MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p03

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018510	TGATA	2	10	2737	2746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018510	TTTAT	2	10	5073	5082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018510	ATATT	2	10	8985	8994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018510	AATAT	2	10	22964	22973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018510	TCTCA	2	10	40473	40482	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018510	AATTT	2	10	48846	48855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018510	CCATT	2	10	48917	48926	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_018510	TCCCC	2	10	49735	49744	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_018510	AAGAG	2	10	51393	51402	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018510	ATTCA	2	10	52880	52889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018510	TTATT	2	10	52980	52989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018510	CTTTT	2	10	53652	53661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018510	AATTT	2	10	60387	60396	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018510	TAAAG	2	10	61427	61436	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018510	TTATT	2	10	61516	61525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018510	AAAAT	2	10	61844	61853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018510	ATATT	2	10	64579	64588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018510	AAATA	2	10	64715	64724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018510	CAAAA	2	10	67723	67732	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018510	TTTTG	2	10	67756	67765	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018510	AATTC	2	10	72316	72325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018510	AATAT	2	10	72461	72470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018510	CAAAA	2	10	77054	77063	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018510	TAGGT	2	10	78761	78770	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018510	TTCAC	2	10	81971	81980	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_018510	TATAA	2	10	87238	87247	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018510	TATAC	2	10	87263	87272	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018510	AAGTA	2	10	98385	98394	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018510	CTTTT	2	10	98924	98933	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_018510	TGATA	2	10	98952	98961	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018510	TAGAT	2	10	100096	100105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018510	TATGA	2	10	100229	100238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018510	TTTAT	2	10	103604	103613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018510	GAAAA	2	10	103625	103634	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018510	TTCCT	2	10	113190	113199	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018510	AATTT	2	10	113242	113251	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018510	GCTTT	2	10	113481	113490	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018510	ATTAA	2	10	121523	121532	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018510	TTTTA	2	10	121608	121617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018510	TAATT	2	10	121742	121751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018510	ATCTA	2	10	124680	124689	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018510	TCAAG	2	10	125574	125583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018510	TTTAC	2	10	126924	126933	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018510	CAAGA	2	10	126972	126981	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018510	TTTCA	2	10	127274	127283	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018510	TGTTT	2	10	131243	131252	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018510	TACGT	2	10	133763	133772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018510	AGTAA	2	10	147392	147401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018510	ACCAT	2	10	149150	149159	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018510	TCCAT	2	10	149725	149734	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_018510	AGGTT	2	10	152762	152771	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018510	ATGGT	2	10	156556	156565	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018510	TCTAA	2	10	158102	158111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_018510	ATTAA	2	10	160098	160107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018510	TTTTG	2	10	160572	160581	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018510	ACATA	2	10	166688	166697	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_018510	TCTTT	2	10	172149	172158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018510	TTATA	2	10	172291	172300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018510	TAAAA	2	10	174524	174533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018510	CTTCA	2	10	190534	190543	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018510	TCCCT	2	10	194007	194016	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_018510	CAAAA	2	10	196365	196374	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018510	TCTTA	2	10	198210	198219	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018510	GGCGG	2	10	198353	198362	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018510	TAATA	2	10	200074	200083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018510	TTTAA	2	10	200201	200210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018510	TTTTG	2	10	205093	205102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018510	TTGAA	2	10	206963	206972	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018510	TCTTG	2	10	210026	210035	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_018510	TACAA	2	10	214831	214840	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018510	TAACA	2	10	214915	214924	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018510	TGTTT	2	10	218522	218531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018510	ATTCC	2	10	221428	221437	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_018510	AGGTA	2	10	221556	221565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.