MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p03

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018510	TTCATA	2	12	1370	1381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379568
2	NC_018510	ATTTTA	2	12	2257	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379569
3	NC_018510	ATCAAA	2	12	3270	3281	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379571
4	NC_018510	TTTCTG	2	12	3985	3996	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434379572
5	NC_018510	ACTCCA	2	12	5647	5658	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434379574
6	NC_018510	TAGCAT	2	12	7411	7422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379575
7	NC_018510	TTTAAC	2	12	15405	15416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379582
8	NC_018510	TTTTTG	2	12	17431	17442	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434379584
9	NC_018510	CTTTTT	2	12	18035	18046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434379585
10	NC_018510	ATTGGC	2	12	18072	18083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379585
11	NC_018510	AATTTT	2	12	21865	21876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379588
12	NC_018510	TTTTCA	2	12	28462	28473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379596
13	NC_018510	ATCAAA	2	12	35903	35914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379602
14	NC_018510	TATTTA	2	12	40558	40569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379606
15	NC_018510	ATCAAT	2	12	41261	41272	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434379606
16	NC_018510	AACGTA	2	12	41921	41932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379607
17	NC_018510	CTGTTA	2	12	44646	44657	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379608
18	NC_018510	TTTGCA	2	12	45678	45689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379608
19	NC_018510	GCACAT	2	12	51930	51941	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434379611
20	NC_018510	CGTATT	2	12	54071	54082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379614
21	NC_018510	TAAATG	2	12	57046	57057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379617
22	NC_018510	AAAATT	2	12	57833	57844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379617
23	NC_018510	ACAATC	2	12	58972	58983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434379618
24	NC_018510	TTCTAT	2	12	59161	59172	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379618
25	NC_018510	CCTTTA	2	12	59196	59207	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379618
26	NC_018510	CACATC	2	12	59229	59240	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434379618
27	NC_018510	ATTCAT	2	12	59455	59466	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379618
28	NC_018510	TAAATT	2	12	62597	62608	50 %	50 %	0 %	0 %	434379620
29	NC_018510	TTTTCA	2	12	66850	66861	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379623
30	NC_018510	TCTTTT	2	12	68032	68043	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434379625
31	NC_018510	TTTAAC	2	12	68321	68332	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379625
32	NC_018510	ACGCCA	2	12	68560	68571	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	434379625
33	NC_018510	AATGAT	2	12	73679	73690	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379628
34	NC_018510	TTTGAT	2	12	74746	74757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379630
35	NC_018510	TTTTGT	2	12	75255	75266	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434379632
36	NC_018510	ACGATA	2	12	75802	75813	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379632
37	NC_018510	CTAATG	2	12	79457	79468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379635
38	NC_018510	ATCAAA	2	12	81442	81453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379636
39	NC_018510	TTTGAT	2	12	84887	84898	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379638
40	NC_018510	ATCCCA	2	12	87956	87967	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434379644
41	NC_018510	AACTAT	2	12	92778	92789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434379649
42	NC_018510	TCTGGT	2	12	95034	95045	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434379652
43	NC_018510	ATGGGA	2	12	96176	96187	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434379653
44	NC_018510	ATTGGT	2	12	96605	96616	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379653
45	NC_018510	CCAATC	2	12	98178	98189	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434379655
46	NC_018510	GTAATA	2	12	99418	99429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379656
47	NC_018510	AATACG	2	12	103204	103215	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379662
48	NC_018510	TACATG	2	12	105052	105063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379665
49	NC_018510	ATCAAA	2	12	107528	107539	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379669
50	NC_018510	ATATTT	2	12	109988	109999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379670
51	NC_018510	ATCAAA	2	12	120531	120542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379676
52	NC_018510	TTTAAC	2	12	132969	132980	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379687
53	NC_018510	TCATAT	2	12	137061	137072	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379691
54	NC_018510	TCATAT	2	12	137664	137675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379691
55	NC_018510	CTGTTA	2	12	138211	138222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379691
56	NC_018510	GTTCCA	2	12	138864	138875	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434379691
57	NC_018510	CATATC	2	12	139516	139527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379691
58	NC_018510	ATCTTT	2	12	139796	139807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379691
59	NC_018510	TCCGTT	2	12	142182	142193	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434379691
60	NC_018510	CTATTC	2	12	145690	145701	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379693
61	NC_018510	GTTAAA	2	12	148243	148254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379694
62	NC_018510	AGAAAA	2	12	148486	148497	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434379694
63	NC_018510	AAGGAG	2	12	151039	151050	50 %	0 %	50 %	0 %	434379697
64	NC_018510	TAAATC	2	12	151442	151453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434379697
65	NC_018510	TTGTGC	2	12	152606	152617	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434379698
66	NC_018510	GAAAAA	2	12	153951	153962	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434379700
67	NC_018510	TTTTCC	2	12	157122	157133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379701
68	NC_018510	TGTTAA	2	12	159635	159646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434379704
69	NC_018510	ATATTT	2	12	163681	163692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379706
70	NC_018510	TATTTC	2	12	165361	165372	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379707
71	NC_018510	TGTATT	2	12	168303	168314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379709
72	NC_018510	CTACAT	2	12	168445	168456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379709
73	NC_018510	TCATTT	2	12	172847	172858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379715
74	NC_018510	TATGTT	2	12	176192	176203	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379721
75	NC_018510	CCATAA	2	12	176478	176489	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434379721
76	NC_018510	ACCAGA	2	12	176793	176804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434379722
77	NC_018510	TTTCTT	2	12	177609	177620	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434379722
78	NC_018510	TTCCAT	2	12	186529	186540	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379732
79	NC_018510	AATCCA	2	12	187852	187863	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434379733
80	NC_018510	GGTTGT	2	12	191198	191209	0 %	50 %	50 %	0 %	434379738
81	NC_018510	TGGTTG	2	12	191281	191292	0 %	50 %	50 %	0 %	434379738
82	NC_018510	ATTTTT	2	12	195127	195138	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434379742
83	NC_018510	TCATTT	2	12	199755	199766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379745
84	NC_018510	ATCCTT	2	12	199784	199795	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379745
85	NC_018510	ATATTT	2	12	209055	209066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.