MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	TTAGG	2	10	1575	1584	20 %	40 %	40 %	0 %	434379281
2	NC_018509	AATTT	2	10	2222	2231	40 %	60 %	0 %	0 %	434379281
3	NC_018509	TCTGT	2	10	2769	2778	0 %	60 %	20 %	20 %	434379282
4	NC_018509	GAATA	2	10	3630	3639	60 %	20 %	20 %	0 %	434379282
5	NC_018509	CTTAG	2	10	8362	8371	20 %	40 %	20 %	20 %	434379288
6	NC_018509	ATCGA	2	10	8703	8712	40 %	20 %	20 %	20 %	434379288
7	NC_018509	GTGCT	2	10	13055	13064	0 %	40 %	40 %	20 %	434379289
8	NC_018509	AGCGA	2	10	13374	13383	40 %	0 %	40 %	20 %	434379289
9	NC_018509	AACAT	2	10	15388	15397	60 %	20 %	0 %	20 %	434379289
10	NC_018509	AATCC	2	10	16152	16161	40 %	20 %	0 %	40 %	434379289
11	NC_018509	TTAAT	2	10	17744	17753	40 %	60 %	0 %	0 %	434379289
12	NC_018509	TGATA	2	10	18739	18748	40 %	40 %	20 %	0 %	434379290
13	NC_018509	CATGA	2	10	21325	21334	40 %	20 %	20 %	20 %	434379290
14	NC_018509	AAATG	2	10	22573	22582	60 %	20 %	20 %	0 %	434379292
15	NC_018509	TCGAT	2	10	22718	22727	20 %	40 %	20 %	20 %	434379292
16	NC_018509	CATTT	2	10	23227	23236	20 %	60 %	0 %	20 %	434379292
17	NC_018509	GTTTT	2	10	25545	25554	0 %	80 %	20 %	0 %	434379292
18	NC_018509	GTTTT	2	10	27267	27276	0 %	80 %	20 %	0 %	434379293
19	NC_018509	TCCAT	2	10	29756	29765	20 %	40 %	0 %	40 %	434379294
20	NC_018509	ACCGT	2	10	30347	30356	20 %	20 %	20 %	40 %	434379294
21	NC_018509	ATTTG	2	10	30881	30890	20 %	60 %	20 %	0 %	434379294
22	NC_018509	CTTCG	2	10	31993	32002	0 %	40 %	20 %	40 %	434379294
23	NC_018509	TTCTT	2	10	33505	33514	0 %	80 %	0 %	20 %	434379295
24	NC_018509	ATTGT	2	10	35868	35877	20 %	60 %	20 %	0 %	434379297
25	NC_018509	TGTCA	2	10	40229	40238	20 %	40 %	20 %	20 %	434379303
26	NC_018509	CTTTT	2	10	41011	41020	0 %	80 %	0 %	20 %	434379303
27	NC_018509	TTGCC	2	10	41756	41765	0 %	40 %	20 %	40 %	434379304
28	NC_018509	TACCT	2	10	42837	42846	20 %	40 %	0 %	40 %	434379304
29	NC_018509	TATCG	2	10	43401	43410	20 %	40 %	20 %	20 %	434379305
30	NC_018509	AATTT	2	10	46286	46295	40 %	60 %	0 %	0 %	434379305
31	NC_018509	AATCC	2	10	51569	51578	40 %	20 %	0 %	40 %	434379306
32	NC_018509	AATTA	2	10	52512	52521	60 %	40 %	0 %	0 %	434379306
33	NC_018509	ATTGA	2	10	52906	52915	40 %	40 %	20 %	0 %	434379306
34	NC_018509	TCCAT	2	10	54241	54250	20 %	40 %	0 %	40 %	434379306
35	NC_018509	GATTT	2	10	54354	54363	20 %	60 %	20 %	0 %	434379306
36	NC_018509	TAATT	2	10	59616	59625	40 %	60 %	0 %	0 %	434379307
37	NC_018509	TTCTT	2	10	59686	59695	0 %	80 %	0 %	20 %	434379307
38	NC_018509	ATATT	2	10	60682	60691	40 %	60 %	0 %	0 %	434379307
39	NC_018509	ATTTT	2	10	63952	63961	20 %	80 %	0 %	0 %	434379307
40	NC_018509	CTCTT	2	10	64408	64417	0 %	60 %	0 %	40 %	434379307
41	NC_018509	TAGAA	2	10	64712	64721	60 %	20 %	20 %	0 %	434379308
42	NC_018509	AGTTG	2	10	67991	68000	20 %	40 %	40 %	0 %	434379313
43	NC_018509	TCTCT	2	10	69407	69416	0 %	60 %	0 %	40 %	434379314
44	NC_018509	ATTGT	2	10	71502	71511	20 %	60 %	20 %	0 %	434379316
45	NC_018509	AAAAT	2	10	74038	74047	80 %	20 %	0 %	0 %	434379318
46	NC_018509	TAGAT	2	10	75084	75093	40 %	40 %	20 %	0 %	434379319
47	NC_018509	TCATT	2	10	80835	80844	20 %	60 %	0 %	20 %	434379323
48	NC_018509	TGTAG	2	10	82536	82545	20 %	40 %	40 %	0 %	434379324
49	NC_018509	TCATA	2	10	82757	82766	40 %	40 %	0 %	20 %	434379324
50	NC_018509	TTGTT	2	10	84108	84117	0 %	80 %	20 %	0 %	434379324
51	NC_018509	TCTTT	2	10	85333	85342	0 %	80 %	0 %	20 %	434379326
52	NC_018509	GCATA	2	10	87617	87626	40 %	20 %	20 %	20 %	434379329
53	NC_018509	GTAAT	2	10	90163	90172	40 %	40 %	20 %	0 %	434379332
54	NC_018509	AAAAG	2	10	94437	94446	80 %	0 %	20 %	0 %	434379334
55	NC_018509	TACAT	2	10	94467	94476	40 %	40 %	0 %	20 %	434379334
56	NC_018509	TTAAC	2	10	96272	96281	40 %	40 %	0 %	20 %	434379335
57	NC_018509	CAATT	2	10	96749	96758	40 %	40 %	0 %	20 %	434379336
58	NC_018509	TCAGC	2	10	97688	97697	20 %	20 %	20 %	40 %	434379338
59	NC_018509	AAGGT	2	10	98636	98645	40 %	20 %	40 %	0 %	434379340
60	NC_018509	GATAT	2	10	104429	104438	40 %	40 %	20 %	0 %	434379352
61	NC_018509	TCAAT	2	10	106308	106317	40 %	40 %	0 %	20 %	434379356
62	NC_018509	TTTAA	2	10	106904	106913	40 %	60 %	0 %	0 %	434379356
63	NC_018509	ATTAC	2	10	107088	107097	40 %	40 %	0 %	20 %	434379356
64	NC_018509	ATGAA	2	10	109274	109283	60 %	20 %	20 %	0 %	434379360
65	NC_018509	TCCGT	2	10	109558	109567	0 %	40 %	20 %	40 %	434379360
66	NC_018509	TCTAT	2	10	109779	109788	20 %	60 %	0 %	20 %	434379360
67	NC_018509	TCAAT	2	10	109810	109819	40 %	40 %	0 %	20 %	434379360
68	NC_018509	TAGCA	2	10	113841	113850	40 %	20 %	20 %	20 %	434379365
69	NC_018509	TAAAG	2	10	114385	114394	60 %	20 %	20 %	0 %	434379366
70	NC_018509	TGTTT	2	10	116301	116310	0 %	80 %	20 %	0 %	434379367
71	NC_018509	TGTGT	2	10	116416	116425	0 %	60 %	40 %	0 %	434379367
72	NC_018509	ATTGT	2	10	117953	117962	20 %	60 %	20 %	0 %	434379369
73	NC_018509	AATTC	2	10	123396	123405	40 %	40 %	0 %	20 %	434379374
74	NC_018509	TACAT	2	10	123924	123933	40 %	40 %	0 %	20 %	434379375
75	NC_018509	TCAAT	2	10	124810	124819	40 %	40 %	0 %	20 %	434379376
76	NC_018509	TAGAG	2	10	126386	126395	40 %	20 %	40 %	0 %	434379378
77	NC_018509	AATTA	2	10	127086	127095	60 %	40 %	0 %	0 %	434379379
78	NC_018509	GGTTT	2	10	127273	127282	0 %	60 %	40 %	0 %	434379379
79	NC_018509	GACAA	2	10	127826	127835	60 %	0 %	20 %	20 %	434379380
80	NC_018509	TCGAT	2	10	128629	128638	20 %	40 %	20 %	20 %	434379381
81	NC_018509	TCTTG	2	10	128684	128693	0 %	60 %	20 %	20 %	434379381
82	NC_018509	TATTC	2	10	128994	129003	20 %	60 %	0 %	20 %	434379381
83	NC_018509	TTCTA	2	10	130202	130211	20 %	60 %	0 %	20 %	434379382
84	NC_018509	TCCCA	2	10	132414	132423	20 %	20 %	0 %	60 %	434379383
85	NC_018509	TCAAT	2	10	132522	132531	40 %	40 %	0 %	20 %	434379383
86	NC_018509	GCATC	2	10	132781	132790	20 %	20 %	20 %	40 %	434379384
87	NC_018509	GTATT	2	10	133180	133189	20 %	60 %	20 %	0 %	434379385
88	NC_018509	AGGTA	2	10	135237	135246	40 %	20 %	40 %	0 %	434379386
89	NC_018509	ATGGA	2	10	137127	137136	40 %	20 %	40 %	0 %	434379388
90	NC_018509	TTAAA	2	10	139013	139022	60 %	40 %	0 %	0 %	434379390
91	NC_018509	ATAAC	2	10	139034	139043	60 %	20 %	0 %	20 %	434379390
92	NC_018509	CTTAT	2	10	139169	139178	20 %	60 %	0 %	20 %	434379390
93	NC_018509	ATGGA	2	10	139230	139239	40 %	20 %	40 %	0 %	434379390
94	NC_018509	TTTTC	2	10	143404	143413	0 %	80 %	0 %	20 %	434379397
95	NC_018509	TTTAC	2	10	143896	143905	20 %	60 %	0 %	20 %	434379397
96	NC_018509	GATAT	2	10	145272	145281	40 %	40 %	20 %	0 %	434379399
97	NC_018509	GATTG	2	10	148603	148612	20 %	40 %	40 %	0 %	434379404
98	NC_018509	ATTCC	2	10	149270	149279	20 %	40 %	0 %	40 %	434379405
99	NC_018509	ACGAT	2	10	150761	150770	40 %	20 %	20 %	20 %	434379407
100	NC_018509	AAATG	2	10	150882	150891	60 %	20 %	20 %	0 %	434379407
101	NC_018509	AAATC	2	10	150918	150927	60 %	20 %	0 %	20 %	434379407
102	NC_018509	ATTCA	2	10	151338	151347	40 %	40 %	0 %	20 %	434379408
103	NC_018509	TGCTT	2	10	152034	152043	0 %	60 %	20 %	20 %	434379408
104	NC_018509	ATTTT	2	10	158467	158476	20 %	80 %	0 %	0 %	434379411
105	NC_018509	AAATT	2	10	159783	159792	60 %	40 %	0 %	0 %	434379413
106	NC_018509	ATCGA	2	10	163203	163212	40 %	20 %	20 %	20 %	434379418
107	NC_018509	ATTCA	2	10	168305	168314	40 %	40 %	0 %	20 %	434379423
108	NC_018509	AGAAA	2	10	169008	169017	80 %	0 %	20 %	0 %	434379425
109	NC_018509	CGTTC	2	10	170998	171007	0 %	40 %	20 %	40 %	434379427
110	NC_018509	AGAAA	2	10	171390	171399	80 %	0 %	20 %	0 %	434379427
111	NC_018509	GATTG	2	10	171953	171962	20 %	40 %	40 %	0 %	434379427
112	NC_018509	TCTTA	2	10	172960	172969	20 %	60 %	0 %	20 %	434379429
113	NC_018509	TACAG	2	10	172997	173006	40 %	20 %	20 %	20 %	434379429
114	NC_018509	TCTTT	2	10	175184	175193	0 %	80 %	0 %	20 %	434379433
115	NC_018509	AAATA	2	10	175632	175641	80 %	20 %	0 %	0 %	434379433
116	NC_018509	GCGAA	2	10	177654	177663	40 %	0 %	40 %	20 %	434379437
117	NC_018509	GCCAG	2	10	177671	177680	20 %	0 %	40 %	40 %	434379437
118	NC_018509	TCCAA	2	10	177722	177731	40 %	20 %	0 %	40 %	434379437
119	NC_018509	GAAAC	2	10	178154	178163	60 %	0 %	20 %	20 %	434379438
120	NC_018509	ATATT	2	10	178219	178228	40 %	60 %	0 %	0 %	434379438
121	NC_018509	AGGTA	2	10	179491	179500	40 %	20 %	40 %	0 %	434379438
122	NC_018509	GGGCG	2	10	179682	179691	0 %	0 %	80 %	20 %	434379438
123	NC_018509	ATGTT	2	10	181127	181136	20 %	60 %	20 %	0 %	434379440
124	NC_018509	TCACG	2	10	181232	181241	20 %	20 %	20 %	40 %	434379440
125	NC_018509	CTTGG	2	10	182285	182294	0 %	40 %	40 %	20 %	434379441
126	NC_018509	AACAA	2	10	183626	183635	80 %	0 %	0 %	20 %	434379442
127	NC_018509	TTTCT	2	10	183772	183781	0 %	80 %	0 %	20 %	434379442
128	NC_018509	TTCCT	2	10	184475	184484	0 %	60 %	0 %	40 %	434379442
129	NC_018509	TGAAG	2	10	187983	187992	40 %	20 %	40 %	0 %	434379449
130	NC_018509	AGAAA	2	10	189042	189051	80 %	0 %	20 %	0 %	434379450
131	NC_018509	TCAAT	2	10	194923	194932	40 %	40 %	0 %	20 %	434379460
132	NC_018509	GTTAA	2	10	196277	196286	40 %	40 %	20 %	0 %	434379463
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134	NC_018509	ATGTA	2	10	199429	199438	40 %	40 %	20 %	0 %	434379470
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.