MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p01

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018516	AT	3	6	1090	1095	50 %	50 %	0 %	0 %	434379900
2	NC_018516	AC	3	6	2469	2474	50 %	0 %	0 %	50 %	434379902
3	NC_018516	TC	3	6	2732	2737	0 %	50 %	0 %	50 %	434379902
4	NC_018516	TA	3	6	3190	3195	50 %	50 %	0 %	0 %	434379903
5	NC_018516	CT	3	6	3788	3793	0 %	50 %	0 %	50 %	434379904
6	NC_018516	TC	3	6	4435	4440	0 %	50 %	0 %	50 %	434379905
7	NC_018516	TC	3	6	5252	5257	0 %	50 %	0 %	50 %	434379907
8	NC_018516	TG	3	6	6439	6444	0 %	50 %	50 %	0 %	434379910
9	NC_018516	AC	3	6	6657	6662	50 %	0 %	0 %	50 %	434379911
10	NC_018516	AT	3	6	6895	6900	50 %	50 %	0 %	0 %	434379911
11	NC_018516	TC	3	6	8397	8402	0 %	50 %	0 %	50 %	434379914
12	NC_018516	CT	4	8	9032	9039	0 %	50 %	0 %	50 %	434379916
13	NC_018516	GA	3	6	9371	9376	50 %	0 %	50 %	0 %	434379916
14	NC_018516	CT	3	6	11038	11043	0 %	50 %	0 %	50 %	434379920
15	NC_018516	TC	3	6	11713	11718	0 %	50 %	0 %	50 %	434379921
16	NC_018516	CT	3	6	12032	12037	0 %	50 %	0 %	50 %	434379922
17	NC_018516	TA	3	6	12433	12438	50 %	50 %	0 %	0 %	434379922
18	NC_018516	AT	3	6	12544	12549	50 %	50 %	0 %	0 %	434379923
19	NC_018516	AC	3	6	13601	13606	50 %	0 %	0 %	50 %	434379925
20	NC_018516	TA	3	6	13679	13684	50 %	50 %	0 %	0 %	434379925
21	NC_018516	TC	3	6	14140	14145	0 %	50 %	0 %	50 %	434379927
22	NC_018516	TG	3	6	14236	14241	0 %	50 %	50 %	0 %	434379927
23	NC_018516	TA	3	6	14403	14408	50 %	50 %	0 %	0 %	434379927
24	NC_018516	TC	3	6	14771	14776	0 %	50 %	0 %	50 %	434379927
25	NC_018516	TA	3	6	15303	15308	50 %	50 %	0 %	0 %	434379928
26	NC_018516	AT	3	6	16860	16865	50 %	50 %	0 %	0 %	434379931
27	NC_018516	TA	3	6	17495	17500	50 %	50 %	0 %	0 %	434379932
28	NC_018516	CT	3	6	17669	17674	0 %	50 %	0 %	50 %	434379933
29	NC_018516	CT	3	6	17737	17742	0 %	50 %	0 %	50 %	434379933
30	NC_018516	TA	3	6	18194	18199	50 %	50 %	0 %	0 %	434379934
31	NC_018516	AT	3	6	18220	18225	50 %	50 %	0 %	0 %	434379934
32	NC_018516	TC	3	6	18298	18303	0 %	50 %	0 %	50 %	434379934
33	NC_018516	TA	3	6	19316	19321	50 %	50 %	0 %	0 %	434379936
34	NC_018516	CT	3	6	19410	19415	0 %	50 %	0 %	50 %	434379936
35	NC_018516	TA	3	6	19462	19467	50 %	50 %	0 %	0 %	434379936
36	NC_018516	TA	3	6	19744	19749	50 %	50 %	0 %	0 %	434379937
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39	NC_018516	CT	3	6	21838	21843	0 %	50 %	0 %	50 %	434379941
40	NC_018516	TA	3	6	22428	22433	50 %	50 %	0 %	0 %	434379942
41	NC_018516	TG	3	6	23903	23908	0 %	50 %	50 %	0 %	434379943
42	NC_018516	TC	3	6	24189	24194	0 %	50 %	0 %	50 %	434379943
43	NC_018516	TC	3	6	24226	24231	0 %	50 %	0 %	50 %	434379943
44	NC_018516	TA	3	6	25454	25459	50 %	50 %	0 %	0 %	434379943
45	NC_018516	TC	3	6	28356	28361	0 %	50 %	0 %	50 %	434379944
46	NC_018516	CT	3	6	28582	28587	0 %	50 %	0 %	50 %	434379944
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48	NC_018516	TA	3	6	29747	29752	50 %	50 %	0 %	0 %	434379944
49	NC_018516	TG	3	6	30430	30435	0 %	50 %	50 %	0 %	434379945
50	NC_018516	AT	3	6	31290	31295	50 %	50 %	0 %	0 %	434379946
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52	NC_018516	CT	3	6	32148	32153	0 %	50 %	0 %	50 %	434379946
53	NC_018516	TC	3	6	33265	33270	0 %	50 %	0 %	50 %	434379947
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.