MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nocardiopsis alba ATCC BAA-2165 chromosome

Total Repeats: 101515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018524	GAC	2	6	2381	2386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
2	NC_018524	GCA	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
3	NC_018524	CGA	2	6	2419	2424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
4	NC_018524	CGT	2	6	2440	2445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
5	NC_018524	GTT	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403507511
6	NC_018524	CCT	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
7	NC_018524	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507511
8	NC_018524	CCT	2	6	2689	2694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
9	NC_018524	TCC	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
10	NC_018524	GTG	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507511
11	NC_018524	GCT	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
12	NC_018524	CTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
13	NC_018524	TCC	2	6	2811	2816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507511
14	NC_018524	GTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
15	NC_018524	CGG	2	6	3027	3032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
16	NC_018524	CGG	2	6	3046	3051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
17	NC_018524	ACC	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507511
18	NC_018524	GGA	2	6	3085	3090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507511
19	NC_018524	GCG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
20	NC_018524	AGC	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
21	NC_018524	GGC	2	6	3181	3186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507511
22	NC_018524	GCA	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507511
23	NC_018524	TCG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507511
24	NC_018524	ATG	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507511
25	NC_018524	CAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507512
26	NC_018524	CAC	2	6	3964	3969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507512
27	NC_018524	CCT	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507512
28	NC_018524	TCG	2	6	4079	4084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
29	NC_018524	CGC	3	9	4095	4103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
30	NC_018524	CCT	2	6	4163	4168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507512
31	NC_018524	GAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403507512
32	NC_018524	GGT	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507512
33	NC_018524	GCC	2	6	4396	4401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
34	NC_018524	CCG	2	6	4479	4484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
35	NC_018524	CCG	2	6	4496	4501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
36	NC_018524	CCG	2	6	4503	4508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507512
37	NC_018524	GGC	2	6	4569	4574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507512
38	NC_018524	CGT	2	6	4650	4655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
39	NC_018524	TCC	2	6	4723	4728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507512
40	NC_018524	TGC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
41	NC_018524	TCG	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507512
42	NC_018524	GCC	2	6	4805	4810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507513
43	NC_018524	CGA	2	6	4819	4824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507513
44	NC_018524	CCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507513
45	NC_018524	CGT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507513
46	NC_018524	GGA	2	6	5089	5094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507513
47	NC_018524	GTT	2	6	5110	5115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403507513
48	NC_018524	GAG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507513
49	NC_018524	TCG	2	6	5220	5225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507513
50	NC_018524	CGG	2	6	5239	5244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507513
51	NC_018524	GGA	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507513
52	NC_018524	CGA	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507513
53	NC_018524	CGC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507514
54	NC_018524	ATC	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507514
55	NC_018524	TCC	2	6	5504	5509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507515
56	NC_018524	ATC	2	6	5546	5551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507515
57	NC_018524	TCG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
58	NC_018524	TGC	2	6	5589	5594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
59	NC_018524	GAG	3	9	5714	5722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
60	NC_018524	CAC	2	6	5788	5793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507515
61	NC_018524	CGA	3	9	5836	5844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507515
62	NC_018524	ACC	2	6	5922	5927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507515
63	NC_018524	AGG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
64	NC_018524	GAG	2	6	5978	5983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
65	NC_018524	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507515
66	NC_018524	GGA	2	6	6007	6012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
67	NC_018524	GAG	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507515
68	NC_018524	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507515
69	NC_018524	GCT	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507515
70	NC_018524	CGG	2	6	6397	6402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507516
71	NC_018524	GTC	2	6	6422	6427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507516
72	NC_018524	CAC	2	6	6545	6550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507516
73	NC_018524	CCT	2	6	6565	6570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507516
74	NC_018524	GTG	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507516
75	NC_018524	GAC	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507516
76	NC_018524	TCC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507516
77	NC_018524	TCC	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507516
78	NC_018524	CGG	3	9	6706	6714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507516
79	NC_018524	GGT	2	6	6746	6751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507516
80	NC_018524	ACC	2	6	6820	6825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507517
81	NC_018524	CAC	2	6	6927	6932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507517
82	NC_018524	GAG	2	6	6975	6980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507517
83	NC_018524	CGC	2	6	6983	6988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507517
84	NC_018524	GTC	2	6	7043	7048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
85	NC_018524	AGG	2	6	7050	7055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507517
86	NC_018524	CGG	2	6	7096	7101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507517
87	NC_018524	CGG	3	9	7111	7119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507517
88	NC_018524	GAC	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507517
89	NC_018524	GCG	2	6	7149	7154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507517
90	NC_018524	CGG	2	6	7209	7214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507517
91	NC_018524	GCC	2	6	7219	7224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507517
92	NC_018524	CCG	2	6	7511	7516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507517
93	NC_018524	CGT	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
94	NC_018524	GAC	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507517
95	NC_018524	CGC	2	6	7646	7651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507517
96	NC_018524	GTC	2	6	7654	7659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
97	NC_018524	GCT	2	6	7665	7670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
98	NC_018524	CGT	2	6	7699	7704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
99	NC_018524	GTC	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
100	NC_018524	CCT	2	6	7830	7835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507517
101	NC_018524	CGA	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507517
102	NC_018524	CGG	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507517
103	NC_018524	GTA	2	6	7960	7965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507517
104	NC_018524	TGT	2	6	7989	7994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403507517
105	NC_018524	TGG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507517
106	NC_018524	GCG	2	6	8009	8014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507517
107	NC_018524	CGA	2	6	8091	8096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507517
108	NC_018524	ATG	2	6	8108	8113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507517
109	NC_018524	TGC	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507517
110	NC_018524	CTC	2	6	8304	8309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507518
111	NC_018524	CAT	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403507518
112	NC_018524	CCA	2	6	8321	8326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507518
113	NC_018524	CGG	2	6	8360	8365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507518
114	NC_018524	CGA	2	6	8372	8377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507518
115	NC_018524	GGA	2	6	8399	8404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507518
116	NC_018524	CGC	2	6	8454	8459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507518
117	NC_018524	TCG	2	6	8560	8565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507518
118	NC_018524	TCC	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507518
119	NC_018524	CTC	2	6	8574	8579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507518
120	NC_018524	GTG	2	6	8585	8590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507518
121	NC_018524	CGG	2	6	8632	8637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507518
122	NC_018524	TCC	2	6	8665	8670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507519
123	NC_018524	TGG	2	6	8671	8676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507519
124	NC_018524	GAG	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507519
125	NC_018524	CGG	2	6	8913	8918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507519
126	NC_018524	CGA	3	9	9018	9026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507519
127	NC_018524	GTC	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507519
128	NC_018524	CGG	2	6	9096	9101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507519
129	NC_018524	CCA	2	6	9147	9152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507519
130	NC_018524	CCG	2	6	9158	9163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507519
131	NC_018524	CCG	2	6	9198	9203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507519
132	NC_018524	CCA	2	6	9225	9230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507519
133	NC_018524	GGC	2	6	9334	9339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507519
134	NC_018524	ACG	2	6	9376	9381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507519
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249	NC_018524	CTG	2	6	15643	15648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507525
250	NC_018524	CGC	2	6	15678	15683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507525
251	NC_018524	TGA	2	6	15684	15689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403507525
252	NC_018524	CCT	2	6	15711	15716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507525
253	NC_018524	GGC	3	9	15739	15747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507525
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255	NC_018524	CGT	2	6	15765	15770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507525
256	NC_018524	GCC	2	6	15913	15918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507525
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380	NC_018524	ACC	2	6	23245	23250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403507532
381	NC_018524	GTC	2	6	23256	23261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507532
382	NC_018524	CGG	2	6	23282	23287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403507532
383	NC_018524	CGT	2	6	23318	23323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403507532
384	NC_018524	CTC	2	6	23334	23339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507532
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392	NC_018524	TGG	2	6	23921	23926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403507533
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491	NC_018524	GAC	3	9	29873	29881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507536
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493	NC_018524	CTC	2	6	29999	30004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403507536
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497	NC_018524	GCC	2	6	30352	30357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403507537
498	NC_018524	AGG	2	6	30480	30485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403507537
499	NC_018524	GAA	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403507537
500	NC_018524	CGA	2	6	30525	30530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403507537

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