MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018516	CTGTT	2	10	123	132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018516	TTGAA	2	10	234	243	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018516	TTCAT	2	10	2275	2284	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_018516	TTTAT	2	10	12469	12478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018516	TTATA	2	10	14987	14996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018516	TTATA	2	10	17118	17127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018516	AAAGA	2	10	20905	20914	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018516	ATAAA	2	10	22388	22397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018516	TACCC	2	10	22410	22419	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_018516	TATCT	2	10	29850	29859	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018516	GATTA	2	10	36147	36156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018516	TCCCT	2	10	38417	38426	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_018516	AAAGA	2	10	38872	38881	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018516	TACTT	2	10	40243	40252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018516	TATAA	2	10	40646	40655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018516	TTTAC	2	10	41291	41300	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018516	TTTTA	2	10	41410	41419	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018516	TATCT	2	10	41781	41790	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_018516	TAGTT	2	10	43563	43572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018516	TAAAA	2	10	44440	44449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018516	GAAAA	2	10	48689	48698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018516	TTATC	2	10	48848	48857	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_018516	CTTAT	2	10	54767	54776	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018516	TTTAA	2	10	67670	67679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018516	TATTT	2	10	85828	85837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018516	TAATC	2	10	97067	97076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018516	CCTTA	2	10	112677	112686	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_018516	CTACC	2	10	124377	124386	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_018516	GACTA	2	10	132557	132566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018516	TTATA	2	10	135903	135912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018516	AAAGA	2	10	141131	141140	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018516	TCTAG	2	10	141984	141993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018516	AAAAG	2	10	146050	146059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018516	TATAT	2	10	147149	147158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018516	CTTTA	2	10	148222	148231	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018516	AACAA	2	10	154379	154388	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018516	TTTAT	2	10	160894	160903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018516	ACAAA	2	10	166401	166410	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_018516	ATCTA	2	10	180888	180897	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018516	TATCT	2	10	183355	183364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018516	CTTTT	2	10	185664	185673	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018516	AAAAG	2	10	185877	185886	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018516	AAAGA	2	10	192898	192907	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018516	CTTTA	2	10	223929	223938	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018516	GTAAT	2	10	227312	227321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018516	TATTG	2	10	230074	230083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018516	ATAAA	2	10	230261	230270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018516	TTGTT	2	10	230313	230322	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018516	CTCTT	2	10	232464	232473	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018516	CTTTT	2	10	233740	233749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018516	TTTAT	2	10	233755	233764	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018516	TTATA	2	10	245496	245505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018516	ACTCA	2	10	268683	268692	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_018516	AAATT	2	10	279632	279641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018516	ATTAC	2	10	284847	284856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018516	TCTTA	2	10	285104	285113	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018516	ATAAG	2	10	293428	293437	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018516	CTTTT	2	10	299602	299611	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018516	TTATA	2	10	304851	304860	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018516	TAAAA	2	10	304896	304905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018516	AAAAG	2	10	308134	308143	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018516	TTAGA	2	10	317335	317344	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018516	ATCAC	2	10	318382	318391	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_018516	AAATA	2	10	321123	321132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018516	TTGTT	2	10	325882	325891	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018516	TATAT	2	10	330117	330126	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018516	TAATT	2	10	333568	333577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018516	TTACT	2	10	336266	336275	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018516	CTATT	2	10	336773	336782	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018516	ACTAC	2	10	336811	336820	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_018516	TACCT	2	10	336961	336970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_018516	CTTTT	2	10	337084	337093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_018516	ACAAA	2	10	344507	344516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_018516	CTTCT	2	10	347578	347587	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.