MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bordetella pertussis 18323

Total Repeats: 12290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018518	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	408414083
2	NC_018518	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	408414083
3	NC_018518	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	408414083
4	NC_018518	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	408414083
5	NC_018518	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	408414083
6	NC_018518	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	408414083
7	NC_018518	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	408414083
8	NC_018518	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	408414084
9	NC_018518	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	408414084
10	NC_018518	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	408414084
11	NC_018518	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	408414085
12	NC_018518	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	408414085
13	NC_018518	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	408414085
14	NC_018518	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	408414086
15	NC_018518	GCCA	2	8	4031	4038	25 %	0 %	25 %	50 %	408414086
16	NC_018518	CCTG	2	8	4337	4344	0 %	25 %	25 %	50 %	408414087
17	NC_018518	GTGC	2	8	4455	4462	0 %	25 %	50 %	25 %	408414087
18	NC_018518	GGCC	2	8	4532	4539	0 %	0 %	50 %	50 %	408414087
19	NC_018518	GGCG	2	8	4784	4791	0 %	0 %	75 %	25 %	408414087
20	NC_018518	GGCC	2	8	5265	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018518	CGAC	2	8	5381	5388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018518	CGGC	2	8	5697	5704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018518	GGCG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	75 %	25 %	408414088
24	NC_018518	TATG	2	8	7980	7987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018518	TTGC	2	8	8316	8323	0 %	50 %	25 %	25 %	408414089
26	NC_018518	AAGG	2	8	8937	8944	50 %	0 %	50 %	0 %	408414090
27	NC_018518	CCCG	2	8	9356	9363	0 %	0 %	25 %	75 %	408414091
28	NC_018518	CCTA	2	8	11762	11769	25 %	25 %	0 %	50 %	408414095
29	NC_018518	TCGT	2	8	12076	12083	0 %	50 %	25 %	25 %	408414095
30	NC_018518	GTCG	2	8	13662	13669	0 %	25 %	50 %	25 %	408414095
31	NC_018518	TCGC	2	8	14195	14202	0 %	25 %	25 %	50 %	408414095
32	NC_018518	GGCC	2	8	14916	14923	0 %	0 %	50 %	50 %	408414095
33	NC_018518	TCGC	2	8	15735	15742	0 %	25 %	25 %	50 %	408414095
34	NC_018518	CAAG	2	8	15797	15804	50 %	0 %	25 %	25 %	408414096
35	NC_018518	ATGG	2	8	16478	16485	25 %	25 %	50 %	0 %	408414096
36	NC_018518	AAGG	2	8	17721	17728	50 %	0 %	50 %	0 %	408414096
37	NC_018518	ATCG	2	8	18536	18543	25 %	25 %	25 %	25 %	408414096
38	NC_018518	GGTG	2	8	19079	19086	0 %	25 %	75 %	0 %	408414096
39	NC_018518	ACTG	2	8	20025	20032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018518	CGTA	2	8	20391	20398	25 %	25 %	25 %	25 %	408414097
41	NC_018518	CCTG	2	8	21093	21100	0 %	25 %	25 %	50 %	408414098
42	NC_018518	GCCC	2	8	21826	21833	0 %	0 %	25 %	75 %	408414098
43	NC_018518	CACG	2	8	21944	21951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018518	TTCG	2	8	22128	22135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018518	CACG	2	8	22241	22248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018518	CGGA	2	8	22271	22278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_018518	GCCG	2	8	22980	22987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018518	CGCC	2	8	23493	23500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_018518	GGCC	2	8	23679	23686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018518	GCTG	2	8	24139	24146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018518	GCCG	2	8	24147	24154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018518	GCCA	2	8	24272	24279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018518	CGGG	2	8	24284	24291	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018518	TGCT	2	8	25285	25292	0 %	50 %	25 %	25 %	408414099
55	NC_018518	GCCT	2	8	25885	25892	0 %	25 %	25 %	50 %	408414100
56	NC_018518	GCCG	2	8	26508	26515	0 %	0 %	50 %	50 %	408414101
57	NC_018518	TGAG	2	8	26671	26678	25 %	25 %	50 %	0 %	408414101
58	NC_018518	CGCC	2	8	26804	26811	0 %	0 %	25 %	75 %	408414101
59	NC_018518	CTGC	2	8	26816	26823	0 %	25 %	25 %	50 %	408414101
60	NC_018518	GCCG	2	8	26852	26859	0 %	0 %	50 %	50 %	408414101
61	NC_018518	CGGC	2	8	27064	27071	0 %	0 %	50 %	50 %	408414101
62	NC_018518	GCTG	2	8	27092	27099	0 %	25 %	50 %	25 %	408414101
63	NC_018518	CGGC	2	8	27826	27833	0 %	0 %	50 %	50 %	408414102
64	NC_018518	GCTG	2	8	27887	27894	0 %	25 %	50 %	25 %	408414102
65	NC_018518	CCGG	2	8	28190	28197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018518	CACG	2	8	28350	28357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018518	GAAC	2	8	28414	28421	50 %	0 %	25 %	25 %	408414103
68	NC_018518	GGGT	2	8	29127	29134	0 %	25 %	75 %	0 %	408414103
69	NC_018518	GCCG	2	8	29348	29355	0 %	0 %	50 %	50 %	408414104
70	NC_018518	GCGG	2	8	29962	29969	0 %	0 %	75 %	25 %	408414104
71	NC_018518	GGGC	2	8	30117	30124	0 %	0 %	75 %	25 %	408414105
72	NC_018518	CGTC	2	8	30479	30486	0 %	25 %	25 %	50 %	408414105
73	NC_018518	GGCC	2	8	30894	30901	0 %	0 %	50 %	50 %	408414105
74	NC_018518	GCCG	2	8	31355	31362	0 %	0 %	50 %	50 %	408414106
75	NC_018518	CGGC	2	8	31443	31450	0 %	0 %	50 %	50 %	408414106
76	NC_018518	CGCC	2	8	32496	32503	0 %	0 %	25 %	75 %	408414106
77	NC_018518	GTGG	2	8	32794	32801	0 %	25 %	75 %	0 %	408414106
78	NC_018518	AACG	2	8	33248	33255	50 %	0 %	25 %	25 %	408414106
79	NC_018518	GTCG	2	8	33301	33308	0 %	25 %	50 %	25 %	408414106
80	NC_018518	CCTG	2	8	33375	33382	0 %	25 %	25 %	50 %	408414106
81	NC_018518	GGCC	2	8	33499	33506	0 %	0 %	50 %	50 %	408414106
82	NC_018518	CGCA	2	8	33785	33792	25 %	0 %	25 %	50 %	408414106
83	NC_018518	GCTG	2	8	34002	34009	0 %	25 %	50 %	25 %	408414106
84	NC_018518	CCGG	2	8	34217	34224	0 %	0 %	50 %	50 %	408414106
85	NC_018518	GGCC	2	8	34560	34567	0 %	0 %	50 %	50 %	408414106
86	NC_018518	CGGC	2	8	35675	35682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018518	CTGG	2	8	36510	36517	0 %	25 %	50 %	25 %	408414108
88	NC_018518	GCCG	2	8	36549	36556	0 %	0 %	50 %	50 %	408414108
89	NC_018518	CGTG	2	8	36790	36797	0 %	25 %	50 %	25 %	408414109
90	NC_018518	GGCC	2	8	36977	36984	0 %	0 %	50 %	50 %	408414109
91	NC_018518	TGGA	2	8	37269	37276	25 %	25 %	50 %	0 %	408414109
92	NC_018518	GTCG	2	8	37816	37823	0 %	25 %	50 %	25 %	408414110
93	NC_018518	CGAC	2	8	38346	38353	25 %	0 %	25 %	50 %	408414110
94	NC_018518	GCCG	2	8	38869	38876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018518	GATT	2	8	38893	38900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018518	CTGG	2	8	39267	39274	0 %	25 %	50 %	25 %	408414111
97	NC_018518	GGGC	2	8	39471	39478	0 %	0 %	75 %	25 %	408414111
98	NC_018518	CCGG	2	8	39542	39549	0 %	0 %	50 %	50 %	408414111
99	NC_018518	GCTG	2	8	39605	39612	0 %	25 %	50 %	25 %	408414111
100	NC_018518	CCAG	2	8	39881	39888	25 %	0 %	25 %	50 %	408414111
101	NC_018518	CACG	2	8	41839	41846	25 %	0 %	25 %	50 %	408414113
102	NC_018518	CCCG	2	8	42259	42266	0 %	0 %	25 %	75 %	408414114
103	NC_018518	GGCC	2	8	43141	43148	0 %	0 %	50 %	50 %	408414115
104	NC_018518	CGCC	2	8	43340	43347	0 %	0 %	25 %	75 %	408414115
105	NC_018518	GGGT	2	8	43358	43365	0 %	25 %	75 %	0 %	408414115
106	NC_018518	CTGG	2	8	43410	43417	0 %	25 %	50 %	25 %	408414115
107	NC_018518	CGGC	2	8	43502	43509	0 %	0 %	50 %	50 %	408414115
108	NC_018518	TGGC	2	8	43519	43526	0 %	25 %	50 %	25 %	408414115
109	NC_018518	CGGC	2	8	43704	43711	0 %	0 %	50 %	50 %	408414116
110	NC_018518	CGAT	2	8	43980	43987	25 %	25 %	25 %	25 %	408414116
111	NC_018518	GCGT	2	8	44240	44247	0 %	25 %	50 %	25 %	408414116
112	NC_018518	CCAG	2	8	44634	44641	25 %	0 %	25 %	50 %	408414116
113	NC_018518	GCGG	2	8	44853	44860	0 %	0 %	75 %	25 %	408414116
114	NC_018518	TGGT	2	8	44897	44904	0 %	50 %	50 %	0 %	408414116
115	NC_018518	GCCG	2	8	45173	45180	0 %	0 %	50 %	50 %	408414117
116	NC_018518	GCGG	2	8	46517	46524	0 %	0 %	75 %	25 %	408414117
117	NC_018518	CGCC	2	8	46778	46785	0 %	0 %	25 %	75 %	408414118
118	NC_018518	CCTG	2	8	48814	48821	0 %	25 %	25 %	50 %	408414121
119	NC_018518	CGGC	2	8	49104	49111	0 %	0 %	50 %	50 %	408414121
120	NC_018518	CGGG	2	8	49149	49156	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018518	GGGC	2	8	49386	49393	0 %	0 %	75 %	25 %	408414122
122	NC_018518	GGCC	2	8	49676	49683	0 %	0 %	50 %	50 %	408414122
123	NC_018518	GCCG	2	8	49770	49777	0 %	0 %	50 %	50 %	408414122
124	NC_018518	CGGG	2	8	49817	49824	0 %	0 %	75 %	25 %	408414122
125	NC_018518	TGCC	2	8	49874	49881	0 %	25 %	25 %	50 %	408414122
126	NC_018518	GGTT	2	8	49959	49966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018518	TGCG	2	8	50024	50031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018518	TGGC	2	8	50408	50415	0 %	25 %	50 %	25 %	408414123
129	NC_018518	GATC	2	8	50609	50616	25 %	25 %	25 %	25 %	408414123
130	NC_018518	CTGG	2	8	50834	50841	0 %	25 %	50 %	25 %	408414123
131	NC_018518	GGCG	2	8	50882	50889	0 %	0 %	75 %	25 %	408414123
132	NC_018518	GGCC	2	8	50997	51004	0 %	0 %	50 %	50 %	408414123
133	NC_018518	GGCG	2	8	51628	51635	0 %	0 %	75 %	25 %	408414124
134	NC_018518	GCCA	3	12	51638	51649	25 %	0 %	25 %	50 %	408414124
135	NC_018518	AACG	2	8	51745	51752	50 %	0 %	25 %	25 %	408414125
136	NC_018518	AGCG	2	8	51871	51878	25 %	0 %	50 %	25 %	408414125
137	NC_018518	GCTG	2	8	52178	52185	0 %	25 %	50 %	25 %	408414125
138	NC_018518	GCCG	2	8	52486	52493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018518	CGGG	2	8	52772	52779	0 %	0 %	75 %	25 %	408414126
140	NC_018518	GGCC	2	8	52786	52793	0 %	0 %	50 %	50 %	408414126
141	NC_018518	CGCC	2	8	53148	53155	0 %	0 %	25 %	75 %	408414126
142	NC_018518	CGGC	2	8	53666	53673	0 %	0 %	50 %	50 %	408414126
143	NC_018518	GGCG	2	8	54431	54438	0 %	0 %	75 %	25 %	408414127
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