MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018516	CTGTT	2	10	123	132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018516	TTGAA	2	10	234	243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018516	TTCAT	2	10	2275	2284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018516	CTTTT	2	10	3575	3584	0 %	80 %	0 %	20 %	434379904
5	NC_018516	CCCTT	2	10	6790	6799	0 %	40 %	0 %	60 %	434379911
6	NC_018516	CAATG	2	10	7453	7462	40 %	20 %	20 %	20 %	434379912
7	NC_018516	TCTCT	2	10	8009	8018	0 %	60 %	0 %	40 %	434379913
8	NC_018516	TAACT	2	10	8749	8758	40 %	40 %	0 %	20 %	434379915
9	NC_018516	TTGTT	2	10	9188	9197	0 %	80 %	20 %	0 %	434379916
10	NC_018516	ACTAA	2	10	9929	9938	60 %	20 %	0 %	20 %	434379917
11	NC_018516	ATTCC	2	10	9972	9981	20 %	40 %	0 %	40 %	434379917
12	NC_018516	TAACC	2	10	10065	10074	40 %	20 %	0 %	40 %	434379917
13	NC_018516	AGTTT	2	10	11832	11841	20 %	60 %	20 %	0 %	434379921
14	NC_018516	TTTAT	2	10	12469	12478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018516	TTTAC	2	10	12941	12950	20 %	60 %	0 %	20 %	434379923
16	NC_018516	ATTTA	2	10	14042	14051	40 %	60 %	0 %	0 %	434379926
17	NC_018516	TTATA	2	10	14987	14996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018516	ATTGT	2	10	15584	15593	20 %	60 %	20 %	0 %	434379929
19	NC_018516	TTATA	2	10	17118	17127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018516	TAATG	2	10	17310	17319	40 %	40 %	20 %	0 %	434379932
21	NC_018516	TAAAT	2	10	17505	17514	60 %	40 %	0 %	0 %	434379932
22	NC_018516	AATAA	2	10	19880	19889	80 %	20 %	0 %	0 %	434379937
23	NC_018516	AACCC	2	10	20447	20456	40 %	0 %	0 %	60 %	434379938
24	NC_018516	AGGTA	2	10	20730	20739	40 %	20 %	40 %	0 %	434379938
25	NC_018516	AAAGA	2	10	20905	20914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018516	ATCTT	2	10	21385	21394	20 %	60 %	0 %	20 %	434379940
27	NC_018516	ATACT	2	10	21997	22006	40 %	40 %	0 %	20 %	434379941
28	NC_018516	ATAAA	2	10	22388	22397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018516	TACCC	2	10	22410	22419	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_018516	TTTGG	2	10	24470	24479	0 %	60 %	40 %	0 %	434379943
31	NC_018516	CTGCT	2	10	28590	28599	0 %	40 %	20 %	40 %	434379944
32	NC_018516	ATTTC	2	10	28636	28645	20 %	60 %	0 %	20 %	434379944
33	NC_018516	GTTGA	2	10	29783	29792	20 %	40 %	40 %	0 %	434379944
34	NC_018516	TATCT	2	10	29850	29859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018516	ATTGA	2	10	30078	30087	40 %	40 %	20 %	0 %	434379945
36	NC_018516	CAACC	2	10	30927	30936	40 %	0 %	0 %	60 %	434379946
37	NC_018516	TTAAA	2	10	31062	31071	60 %	40 %	0 %	0 %	434379946
38	NC_018516	GATTA	2	10	36147	36156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018516	TCCCT	2	10	38417	38426	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_018516	AAAGA	2	10	38872	38881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018516	TACTC	2	10	38950	38959	20 %	40 %	0 %	40 %	434379953
42	NC_018516	TACTT	2	10	40243	40252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018516	TATAA	2	10	40646	40655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018516	TTTAC	2	10	41291	41300	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018516	TTTTA	2	10	41410	41419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018516	TATCT	2	10	41781	41790	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018516	TAGTT	2	10	43563	43572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018516	TAAAA	2	10	44440	44449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018516	GTAAT	2	10	44977	44986	40 %	40 %	20 %	0 %	434379954
50	NC_018516	ATTTA	2	10	46543	46552	40 %	60 %	0 %	0 %	434379958
51	NC_018516	ATTTC	2	10	46880	46889	20 %	60 %	0 %	20 %	434379959
52	NC_018516	GAAAA	2	10	48689	48698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018516	TTATC	2	10	48848	48857	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018516	CTTAT	2	10	54767	54776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018516	TTGTT	2	10	57378	57387	0 %	80 %	20 %	0 %	434379973
56	NC_018516	TTACC	2	10	58794	58803	20 %	40 %	0 %	40 %	434379973
57	NC_018516	CAATG	2	10	59629	59638	40 %	20 %	20 %	20 %	434379973
58	NC_018516	GATTT	2	10	60629	60638	20 %	60 %	20 %	0 %	434379973
59	NC_018516	ATTGA	2	10	62511	62520	40 %	40 %	20 %	0 %	434379974
60	NC_018516	TACCC	2	10	63945	63954	20 %	20 %	0 %	60 %	434379975
61	NC_018516	GTATT	2	10	65252	65261	20 %	60 %	20 %	0 %	434379976
62	NC_018516	ATAAC	2	10	67524	67533	60 %	20 %	0 %	20 %	434379978
63	NC_018516	TTTAA	2	10	67670	67679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018516	AGAAA	2	10	67777	67786	80 %	0 %	20 %	0 %	434379979
65	NC_018516	TTTTG	2	10	68852	68861	0 %	80 %	20 %	0 %	434379980
66	NC_018516	CTTTT	2	10	70283	70292	0 %	80 %	0 %	20 %	434379982
67	NC_018516	TTAAC	2	10	70634	70643	40 %	40 %	0 %	20 %	434379983
68	NC_018516	TTACC	2	10	71762	71771	20 %	40 %	0 %	40 %	434379985
69	NC_018516	TTCTT	2	10	72765	72774	0 %	80 %	0 %	20 %	434379987
70	NC_018516	ACTTA	2	10	73446	73455	40 %	40 %	0 %	20 %	434379988
71	NC_018516	TTTAC	2	10	75330	75339	20 %	60 %	0 %	20 %	434379990
72	NC_018516	CCATA	2	10	75583	75592	40 %	20 %	0 %	40 %	434379990
73	NC_018516	TTTGA	2	10	76141	76150	20 %	60 %	20 %	0 %	434379991
74	NC_018516	TTACC	2	10	76938	76947	20 %	40 %	0 %	40 %	434379993
75	NC_018516	TATAT	2	10	77263	77272	40 %	60 %	0 %	0 %	434379993
76	NC_018516	TTTGA	2	10	77914	77923	20 %	60 %	20 %	0 %	434379994
77	NC_018516	TGTTT	2	10	78576	78585	0 %	80 %	20 %	0 %	434379994
78	NC_018516	TTTCT	2	10	79758	79767	0 %	80 %	0 %	20 %	434379995
79	NC_018516	CTTTT	2	10	81099	81108	0 %	80 %	0 %	20 %	434379999
80	NC_018516	ACTTT	2	10	81351	81360	20 %	60 %	0 %	20 %	434380000
81	NC_018516	TCTTT	2	10	81880	81889	0 %	80 %	0 %	20 %	434380002
82	NC_018516	TTTCT	2	10	82413	82422	0 %	80 %	0 %	20 %	434380003
83	NC_018516	TTTCT	2	10	83099	83108	0 %	80 %	0 %	20 %	434380004
84	NC_018516	TATTT	2	10	85828	85837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018516	TTTAC	2	10	88865	88874	20 %	60 %	0 %	20 %	434380012
86	NC_018516	CTTGA	2	10	89525	89534	20 %	40 %	20 %	20 %	434380012
87	NC_018516	CTTTA	2	10	91038	91047	20 %	60 %	0 %	20 %	434380014
88	NC_018516	TCTCT	2	10	91078	91087	0 %	60 %	0 %	40 %	434380014
89	NC_018516	TTCTT	2	10	94439	94448	0 %	80 %	0 %	20 %	434380020
90	NC_018516	TACTT	2	10	95975	95984	20 %	60 %	0 %	20 %	434380022
91	NC_018516	TAATT	2	10	96041	96050	40 %	60 %	0 %	0 %	434380022
92	NC_018516	TAATC	2	10	97067	97076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018516	ATAAA	2	10	98076	98085	80 %	20 %	0 %	0 %	434380025
94	NC_018516	TTTTC	2	10	98461	98470	0 %	80 %	0 %	20 %	434380026
95	NC_018516	CTACA	2	10	100942	100951	40 %	20 %	0 %	40 %	434380029
96	NC_018516	TTATT	2	10	101638	101647	20 %	80 %	0 %	0 %	434380031
97	NC_018516	TTGAT	2	10	103947	103956	20 %	60 %	20 %	0 %	434380033
98	NC_018516	TTTTG	2	10	104003	104012	0 %	80 %	20 %	0 %	434380033
99	NC_018516	GACTC	2	10	105126	105135	20 %	20 %	20 %	40 %	434380033
100	NC_018516	CTACA	2	10	105495	105504	40 %	20 %	0 %	40 %	434380033
101	NC_018516	CTTTA	2	10	105921	105930	20 %	60 %	0 %	20 %	434380034
102	NC_018516	CAAAT	2	10	106705	106714	60 %	20 %	0 %	20 %	434380035
103	NC_018516	TGTAA	2	10	108514	108523	40 %	40 %	20 %	0 %	434380036
104	NC_018516	CTACA	2	10	112252	112261	40 %	20 %	0 %	40 %	434380038
105	NC_018516	TTTCT	2	10	112439	112448	0 %	80 %	0 %	20 %	434380039
106	NC_018516	CCTTA	2	10	112677	112686	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_018516	TAACC	2	10	112938	112947	40 %	20 %	0 %	40 %	434380040
108	NC_018516	TTTCA	2	10	113304	113313	20 %	60 %	0 %	20 %	434380041
109	NC_018516	TACAT	2	10	113391	113400	40 %	40 %	0 %	20 %	434380041
110	NC_018516	TCTTG	2	10	114781	114790	0 %	60 %	20 %	20 %	434380042
111	NC_018516	TGTTT	2	10	115440	115449	0 %	80 %	20 %	0 %	434380043
112	NC_018516	CTTCT	2	10	116059	116068	0 %	60 %	0 %	40 %	434380044
113	NC_018516	CTACA	2	10	117241	117250	40 %	20 %	0 %	40 %	434380046
114	NC_018516	TAATC	2	10	117476	117485	40 %	40 %	0 %	20 %	434380046
115	NC_018516	TGTAT	2	10	117965	117974	20 %	60 %	20 %	0 %	434380047
116	NC_018516	CAATA	2	10	118727	118736	60 %	20 %	0 %	20 %	434380048
117	NC_018516	TTTTA	2	10	120477	120486	20 %	80 %	0 %	0 %	434380050
118	NC_018516	TTTCT	2	10	120782	120791	0 %	80 %	0 %	20 %	434380051
119	NC_018516	TTTCA	2	10	120917	120926	20 %	60 %	0 %	20 %	434380051
120	NC_018516	CTTTT	2	10	121126	121135	0 %	80 %	0 %	20 %	434380051
121	NC_018516	CTTAC	2	10	122268	122277	20 %	40 %	0 %	40 %	434380052
122	NC_018516	TCTTG	2	10	122689	122698	0 %	60 %	20 %	20 %	434380052
123	NC_018516	TTTGG	2	10	123803	123812	0 %	60 %	40 %	0 %	434380053
124	NC_018516	AAGTA	2	10	123877	123886	60 %	20 %	20 %	0 %	434380053
125	NC_018516	CTACC	2	10	124377	124386	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_018516	CGTAA	2	10	125255	125264	40 %	20 %	20 %	20 %	434380054
127	NC_018516	TTTCA	2	10	125401	125410	20 %	60 %	0 %	20 %	434380054
128	NC_018516	TTCCA	2	10	125563	125572	20 %	40 %	0 %	40 %	434380055
129	NC_018516	CATTC	2	10	128372	128381	20 %	40 %	0 %	40 %	434380058
130	NC_018516	CTTCT	2	10	130945	130954	0 %	60 %	0 %	40 %	434380062
131	NC_018516	GACTA	2	10	132557	132566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018516	TTCTG	2	10	133587	133596	0 %	60 %	20 %	20 %	434380064
133	NC_018516	ATAGT	2	10	134014	134023	40 %	40 %	20 %	0 %	434380065
134	NC_018516	CATAT	2	10	134881	134890	40 %	40 %	0 %	20 %	434380066
135	NC_018516	AACTT	2	10	135351	135360	40 %	40 %	0 %	20 %	434380066
136	NC_018516	TTATA	2	10	135903	135912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018516	ACAAT	2	10	136203	136212	60 %	20 %	0 %	20 %	434380067
138	NC_018516	TTATA	2	10	137294	137303	40 %	60 %	0 %	0 %	434380068
139	NC_018516	GTAAC	2	10	137403	137412	40 %	20 %	20 %	20 %	434380068
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141	NC_018516	ATGTT	2	10	140686	140695	20 %	60 %	20 %	0 %	434380072
142	NC_018516	TCTTT	2	10	140916	140925	0 %	80 %	0 %	20 %	434380072
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149	NC_018516	TATAA	2	10	146098	146107	60 %	40 %	0 %	0 %	434380080
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153	NC_018516	TATAT	2	10	147149	147158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018516	CTTTA	2	10	148222	148231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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173	NC_018516	ATATA	2	10	166683	166692	60 %	40 %	0 %	0 %	434380119
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185	NC_018516	TTTTG	2	10	182162	182171	0 %	80 %	20 %	0 %	434380145
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244	NC_018516	TCTTT	2	10	246095	246104	0 %	80 %	0 %	20 %	434380216
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259	NC_018516	TCTTA	2	10	264930	264939	20 %	60 %	0 %	20 %	434380241
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263	NC_018516	TTTCT	2	10	268284	268293	0 %	80 %	0 %	20 %	434380244
264	NC_018516	TCAGT	2	10	268376	268385	20 %	40 %	20 %	20 %	434380244
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266	NC_018516	AATTG	2	10	269758	269767	40 %	40 %	20 %	0 %	434380245
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268	NC_018516	TACTT	2	10	275220	275229	20 %	60 %	0 %	20 %	434380245
269	NC_018516	AATTT	2	10	276848	276857	40 %	60 %	0 %	0 %	434380245
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271	NC_018516	TTTCA	2	10	278796	278805	20 %	60 %	0 %	20 %	434380245
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.