42083	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_018527	AACGC	2	10	42948	42957	40 %	0 %	20 %	40 %	403516715
68	NC_018527	GCGCG	2	10	42972	42981	0 %	0 %	60 %	40 %	403516715
69	NC_018527	CGGCG	2	10	42994	43003	0 %	0 %	60 %	40 %	403516715
70	NC_018527	CGGCG	2	10	45102	45111	0 %	0 %	60 %	40 %	403516716
71	NC_018527	CGGCG	3	15	46833	46847	0 %	0 %	60 %	40 %	403516716
72	NC_018527	CGTGC	2	10	46865	46874	0 %	20 %	40 %	40 %	403516716
73	NC_018527	CGTTT	2	10	47327	47336	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018527	GGCGC	2	10	47481	47490	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018527	CATTT	2	10	47590	47599	20 %	60 %	0 %	20 %	403516717
76	NC_018527	ACGCG	2	10	50437	50446	20 %	0 %	40 %	40 %	403516720
77	NC_018527	GGCGC	2	10	51715	51724	0 %	0 %	60 %	40 %	403516721
78	NC_018527	GCGCC	2	10	51775	51784	0 %	0 %	40 %	60 %	403516721
79	NC_018527	CGCGA	2	10	52211	52220	20 %	0 %	40 %	40 %	403516722
80	NC_018527	GCGCC	2	10	52275	52284	0 %	0 %	40 %	60 %	403516722
81	NC_018527	GCGCG	2	10	55551	55560	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_018527	GCGCC	2	10	56187	56196	0 %	0 %	40 %	60 %	403516725
83	NC_018527	GCGCC	2	10	56364	56373	0 %	0 %	40 %	60 %	403516725
84	NC_018527	CGGCA	2	10	61315	61324	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_018527	GCACG	2	10	61975	61984	20 %	0 %	40 %	40 %	403516730
86	NC_018527	CGAGA	2	10	63743	63752	40 %	0 %	40 %	20 %	403516734
87	NC_018527	GATCG	2	10	63767	63776	20 %	20 %	40 %	20 %	403516734
88	NC_018527	CGTGC	2	10	64597	64606	0 %	20 %	40 %	40 %	403516735
89	NC_018527	CGCGC	2	10	64771	64780	0 %	0 %	40 %	60 %	403516735
90	NC_018527	TCGCG	2	10	64904	64913	0 %	20 %	40 %	40 %	403516736
91	NC_018527	GCGGT	2	10	65401	65410	0 %	20 %	60 %	20 %	403516736
92	NC_018527	CGCGC	2	10	66255	66264	0 %	0 %	40 %	60 %	403516737
93	NC_018527	CGCGC	2	10	67357	67366	0 %	0 %	40 %	60 %	403516737
94	NC_018527	TGGCG	2	10	68671	68680	0 %	20 %	60 %	20 %	403516739
95	NC_018527	CGCGC	2	10	70012	70021	0 %	0 %	40 %	60 %	403516739
96	NC_018527	GGTGT	2	10	72634	72643	0 %	40 %	60 %	0 %	403516741
97	NC_018527	GCGCG	2	10	73988	73997	0 %	0 %	60 %	40 %	403516742
98	NC_018527	GGCGC	2	10	74624	74633	0 %	0 %	60 %	40 %	403516743
99	NC_018527	GCGCG	2	10	75901	75910	0 %	0 %	60 %	40 %	403516745
100	NC_018527	CGCGG	2	10	75958	75967	0 %	0 %	60 %	40 %	403516745
101	NC_018527	GCCGC	2	10	77784	77793	0 %	0 %	40 %	60 %	403516750
102	NC_018527	CGGCG	2	10	77981	77990	0 %	0 %	60 %	40 %	403516750
103	NC_018527	CGGCG	2	10	78091	78100	0 %	0 %	60 %	40 %	403516750
104	NC_018527	TTCAT	2	10	78315	78324	20 %	60 %	0 %	20 %	403516750
105	NC_018527	CGGCG	2	10	79234	79243	0 %	0 %	60 %	40 %	403516752
106	NC_018527	GGCGC	2	10	79744	79753	0 %	0 %	60 %	40 %	403516752
107	NC_018527	CGGCG	2	10	80044	80053	0 %	0 %	60 %	40 %	403516752
108	NC_018527	GGTTT	2	10	80460	80469	0 %	60 %	40 %	0 %	403516753
109	NC_018527	AGCAC	2	10	83064	83073	40 %	0 %	20 %	40 %	403516754
110	NC_018527	AACCG	2	10	85333	85342	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018527	GCCGG	2	10	86655	86664	0 %	0 %	60 %	40 %	403516756
112	NC_018527	CACGT	2	10	86922	86931	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_018527	GCGCC	2	10	89022	89031	0 %	0 %	40 %	60 %	403516761
114	NC_018527	ACGTC	2	10	89187	89196	20 %	20 %	20 %	40 %	403516761
115	NC_018527	GCGCG	2	10	89794	89803	0 %	0 %	60 %	40 %	403516761
116	NC_018527	CATTT	2	10	90979	90988	20 %	60 %	0 %	20 %	403516764
117	NC_018527	TCCGA	2	10	91021	91030	20 %	20 %	20 %	40 %	403516765
118	NC_018527	CGCGG	2	10	92860	92869	0 %	0 %	60 %	40 %	403516766
119	NC_018527	GCATG	2	10	93849	93858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018527	GCGCC	2	10	94127	94136	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_018527	CGTGA	2	10	97546	97555	20 %	20 %	40 %	20 %	403516768
122	NC_018527	GCCGC	2	10	99621	99630	0 %	0 %	40 %	60 %	403516773
123	NC_018527	GGCGC	2	10	103440	103449	0 %	0 %	60 %	40 %	403516776
124	NC_018527	CAGAT	2	10	104293	104302	40 %	20 %	20 %	20 %	403516778
125	NC_018527	TTTTA	2	10	105012	105021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018527	CGGGG	2	10	107230	107239	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018527	CCGAA	2	10	108947	108956	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_018527	GCGCC	2	10	109838	109847	0 %	0 %	40 %	60 %	403516785
129	NC_018527	TGCGT	2	10	111387	111396	0 %	40 %	40 %	20 %	403516786
130	NC_018527	GCGCC	2	10	112015	112024	0 %	0 %	40 %	60 %	403516787
131	NC_018527	CTCGG	2	10	112922	112931	0 %	20 %	40 %	40 %	403516788
132	NC_018527	CGATC	2	10	114821	114830	20 %	20 %	20 %	40 %	403516790
133	NC_018527	GCGCG	2	10	115317	115326	0 %	0 %	60 %	40 %	403516790
134	NC_018527	CGGCG	2	10	115528	115537	0 %	0 %	60 %	40 %	403516791
135	NC_018527	CGCGG	2	10	119773	119782	0 %	0 %	60 %	40 %	403516796
136	NC_018527	TGCGC	2	10	119896	119905	0 %	20 %	40 %	40 %	403516796
137	NC_018527	GCACG	2	10	120239	120248	20 %	0 %	40 %	40 %	403516797
138	NC_018527	CGCGC	2	10	121233	121242	0 %	0 %	40 %	60 %	403516797
139	NC_018527	CGCGC	2	10	128114	128123	0 %	0 %	40 %	60 %	403516807
140	NC_018527	CTTCA	2	10	129070	129079	20 %	40 %	0 %	40 %	403516808
141	NC_018527	CCGGT	3	15	129219	129233	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_018527	ACGGC	2	10	129257	129266	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_018527	GCCGA	2	10	129357	129366	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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167	NC_018527	CGAAG	2	10	159275	159284	40 %	0 %	40 %	20 %	403516836
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250	NC_018527	CGACG	2	10	237001	237010	20 %	0 %	40 %	40 %	403516920
251	NC_018527	CGCGA	2	10	238959	238968	20 %	0 %	40 %	40 %	403516921
252	NC_018527	TCGCT	2	10	239152	239161	0 %	40 %	20 %	40 %	403516921
253	NC_018527	GCGCT	2	10	239259	239268	0 %	20 %	40 %	40 %	403516921
254	NC_018527	GTGCC	2	10	239520	239529	0 %	20 %	40 %	40 %	403516922
255	NC_018527	CGATG	2	10	239840	239849	20 %	20 %	40 %	20 %	403516922
256	NC_018527	CGCGG	2	10	239915	239924	0 %	0 %	60 %	40 %	403516922
257	NC_018527	TGCGC	2	10	241000	241009	0 %	20 %	40 %	40 %	403516923
258	NC_018527	ATTCG	2	10	244713	244722	20 %	40 %	20 %	20 %	403516927
259	NC_018527	CGCGC	2	10	244929	244938	0 %	0 %	40 %	60 %	403516927
260	NC_018527	GCGCC	2	10	245033	245042	0 %	0 %	40 %	60 %	403516927
261	NC_018527	CGGCG	2	10	245538	245547	0 %	0 %	60 %	40 %	403516928
262	NC_018527	GCGAC	2	10	252258	252267	20 %	0 %	40 %	40 %	403516937
263	NC_018527	CGAGC	2	10	253027	253036	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
264	NC_018527	TCCGA	2	10	254948	254957	20 %	20 %	20 %	40 %	403516939
265	NC_018527	CGCTT	2	10	257543	257552	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
266	NC_018527	TGCCG	2	10	260049	260058	0 %	20 %	40 %	40 %	403516943
267	NC_018527	TCGCG	2	10	260862	260871	0 %	20 %	40 %	40 %	403516944
268	NC_018527	CGCGC	2	10	260872	260881	0 %	0 %	40 %	60 %	403516944
269	NC_018527	ATGCG	2	10	261667	261676	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
270	NC_018527	GCCGC	2	10	261718	261727	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
271	NC_018527	GCGCG	2	10	261755	261764	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
272	NC_018527	CGCGC	2	10	263282	263291	0 %	0 %	40 %	60 %	403516948
273	NC_018527	CGCGC	2	10	263309	263318	0 %	0 %	40 %	60 %	403516948
274	NC_018527	GGCGC	2	10	263483	263492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
275	NC_018527	TGCGC	2	10	265138	265147	0 %	20 %	40 %	40 %	403516951
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278	NC_018527	CGCGA	2	10	267393	267402	20 %	0 %	40 %	40 %	403516955
279	NC_018527	GCGCG	2	10	267759	267768	0 %	0 %	60 %	40 %	403516955
280	NC_018527	GGCGC	2	10	268555	268564	0 %	0 %	60 %	40 %	403516956
281	NC_018527	GCCGG	2	10	269418	269427	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
282	NC_018527	CGTGC	2	10	270358	270367	0 %	20 %	40 %	40 %	403516957
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286	NC_018527	CGGCG	2	10	273855	273864	0 %	0 %	60 %	40 %	403516962
287	NC_018527	CGCGC	2	10	274369	274378	0 %	0 %	40 %	60 %	403516962
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290	NC_018527	TCGCG	2	10	275334	275343	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
291	NC_018527	TCCGT	2	10	277072	277081	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_018527	GTCGC	2	10	277099	277108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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294	NC_018527	ACAAG	2	10	279069	279078	60 %	0 %	20 %	20 %	403516968
295	NC_018527	GCCGC	2	10	280566	280575	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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345	NC_018527	GCGCC	2	10	313322	313331	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
346	NC_018527	CGCGC	3	15	313602	313616	0 %	0 %	40 %	60 %	403517006
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370	NC_018527	GAGGC	2	10	333186	333195	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
371	NC_018527	CTCGG	2	10	333286	333295	0 %	20 %	40 %	40 %	403517032
372	NC_018527	GCCGC	2	10	333600	333609	0 %	0 %	40 %	60 %	403517033
373	NC_018527	GCGCA	2	10	334147	334156	20 %	0 %	40 %	40 %	403517033
374	NC_018527	ACCCA	2	10	335413	335422	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
375	NC_018527	TCTGC	2	10	336680	336689	0 %	40 %	20 %	40 %	403517037
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379	NC_018527	ATTGC	2	10	340151	340160	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
380	NC_018527	CGGCT	2	10	340629	340638	0 %	20 %	40 %	40 %	403517044
381	NC_018527	GCGCA	2	10	341112	341121	20 %	0 %	40 %	40 %	403517044
382	NC_018527	CGGCG	2	10	342235	342244	0 %	0 %	60 %	40 %	403517045
383	NC_018527	GCGGA	2	10	343507	343516	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
384	NC_018527	TTGCG	2	10	343624	343633	0 %	40 %	40 %	20 %	403517048
385	NC_018527	TGCGG	2	10	345003	345012	0 %	20 %	60 %	20 %	403517049
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387	NC_018527	GCGCC	2	10	346871	346880	0 %	0 %	40 %	60 %	403517049
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391	NC_018527	ACGTG	2	10	349057	349066	20 %	20 %	40 %	20 %	403517051
392	NC_018527	GGCGA	2	10	349765	349774	20 %	0 %	60 %	20 %	403517052
393	NC_018527	ATTGC	2	10	351082	351091	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
394	NC_018527	TCAAT	2	10	351858	351867	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
395	NC_018527	CGAGC	2	10	352301	352310	20 %	0 %	40 %	40 %	403517056
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397	NC_018527	CGCGG	2	10	353304	353313	0 %	0 %	60 %	40 %	403517056
398	NC_018527	GCGCG	2	10	353360	353369	0 %	0 %	60 %	40 %	403517056
399	NC_018527	GCACG	2	10	354345	354354	20 %	0 %	40 %	40 %	403517057
400	NC_018527	TGCGA	2	10	354827	354836	20 %	20 %	40 %	20 %	403517058
401	NC_018527	GCGCG	2	10	355759	355768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
402	NC_018527	CGCGC	2	10	355950	355959	0 %	0 %	40 %	60 %	403517059
403	NC_018527	GCCGC	2	10	356830	356839	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
404	NC_018527	GCGCG	2	10	357843	357852	0 %	0 %	60 %	40 %	403517061
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452	NC_018527	GGCAA	10	50	392058	392107	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
453	NC_018527	CGGGA	3	15	392110	392124	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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