MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	AAAAT	2	10	7887	7896	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018509	TGAAT	2	10	9423	9432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018509	TTGTA	2	10	10953	10962	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018509	ACCTC	2	10	73651	73660	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_018509	CTCTT	2	10	88238	88247	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_018509	TAACC	2	10	88548	88557	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018509	TTTTA	2	10	93077	93086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018509	CTCCC	2	10	99276	99285	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_018509	TCTGT	2	10	111538	111547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018509	ATGTA	2	10	112967	112976	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018509	AAATA	2	10	113193	113202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018509	ATTTT	2	10	116711	116720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018509	TTACA	2	10	116721	116730	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018509	CGAAA	2	10	116740	116749	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018509	AAATA	2	10	120012	120021	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018509	AGAAA	2	10	120405	120414	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018509	TGAGC	2	10	125698	125707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018509	AAAGT	2	10	125948	125957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018509	TATCC	2	10	125969	125978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018509	GTAGG	2	10	126005	126014	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018509	GATTG	2	10	136942	136951	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018509	TTATT	2	10	142047	142056	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018509	ATCAA	2	10	146244	146253	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018509	AAAAG	2	10	151116	151125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018509	CTTTT	2	10	151211	151220	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018509	TTATG	2	10	155113	155122	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018509	TTTAT	2	10	155987	155996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018509	ATTAT	2	10	156449	156458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018509	AAGAA	2	10	167156	167165	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018509	AAGGA	2	10	173802	173811	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018509	AAAAT	2	10	184709	184718	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018509	CTTAA	2	10	192214	192223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018509	TTGGA	2	10	194462	194471	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018509	TAATA	2	10	196565	196574	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018509	TGTTT	2	10	215916	215925	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018509	AAGAA	2	10	217239	217248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018509	TGTTA	2	10	219144	219153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018509	TTTTA	2	10	225340	225349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018509	ACAAA	2	10	225384	225393	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018509	TAAAA	2	10	229030	229039	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018509	TACGT	2	10	229265	229274	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_018509	TGAAA	2	10	229630	229639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018509	CTTTT	2	10	233609	233618	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018509	TATCG	2	10	235338	235347	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.