MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 chromosome

Total Repeats: 5414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018524	TGACG	2	10	147	156	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018524	CACGA	2	10	484	493	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_018524	ACCCG	2	10	1558	1567	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_018524	TGTGT	2	10	1824	1833	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018524	CTTTA	2	10	1834	1843	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018524	GCCTC	2	10	2455	2464	0 %	20 %	20 %	60 %	403507511
7	NC_018524	CGGCC	2	10	2662	2671	0 %	0 %	40 %	60 %	403507511
8	NC_018524	GAGCG	2	10	4220	4229	20 %	0 %	60 %	20 %	403507512
9	NC_018524	CCAGG	2	10	5680	5689	20 %	0 %	40 %	40 %	403507515
10	NC_018524	ACGGG	2	10	6916	6925	20 %	0 %	60 %	20 %	403507517
11	NC_018524	CCCCG	2	10	8098	8107	0 %	0 %	20 %	80 %	403507517
12	NC_018524	CCAGG	2	10	9907	9916	20 %	0 %	40 %	40 %	403507519
13	NC_018524	CGGCC	2	10	13767	13776	0 %	0 %	40 %	60 %	403507525
14	NC_018524	CCGAC	2	10	13946	13955	20 %	0 %	20 %	60 %	403507525
15	NC_018524	CGCGC	2	10	14758	14767	0 %	0 %	40 %	60 %	403507525
16	NC_018524	CCCGG	2	10	15001	15010	0 %	0 %	40 %	60 %	403507525
17	NC_018524	GCTGA	2	10	16216	16225	20 %	20 %	40 %	20 %	403507525
18	NC_018524	GGTCC	2	10	17923	17932	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_018524	CCCGG	2	10	18927	18936	0 %	0 %	40 %	60 %	403507528
20	NC_018524	CGGCC	2	10	19395	19404	0 %	0 %	40 %	60 %	403507528
21	NC_018524	GTGCG	2	10	19691	19700	0 %	20 %	60 %	20 %	403507529
22	NC_018524	CCGGT	2	10	20076	20085	0 %	20 %	40 %	40 %	403507529
23	NC_018524	TGACC	2	10	21372	21381	20 %	20 %	20 %	40 %	403507530
24	NC_018524	ACTCC	2	10	21450	21459	20 %	20 %	0 %	60 %	403507530
25	NC_018524	GCCGC	2	10	21823	21832	0 %	0 %	40 %	60 %	403507531
26	NC_018524	TGGAC	2	10	23551	23560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018524	CGCGG	2	10	23637	23646	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018524	CCCGC	2	10	25163	25172	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
29	NC_018524	GTCCC	2	10	25787	25796	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_018524	CCCGG	2	10	27776	27785	0 %	0 %	40 %	60 %	403507536
31	NC_018524	GCGTC	2	10	30615	30624	0 %	20 %	40 %	40 %	403507537
32	NC_018524	CAGGG	2	10	30947	30956	20 %	0 %	60 %	20 %	403507537
33	NC_018524	CCCGC	2	10	31899	31908	0 %	0 %	20 %	80 %	403507538
34	NC_018524	CACGG	2	10	32665	32674	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_018524	GACCG	2	10	33316	33325	20 %	0 %	40 %	40 %	403507539
36	NC_018524	GTCCG	2	10	34438	34447	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_018524	CGCTC	2	10	34952	34961	0 %	20 %	20 %	60 %	403507542
38	NC_018524	CGGGA	2	10	38078	38087	20 %	0 %	60 %	20 %	403507544
39	NC_018524	GTCGG	2	10	38700	38709	0 %	20 %	60 %	20 %	403507544
40	NC_018524	TCCTC	2	10	41725	41734	0 %	40 %	0 %	60 %	403507548
41	NC_018524	TCACG	2	10	41986	41995	20 %	20 %	20 %	40 %	403507548
42	NC_018524	CGCGG	2	10	42032	42041	0 %	0 %	60 %	40 %	403507548
43	NC_018524	GCGAG	2	10	43334	43343	20 %	0 %	60 %	20 %	403507549
44	NC_018524	CCGTG	2	10	46508	46517	0 %	20 %	40 %	40 %	403507553
45	NC_018524	CCGGC	2	10	46678	46687	0 %	0 %	40 %	60 %	403507553
46	NC_018524	CGGTC	2	10	48172	48181	0 %	20 %	40 %	40 %	403507554
47	NC_018524	CTGCC	2	10	48232	48241	0 %	20 %	20 %	60 %	403507554
48	NC_018524	TCCGG	2	10	49550	49559	0 %	20 %	40 %	40 %	403507554
49	NC_018524	CCCGG	2	10	49989	49998	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_018524	TCCCG	2	10	50482	50491	0 %	20 %	20 %	60 %	403507555
51	NC_018524	GCCAG	2	10	51389	51398	20 %	0 %	40 %	40 %	403507556
52	NC_018524	GGCAT	2	10	52516	52525	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018524	CGGTC	2	10	55082	55091	0 %	20 %	40 %	40 %	403507560
54	NC_018524	GCCCG	2	10	55121	55130	0 %	0 %	40 %	60 %	403507560
55	NC_018524	GGCCC	2	10	57523	57532	0 %	0 %	40 %	60 %	403507562
56	NC_018524	CCGCG	2	10	58062	58071	0 %	0 %	40 %	60 %	403507562
57	NC_018524	CGGGG	2	10	59405	59414	0 %	0 %	80 %	20 %	403507564
58	NC_018524	GACGG	2	10	59532	59541	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018524	CGCTG	2	10	60182	60191	0 %	20 %	40 %	40 %	403507565
60	NC_018524	CCGAC	2	10	60604	60613	20 %	0 %	20 %	60 %	403507566
61	NC_018524	GCCGG	2	10	61865	61874	0 %	0 %	60 %	40 %	403507568
62	NC_018524	CGCCC	2	10	62366	62375	0 %	0 %	20 %	80 %	403507568
63	NC_018524	CCGGA	2	10	63392	63401	20 %	0 %	40 %	40 %	403507569
64	NC_018524	AGCCC	2	10	65429	65438	20 %	0 %	20 %	60 %	403507570
65	NC_018524	TCGCC	2	10	65750	65759	0 %	20 %	20 %	60 %	403507570
66	NC_018524	CGGCC	2	10	67091	67100	0 %	0 %	40 %	60 %	403507571
67	NC_018524	TGCGC	2	10	67757	67766	0 %	20 %	40 %	40 %	403507571
68	NC_018524	CTTCC	2	10	68111	68120	0 %	40 %	0 %	60 %	403507572
69	NC_018524	GTGCG	2	10	69439	69448	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018524	CGGGG	2	10	69568	69577	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018524	CGGGC	2	10	70561	70570	0 %	0 %	60 %	40 %	403507574
72	NC_018524	GGCCG	2	10	72256	72265	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_018524	TCCCC	2	10	72271	72280	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_018524	GGCTC	2	10	72713	72722	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_018524	ATCCG	2	10	74345	74354	20 %	20 %	20 %	40 %	403507578
76	NC_018524	GGCGC	2	10	74502	74511	0 %	0 %	60 %	40 %	403507578
77	NC_018524	GCCTG	2	10	74733	74742	0 %	20 %	40 %	40 %	403507578
78	NC_018524	GAATC	2	10	75493	75502	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018524	CCGGA	2	10	75705	75714	20 %	0 %	40 %	40 %	403507579
80	NC_018524	CCGGG	2	10	77175	77184	0 %	0 %	60 %	40 %	403507580
81	NC_018524	CGGCC	2	10	77367	77376	0 %	0 %	40 %	60 %	403507580
82	NC_018524	GTCGC	2	10	77384	77393	0 %	20 %	40 %	40 %	403507580
83	NC_018524	GTCGC	2	10	77592	77601	0 %	20 %	40 %	40 %	403507580
84	NC_018524	TGCGA	2	10	77924	77933	20 %	20 %	40 %	20 %	403507581
85	NC_018524	GACCT	2	10	81539	81548	20 %	20 %	20 %	40 %	403507585
86	NC_018524	CCGGG	2	10	82396	82405	0 %	0 %	60 %	40 %	403507586
87	NC_018524	GCAGG	2	10	83106	83115	20 %	0 %	60 %	20 %	403507587
88	NC_018524	CCCCG	2	10	83637	83646	0 %	0 %	20 %	80 %	403507587
89	NC_018524	GACCG	2	10	84004	84013	20 %	0 %	40 %	40 %	403507587
90	NC_018524	ACGGA	2	10	85555	85564	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_018524	CCCCG	2	10	85587	85596	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
92	NC_018524	CAGCG	2	10	89507	89516	20 %	0 %	40 %	40 %	403507592
93	NC_018524	GGCCA	2	10	91933	91942	20 %	0 %	40 %	40 %	403507595
94	NC_018524	ACGGA	2	10	92838	92847	40 %	0 %	40 %	20 %	403507596
95	NC_018524	GTCCC	2	10	94964	94973	0 %	20 %	20 %	60 %	403507598
96	NC_018524	CGTGA	2	10	96792	96801	20 %	20 %	40 %	20 %	403507600
97	NC_018524	GTCGA	2	10	97056	97065	20 %	20 %	40 %	20 %	403507600
98	NC_018524	ACCCG	2	10	98608	98617	20 %	0 %	20 %	60 %	403507601
99	NC_018524	CGTCC	2	10	100103	100112	0 %	20 %	20 %	60 %	403507603
100	NC_018524	GGGCC	2	10	100950	100959	0 %	0 %	60 %	40 %	403507604
101	NC_018524	ACCCC	2	10	102799	102808	20 %	0 %	0 %	80 %	403507605
102	NC_018524	CAGCG	2	10	103399	103408	20 %	0 %	40 %	40 %	403507606
103	NC_018524	CGGAA	2	10	104702	104711	40 %	0 %	40 %	20 %	403507609
104	NC_018524	CCCGG	2	10	105309	105318	0 %	0 %	40 %	60 %	403507609
105	NC_018524	GGATC	2	10	105842	105851	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018524	GGTGC	2	10	108998	109007	0 %	20 %	60 %	20 %	403507613
107	NC_018524	CCCCG	2	10	109044	109053	0 %	0 %	20 %	80 %	403507613
108	NC_018524	GCCCT	2	10	110531	110540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_018524	GACCT	2	10	111114	111123	20 %	20 %	20 %	40 %	403507615
110	NC_018524	CGACC	2	10	112380	112389	20 %	0 %	20 %	60 %	403507617
111	NC_018524	GACCT	2	10	112447	112456	20 %	20 %	20 %	40 %	403507617
112	NC_018524	CCCCG	2	10	113174	113183	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
113	NC_018524	CGAAG	2	10	113192	113201	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018524	GCGAA	2	10	113209	113218	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018524	CGGGG	2	10	113625	113634	0 %	0 %	80 %	20 %	403507618
116	NC_018524	GATCG	2	10	113649	113658	20 %	20 %	40 %	20 %	403507618
117	NC_018524	TGCCG	2	10	114068	114077	0 %	20 %	40 %	40 %	403507618
118	NC_018524	GGCCG	2	10	119738	119747	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_018524	TCGGG	2	10	120744	120753	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018524	GCGCG	2	10	120907	120916	0 %	0 %	60 %	40 %	403507625
121	NC_018524	GTCCT	2	10	122407	122416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_018524	CGGGG	2	10	122664	122673	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018524	GCCCC	2	10	123365	123374	0 %	0 %	20 %	80 %	403507628
124	NC_018524	CCGGG	2	10	124671	124680	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_018524	GCCCG	2	10	126199	126208	0 %	0 %	40 %	60 %	403507632
126	NC_018524	ACCCC	2	10	126523	126532	20 %	0 %	0 %	80 %	403507632
127	NC_018524	ACCAC	2	10	127066	127075	40 %	0 %	0 %	60 %	403507633
128	NC_018524	GAGGG	2	10	127762	127771	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018524	CCATG	2	10	127976	127985	20 %	20 %	20 %	40 %	403507634
130	NC_018524	GGCTG	2	10	129357	129366	0 %	20 %	60 %	20 %	403507636
131	NC_018524	ACCCG	2	10	130041	130050	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
132	NC_018524	CCCCA	2	10	130188	130197	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_018524	GCCCT	2	10	133218	133227	0 %	20 %	20 %	60 %	403507638
134	NC_018524	CCCCG	2	10	134114	134123	0 %	0 %	20 %	80 %	403507639
135	NC_018524	CGGTC	2	10	134978	134987	0 %	20 %	40 %	40 %	403507640
136	NC_018524	GCCCG	2	10	135146	135155	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_018524	CCGGG	2	10	135173	135182	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_018524	GGCAC	2	10	135472	135481	20 %	0 %	40 %	40 %	403507641
139	NC_018524	CGCGG	2	10	135774	135783	0 %	0 %	60 %	40 %	403507641
140	NC_018524	CCGCC	2	10	135924	135933	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
141	NC_018524	GCCGG	2	10	136564	136573	0 %	0 %	60 %	40 %	403507643
142	NC_018524	ACCTG	2	10	136755	136764	20 %	20 %	20 %	40 %	403507643
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149	NC_018524	GAACT	2	10	147941	147950	40 %	20 %	20 %	20 %	403507655
150	NC_018524	GGCGA	2	10	148253	148262	20 %	0 %	60 %	20 %	403507655
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154	NC_018524	CCGGC	2	10	152291	152300	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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161	NC_018524	GCCCC	2	10	160444	160453	0 %	0 %	20 %	80 %	403507666
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165	NC_018524	CGGCG	2	10	164030	164039	0 %	0 %	60 %	40 %	403507668
166	NC_018524	GACGG	2	10	165481	165490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
167	NC_018524	CCGCG	2	10	167124	167133	0 %	0 %	40 %	60 %	403507670
168	NC_018524	CGCTC	2	10	167333	167342	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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198	NC_018524	GGGCC	2	10	195966	195975	0 %	0 %	60 %	40 %	403507697
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214	NC_018524	GCGAG	2	10	211487	211496	20 %	0 %	60 %	20 %	403507713
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221	NC_018524	GCCCG	2	10	218619	218628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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238	NC_018524	CGAAA	2	10	237516	237525	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
239	NC_018524	CTCTC	2	10	238399	238408	0 %	40 %	0 %	60 %	403507738
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249	NC_018524	CGGCG	2	10	244997	245006	0 %	0 %	60 %	40 %	403507744
250	NC_018524	GGGCG	3	15	245090	245104	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
251	NC_018524	CCCGC	2	10	245113	245122	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
252	NC_018524	GGCCC	2	10	245296	245305	0 %	0 %	40 %	60 %	403507745
253	NC_018524	CGACG	2	10	247621	247630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_018524	GTGCG	2	10	249866	249875	0 %	20 %	60 %	20 %	403507747
255	NC_018524	TCCGG	2	10	250869	250878	0 %	20 %	40 %	40 %	403507748
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258	NC_018524	GGGCG	2	10	252980	252989	0 %	0 %	80 %	20 %	403507749
259	NC_018524	CTCGG	2	10	253227	253236	0 %	20 %	40 %	40 %	403507749
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262	NC_018524	GCCCC	2	10	255199	255208	0 %	0 %	20 %	80 %	403507750
263	NC_018524	CGGTC	2	10	255330	255339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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266	NC_018524	GGGGC	2	10	259049	259058	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
267	NC_018524	CCGAC	2	10	259184	259193	20 %	0 %	20 %	60 %	403507755
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269	NC_018524	CCGGC	2	10	262671	262680	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
270	NC_018524	GCGCG	2	10	263291	263300	0 %	0 %	60 %	40 %	403507759
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274	NC_018524	GGTCG	2	10	268741	268750	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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381	NC_018524	GGAGC	2	10	396619	396628	20 %	0 %	60 %	20 %	403507897
382	NC_018524	CGCGG	2	10	397653	397662	0 %	0 %	60 %	40 %	403507898
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385	NC_018524	CCCGG	2	10	402157	402166	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
386	NC_018524	CGGCC	2	10	404507	404516	0 %	0 %	40 %	60 %	403507904
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399	NC_018524	GGCCG	2	10	416387	416396	0 %	0 %	60 %	40 %	403507915
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402	NC_018524	CCGGC	2	10	419169	419178	0 %	0 %	40 %	60 %	403507916
403	NC_018524	ACGTG	2	10	421497	421506	20 %	20 %	40 %	20 %	403507919
404	NC_018524	CGTTC	2	10	423465	423474	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
405	NC_018524	CCGGG	2	10	424549	424558	0 %	0 %	60 %	40 %	403507922
406	NC_018524	ACGGA	2	10	425176	425185	40 %	0 %	40 %	20 %	403507922
407	NC_018524	GCCGT	2	10	425628	425637	0 %	20 %	40 %	40 %	403507923
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413	NC_018524	GGCCG	2	10	430961	430970	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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441	NC_018524	CGATT	2	10	457885	457894	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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