MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p03

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018510	ATATT	2	10	2401	2410	40 %	60 %	0 %	0 %	434379569
2	NC_018510	CCAGC	2	10	7346	7355	20 %	0 %	20 %	60 %	434379575
3	NC_018510	CCAAT	2	10	8111	8120	40 %	20 %	0 %	40 %	434379575
4	NC_018510	CTCTT	2	10	10353	10362	0 %	60 %	0 %	40 %	434379578
5	NC_018510	TCCCA	2	10	10907	10916	20 %	20 %	0 %	60 %	434379578
6	NC_018510	AGTTG	2	10	11487	11496	20 %	40 %	40 %	0 %	434379579
7	NC_018510	CTTTT	2	10	15161	15170	0 %	80 %	0 %	20 %	434379582
8	NC_018510	AAAGA	2	10	15777	15786	80 %	0 %	20 %	0 %	434379582
9	NC_018510	AGTAC	2	10	15846	15855	40 %	20 %	20 %	20 %	434379582
10	NC_018510	TCACT	2	10	19635	19644	20 %	40 %	0 %	40 %	434379586
11	NC_018510	TGAAA	2	10	21554	21563	60 %	20 %	20 %	0 %	434379588
12	NC_018510	AAGTA	2	10	21929	21938	60 %	20 %	20 %	0 %	434379588
13	NC_018510	TTTTA	2	10	27331	27340	20 %	80 %	0 %	0 %	434379593
14	NC_018510	GAATC	2	10	27341	27350	40 %	20 %	20 %	20 %	434379593
15	NC_018510	TCTTT	2	10	28966	28975	0 %	80 %	0 %	20 %	434379596
16	NC_018510	CTTCA	2	10	29896	29905	20 %	40 %	0 %	40 %	434379597
17	NC_018510	ATTAT	2	10	30254	30263	40 %	60 %	0 %	0 %	434379597
18	NC_018510	TATTT	2	10	30367	30376	20 %	80 %	0 %	0 %	434379597
19	NC_018510	CGTGC	2	10	31356	31365	0 %	20 %	40 %	40 %	434379598
20	NC_018510	AAATC	2	10	32497	32506	60 %	20 %	0 %	20 %	434379599
21	NC_018510	GATAG	2	10	33482	33491	40 %	20 %	40 %	0 %	434379600
22	NC_018510	ATGGA	2	10	34000	34009	40 %	20 %	40 %	0 %	434379601
23	NC_018510	AGAAA	2	10	34896	34905	80 %	0 %	20 %	0 %	434379601
24	NC_018510	AGGTA	2	10	36676	36685	40 %	20 %	40 %	0 %	434379603
25	NC_018510	AATGT	2	10	37294	37303	40 %	40 %	20 %	0 %	434379603
26	NC_018510	TAAAT	2	10	37541	37550	60 %	40 %	0 %	0 %	434379603
27	NC_018510	AAAAG	2	10	38486	38495	80 %	0 %	20 %	0 %	434379604
28	NC_018510	ATTTA	2	10	41330	41339	40 %	60 %	0 %	0 %	434379606
29	NC_018510	TTCTT	2	10	41396	41405	0 %	80 %	0 %	20 %	434379606
30	NC_018510	TTGCA	2	10	44960	44969	20 %	40 %	20 %	20 %	434379608
31	NC_018510	GTTAA	2	10	45564	45573	40 %	40 %	20 %	0 %	434379608
32	NC_018510	ATTTT	2	10	48019	48028	20 %	80 %	0 %	0 %	434379609
33	NC_018510	TCTTT	2	10	51760	51769	0 %	80 %	0 %	20 %	434379611
34	NC_018510	GTAAA	2	10	52057	52066	60 %	20 %	20 %	0 %	434379611
35	NC_018510	ATTAA	2	10	52220	52229	60 %	40 %	0 %	0 %	434379611
36	NC_018510	ATGTT	2	10	56190	56199	20 %	60 %	20 %	0 %	434379616
37	NC_018510	TTATT	2	10	56241	56250	20 %	80 %	0 %	0 %	434379616
38	NC_018510	CTATT	2	10	57472	57481	20 %	60 %	0 %	20 %	434379617
39	NC_018510	AATAT	2	10	57551	57560	60 %	40 %	0 %	0 %	434379617
40	NC_018510	AGTGA	2	10	58935	58944	40 %	20 %	40 %	0 %	434379618
41	NC_018510	GATTT	2	10	62999	63008	20 %	60 %	20 %	0 %	434379620
42	NC_018510	TATAT	2	10	63483	63492	40 %	60 %	0 %	0 %	434379621
43	NC_018510	ACAGA	2	10	66889	66898	60 %	0 %	20 %	20 %	434379623
44	NC_018510	AAATA	2	10	72154	72163	80 %	20 %	0 %	0 %	434379626
45	NC_018510	ATATG	2	10	74530	74539	40 %	40 %	20 %	0 %	434379630
46	NC_018510	CATAT	2	10	81660	81669	40 %	40 %	0 %	20 %	434379636
47	NC_018510	ACAAT	2	10	83163	83172	60 %	20 %	0 %	20 %	434379637
48	NC_018510	ATAAA	2	10	83261	83270	80 %	20 %	0 %	0 %	434379637
49	NC_018510	GTAGT	2	10	83966	83975	20 %	40 %	40 %	0 %	434379637
50	NC_018510	AAAAT	2	10	84230	84239	80 %	20 %	0 %	0 %	434379637
51	NC_018510	ATATG	2	10	84671	84680	40 %	40 %	20 %	0 %	434379638
52	NC_018510	CGATT	2	10	87120	87129	20 %	40 %	20 %	20 %	434379642
53	NC_018510	TTTGA	2	10	90391	90400	20 %	60 %	20 %	0 %	434379647
54	NC_018510	TAAAT	2	10	90527	90536	60 %	40 %	0 %	0 %	434379647
55	NC_018510	CATGT	2	10	90998	91007	20 %	40 %	20 %	20 %	434379648
56	NC_018510	CCATT	2	10	91039	91048	20 %	40 %	0 %	40 %	434379648
57	NC_018510	CACTT	2	10	92061	92070	20 %	40 %	0 %	40 %	434379649
58	NC_018510	AAAAT	2	10	92834	92843	80 %	20 %	0 %	0 %	434379649
59	NC_018510	TCCCA	2	10	100994	101003	20 %	20 %	0 %	60 %	434379658
60	NC_018510	TTCAT	2	10	101028	101037	20 %	60 %	0 %	20 %	434379658
61	NC_018510	AAAAT	2	10	104992	105001	80 %	20 %	0 %	0 %	434379665
62	NC_018510	GGAAT	2	10	106567	106576	40 %	20 %	40 %	0 %	434379667
63	NC_018510	CATAT	2	10	107746	107755	40 %	40 %	0 %	20 %	434379669
64	NC_018510	ACCCT	2	10	110195	110204	20 %	20 %	0 %	60 %	434379670
65	NC_018510	ATATA	2	10	116596	116605	60 %	40 %	0 %	0 %	434379672
66	NC_018510	AATGA	2	10	119474	119483	60 %	20 %	20 %	0 %	434379674
67	NC_018510	AAAAC	2	10	120084	120093	80 %	0 %	0 %	20 %	434379675
68	NC_018510	CGTTT	2	10	122109	122118	0 %	60 %	20 %	20 %	434379677
69	NC_018510	TAAAT	2	10	125184	125193	60 %	40 %	0 %	0 %	434379678
70	NC_018510	ATATG	2	10	128412	128421	40 %	40 %	20 %	0 %	434379681
71	NC_018510	TTATC	2	10	131359	131368	20 %	60 %	0 %	20 %	434379685
72	NC_018510	CTTTT	2	10	132725	132734	0 %	80 %	0 %	20 %	434379687
73	NC_018510	AAAGA	2	10	133341	133350	80 %	0 %	20 %	0 %	434379687
74	NC_018510	AGTAC	2	10	133410	133419	40 %	20 %	20 %	20 %	434379687
75	NC_018510	AAATA	2	10	134709	134718	80 %	20 %	0 %	0 %	434379688
76	NC_018510	TTGGT	2	10	137090	137099	0 %	60 %	40 %	0 %	434379691
77	NC_018510	CTGTT	2	10	137155	137164	0 %	60 %	20 %	20 %	434379691
78	NC_018510	CGTTT	2	10	137503	137512	0 %	60 %	20 %	20 %	434379691
79	NC_018510	CTTTA	2	10	139676	139685	20 %	60 %	0 %	20 %	434379691
80	NC_018510	ATTTA	2	10	145403	145412	40 %	60 %	0 %	0 %	434379692
81	NC_018510	GTACT	2	10	147804	147813	20 %	40 %	20 %	20 %	434379694
82	NC_018510	TCTTT	2	10	147873	147882	0 %	80 %	0 %	20 %	434379694
83	NC_018510	ATATT	2	10	148228	148237	40 %	60 %	0 %	0 %	434379694
84	NC_018510	AAATA	2	10	150345	150354	80 %	20 %	0 %	0 %	434379696
85	NC_018510	TTCAT	2	10	150481	150490	20 %	60 %	0 %	20 %	434379696
86	NC_018510	CTTTT	2	10	151352	151361	0 %	80 %	0 %	20 %	434379697
87	NC_018510	TTTAT	2	10	151593	151602	20 %	80 %	0 %	0 %	434379697
88	NC_018510	GATAC	2	10	153574	153583	40 %	20 %	20 %	20 %	434379700
89	NC_018510	ATTCC	2	10	154306	154315	20 %	40 %	0 %	40 %	434379700
90	NC_018510	ATTAA	2	10	155228	155237	60 %	40 %	0 %	0 %	434379700
91	NC_018510	CATTC	2	10	157804	157813	20 %	40 %	0 %	40 %	434379703
92	NC_018510	TAGAT	2	10	158588	158597	40 %	40 %	20 %	0 %	434379704
93	NC_018510	AGTAT	2	10	159150	159159	40 %	40 %	20 %	0 %	434379704
94	NC_018510	CAATC	2	10	161706	161715	40 %	20 %	0 %	40 %	434379705
95	NC_018510	AATGC	2	10	162654	162663	40 %	20 %	20 %	20 %	434379705
96	NC_018510	ATTTG	2	10	166502	166511	20 %	60 %	20 %	0 %	434379707
97	NC_018510	TTCCT	2	10	166573	166582	0 %	60 %	0 %	40 %	434379707
98	NC_018510	TCATG	2	10	169780	169789	20 %	40 %	20 %	20 %	434379711
99	NC_018510	ATTTA	2	10	172695	172704	40 %	60 %	0 %	0 %	434379715
100	NC_018510	GATTT	2	10	172870	172879	20 %	60 %	20 %	0 %	434379715
101	NC_018510	AAATA	2	10	173643	173652	80 %	20 %	0 %	0 %	434379716
102	NC_018510	CTTTT	2	10	176277	176286	0 %	80 %	0 %	20 %	434379721
103	NC_018510	TTTCT	2	10	176430	176439	0 %	80 %	0 %	20 %	434379721
104	NC_018510	CTTTC	2	10	179225	179234	0 %	60 %	0 %	40 %	434379724
105	NC_018510	TTTCC	2	10	182448	182457	0 %	60 %	0 %	40 %	434379726
106	NC_018510	CAATT	2	10	182735	182744	40 %	40 %	0 %	20 %	434379726
107	NC_018510	TGTAA	2	10	183276	183285	40 %	40 %	20 %	0 %	434379726
108	NC_018510	GTTTT	2	10	185505	185514	0 %	80 %	20 %	0 %	434379729
109	NC_018510	TTCCT	2	10	185559	185568	0 %	60 %	0 %	40 %	434379729
110	NC_018510	ATTTC	2	10	185831	185840	20 %	60 %	0 %	20 %	434379730
111	NC_018510	ATAAA	2	10	186203	186212	80 %	20 %	0 %	0 %	434379731
112	NC_018510	ATCTT	2	10	189454	189463	20 %	60 %	0 %	20 %	434379733
113	NC_018510	TATCT	2	10	190438	190447	20 %	60 %	0 %	20 %	434379735
114	NC_018510	GAATA	2	10	190889	190898	60 %	20 %	20 %	0 %	434379737
115	NC_018510	TTGAT	2	10	190974	190983	20 %	60 %	20 %	0 %	434379737
116	NC_018510	TTTCA	2	10	192466	192475	20 %	60 %	0 %	20 %	434379738
117	NC_018510	AAATC	2	10	196819	196828	60 %	20 %	0 %	20 %	434379743
118	NC_018510	TTTTA	2	10	199604	199613	20 %	80 %	0 %	0 %	434379745
119	NC_018510	TTATC	2	10	204181	204190	20 %	60 %	0 %	20 %	434379748
120	NC_018510	AAGAA	2	10	204210	204219	80 %	0 %	20 %	0 %	434379748
121	NC_018510	AAATT	2	10	204547	204556	60 %	40 %	0 %	0 %	434379748
122	NC_018510	TTTCT	2	10	205206	205215	0 %	80 %	0 %	20 %	434379750
123	NC_018510	TCTCT	2	10	205681	205690	0 %	60 %	0 %	40 %	434379750
124	NC_018510	TAACA	2	10	206201	206210	60 %	20 %	0 %	20 %	434379751
125	NC_018510	CTTTC	2	10	208945	208954	0 %	60 %	0 %	40 %	434379754
126	NC_018510	CAAAA	2	10	209476	209485	80 %	0 %	0 %	20 %	434379756
127	NC_018510	AGGAG	2	10	210962	210971	40 %	0 %	60 %	0 %	434379757
128	NC_018510	GAAAC	2	10	211806	211815	60 %	0 %	20 %	20 %	434379758
129	NC_018510	TAAAC	2	10	211865	211874	60 %	20 %	0 %	20 %	434379758
130	NC_018510	GGAAT	2	10	214176	214185	40 %	20 %	40 %	0 %	434379761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.