MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p03

Total Repeats: 240

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018510	ACAA	2	8	403	410	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018510	TTTA	2	8	2683	2690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018510	CTTC	2	8	4413	4420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018510	ACAA	2	8	4579	4586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018510	ACAT	2	8	5104	5111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018510	ATTG	2	8	5179	5186	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018510	TAAT	2	8	5263	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018510	ACAA	2	8	6874	6881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018510	TATT	2	8	7067	7074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018510	ACAT	2	8	11007	11014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018510	TACA	2	8	11041	11048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018510	AGTA	2	8	12039	12046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018510	ATCT	2	8	12080	12087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018510	GTTT	2	8	13562	13569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018510	TGTT	2	8	13772	13779	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018510	GGAT	2	8	14533	14540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018510	AAGA	2	8	16110	16117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018510	AAAC	2	8	17071	17078	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018510	AGTG	2	8	20950	20957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018510	GTAT	2	8	22520	22527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018510	ATTC	2	8	23002	23009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018510	TGAA	2	8	23065	23072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018510	CTAT	2	8	23265	23272	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018510	ATTC	2	8	23354	23361	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018510	CATT	2	8	23406	23413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018510	CTTT	2	8	23460	23467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018510	AGAT	2	8	23541	23548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018510	TTTC	2	8	23887	23894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018510	ATAG	2	8	24126	24133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018510	ACAA	2	8	24490	24497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018510	ATGA	2	8	25337	25344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018510	TATT	2	8	25426	25433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018510	TTAT	2	8	25445	25452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018510	ATTT	2	8	29359	29366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018510	TTGG	2	8	33910	33917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018510	CACT	2	8	35455	35462	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018510	ATTT	2	8	35520	35527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018510	TATT	2	8	36539	36546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018510	GTAA	2	8	40414	40421	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018510	AGAA	2	8	40426	40433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018510	AATT	2	8	42135	42142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018510	CATA	2	8	46412	46419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018510	AAAT	2	8	46626	46633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018510	CATA	2	8	46822	46829	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018510	AAAT	2	8	47470	47477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018510	ATAA	2	8	48344	48351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018510	TTAA	2	8	48528	48535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018510	TTAT	3	12	48536	48547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018510	GTTT	2	8	49860	49867	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018510	GAAT	2	8	50002	50009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018510	TCTA	2	8	50056	50063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018510	TTTA	2	8	50155	50162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018510	TTTA	2	8	52786	52793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018510	AAAC	2	8	53018	53025	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018510	ATTT	2	8	55739	55746	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018510	ATTA	2	8	56644	56651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018510	ACTC	2	8	56869	56876	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018510	ATTC	2	8	58832	58839	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018510	TCTT	2	8	59528	59535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018510	ATAC	2	8	59779	59786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018510	TCAT	2	8	59825	59832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018510	CATA	2	8	60173	60180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018510	AATT	2	8	60325	60332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018510	TATT	2	8	61257	61264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018510	TACC	2	8	61303	61310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018510	ATGT	2	8	61664	61671	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018510	TTAT	2	8	62127	62134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018510	GTAT	2	8	62184	62191	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018510	TTAT	2	8	62491	62498	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018510	ATAA	2	8	62510	62517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018510	ATAC	2	8	63030	63037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018510	CCAA	2	8	63082	63089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018510	CTAC	2	8	63254	63261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_018510	TTAT	2	8	64607	64614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018510	TAAC	2	8	65030	65037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_018510	CATA	2	8	65137	65144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018510	AAAG	2	8	65189	65196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018510	AAGA	2	8	65767	65774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018510	TACT	2	8	65949	65956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018510	TATT	2	8	66119	66126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018510	TTAC	2	8	66189	66196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018510	TAAT	2	8	67157	67164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018510	TAAA	2	8	67642	67649	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018510	AGCA	2	8	67863	67870	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018510	TCAT	2	8	69707	69714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_018510	TGTA	2	8	69733	69740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018510	ATTT	2	8	70372	70379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018510	GTTT	2	8	72216	72223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018510	TTTC	2	8	72689	72696	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018510	ATAC	2	8	73994	74001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018510	TCAA	2	8	76426	76433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018510	CAAA	2	8	76888	76895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_018510	TTTA	2	8	77162	77169	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018510	TAAA	2	8	77204	77211	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018510	TAAT	2	8	77423	77430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018510	GAAT	2	8	77688	77695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018510	TTTA	2	8	78462	78469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018510	AAAT	2	8	78605	78612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018510	AATT	2	8	78790	78797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018510	TAAA	2	8	80739	80746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018510	TCCG	2	8	80818	80825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018510	TCCT	2	8	81030	81037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018510	TCTT	2	8	82123	82130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018510	ATCT	2	8	82310	82317	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018510	AATA	2	8	85296	85303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018510	CCCT	2	8	88467	88474	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_018510	ATGT	2	8	89770	89777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018510	CTAT	2	8	93393	93400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018510	TTAT	2	8	93437	93444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018510	CATA	2	8	96830	96837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018510	TTCT	2	8	97791	97798	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018510	AGAT	2	8	97804	97811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018510	CCTT	2	8	98191	98198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018510	ATAC	2	8	100086	100093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018510	CTTG	2	8	100429	100436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018510	GTAT	2	8	100486	100493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018510	TTTC	2	8	101943	101950	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018510	AGGA	2	8	104069	104076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018510	CATG	2	8	105174	105181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018510	TAAA	2	8	105284	105291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018510	TTGT	2	8	105423	105430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018510	GATG	2	8	105521	105528	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018510	AAAC	2	8	106845	106852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018510	TCAT	2	8	112768	112775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_018510	TAAA	2	8	113282	113289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018510	TTTA	2	8	113570	113577	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018510	ATAA	2	8	113877	113884	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018510	ATTG	2	8	113908	113915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018510	TTTG	2	8	113947	113954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018510	TGTC	2	8	114182	114189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018510	TCTT	2	8	114548	114555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018510	TCCA	2	8	114938	114945	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018510	ATCA	2	8	115171	115178	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_018510	AGGA	2	8	115185	115192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018510	ATAG	2	8	117378	117385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018510	TCTT	2	8	119190	119197	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018510	TAAA	2	8	121322	121329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018510	CTAT	2	8	121922	121929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018510	ATAG	2	8	123674	123681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018510	TAAA	2	8	123706	123713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018510	ATTT	2	8	124549	124556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018510	AATG	2	8	126390	126397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018510	CAAA	2	8	126415	126422	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018510	GATC	2	8	127771	127778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018510	ATCT	2	8	128763	128770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_018510	AGGA	2	8	128771	128778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018510	TACT	2	8	129914	129921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018510	GTTT	2	8	130098	130105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018510	ATTT	2	8	130120	130127	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018510	AAAG	2	8	131175	131182	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018510	CGTT	2	8	131449	131456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018510	TAAT	2	8	131472	131479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018510	AAGA	2	8	133674	133681	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018510	CTAT	2	8	133949	133956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_018510	AAAT	2	8	134874	134881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.