MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	TTAGG	2	10	1575	1584	20 %	40 %	40 %	0 %	434379281
2	NC_018509	AATTT	2	10	2222	2231	40 %	60 %	0 %	0 %	434379281
3	NC_018509	TCTGT	2	10	2769	2778	0 %	60 %	20 %	20 %	434379282
4	NC_018509	GAATA	2	10	3630	3639	60 %	20 %	20 %	0 %	434379282
5	NC_018509	AAAAT	2	10	7887	7896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018509	CTTAG	2	10	8362	8371	20 %	40 %	20 %	20 %	434379288
7	NC_018509	ATCGA	2	10	8703	8712	40 %	20 %	20 %	20 %	434379288
8	NC_018509	TGAAT	2	10	9423	9432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018509	TTGTA	2	10	10953	10962	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018509	GTGCT	2	10	13055	13064	0 %	40 %	40 %	20 %	434379289
11	NC_018509	AGCGA	2	10	13374	13383	40 %	0 %	40 %	20 %	434379289
12	NC_018509	AACAT	2	10	15388	15397	60 %	20 %	0 %	20 %	434379289
13	NC_018509	AATCC	2	10	16152	16161	40 %	20 %	0 %	40 %	434379289
14	NC_018509	TTAAT	2	10	17744	17753	40 %	60 %	0 %	0 %	434379289
15	NC_018509	TGATA	2	10	18739	18748	40 %	40 %	20 %	0 %	434379290
16	NC_018509	CATGA	2	10	21325	21334	40 %	20 %	20 %	20 %	434379290
17	NC_018509	AAATG	2	10	22573	22582	60 %	20 %	20 %	0 %	434379292
18	NC_018509	TCGAT	2	10	22718	22727	20 %	40 %	20 %	20 %	434379292
19	NC_018509	CATTT	2	10	23227	23236	20 %	60 %	0 %	20 %	434379292
20	NC_018509	GTTTT	2	10	25545	25554	0 %	80 %	20 %	0 %	434379292
21	NC_018509	GTTTT	2	10	27267	27276	0 %	80 %	20 %	0 %	434379293
22	NC_018509	TCCAT	2	10	29756	29765	20 %	40 %	0 %	40 %	434379294
23	NC_018509	ACCGT	2	10	30347	30356	20 %	20 %	20 %	40 %	434379294
24	NC_018509	ATTTG	2	10	30881	30890	20 %	60 %	20 %	0 %	434379294
25	NC_018509	CTTCG	2	10	31993	32002	0 %	40 %	20 %	40 %	434379294
26	NC_018509	TTCTT	2	10	33505	33514	0 %	80 %	0 %	20 %	434379295
27	NC_018509	ATTGT	2	10	35868	35877	20 %	60 %	20 %	0 %	434379297
28	NC_018509	TGTCA	2	10	40229	40238	20 %	40 %	20 %	20 %	434379303
29	NC_018509	CTTTT	2	10	41011	41020	0 %	80 %	0 %	20 %	434379303
30	NC_018509	TTGCC	2	10	41756	41765	0 %	40 %	20 %	40 %	434379304
31	NC_018509	TACCT	2	10	42837	42846	20 %	40 %	0 %	40 %	434379304
32	NC_018509	TATCG	2	10	43401	43410	20 %	40 %	20 %	20 %	434379305
33	NC_018509	AATTT	2	10	46286	46295	40 %	60 %	0 %	0 %	434379305
34	NC_018509	AATCC	2	10	51569	51578	40 %	20 %	0 %	40 %	434379306
35	NC_018509	AATTA	2	10	52512	52521	60 %	40 %	0 %	0 %	434379306
36	NC_018509	ATTGA	2	10	52906	52915	40 %	40 %	20 %	0 %	434379306
37	NC_018509	TCCAT	2	10	54241	54250	20 %	40 %	0 %	40 %	434379306
38	NC_018509	GATTT	2	10	54354	54363	20 %	60 %	20 %	0 %	434379306
39	NC_018509	TAATT	2	10	59616	59625	40 %	60 %	0 %	0 %	434379307
40	NC_018509	TTCTT	2	10	59686	59695	0 %	80 %	0 %	20 %	434379307
41	NC_018509	ATATT	2	10	60682	60691	40 %	60 %	0 %	0 %	434379307
42	NC_018509	ATTTT	2	10	63952	63961	20 %	80 %	0 %	0 %	434379307
43	NC_018509	CTCTT	2	10	64408	64417	0 %	60 %	0 %	40 %	434379307
44	NC_018509	TAGAA	2	10	64712	64721	60 %	20 %	20 %	0 %	434379308
45	NC_018509	AGTTG	2	10	67991	68000	20 %	40 %	40 %	0 %	434379313
46	NC_018509	TCTCT	2	10	69407	69416	0 %	60 %	0 %	40 %	434379314
47	NC_018509	ATTGT	2	10	71502	71511	20 %	60 %	20 %	0 %	434379316
48	NC_018509	ACCTC	2	10	73651	73660	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_018509	AAAAT	2	10	74038	74047	80 %	20 %	0 %	0 %	434379318
50	NC_018509	TAGAT	2	10	75084	75093	40 %	40 %	20 %	0 %	434379319
51	NC_018509	TCATT	2	10	80835	80844	20 %	60 %	0 %	20 %	434379323
52	NC_018509	TGTAG	2	10	82536	82545	20 %	40 %	40 %	0 %	434379324
53	NC_018509	TCATA	2	10	82757	82766	40 %	40 %	0 %	20 %	434379324
54	NC_018509	TTGTT	2	10	84108	84117	0 %	80 %	20 %	0 %	434379324
55	NC_018509	TCTTT	2	10	85333	85342	0 %	80 %	0 %	20 %	434379326
56	NC_018509	GCATA	2	10	87617	87626	40 %	20 %	20 %	20 %	434379329
57	NC_018509	CTCTT	2	10	88238	88247	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_018509	TAACC	2	10	88548	88557	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_018509	GTAAT	2	10	90163	90172	40 %	40 %	20 %	0 %	434379332
60	NC_018509	TTTTA	2	10	93077	93086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018509	AAAAG	2	10	94437	94446	80 %	0 %	20 %	0 %	434379334
62	NC_018509	TACAT	2	10	94467	94476	40 %	40 %	0 %	20 %	434379334
63	NC_018509	TTAAC	2	10	96272	96281	40 %	40 %	0 %	20 %	434379335
64	NC_018509	CAATT	2	10	96749	96758	40 %	40 %	0 %	20 %	434379336
65	NC_018509	TCAGC	2	10	97688	97697	20 %	20 %	20 %	40 %	434379338
66	NC_018509	AAGGT	2	10	98636	98645	40 %	20 %	40 %	0 %	434379340
67	NC_018509	CTCCC	2	10	99276	99285	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_018509	GATAT	2	10	104429	104438	40 %	40 %	20 %	0 %	434379352
69	NC_018509	TCAAT	2	10	106308	106317	40 %	40 %	0 %	20 %	434379356
70	NC_018509	TTTAA	2	10	106904	106913	40 %	60 %	0 %	0 %	434379356
71	NC_018509	ATTAC	2	10	107088	107097	40 %	40 %	0 %	20 %	434379356
72	NC_018509	ATGAA	2	10	109274	109283	60 %	20 %	20 %	0 %	434379360
73	NC_018509	TCCGT	2	10	109558	109567	0 %	40 %	20 %	40 %	434379360
74	NC_018509	TCTAT	2	10	109779	109788	20 %	60 %	0 %	20 %	434379360
75	NC_018509	TCAAT	2	10	109810	109819	40 %	40 %	0 %	20 %	434379360
76	NC_018509	TCTGT	2	10	111538	111547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018509	ATGTA	2	10	112967	112976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018509	AAATA	2	10	113193	113202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018509	TAGCA	2	10	113841	113850	40 %	20 %	20 %	20 %	434379365
80	NC_018509	TAAAG	2	10	114385	114394	60 %	20 %	20 %	0 %	434379366
81	NC_018509	TGTTT	2	10	116301	116310	0 %	80 %	20 %	0 %	434379367
82	NC_018509	TGTGT	2	10	116416	116425	0 %	60 %	40 %	0 %	434379367
83	NC_018509	ATTTT	2	10	116711	116720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018509	TTACA	2	10	116721	116730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018509	CGAAA	2	10	116740	116749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_018509	ATTGT	2	10	117953	117962	20 %	60 %	20 %	0 %	434379369
87	NC_018509	AAATA	2	10	120012	120021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018509	AGAAA	2	10	120405	120414	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018509	AATTC	2	10	123396	123405	40 %	40 %	0 %	20 %	434379374
90	NC_018509	TACAT	2	10	123924	123933	40 %	40 %	0 %	20 %	434379375
91	NC_018509	TCAAT	2	10	124810	124819	40 %	40 %	0 %	20 %	434379376
92	NC_018509	TGAGC	2	10	125698	125707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018509	AAAGT	2	10	125948	125957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018509	TATCC	2	10	125969	125978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_018509	GTAGG	2	10	126005	126014	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018509	TAGAG	2	10	126386	126395	40 %	20 %	40 %	0 %	434379378
97	NC_018509	AATTA	2	10	127086	127095	60 %	40 %	0 %	0 %	434379379
98	NC_018509	GGTTT	2	10	127273	127282	0 %	60 %	40 %	0 %	434379379
99	NC_018509	GACAA	2	10	127826	127835	60 %	0 %	20 %	20 %	434379380
100	NC_018509	TCGAT	2	10	128629	128638	20 %	40 %	20 %	20 %	434379381
101	NC_018509	TCTTG	2	10	128684	128693	0 %	60 %	20 %	20 %	434379381
102	NC_018509	TATTC	2	10	128994	129003	20 %	60 %	0 %	20 %	434379381
103	NC_018509	TTCTA	2	10	130202	130211	20 %	60 %	0 %	20 %	434379382
104	NC_018509	TCCCA	2	10	132414	132423	20 %	20 %	0 %	60 %	434379383
105	NC_018509	TCAAT	2	10	132522	132531	40 %	40 %	0 %	20 %	434379383
106	NC_018509	GCATC	2	10	132781	132790	20 %	20 %	20 %	40 %	434379384
107	NC_018509	GTATT	2	10	133180	133189	20 %	60 %	20 %	0 %	434379385
108	NC_018509	AGGTA	2	10	135237	135246	40 %	20 %	40 %	0 %	434379386
109	NC_018509	GATTG	2	10	136942	136951	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018509	ATGGA	2	10	137127	137136	40 %	20 %	40 %	0 %	434379388
111	NC_018509	TTAAA	2	10	139013	139022	60 %	40 %	0 %	0 %	434379390
112	NC_018509	ATAAC	2	10	139034	139043	60 %	20 %	0 %	20 %	434379390
113	NC_018509	CTTAT	2	10	139169	139178	20 %	60 %	0 %	20 %	434379390
114	NC_018509	ATGGA	2	10	139230	139239	40 %	20 %	40 %	0 %	434379390
115	NC_018509	TTATT	2	10	142047	142056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018509	TTTTC	2	10	143404	143413	0 %	80 %	0 %	20 %	434379397
117	NC_018509	TTTAC	2	10	143896	143905	20 %	60 %	0 %	20 %	434379397
118	NC_018509	GATAT	2	10	145272	145281	40 %	40 %	20 %	0 %	434379399
119	NC_018509	ATCAA	2	10	146244	146253	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018509	GATTG	2	10	148603	148612	20 %	40 %	40 %	0 %	434379404
121	NC_018509	ATTCC	2	10	149270	149279	20 %	40 %	0 %	40 %	434379405
122	NC_018509	ACGAT	2	10	150761	150770	40 %	20 %	20 %	20 %	434379407
123	NC_018509	AAATG	2	10	150882	150891	60 %	20 %	20 %	0 %	434379407
124	NC_018509	AAATC	2	10	150918	150927	60 %	20 %	0 %	20 %	434379407
125	NC_018509	AAAAG	2	10	151116	151125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018509	CTTTT	2	10	151211	151220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_018509	ATTCA	2	10	151338	151347	40 %	40 %	0 %	20 %	434379408
128	NC_018509	TGCTT	2	10	152034	152043	0 %	60 %	20 %	20 %	434379408
129	NC_018509	TTATG	2	10	155113	155122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018509	TTTAT	2	10	155987	155996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018509	ATTAT	2	10	156449	156458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018509	ATTTT	2	10	158467	158476	20 %	80 %	0 %	0 %	434379411
133	NC_018509	AAATT	2	10	159783	159792	60 %	40 %	0 %	0 %	434379413
134	NC_018509	ATCGA	2	10	163203	163212	40 %	20 %	20 %	20 %	434379418
135	NC_018509	AAGAA	2	10	167156	167165	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018509	ATTCA	2	10	168305	168314	40 %	40 %	0 %	20 %	434379423
137	NC_018509	AGAAA	2	10	169008	169017	80 %	0 %	20 %	0 %	434379425
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192	NC_018509	TTAAA	2	10	228259	228268	60 %	40 %	0 %	0 %	434379509
193	NC_018509	TAAAA	2	10	229030	229039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_018509	TGAAA	2	10	229630	229639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018509	AAGTA	2	10	229900	229909	60 %	20 %	20 %	0 %	434379511
197	NC_018509	AAAAG	2	10	232722	232731	80 %	0 %	20 %	0 %	434379516
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199	NC_018509	GGTAA	2	10	234102	234111	40 %	20 %	40 %	0 %	434379519
200	NC_018509	TATCG	2	10	235338	235347	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.