MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-BN148

Total Repeats: 998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018521	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403054818
2	NC_018521	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403054818
3	NC_018521	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403054819
4	NC_018521	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403054819
5	NC_018521	ATGCTA	2	12	9432	9443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054823
6	NC_018521	ATTTAA	2	12	10236	10247	50 %	50 %	0 %	0 %	403054823
7	NC_018521	GAAAAT	2	12	13085	13096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054824
8	NC_018521	TATTGC	2	12	13414	13425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054824
9	NC_018521	AAATGA	2	12	14200	14211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054824
10	NC_018521	GCTTTA	2	12	16567	16578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054827
11	NC_018521	TTTTCA	2	12	17147	17158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403054828
12	NC_018521	ATGGGT	2	12	18925	18936	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403054829
13	NC_018521	TTCATT	2	12	20077	20088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403054831
14	NC_018521	AAGAAA	2	12	21280	21291	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403054832
15	NC_018521	AAGATA	2	12	22199	22210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054833
16	NC_018521	AGCAAA	2	12	22982	22993	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403054833
17	NC_018521	TTTTCT	2	12	23489	23500	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403054834
18	NC_018521	TATAAG	2	12	27921	27932	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403054838
19	NC_018521	TTTTAT	2	12	28284	28295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	403054838
20	NC_018521	TTATGC	2	12	29346	29357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054839
21	NC_018521	GAACTT	2	12	29831	29842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054840
22	NC_018521	CTTTAA	2	12	31593	31604	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403054840
23	NC_018521	ATGTGT	2	12	32407	32418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	403054841
24	NC_018521	ATGGAT	2	12	36274	36285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403054844
25	NC_018521	GAAATT	2	12	36483	36494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403054844
26	NC_018521	AACAAA	2	12	45779	45790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	403054846
27	NC_018521	TGCTAA	2	12	52041	52052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054849
28	NC_018521	TACACT	2	12	52552	52563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403054849
29	NC_018521	ATGAAA	2	12	54301	54312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054851
30	NC_018521	TAAGCT	2	12	54833	54844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054851
31	NC_018521	AGTTTT	2	12	57015	57026	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403054853
32	NC_018521	TTCTTT	2	12	57231	57242	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403054854
33	NC_018521	CCAATG	2	12	61060	61071	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403054856
34	NC_018521	CAAAAT	2	12	61176	61187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	403054856
35	NC_018521	TTCATC	2	12	62110	62121	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403054857
36	NC_018521	TAATTT	2	12	63904	63915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403054859
37	NC_018521	ATTTTA	2	12	64156	64167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403054859
38	NC_018521	AAATAT	2	12	64513	64524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403054859
39	NC_018521	GTTGGA	2	12	65453	65464	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	403054859
40	NC_018521	GTTTTT	2	12	65598	65609	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	403054859
41	NC_018521	TAGCTT	2	12	74372	74383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054868
42	NC_018521	TTCATT	2	12	76731	76742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403054871
43	NC_018521	CATCTT	2	12	78477	78488	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403054872
44	NC_018521	TTTAAA	2	12	80897	80908	50 %	50 %	0 %	0 %	403054875
45	NC_018521	CTAGCT	2	12	81329	81340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403054876
46	NC_018521	GAATGA	2	12	81583	81594	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403054876
47	NC_018521	GATGCT	2	12	82745	82756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403054877
48	NC_018521	TAAATT	2	12	84459	84470	50 %	50 %	0 %	0 %	403054879
49	NC_018521	TTTTTG	2	12	91322	91333	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	403054886
50	NC_018521	GAATTT	2	12	91642	91653	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403054887
51	NC_018521	AACTCA	2	12	92157	92168	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403054887
52	NC_018521	ATTTAT	2	12	93718	93729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403054888
53	NC_018521	CTTTAA	2	12	93937	93948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403054888
54	NC_018521	ATATTT	2	12	94697	94708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403054889
55	NC_018521	GTAACT	2	12	97106	97117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054891
56	NC_018521	CAGGAA	2	12	97812	97823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403054892
57	NC_018521	TTGTGT	2	12	98398	98409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403054892
58	NC_018521	ATAAAA	2	12	100223	100234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054893
59	NC_018521	TTAATG	2	12	102440	102451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403054896
60	NC_018521	GCAAGC	2	12	102520	102531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403054896
61	NC_018521	AACTTA	2	12	105258	105269	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403054900
62	NC_018521	GAACTT	2	12	107504	107515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054902
63	NC_018521	TTAGAA	2	12	107555	107566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403054902
64	NC_018521	TGGCTG	2	12	108393	108404	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403054904
65	NC_018521	AAAAAT	2	12	109858	109869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054905
66	NC_018521	GGTTTG	2	12	115564	115575	0 %	50 %	50 %	0 %	403054912
67	NC_018521	AAAGAA	2	12	115843	115854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403054913
68	NC_018521	AAAATA	2	12	117375	117386	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054915
69	NC_018521	ATTTTG	2	12	118912	118923	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403054917
70	NC_018521	GAAAAA	2	12	119819	119830	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403054918
71	NC_018521	GTTGTG	2	12	120666	120677	0 %	50 %	50 %	0 %	403054919
72	NC_018521	GGACAT	2	12	120707	120718	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403054919
73	NC_018521	TTTGAT	2	12	122292	122303	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403054921
74	NC_018521	TTCTTT	2	12	131435	131446	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403054933
75	NC_018521	GGGCTT	2	12	132114	132125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403054934
76	NC_018521	AAAGAT	2	12	135186	135197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054936
77	NC_018521	TTGTTA	2	12	137274	137285	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403054940
78	NC_018521	AAAGAA	2	12	137413	137424	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403054940
79	NC_018521	GAAAAA	2	12	140108	140119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403054942
80	NC_018521	AAAATG	2	12	141571	141582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054943
81	NC_018521	TAAAAA	2	12	141797	141808	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054943
82	NC_018521	ATGATA	2	12	142444	142455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403054943
83	NC_018521	ACCTTT	2	12	143949	143960	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403054944
84	NC_018521	AGCTAT	2	12	144001	144012	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054945
85	NC_018521	CTATAC	2	12	144597	144608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403054945
86	NC_018521	TAAGGA	2	12	148905	148916	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403054949
87	NC_018521	TTTTAC	2	12	150920	150931	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403054950
88	NC_018521	CTGCTC	2	12	152796	152807	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	403054953
89	NC_018521	ATTTTC	2	12	153718	153729	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403054954
90	NC_018521	AAAACT	2	12	156757	156768	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	403054957
91	NC_018521	ATAAAA	2	12	156825	156836	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054957
92	NC_018521	TTTTGC	2	12	157381	157392	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	403054958
93	NC_018521	AGCTAT	2	12	158436	158447	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403054960
94	NC_018521	GGCTAA	2	12	158835	158846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403054960
95	NC_018521	TCAAAT	2	12	160461	160472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403054963
96	NC_018521	AAATAA	2	12	163230	163241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054968
97	NC_018521	ATTTTC	2	12	165302	165313	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403054970
98	NC_018521	AGCTTT	2	12	165998	166009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054971
99	NC_018521	GGCTGT	2	12	166625	166636	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403054972
100	NC_018521	TATAAA	2	12	168034	168045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403054974
101	NC_018521	AAAAGC	2	12	169538	169549	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403054975
102	NC_018521	AACAAG	2	12	170330	170341	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403054976
103	NC_018521	TAAAAA	2	12	173251	173262	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403054979
104	NC_018521	TGGAAA	2	12	173312	173323	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	403054979
105	NC_018521	TTAAAT	2	12	176079	176090	50 %	50 %	0 %	0 %	403054981
106	NC_018521	CTTTCT	2	12	176166	176177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403054981
107	NC_018521	ATTCTA	2	12	178167	178178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403054984
108	NC_018521	GCTATT	2	12	178394	178405	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054984
109	NC_018521	TTGCAG	2	12	179741	179752	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403054985
110	NC_018521	TGACTT	2	12	182432	182443	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403054988
111	NC_018521	GCAAAG	2	12	183306	183317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403054989
112	NC_018521	AAAACC	2	12	183536	183547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403054990
113	NC_018521	CAAGGA	2	12	185906	185917	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	403054992
114	NC_018521	AATGAA	2	12	190309	190320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403054997
115	NC_018521	AAGTGC	2	12	191514	191525	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403054997
116	NC_018521	CCTAAT	2	12	191533	191544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403054997
117	NC_018521	CTTACT	2	12	193133	193144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	403054999
118	NC_018521	AATTAA	2	12	194511	194522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403055000
119	NC_018521	AAATTC	2	12	195225	195236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403055001
120	NC_018521	TTTTAG	2	12	203913	203924	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403055008
121	NC_018521	AAAGAA	2	12	204052	204063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	403055009
122	NC_018521	TGAACT	2	12	209464	209475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403055011
123	NC_018521	TTTGAT	2	12	210260	210271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403055011
124	NC_018521	TAAAAT	2	12	211482	211493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403055013
125	NC_018521	GAAATA	2	12	213618	213629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403055016
126	NC_018521	TGATTT	2	12	214395	214406	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403055017
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130	NC_018521	AATTTA	2	12	220065	220076	50 %	50 %	0 %	0 %	403055025
131	NC_018521	ATAAAG	2	12	225109	225120	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403055029
132	NC_018521	TGGTTT	2	12	227740	227751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403055032
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138	NC_018521	GCTATA	2	12	241553	241564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403055049
139	NC_018521	ATAATT	2	12	242419	242430	50 %	50 %	0 %	0 %	403055050
140	NC_018521	TTCTTT	2	12	244574	244585	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	403055051
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144	NC_018521	AAATGA	2	12	251873	251884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403055061
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147	NC_018521	CCTTAG	2	12	259137	259148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403055066
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149	NC_018521	TCAATT	2	12	261802	261813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403055069
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216	NC_018521	ATTTTC	2	12	385862	385873	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403055202
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221	NC_018521	AACAAA	2	12	401333	401344	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	403055214
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227	NC_018521	TAATTG	2	12	411576	411587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403055224
228	NC_018521	AGGCTT	2	12	412200	412211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	403055224
229	NC_018521	GATTTA	2	12	417737	417748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403055230
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231	NC_018521	AGTATA	2	12	425887	425898	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	403055239
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233	NC_018521	TAAAAT	2	12	431394	431405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403055244
234	NC_018521	GATTTT	2	12	431665	431676	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403055245
235	NC_018521	TCCAAC	2	12	435022	435033	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	403055248
236	NC_018521	ATTAAA	2	12	436569	436580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403055251
237	NC_018521	TAAAAA	2	12	438461	438472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	403055254
238	NC_018521	AGCTGA	2	12	438820	438831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	403055255
239	NC_018521	CATTTT	2	12	441229	441240	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403055256
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241	NC_018521	AATGAA	2	12	449861	449872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403055260
242	NC_018521	AGTTAG	2	12	451068	451079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403055262
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272	NC_018521	ATTTAA	2	12	493353	493364	50 %	50 %	0 %	0 %	403055305
273	NC_018521	TTAAAT	2	12	496431	496442	50 %	50 %	0 %	0 %	403055307
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347	NC_018521	GAAACA	2	12	595109	595120	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	403055405
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349	NC_018521	TTTAAA	2	12	596074	596085	50 %	50 %	0 %	0 %	403055406
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