MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cepacia GG4 chromosome 2

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018514	GCACCG	2	12	15319	15330	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018514	CGCACG	2	12	22335	22346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018514	GATATC	2	12	62068	62079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018514	GCGCAC	2	12	75452	75463	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018514	GCGGGC	2	12	94059	94070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018514	GTCGAG	2	12	96522	96533	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018514	CGATCG	2	12	103141	103152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018514	TGCGCG	2	12	103257	103268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018514	CGCCTG	2	12	198699	198710	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_018514	TCAACG	2	12	224191	224202	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018514	CGTCAA	2	12	226977	226988	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018514	TCTCCG	2	12	235135	235146	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018514	CCGCGT	2	12	238706	238717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018514	TTTCCG	2	12	249021	249032	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018514	GGCGAC	2	12	255695	255706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018514	TCGGCG	2	12	258737	258748	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018514	CGCAAC	2	12	286916	286927	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018514	CGATTG	2	12	299774	299785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018514	TGTGTC	2	12	344119	344130	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018514	CGACAT	3	18	372781	372798	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018514	TGGTAA	2	12	382692	382703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018514	CCGGGG	2	12	384142	384153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018514	CGAGGG	2	12	386841	386852	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018514	CGCGTC	2	12	387699	387710	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_018514	CCGGCG	2	12	449039	449050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018514	TGCGCG	2	12	457442	457453	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018514	GCCGCT	2	12	458410	458421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018514	GACAGT	2	12	470740	470751	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018514	CGACAA	2	12	475110	475121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018514	CTGCCG	2	12	475276	475287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018514	TGAAAA	2	12	514310	514321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018514	CGTGTG	2	12	538548	538559	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018514	GACGGC	2	12	539815	539826	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018514	GCCTCC	4	24	540804	540827	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_018514	CCCGCA	6	36	541846	541881	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018514	TTCGCA	2	12	541882	541893	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018514	GCGCGT	2	12	563152	563163	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018514	GCGAGT	2	12	572120	572131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018514	TGCCGG	2	12	642715	642726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018514	GCGGCC	2	12	651123	651134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018514	CGGTGC	2	12	668727	668738	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018514	CGCGGC	2	12	745883	745894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018514	CGATGA	2	12	772071	772082	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018514	CGAACC	2	12	773365	773376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018514	CACTTC	2	12	821898	821909	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018514	CGGGCG	2	12	825746	825757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018514	GGGACG	2	12	842348	842359	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018514	CGGCCG	2	12	876810	876821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018514	TCCGCC	2	12	895718	895729	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018514	TCGACT	2	12	928471	928482	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018514	GTTTAG	2	12	934749	934760	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018514	CGGGCC	2	12	991471	991482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018514	GCATCG	2	12	996669	996680	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018514	GTGACG	2	12	997839	997850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018514	CGCCAA	2	12	1000434	1000445	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018514	CGGGAA	2	12	1002929	1002940	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_018514	TGATTT	2	12	1061001	1061012	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018514	CCACAA	2	12	1068418	1068429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018514	CCGGCA	2	12	1081237	1081248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018514	GTTCCG	2	12	1095446	1095457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018514	TGGTTT	2	12	1117030	1117041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018514	CCTCGC	2	12	1186897	1186908	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018514	TTCGCG	2	12	1197297	1197308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018514	ATCGCG	2	12	1197996	1198007	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018514	GTGGAA	2	12	1207160	1207171	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018514	TCCGCC	2	12	1214094	1214105	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018514	ATACGG	2	12	1274378	1274389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018514	ACCGGA	2	12	1306482	1306493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_018514	CGTATC	2	12	1319064	1319075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018514	ACGTGC	2	12	1342045	1342056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018514	GCGTGC	2	12	1350135	1350146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018514	CGCATC	2	12	1358736	1358747	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018514	CCCGAA	2	12	1375511	1375522	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018514	CGCCCC	2	12	1442955	1442966	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
75	NC_018514	AGGAAA	2	12	1502865	1502876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018514	GCGCCG	2	12	1554488	1554499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018514	CGGTTC	2	12	1593815	1593826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018514	GGGAAA	2	12	1676745	1676756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018514	GCGTCC	2	12	1684696	1684707	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018514	TCCTTT	2	12	1704742	1704753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018514	CGCTAG	2	12	1706107	1706118	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018514	CACGCA	2	12	1768094	1768105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018514	CCGGCC	2	12	1782332	1782343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_018514	CGGAAC	2	12	1786126	1786137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018514	TCGACG	2	12	1786295	1786306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018514	TCGATT	2	12	1796240	1796251	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_018514	GCGCGG	2	12	1812858	1812869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018514	CAGCGG	2	12	1822718	1822729	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018514	CGAGTC	2	12	1837748	1837759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018514	CCCGCG	2	12	1853760	1853771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018514	GCGGGA	3	18	1854495	1854512	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018514	GTTTGT	2	12	1882672	1882683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018514	GCCGGC	2	12	1885413	1885424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018514	CCGGGC	2	12	1889824	1889835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_018514	ATTACG	2	12	1914721	1914732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018514	CCGGCG	2	12	1930350	1930361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018514	GATCGG	2	12	1979813	1979824	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_018514	CCCGCT	2	12	1979921	1979932	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_018514	TCCGGT	2	12	1987473	1987484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018514	TGCATA	2	12	2034054	2034065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018514	GGGCCG	2	12	2034092	2034103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018514	CCGGGC	2	12	2049012	2049023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018514	CTGGAA	2	12	2049054	2049065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018514	TGCGCG	2	12	2062239	2062250	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018514	CGTTTG	2	12	2064625	2064636	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018514	TCGCGC	2	12	2086282	2086293	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018514	GCGCCC	2	12	2088954	2088965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018514	GCGTGA	2	12	2099511	2099522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018514	GCCGGC	2	12	2100562	2100573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018514	GTCGTG	3	18	2139999	2140016	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018514	CCGCGT	3	18	2140018	2140035	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018514	CGTGTT	2	12	2153270	2153281	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018514	GCGCGG	2	12	2198286	2198297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018514	GATGCG	2	12	2270286	2270297	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018514	CGGCGC	2	12	2317005	2317016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018514	ACCGGC	2	12	2318307	2318318	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_018514	CCGCCC	2	12	2349909	2349920	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
118	NC_018514	TGCGCG	2	12	2351704	2351715	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018514	TGCCGC	2	12	2358974	2358985	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018514	ACAGGA	2	12	2368147	2368158	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_018514	TCCGGC	2	12	2391138	2391149	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018514	TTTCCG	2	12	2435119	2435130	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018514	GCCCGC	2	12	2436305	2436316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_018514	CCGGCC	2	12	2472511	2472522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_018514	CCCAAC	2	12	2494310	2494321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_018514	GCACGC	2	12	2495715	2495726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018514	CGGACG	2	12	2563498	2563509	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018514	GTCTGT	2	12	2582307	2582318	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_018514	GCCCCG	2	12	2584983	2584994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_018514	CCCTCT	2	12	2603564	2603575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_018514	TGTCGA	2	12	2616027	2616038	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_018514	CATCGT	2	12	2616445	2616456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018514	ATATTT	2	12	2630363	2630374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018514	TGCGGT	2	12	2650004	2650015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_018514	ACGCGA	2	12	2708570	2708581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018514	GCCGCG	2	12	2709210	2709221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018514	GCGCGT	2	12	2714654	2714665	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018514	GCCGGT	2	12	2740060	2740071	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018514	ACGACA	2	12	2763067	2763078	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018514	CTGCGC	2	12	2777793	2777804	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018514	CCGGCC	2	12	2813463	2813474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_018514	ACAGGC	2	12	2816223	2816234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018514	TCGGCG	2	12	2819705	2819716	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018514	TGCGGA	2	12	2820589	2820600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_018514	CGCGGG	2	12	2839304	2839315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018514	GGGCCG	2	12	2843840	2843851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018514	GGAAAG	2	12	2855190	2855201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018514	CGTTGC	2	12	2866681	2866692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_018514	GCTAAA	2	12	2873490	2873501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_018514	GTCTTC	2	12	2908955	2908966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_018514	GATACG	2	12	2926645	2926656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_018514	TTCGTC	2	12	2929517	2929528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_018514	TCGAAT	2	12	2932861	2932872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_018514	CGCTGC	2	12	2980206	2980217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
155	NC_018514	ACGGGA	2	12	2989175	2989186	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.