MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 chromosome

Total Repeats: 4336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018524	GCCTC	2	10	2455	2464	0 %	20 %	20 %	60 %	403507511
2	NC_018524	CGGCC	2	10	2662	2671	0 %	0 %	40 %	60 %	403507511
3	NC_018524	GAGCG	2	10	4220	4229	20 %	0 %	60 %	20 %	403507512
4	NC_018524	CCAGG	2	10	5680	5689	20 %	0 %	40 %	40 %	403507515
5	NC_018524	ACGGG	2	10	6916	6925	20 %	0 %	60 %	20 %	403507517
6	NC_018524	CCCCG	2	10	8098	8107	0 %	0 %	20 %	80 %	403507517
7	NC_018524	CCAGG	2	10	9907	9916	20 %	0 %	40 %	40 %	403507519
8	NC_018524	CGGCC	2	10	13767	13776	0 %	0 %	40 %	60 %	403507525
9	NC_018524	CCGAC	2	10	13946	13955	20 %	0 %	20 %	60 %	403507525
10	NC_018524	CGCGC	2	10	14758	14767	0 %	0 %	40 %	60 %	403507525
11	NC_018524	CCCGG	2	10	15001	15010	0 %	0 %	40 %	60 %	403507525
12	NC_018524	GCTGA	2	10	16216	16225	20 %	20 %	40 %	20 %	403507525
13	NC_018524	CCCGG	2	10	18927	18936	0 %	0 %	40 %	60 %	403507528
14	NC_018524	CGGCC	2	10	19395	19404	0 %	0 %	40 %	60 %	403507528
15	NC_018524	GTGCG	2	10	19691	19700	0 %	20 %	60 %	20 %	403507529
16	NC_018524	CCGGT	2	10	20076	20085	0 %	20 %	40 %	40 %	403507529
17	NC_018524	TGACC	2	10	21372	21381	20 %	20 %	20 %	40 %	403507530
18	NC_018524	ACTCC	2	10	21450	21459	20 %	20 %	0 %	60 %	403507530
19	NC_018524	GCCGC	2	10	21823	21832	0 %	0 %	40 %	60 %	403507531
20	NC_018524	CCCGG	2	10	27776	27785	0 %	0 %	40 %	60 %	403507536
21	NC_018524	GCGTC	2	10	30615	30624	0 %	20 %	40 %	40 %	403507537
22	NC_018524	CAGGG	2	10	30947	30956	20 %	0 %	60 %	20 %	403507537
23	NC_018524	CCCGC	2	10	31899	31908	0 %	0 %	20 %	80 %	403507538
24	NC_018524	GACCG	2	10	33316	33325	20 %	0 %	40 %	40 %	403507539
25	NC_018524	CGCTC	2	10	34952	34961	0 %	20 %	20 %	60 %	403507542
26	NC_018524	CGGGA	2	10	38078	38087	20 %	0 %	60 %	20 %	403507544
27	NC_018524	GTCGG	2	10	38700	38709	0 %	20 %	60 %	20 %	403507544
28	NC_018524	TCCTC	2	10	41725	41734	0 %	40 %	0 %	60 %	403507548
29	NC_018524	TCACG	2	10	41986	41995	20 %	20 %	20 %	40 %	403507548
30	NC_018524	CGCGG	2	10	42032	42041	0 %	0 %	60 %	40 %	403507548
31	NC_018524	GCGAG	2	10	43334	43343	20 %	0 %	60 %	20 %	403507549
32	NC_018524	CCGTG	2	10	46508	46517	0 %	20 %	40 %	40 %	403507553
33	NC_018524	CCGGC	2	10	46678	46687	0 %	0 %	40 %	60 %	403507553
34	NC_018524	CGGTC	2	10	48172	48181	0 %	20 %	40 %	40 %	403507554
35	NC_018524	CTGCC	2	10	48232	48241	0 %	20 %	20 %	60 %	403507554
36	NC_018524	TCCGG	2	10	49550	49559	0 %	20 %	40 %	40 %	403507554
37	NC_018524	TCCCG	2	10	50482	50491	0 %	20 %	20 %	60 %	403507555
38	NC_018524	GCCAG	2	10	51389	51398	20 %	0 %	40 %	40 %	403507556
39	NC_018524	CGGTC	2	10	55082	55091	0 %	20 %	40 %	40 %	403507560
40	NC_018524	GCCCG	2	10	55121	55130	0 %	0 %	40 %	60 %	403507560
41	NC_018524	GGCCC	2	10	57523	57532	0 %	0 %	40 %	60 %	403507562
42	NC_018524	CCGCG	2	10	58062	58071	0 %	0 %	40 %	60 %	403507562
43	NC_018524	CGGGG	2	10	59405	59414	0 %	0 %	80 %	20 %	403507564
44	NC_018524	CGCTG	2	10	60182	60191	0 %	20 %	40 %	40 %	403507565
45	NC_018524	CCGAC	2	10	60604	60613	20 %	0 %	20 %	60 %	403507566
46	NC_018524	GCCGG	2	10	61865	61874	0 %	0 %	60 %	40 %	403507568
47	NC_018524	CGCCC	2	10	62366	62375	0 %	0 %	20 %	80 %	403507568
48	NC_018524	CCGGA	2	10	63392	63401	20 %	0 %	40 %	40 %	403507569
49	NC_018524	AGCCC	2	10	65429	65438	20 %	0 %	20 %	60 %	403507570
50	NC_018524	TCGCC	2	10	65750	65759	0 %	20 %	20 %	60 %	403507570
51	NC_018524	CGGCC	2	10	67091	67100	0 %	0 %	40 %	60 %	403507571
52	NC_018524	TGCGC	2	10	67757	67766	0 %	20 %	40 %	40 %	403507571
53	NC_018524	CTTCC	2	10	68111	68120	0 %	40 %	0 %	60 %	403507572
54	NC_018524	CGGGC	2	10	70561	70570	0 %	0 %	60 %	40 %	403507574
55	NC_018524	ATCCG	2	10	74345	74354	20 %	20 %	20 %	40 %	403507578
56	NC_018524	GGCGC	2	10	74502	74511	0 %	0 %	60 %	40 %	403507578
57	NC_018524	GCCTG	2	10	74733	74742	0 %	20 %	40 %	40 %	403507578
58	NC_018524	CCGGA	2	10	75705	75714	20 %	0 %	40 %	40 %	403507579
59	NC_018524	CCGGG	2	10	77175	77184	0 %	0 %	60 %	40 %	403507580
60	NC_018524	CGGCC	2	10	77367	77376	0 %	0 %	40 %	60 %	403507580
61	NC_018524	GTCGC	2	10	77384	77393	0 %	20 %	40 %	40 %	403507580
62	NC_018524	GTCGC	2	10	77592	77601	0 %	20 %	40 %	40 %	403507580
63	NC_018524	TGCGA	2	10	77924	77933	20 %	20 %	40 %	20 %	403507581
64	NC_018524	GACCT	2	10	81539	81548	20 %	20 %	20 %	40 %	403507585
65	NC_018524	CCGGG	2	10	82396	82405	0 %	0 %	60 %	40 %	403507586
66	NC_018524	GCAGG	2	10	83106	83115	20 %	0 %	60 %	20 %	403507587
67	NC_018524	CCCCG	2	10	83637	83646	0 %	0 %	20 %	80 %	403507587
68	NC_018524	GACCG	2	10	84004	84013	20 %	0 %	40 %	40 %	403507587
69	NC_018524	CAGCG	2	10	89507	89516	20 %	0 %	40 %	40 %	403507592
70	NC_018524	GGCCA	2	10	91933	91942	20 %	0 %	40 %	40 %	403507595
71	NC_018524	ACGGA	2	10	92838	92847	40 %	0 %	40 %	20 %	403507596
72	NC_018524	GTCCC	2	10	94964	94973	0 %	20 %	20 %	60 %	403507598
73	NC_018524	CGTGA	2	10	96792	96801	20 %	20 %	40 %	20 %	403507600
74	NC_018524	GTCGA	2	10	97056	97065	20 %	20 %	40 %	20 %	403507600
75	NC_018524	ACCCG	2	10	98608	98617	20 %	0 %	20 %	60 %	403507601
76	NC_018524	CGTCC	2	10	100103	100112	0 %	20 %	20 %	60 %	403507603
77	NC_018524	GGGCC	2	10	100950	100959	0 %	0 %	60 %	40 %	403507604
78	NC_018524	ACCCC	2	10	102799	102808	20 %	0 %	0 %	80 %	403507605
79	NC_018524	CAGCG	2	10	103399	103408	20 %	0 %	40 %	40 %	403507606
80	NC_018524	CGGAA	2	10	104702	104711	40 %	0 %	40 %	20 %	403507609
81	NC_018524	CCCGG	2	10	105309	105318	0 %	0 %	40 %	60 %	403507609
82	NC_018524	GGTGC	2	10	108998	109007	0 %	20 %	60 %	20 %	403507613
83	NC_018524	CCCCG	2	10	109044	109053	0 %	0 %	20 %	80 %	403507613
84	NC_018524	GACCT	2	10	111114	111123	20 %	20 %	20 %	40 %	403507615
85	NC_018524	CGACC	2	10	112380	112389	20 %	0 %	20 %	60 %	403507617
86	NC_018524	GACCT	2	10	112447	112456	20 %	20 %	20 %	40 %	403507617
87	NC_018524	CGGGG	2	10	113625	113634	0 %	0 %	80 %	20 %	403507618
88	NC_018524	GATCG	2	10	113649	113658	20 %	20 %	40 %	20 %	403507618
89	NC_018524	TGCCG	2	10	114068	114077	0 %	20 %	40 %	40 %	403507618
90	NC_018524	GCGCG	2	10	120907	120916	0 %	0 %	60 %	40 %	403507625
91	NC_018524	GCCCC	2	10	123365	123374	0 %	0 %	20 %	80 %	403507628
92	NC_018524	GCCCG	2	10	126199	126208	0 %	0 %	40 %	60 %	403507632
93	NC_018524	ACCCC	2	10	126523	126532	20 %	0 %	0 %	80 %	403507632
94	NC_018524	ACCAC	2	10	127066	127075	40 %	0 %	0 %	60 %	403507633
95	NC_018524	CCATG	2	10	127976	127985	20 %	20 %	20 %	40 %	403507634
96	NC_018524	GGCTG	2	10	129357	129366	0 %	20 %	60 %	20 %	403507636
97	NC_018524	GCCCT	2	10	133218	133227	0 %	20 %	20 %	60 %	403507638
98	NC_018524	CCCCG	2	10	134114	134123	0 %	0 %	20 %	80 %	403507639
99	NC_018524	CGGTC	2	10	134978	134987	0 %	20 %	40 %	40 %	403507640
100	NC_018524	GGCAC	2	10	135472	135481	20 %	0 %	40 %	40 %	403507641
101	NC_018524	CGCGG	2	10	135774	135783	0 %	0 %	60 %	40 %	403507641
102	NC_018524	GCCGG	2	10	136564	136573	0 %	0 %	60 %	40 %	403507643
103	NC_018524	ACCTG	2	10	136755	136764	20 %	20 %	20 %	40 %	403507643
104	NC_018524	GATCG	2	10	137621	137630	20 %	20 %	40 %	20 %	403507644
105	NC_018524	GTCCG	2	10	138758	138767	0 %	20 %	40 %	40 %	403507645
106	NC_018524	GCACC	2	10	140271	140280	20 %	0 %	20 %	60 %	403507648
107	NC_018524	GGCGC	2	10	140344	140353	0 %	0 %	60 %	40 %	403507648
108	NC_018524	GGGCG	2	10	142148	142157	0 %	0 %	80 %	20 %	403507649
109	NC_018524	CACCC	2	10	143560	143569	20 %	0 %	0 %	80 %	403507651
110	NC_018524	GAACT	2	10	147941	147950	40 %	20 %	20 %	20 %	403507655
111	NC_018524	GGCGA	2	10	148253	148262	20 %	0 %	60 %	20 %	403507655
112	NC_018524	CCGAC	2	10	149889	149898	20 %	0 %	20 %	60 %	403507655
113	NC_018524	GGGGC	2	10	149914	149923	0 %	0 %	80 %	20 %	403507655
114	NC_018524	CGGCG	2	10	150670	150679	0 %	0 %	60 %	40 %	403507656
115	NC_018524	AGGTC	2	10	153843	153852	20 %	20 %	40 %	20 %	403507659
116	NC_018524	TGACC	2	10	153909	153918	20 %	20 %	20 %	40 %	403507659
117	NC_018524	GCGGG	2	10	155822	155831	0 %	0 %	80 %	20 %	403507662
118	NC_018524	CCGGG	2	10	157894	157903	0 %	0 %	60 %	40 %	403507664
119	NC_018524	CCGAT	2	10	158529	158538	20 %	20 %	20 %	40 %	403507664
120	NC_018524	GGACC	2	10	158986	158995	20 %	0 %	40 %	40 %	403507664
121	NC_018524	GCCCC	2	10	160444	160453	0 %	0 %	20 %	80 %	403507666
122	NC_018524	CGAAC	2	10	161668	161677	40 %	0 %	20 %	40 %	403507667
123	NC_018524	CGTTC	2	10	162890	162899	0 %	40 %	20 %	40 %	403507668
124	NC_018524	CGGCG	2	10	164030	164039	0 %	0 %	60 %	40 %	403507668
125	NC_018524	CCGCG	2	10	167124	167133	0 %	0 %	40 %	60 %	403507670
126	NC_018524	CCGCG	2	10	168619	168628	0 %	0 %	40 %	60 %	403507671
127	NC_018524	GGCCG	2	10	169711	169720	0 %	0 %	60 %	40 %	403507672
128	NC_018524	CGGGT	2	10	170238	170247	0 %	20 %	60 %	20 %	403507673
129	NC_018524	CCGGC	2	10	170884	170893	0 %	0 %	40 %	60 %	403507673
130	NC_018524	GGGGT	2	10	172077	172086	0 %	20 %	80 %	0 %	403507674
131	NC_018524	TCGGC	2	10	172457	172466	0 %	20 %	40 %	40 %	403507675
132	NC_018524	CTCTC	2	10	176174	176183	0 %	40 %	0 %	60 %	403507679
133	NC_018524	GCGCG	2	10	177822	177831	0 %	0 %	60 %	40 %	403507682
134	NC_018524	CGGGC	2	10	179542	179551	0 %	0 %	60 %	40 %	403507683
135	NC_018524	CGGCG	2	10	181097	181106	0 %	0 %	60 %	40 %	403507685
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262	NC_018524	GCCCT	2	10	350960	350969	0 %	20 %	20 %	60 %	403507851
263	NC_018524	TGGGG	2	10	355060	355069	0 %	20 %	80 %	0 %	403507857
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381	NC_018524	GGAGC	2	10	524754	524763	20 %	0 %	60 %	20 %	403508013
382	NC_018524	GCGCG	2	10	524810	524819	0 %	0 %	60 %	40 %	403508013
383	NC_018524	CGGGT	2	10	524911	524920	0 %	20 %	60 %	20 %	403508013
384	NC_018524	CGATC	2	10	525203	525212	20 %	20 %	20 %	40 %	403508013
385	NC_018524	CACGT	2	10	525773	525782	20 %	20 %	20 %	40 %	403508015
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387	NC_018524	GCGGT	2	10	526557	526566	0 %	20 %	60 %	20 %	403508015
388	NC_018524	TCCCC	2	10	527114	527123	0 %	20 %	0 %	80 %	403508015
389	NC_018524	TCCTG	2	10	534274	534283	0 %	40 %	20 %	40 %	403508020
390	NC_018524	TCGGC	2	10	535621	535630	0 %	20 %	40 %	40 %	403508022
391	NC_018524	CGCGC	2	10	538447	538456	0 %	0 %	40 %	60 %	403508024
392	NC_018524	CCGAC	2	10	541669	541678	20 %	0 %	20 %	60 %	403508026
393	NC_018524	ACCGA	2	10	542155	542164	40 %	0 %	20 %	40 %	403508026
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