MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia cepacia GG4 chromosome 1

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018513	TTTTTC	2	12	5444	5455	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018513	CTCCTT	2	12	6932	6943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018513	ATTTTC	2	12	23973	23984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018513	CTGCGC	2	12	47037	47048	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018513	GAATCT	2	12	66401	66412	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018513	CTTTCC	2	12	71038	71049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_018513	GTTGCC	2	12	109635	109646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018513	GCGCGG	2	12	208727	208738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018513	GATGCC	2	12	226400	226411	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018513	GCGGGC	2	12	247253	247264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018513	CGTTCG	2	12	296993	297004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018513	ACGCAA	2	12	325727	325738	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018513	GCCCGC	2	12	362812	362823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_018513	GCGGGC	2	12	366376	366387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018513	CGGCCG	2	12	397966	397977	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018513	CGGCCG	2	12	398203	398214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018513	GCGCCG	2	12	429236	429247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018513	GATGCA	2	12	439186	439197	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018513	CGTTCG	2	12	442427	442438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018513	CGGCCG	2	12	459193	459204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018513	TCGCGC	2	12	486108	486119	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018513	GTTCTC	5	30	503013	503042	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_018513	GAGGGC	2	12	522260	522271	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018513	CGATGC	2	12	574728	574739	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018513	CCTGTC	2	12	630689	630700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018513	GGTCCG	2	12	652923	652934	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018513	CGATTT	2	12	694767	694778	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_018513	TGCGGA	2	12	697786	697797	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018513	TCCGCT	2	12	702965	702976	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018513	AGAAAA	2	12	704814	704825	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018513	CGGTGG	2	12	742080	742091	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018513	GGCGCT	2	12	775598	775609	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018513	GCCAGT	2	12	801470	801481	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018513	GCCGGT	2	12	801482	801493	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018513	GCCAGT	12	72	801494	801565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018513	GGGCAG	2	12	819739	819750	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018513	TGGCGC	2	12	826025	826036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018513	GTGCCG	2	12	835433	835444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018513	CAACTG	2	12	841553	841564	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018513	TTCGAA	2	12	843141	843152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018513	CGCGCA	2	12	887481	887492	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018513	CCGGCC	2	12	903863	903874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018513	CGGCCC	2	12	964797	964808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018513	CGCCAT	2	12	989483	989494	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018513	AAAAAG	2	12	997324	997335	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018513	GCTTCG	2	12	997445	997456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018513	ACGGCA	2	12	1002574	1002585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018513	GGATGC	2	12	1005912	1005923	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_018513	GCCTGC	2	12	1021006	1021017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018513	CGCGGG	2	12	1065921	1065932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018513	CGGGTA	2	12	1076402	1076413	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018513	CCGGGC	2	12	1103268	1103279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018513	TGCCGC	4	24	1125185	1125208	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018513	TTCAAG	2	12	1160439	1160450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_018513	GTGTCG	2	12	1168605	1168616	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_018513	CGGCCG	2	12	1196004	1196015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018513	GTGCCC	2	12	1235358	1235369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018513	TCCGAT	2	12	1265262	1265273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018513	TGCCGG	2	12	1290356	1290367	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018513	CCATTC	2	12	1316033	1316044	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018513	AACGAG	2	12	1323165	1323176	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_018513	ACATCG	2	12	1347910	1347921	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018513	CCGGCC	2	12	1382513	1382524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018513	CATTTC	2	12	1388922	1388933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018513	GCGCCC	2	12	1442078	1442089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_018513	TGATGC	2	12	1465502	1465513	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_018513	GGCGAT	2	12	1466580	1466591	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_018513	TCGCGC	2	12	1481925	1481936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018513	CGAGCC	2	12	1508720	1508731	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_018513	CGTTTC	2	12	1515128	1515139	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018513	GCGTCG	2	12	1581321	1581332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018513	GCCGCT	2	12	1583966	1583977	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018513	GTGTCG	2	12	1599088	1599099	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018513	GCCGGG	2	12	1645926	1645937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018513	CTCCCG	2	12	1673558	1673569	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018513	GCCGGG	2	12	1703174	1703185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018513	AGTGCC	2	12	1708182	1708193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018513	ACGTTC	2	12	1731541	1731552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018513	CCGCAA	2	12	1735927	1735938	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018513	AGCGGC	2	12	1735956	1735967	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_018513	GGCGCT	2	12	1744870	1744881	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_018513	GCGCCG	2	12	1769730	1769741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018513	GCGCCG	2	12	1793997	1794008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_018513	CCTAAT	2	12	1824395	1824406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018513	ACACCA	2	12	1834773	1834784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018513	CGGCCG	2	12	1838251	1838262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018513	GCCGCG	2	12	1839320	1839331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018513	CGGGCC	2	12	1849148	1849159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018513	CGTTGC	2	12	1857942	1857953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018513	GCCGTC	2	12	1859962	1859973	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_018513	CGCGCC	2	12	1893351	1893362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018513	GTGCAT	2	12	1981737	1981748	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_018513	CCGCGG	2	12	2008484	2008495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018513	CAGTTC	2	12	2013182	2013193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018513	CAGGTA	2	12	2013248	2013259	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018513	ACCGCA	2	12	2045497	2045508	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018513	TCCGCA	2	12	2057009	2057020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018513	GCTCAC	2	12	2058246	2058257	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018513	GGCGCG	2	12	2105965	2105976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018513	GGGATC	2	12	2113860	2113871	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018513	AAATCG	2	12	2172009	2172020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018513	TCGAAA	2	12	2257709	2257720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_018513	GCCGAA	8	48	2285808	2285855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018513	TAGCGG	2	12	2286698	2286709	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_018513	GCGCGG	2	12	2289041	2289052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018513	CATTGC	2	12	2336004	2336015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018513	ACTTCC	2	12	2380189	2380200	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018513	CCGCGC	2	12	2386451	2386462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018513	GCACCG	2	12	2396846	2396857	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_018513	AAAGCC	2	12	2416750	2416761	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018513	GCCGTG	2	12	2434929	2434940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018513	TTCATC	2	12	2436336	2436347	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018513	CATTCC	2	12	2498836	2498847	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018513	TGCAGG	2	12	2524289	2524300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018513	TTTCCG	2	12	2545911	2545922	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018513	CACGTT	2	12	2581753	2581764	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018513	ACAATC	2	12	2608420	2608431	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018513	AGAAAA	2	12	2610427	2610438	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018513	CCTGCA	2	12	2610729	2610740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018513	TGCGGC	2	12	2615991	2616002	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018513	TTTTCG	2	12	2617542	2617553	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018513	ACAAAA	2	12	2631966	2631977	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018513	CGTACC	2	12	2637514	2637525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018513	GCGCAA	2	12	2642247	2642258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_018513	CGGCAC	2	12	2647947	2647958	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018513	CAGCGC	3	18	2731968	2731985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018513	CATCCG	2	12	2737775	2737786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018513	GCGATC	2	12	2740214	2740225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018513	CCGCTT	2	12	2747949	2747960	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_018513	CGCGTG	2	12	2770367	2770378	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_018513	CACCGC	2	12	2771234	2771245	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_018513	GTGCAG	2	12	2779082	2779093	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_018513	GACGGC	2	12	2782385	2782396	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018513	GCGGCC	2	12	2802327	2802338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_018513	ATCGCC	2	12	2852350	2852361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018513	GCGTCG	4	24	2924916	2924939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018513	CGATTT	2	12	2948102	2948113	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_018513	CGCGAT	2	12	3010366	3010377	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018513	CGAAGG	2	12	3019014	3019025	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_018513	GCGCCC	2	12	3091444	3091455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_018513	CGAATC	2	12	3114570	3114581	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018513	CGTCGC	2	12	3115297	3115308	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018513	CGTGCG	2	12	3147996	3148007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018513	TCCTGC	2	12	3173857	3173868	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_018513	GGGCCG	2	12	3198411	3198422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018513	AGCGTT	2	12	3250815	3250826	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_018513	CCTGGC	2	12	3269055	3269066	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018513	GGAGGC	2	12	3393466	3393477	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_018513	CAAAAA	2	12	3429447	3429458	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.