MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p06

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018512	CAA	2	6	243	248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018512	ATT	2	6	285	290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018512	ATA	2	6	325	330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018512	GAG	2	6	372	377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018512	TTC	2	6	671	676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379817
6	NC_018512	TTG	2	6	700	705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379817
7	NC_018512	ATG	2	6	706	711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379817
8	NC_018512	AAT	2	6	852	857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379817
9	NC_018512	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379817
10	NC_018512	ATT	2	6	989	994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379817
11	NC_018512	CAT	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018512	GTA	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018512	GTT	2	6	1310	1315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018512	TTC	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018512	TTC	2	6	1486	1491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018512	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018512	AAT	2	6	1685	1690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018512	CAA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018512	CTT	2	6	1739	1744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018512	TAT	2	6	1878	1883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018512	TTC	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018512	TAA	2	6	2182	2187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
23	NC_018512	TCC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379818
24	NC_018512	AAG	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379818
25	NC_018512	ACC	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379818
26	NC_018512	CAG	2	6	2349	2354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379818
27	NC_018512	TGG	3	9	2683	2691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379818
28	NC_018512	TGG	3	9	2722	2730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379818
29	NC_018512	GCC	2	6	2767	2772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434379818
30	NC_018512	TAA	2	6	3052	3057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
31	NC_018512	TGT	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379818
32	NC_018512	ACT	3	9	3131	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379818
33	NC_018512	CAA	2	6	3192	3197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379818
34	NC_018512	TAT	2	6	3206	3211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379818
35	NC_018512	TAA	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379818
36	NC_018512	ATG	2	6	3408	3413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379818
37	NC_018512	TAA	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018512	ATT	2	6	3530	3535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018512	ACA	3	9	3550	3558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018512	CGC	2	6	3618	3623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018512	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018512	GTC	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018512	AAC	2	6	4251	4256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018512	GAA	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018512	TCA	2	6	4401	4406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018512	TGG	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018512	CAA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379819
48	NC_018512	TAG	2	6	4605	4610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379819
49	NC_018512	TAA	2	6	4650	4655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379819
50	NC_018512	AGT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379819
51	NC_018512	ATT	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379820
52	NC_018512	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379820
53	NC_018512	CAA	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
54	NC_018512	TGT	2	6	4925	4930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379820
55	NC_018512	GTA	2	6	4944	4949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379820
56	NC_018512	AGA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
57	NC_018512	AGA	2	6	5120	5125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
58	NC_018512	ACA	2	6	5177	5182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
59	NC_018512	AGT	2	6	5339	5344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379820
60	NC_018512	ACA	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
61	NC_018512	CAA	2	6	5418	5423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
62	NC_018512	GAA	2	6	5523	5528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
63	NC_018512	AAC	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379820
64	NC_018512	GAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
65	NC_018512	AGA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
66	NC_018512	ATA	2	6	5722	5727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379820
67	NC_018512	AGA	2	6	5735	5740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
68	NC_018512	AAT	2	6	5754	5759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379820
69	NC_018512	AGA	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
70	NC_018512	TTA	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379820
71	NC_018512	AAG	2	6	6002	6007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379820
72	NC_018512	ATT	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018512	TAC	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018512	TAA	2	6	6408	6413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018512	GTG	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018512	TGT	2	6	6458	6463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018512	GTC	2	6	6634	6639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018512	TGG	2	6	6640	6645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018512	AAT	2	6	6735	6740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018512	TAG	2	6	6818	6823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.