MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 271

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018516	CTTTT	2	10	3575	3584	0 %	80 %	0 %	20 %	434379904
2	NC_018516	CCCTT	2	10	6790	6799	0 %	40 %	0 %	60 %	434379911
3	NC_018516	CAATG	2	10	7453	7462	40 %	20 %	20 %	20 %	434379912
4	NC_018516	TCTCT	2	10	8009	8018	0 %	60 %	0 %	40 %	434379913
5	NC_018516	TAACT	2	10	8749	8758	40 %	40 %	0 %	20 %	434379915
6	NC_018516	TTGTT	2	10	9188	9197	0 %	80 %	20 %	0 %	434379916
7	NC_018516	ACTAA	2	10	9929	9938	60 %	20 %	0 %	20 %	434379917
8	NC_018516	ATTCC	2	10	9972	9981	20 %	40 %	0 %	40 %	434379917
9	NC_018516	TAACC	2	10	10065	10074	40 %	20 %	0 %	40 %	434379917
10	NC_018516	AGTTT	2	10	11832	11841	20 %	60 %	20 %	0 %	434379921
11	NC_018516	TTTAC	2	10	12941	12950	20 %	60 %	0 %	20 %	434379923
12	NC_018516	ATTTA	2	10	14042	14051	40 %	60 %	0 %	0 %	434379926
13	NC_018516	ATTGT	2	10	15584	15593	20 %	60 %	20 %	0 %	434379929
14	NC_018516	TAATG	2	10	17310	17319	40 %	40 %	20 %	0 %	434379932
15	NC_018516	TAAAT	2	10	17505	17514	60 %	40 %	0 %	0 %	434379932
16	NC_018516	AATAA	2	10	19880	19889	80 %	20 %	0 %	0 %	434379937
17	NC_018516	AACCC	2	10	20447	20456	40 %	0 %	0 %	60 %	434379938
18	NC_018516	AGGTA	2	10	20730	20739	40 %	20 %	40 %	0 %	434379938
19	NC_018516	ATCTT	2	10	21385	21394	20 %	60 %	0 %	20 %	434379940
20	NC_018516	ATACT	2	10	21997	22006	40 %	40 %	0 %	20 %	434379941
21	NC_018516	TTTGG	2	10	24470	24479	0 %	60 %	40 %	0 %	434379943
22	NC_018516	CTGCT	2	10	28590	28599	0 %	40 %	20 %	40 %	434379944
23	NC_018516	ATTTC	2	10	28636	28645	20 %	60 %	0 %	20 %	434379944
24	NC_018516	GTTGA	2	10	29783	29792	20 %	40 %	40 %	0 %	434379944
25	NC_018516	ATTGA	2	10	30078	30087	40 %	40 %	20 %	0 %	434379945
26	NC_018516	CAACC	2	10	30927	30936	40 %	0 %	0 %	60 %	434379946
27	NC_018516	TTAAA	2	10	31062	31071	60 %	40 %	0 %	0 %	434379946
28	NC_018516	TACTC	2	10	38950	38959	20 %	40 %	0 %	40 %	434379953
29	NC_018516	GTAAT	2	10	44977	44986	40 %	40 %	20 %	0 %	434379954
30	NC_018516	ATTTA	2	10	46543	46552	40 %	60 %	0 %	0 %	434379958
31	NC_018516	ATTTC	2	10	46880	46889	20 %	60 %	0 %	20 %	434379959
32	NC_018516	TTGTT	2	10	57378	57387	0 %	80 %	20 %	0 %	434379973
33	NC_018516	TTACC	2	10	58794	58803	20 %	40 %	0 %	40 %	434379973
34	NC_018516	CAATG	2	10	59629	59638	40 %	20 %	20 %	20 %	434379973
35	NC_018516	GATTT	2	10	60629	60638	20 %	60 %	20 %	0 %	434379973
36	NC_018516	ATTGA	2	10	62511	62520	40 %	40 %	20 %	0 %	434379974
37	NC_018516	TACCC	2	10	63945	63954	20 %	20 %	0 %	60 %	434379975
38	NC_018516	GTATT	2	10	65252	65261	20 %	60 %	20 %	0 %	434379976
39	NC_018516	ATAAC	2	10	67524	67533	60 %	20 %	0 %	20 %	434379978
40	NC_018516	AGAAA	2	10	67777	67786	80 %	0 %	20 %	0 %	434379979
41	NC_018516	TTTTG	2	10	68852	68861	0 %	80 %	20 %	0 %	434379980
42	NC_018516	CTTTT	2	10	70283	70292	0 %	80 %	0 %	20 %	434379982
43	NC_018516	TTAAC	2	10	70634	70643	40 %	40 %	0 %	20 %	434379983
44	NC_018516	TTACC	2	10	71762	71771	20 %	40 %	0 %	40 %	434379985
45	NC_018516	TTCTT	2	10	72765	72774	0 %	80 %	0 %	20 %	434379987
46	NC_018516	ACTTA	2	10	73446	73455	40 %	40 %	0 %	20 %	434379988
47	NC_018516	TTTAC	2	10	75330	75339	20 %	60 %	0 %	20 %	434379990
48	NC_018516	CCATA	2	10	75583	75592	40 %	20 %	0 %	40 %	434379990
49	NC_018516	TTTGA	2	10	76141	76150	20 %	60 %	20 %	0 %	434379991
50	NC_018516	TTACC	2	10	76938	76947	20 %	40 %	0 %	40 %	434379993
51	NC_018516	TATAT	2	10	77263	77272	40 %	60 %	0 %	0 %	434379993
52	NC_018516	TTTGA	2	10	77914	77923	20 %	60 %	20 %	0 %	434379994
53	NC_018516	TGTTT	2	10	78576	78585	0 %	80 %	20 %	0 %	434379994
54	NC_018516	TTTCT	2	10	79758	79767	0 %	80 %	0 %	20 %	434379995
55	NC_018516	CTTTT	2	10	81099	81108	0 %	80 %	0 %	20 %	434379999
56	NC_018516	ACTTT	2	10	81351	81360	20 %	60 %	0 %	20 %	434380000
57	NC_018516	TCTTT	2	10	81880	81889	0 %	80 %	0 %	20 %	434380002
58	NC_018516	TTTCT	2	10	82413	82422	0 %	80 %	0 %	20 %	434380003
59	NC_018516	TTTCT	2	10	83099	83108	0 %	80 %	0 %	20 %	434380004
60	NC_018516	TTTAC	2	10	88865	88874	20 %	60 %	0 %	20 %	434380012
61	NC_018516	CTTGA	2	10	89525	89534	20 %	40 %	20 %	20 %	434380012
62	NC_018516	CTTTA	2	10	91038	91047	20 %	60 %	0 %	20 %	434380014
63	NC_018516	TCTCT	2	10	91078	91087	0 %	60 %	0 %	40 %	434380014
64	NC_018516	TTCTT	2	10	94439	94448	0 %	80 %	0 %	20 %	434380020
65	NC_018516	TACTT	2	10	95975	95984	20 %	60 %	0 %	20 %	434380022
66	NC_018516	TAATT	2	10	96041	96050	40 %	60 %	0 %	0 %	434380022
67	NC_018516	ATAAA	2	10	98076	98085	80 %	20 %	0 %	0 %	434380025
68	NC_018516	TTTTC	2	10	98461	98470	0 %	80 %	0 %	20 %	434380026
69	NC_018516	CTACA	2	10	100942	100951	40 %	20 %	0 %	40 %	434380029
70	NC_018516	TTATT	2	10	101638	101647	20 %	80 %	0 %	0 %	434380031
71	NC_018516	TTGAT	2	10	103947	103956	20 %	60 %	20 %	0 %	434380033
72	NC_018516	TTTTG	2	10	104003	104012	0 %	80 %	20 %	0 %	434380033
73	NC_018516	GACTC	2	10	105126	105135	20 %	20 %	20 %	40 %	434380033
74	NC_018516	CTACA	2	10	105495	105504	40 %	20 %	0 %	40 %	434380033
75	NC_018516	CTTTA	2	10	105921	105930	20 %	60 %	0 %	20 %	434380034
76	NC_018516	CAAAT	2	10	106705	106714	60 %	20 %	0 %	20 %	434380035
77	NC_018516	TGTAA	2	10	108514	108523	40 %	40 %	20 %	0 %	434380036
78	NC_018516	CTACA	2	10	112252	112261	40 %	20 %	0 %	40 %	434380038
79	NC_018516	TTTCT	2	10	112439	112448	0 %	80 %	0 %	20 %	434380039
80	NC_018516	TAACC	2	10	112938	112947	40 %	20 %	0 %	40 %	434380040
81	NC_018516	TTTCA	2	10	113304	113313	20 %	60 %	0 %	20 %	434380041
82	NC_018516	TACAT	2	10	113391	113400	40 %	40 %	0 %	20 %	434380041
83	NC_018516	TCTTG	2	10	114781	114790	0 %	60 %	20 %	20 %	434380042
84	NC_018516	TGTTT	2	10	115440	115449	0 %	80 %	20 %	0 %	434380043
85	NC_018516	CTTCT	2	10	116059	116068	0 %	60 %	0 %	40 %	434380044
86	NC_018516	CTACA	2	10	117241	117250	40 %	20 %	0 %	40 %	434380046
87	NC_018516	TAATC	2	10	117476	117485	40 %	40 %	0 %	20 %	434380046
88	NC_018516	TGTAT	2	10	117965	117974	20 %	60 %	20 %	0 %	434380047
89	NC_018516	CAATA	2	10	118727	118736	60 %	20 %	0 %	20 %	434380048
90	NC_018516	TTTTA	2	10	120477	120486	20 %	80 %	0 %	0 %	434380050
91	NC_018516	TTTCT	2	10	120782	120791	0 %	80 %	0 %	20 %	434380051
92	NC_018516	TTTCA	2	10	120917	120926	20 %	60 %	0 %	20 %	434380051
93	NC_018516	CTTTT	2	10	121126	121135	0 %	80 %	0 %	20 %	434380051
94	NC_018516	CTTAC	2	10	122268	122277	20 %	40 %	0 %	40 %	434380052
95	NC_018516	TCTTG	2	10	122689	122698	0 %	60 %	20 %	20 %	434380052
96	NC_018516	TTTGG	2	10	123803	123812	0 %	60 %	40 %	0 %	434380053
97	NC_018516	AAGTA	2	10	123877	123886	60 %	20 %	20 %	0 %	434380053
98	NC_018516	CGTAA	2	10	125255	125264	40 %	20 %	20 %	20 %	434380054
99	NC_018516	TTTCA	2	10	125401	125410	20 %	60 %	0 %	20 %	434380054
100	NC_018516	TTCCA	2	10	125563	125572	20 %	40 %	0 %	40 %	434380055
101	NC_018516	CATTC	2	10	128372	128381	20 %	40 %	0 %	40 %	434380058
102	NC_018516	CTTCT	2	10	130945	130954	0 %	60 %	0 %	40 %	434380062
103	NC_018516	TTCTG	2	10	133587	133596	0 %	60 %	20 %	20 %	434380064
104	NC_018516	ATAGT	2	10	134014	134023	40 %	40 %	20 %	0 %	434380065
105	NC_018516	CATAT	2	10	134881	134890	40 %	40 %	0 %	20 %	434380066
106	NC_018516	AACTT	2	10	135351	135360	40 %	40 %	0 %	20 %	434380066
107	NC_018516	ACAAT	2	10	136203	136212	60 %	20 %	0 %	20 %	434380067
108	NC_018516	TTATA	2	10	137294	137303	40 %	60 %	0 %	0 %	434380068
109	NC_018516	GTAAC	2	10	137403	137412	40 %	20 %	20 %	20 %	434380068
110	NC_018516	CATAA	2	10	139163	139172	60 %	20 %	0 %	20 %	434380071
111	NC_018516	ATGTT	2	10	140686	140695	20 %	60 %	20 %	0 %	434380072
112	NC_018516	TCTTT	2	10	140916	140925	0 %	80 %	0 %	20 %	434380072
113	NC_018516	ATATA	2	10	141249	141258	60 %	40 %	0 %	0 %	434380073
114	NC_018516	AATAC	2	10	144613	144622	60 %	20 %	0 %	20 %	434380078
115	NC_018516	ATACG	2	10	145576	145585	40 %	20 %	20 %	20 %	434380079
116	NC_018516	TATAA	2	10	146098	146107	60 %	40 %	0 %	0 %	434380080
117	NC_018516	TTTTG	2	10	146408	146417	0 %	80 %	20 %	0 %	434380080
118	NC_018516	ATAAA	2	10	146605	146614	80 %	20 %	0 %	0 %	434380081
119	NC_018516	TATAA	2	10	146678	146687	60 %	40 %	0 %	0 %	434380081
120	NC_018516	CTAAT	2	10	148744	148753	40 %	40 %	0 %	20 %	434380085
121	NC_018516	GATAA	2	10	151652	151661	60 %	20 %	20 %	0 %	434380090
122	NC_018516	ATGTA	2	10	155538	155547	40 %	40 %	20 %	0 %	434380096
123	NC_018516	TATTG	2	10	155802	155811	20 %	60 %	20 %	0 %	434380096
124	NC_018516	ATCTA	2	10	156160	156169	40 %	40 %	0 %	20 %	434380097
125	NC_018516	TTTTC	2	10	156696	156705	0 %	80 %	0 %	20 %	434380098
126	NC_018516	CATTC	2	10	157013	157022	20 %	40 %	0 %	40 %	434380098
127	NC_018516	TTTTG	2	10	159097	159106	0 %	80 %	20 %	0 %	434380101
128	NC_018516	CAACT	2	10	159112	159121	40 %	20 %	0 %	40 %	434380101
129	NC_018516	GTAAT	2	10	160515	160524	40 %	40 %	20 %	0 %	434380105
130	NC_018516	ATAAG	2	10	162225	162234	60 %	20 %	20 %	0 %	434380108
131	NC_018516	GTATG	2	10	162331	162340	20 %	40 %	40 %	0 %	434380109
132	NC_018516	CTTCT	2	10	164028	164037	0 %	60 %	0 %	40 %	434380113
133	NC_018516	TCTTT	2	10	164397	164406	0 %	80 %	0 %	20 %	434380114
134	NC_018516	TAGTT	2	10	166357	166366	20 %	60 %	20 %	0 %	434380118
135	NC_018516	ATATA	2	10	166683	166692	60 %	40 %	0 %	0 %	434380119
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265	NC_018516	CCTTG	2	10	341150	341159	0 %	40 %	20 %	40 %	434380316
266	NC_018516	TGAGT	2	10	342015	342024	20 %	40 %	40 %	0 %	434380318
267	NC_018516	ATGTA	2	10	344207	344216	40 %	40 %	20 %	0 %	434380323
268	NC_018516	TTTGG	2	10	344756	344765	0 %	60 %	40 %	0 %	434380324
269	NC_018516	TACTT	2	10	345161	345170	20 %	60 %	0 %	20 %	434380325
270	NC_018516	TAACA	2	10	345263	345272	60 %	20 %	0 %	20 %	434380325
271	NC_018516	ATTGA	2	10	346887	346896	40 %	40 %	20 %	0 %	434380329

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.