MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	CATAGT	2	12	810	821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379281
2	NC_018509	TCGTTA	2	12	2951	2962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379282
3	NC_018509	ACCTGT	2	12	6417	6428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434379284
4	NC_018509	CAGATA	2	12	6680	6691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379284
5	NC_018509	CTTTTC	2	12	7062	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379285
6	NC_018509	TCTTAT	2	12	7625	7636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379286
7	NC_018509	TCCTCG	2	12	8671	8682	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	434379288
8	NC_018509	CTTCAT	2	12	26596	26607	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379293
9	NC_018509	TTACTT	2	12	34287	34298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379295
10	NC_018509	CTTATC	2	12	35283	35294	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379296
11	NC_018509	TGTTGA	2	12	37914	37925	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379298
12	NC_018509	TAATTC	2	12	37947	37958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379298
13	NC_018509	CAATAT	2	12	41174	41185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434379304
14	NC_018509	ATCCGC	2	12	44383	44394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434379305
15	NC_018509	CTCAAG	2	12	46087	46098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434379305
16	NC_018509	ACGTTG	2	12	47599	47610	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379305
17	NC_018509	TAGCAG	2	12	57005	57016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434379306
18	NC_018509	ACATCT	2	12	58090	58101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379307
19	NC_018509	GTATTG	2	12	58166	58177	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379307
20	NC_018509	AAGGAG	2	12	61121	61132	50 %	0 %	50 %	0 %	434379307
21	NC_018509	TCGCTT	2	12	63656	63667	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434379307
22	NC_018509	CATCTA	2	12	67210	67221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379312
23	NC_018509	TTTGGG	2	12	67374	67385	0 %	50 %	50 %	0 %	434379312
24	NC_018509	AGCTTC	2	12	68962	68973	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434379313
25	NC_018509	GTCTGA	2	12	70909	70920	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379315
26	NC_018509	TGAGCT	2	12	72212	72223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379317
27	NC_018509	TACGCC	2	12	74316	74327	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	434379319
28	NC_018509	GTTAAA	2	12	75572	75583	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379320
29	NC_018509	TACCTG	2	12	76026	76037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434379320
30	NC_018509	CTGAAA	2	12	78828	78839	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379322
31	NC_018509	AATCTA	2	12	87959	87970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434379330
32	NC_018509	CCACAA	2	12	90125	90136	50 %	0 %	0 %	50 %	434379332
33	NC_018509	AGAATT	2	12	91853	91864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379332
34	NC_018509	AAGCTG	2	12	92278	92289	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434379332
35	NC_018509	ATGAAT	2	12	93105	93116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379333
36	NC_018509	CATGAA	2	12	93536	93547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379333
37	NC_018509	CAACAG	2	12	95974	95985	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	434379335
38	NC_018509	AAGATA	2	12	102784	102795	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379348
39	NC_018509	TACAGT	2	12	103008	103019	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379349
40	NC_018509	TTGTGA	2	12	103028	103039	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379349
41	NC_018509	CCTATA	2	12	103357	103368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379350
42	NC_018509	AAAGAA	2	12	103468	103479	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434379350
43	NC_018509	GCGTAA	2	12	105577	105588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434379354
44	NC_018509	TAGTTG	2	12	110982	110993	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379361
45	NC_018509	AATCAA	2	12	111968	111979	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434379362
46	NC_018509	ACTCTT	2	12	114425	114436	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379366
47	NC_018509	AGGATA	2	12	115890	115901	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379367
48	NC_018509	TTTTAC	2	12	117401	117412	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379368
49	NC_018509	TTAACT	2	12	126499	126510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379379
50	NC_018509	CATTTA	2	12	128036	128047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379381
51	NC_018509	AGATGA	2	12	128953	128964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379381
52	NC_018509	TTCGAT	2	12	129134	129145	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379381
53	NC_018509	AAAAAC	2	12	129275	129286	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	434379381
54	NC_018509	TGATGG	2	12	130148	130159	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434379382
55	NC_018509	CTGTTG	2	12	131967	131978	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434379383
56	NC_018509	TAAGCG	2	12	138550	138561	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434379389
57	NC_018509	TTCAAT	2	12	142819	142830	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379395
58	NC_018509	TAGCTG	2	12	143534	143545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379397
59	NC_018509	CAGAAG	2	12	145527	145538	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434379399
60	NC_018509	GATTTT	2	12	148591	148602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379404
61	NC_018509	AATAAA	2	12	149534	149545	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434379405
62	NC_018509	CATTAC	2	12	152775	152786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379408
63	NC_018509	TATGAT	2	12	156937	156948	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434379410
64	NC_018509	AATCTA	2	12	159437	159448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434379412
65	NC_018509	GCTGTA	2	12	160081	160092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379414
66	NC_018509	GAAAAT	2	12	162849	162860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379418
67	NC_018509	TGAAAT	2	12	166184	166195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379420
68	NC_018509	AAGATG	2	12	166576	166587	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379420
69	NC_018509	GTTCAT	2	12	168572	168583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379424
70	NC_018509	AAAGGA	2	12	168631	168642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379424
71	NC_018509	GTAGAA	2	12	169165	169176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379425
72	NC_018509	TGGACT	2	12	169311	169322	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434379425
73	NC_018509	AAGAAA	2	12	171814	171825	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434379427
74	NC_018509	AGATGA	2	12	171875	171886	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379427
75	NC_018509	AGTATG	2	12	172090	172101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379427
76	NC_018509	AGACAG	2	12	175620	175631	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434379433
77	NC_018509	ATTTCA	2	12	177382	177393	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434379437
78	NC_018509	AATATA	2	12	180588	180599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379439
79	NC_018509	ACAGAA	2	12	182675	182686	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434379441
80	NC_018509	GGATTA	2	12	184537	184548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379442
81	NC_018509	AAAAAG	2	12	185732	185743	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434379445
82	NC_018509	TAAGAA	2	12	187452	187463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379448
83	NC_018509	TTCTTT	2	12	189683	189694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434379451
84	NC_018509	ATCTTC	2	12	190277	190288	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434379452
85	NC_018509	TCGCTT	2	12	191431	191442	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434379455
86	NC_018509	ATTTAG	2	12	192530	192541	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434379456
87	NC_018509	AGATGA	2	12	192993	193004	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379457
88	NC_018509	CGTAAT	2	12	193504	193515	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379457
89	NC_018509	TGTTGC	2	12	198334	198345	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434379468
90	NC_018509	CTGTTC	2	12	200611	200622	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	434379472
91	NC_018509	GATGAA	2	12	207382	207393	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434379482
92	NC_018509	TTCTTA	2	12	208540	208551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434379483
93	NC_018509	AATTGA	2	12	209449	209460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434379484
94	NC_018509	AAAAGA	2	12	209563	209574	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434379484
95	NC_018509	AAAAGC	2	12	210466	210477	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	434379485
96	NC_018509	TTATGG	2	12	210798	210809	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379486
97	NC_018509	GTTCTA	2	12	211053	211064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379487
98	NC_018509	GTACGA	2	12	212032	212043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434379488
99	NC_018509	TGTTGA	2	12	213985	213996	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434379491
100	NC_018509	TGAAAA	2	12	225882	225893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379505
101	NC_018509	ACAGAT	2	12	226510	226521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379508
102	NC_018509	TAAAAG	2	12	230788	230799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434379513
103	NC_018509	TTTTTG	2	12	232759	232770	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434379516
104	NC_018509	TTTAGT	2	12	233434	233445	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379517

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.