MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	AAGG	2	8	654	661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018509	CCTA	2	8	9259	9266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_018509	ACCC	2	8	9943	9950	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_018509	GATA	2	8	9961	9968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018509	AGAA	2	8	10350	10357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018509	ATTG	2	8	10816	10823	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018509	TACT	2	8	10868	10875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018509	TTTA	2	8	11008	11015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018509	TAAA	2	8	11027	11034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018509	TATC	2	8	11747	11754	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018509	ATTT	2	8	43155	43162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018509	TCAA	2	8	88574	88581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018509	GTAT	2	8	101483	101490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018509	AACT	2	8	101693	101700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018509	AATA	2	8	103810	103817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018509	ACAA	2	8	110899	110906	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018509	AACC	2	8	111251	111258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018509	TATT	2	8	111599	111606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018509	CATA	2	8	112478	112485	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018509	TATC	2	8	112919	112926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018509	ATGA	2	8	117061	117068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018509	TTTG	2	8	119435	119442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018509	TTGA	2	8	120568	120575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018509	CATT	2	8	120839	120846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018509	CTTT	2	8	121159	121166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018509	TTTA	2	8	125562	125569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018509	AAAG	2	8	125803	125810	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018509	GAAC	2	8	136694	136701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018509	TAAA	3	12	144743	144754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018509	TTGG	2	8	146336	146343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018509	TAAA	2	8	146365	146372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018509	GAAG	2	8	146906	146913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018509	AGGG	2	8	151144	151151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018509	CTTT	2	8	155017	155024	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018509	TCAC	2	8	155976	155983	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018509	AAGT	2	8	156216	156223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018509	TCAA	2	8	156350	156357	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018509	ATTA	2	8	156363	156370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018509	ATTT	2	8	157795	157802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018509	ATCC	2	8	157918	157925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018509	GACT	2	8	158045	158052	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018509	TTCC	2	8	163730	163737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018509	TAAA	2	8	166678	166685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018509	AATA	2	8	174911	174918	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018509	CTTT	2	8	175864	175871	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018509	TAAA	3	12	175909	175920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018509	TCAG	2	8	175984	175991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018509	AAGG	2	8	176003	176010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018509	TTCT	2	8	180898	180905	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018509	TTTC	2	8	191981	191988	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018509	AACT	2	8	192135	192142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018509	AGGT	2	8	192273	192280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018509	TAAA	2	8	192753	192760	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018509	ATTT	2	8	192783	192790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018509	TAAA	2	8	194388	194395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018509	TGTT	2	8	197397	197404	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018509	GGTA	2	8	201620	201627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018509	GATT	2	8	201675	201682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018509	TTTA	2	8	209157	209164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018509	CAAA	2	8	211550	211557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018509	TGTT	2	8	215250	215257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018509	AGGG	2	8	218275	218282	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018509	GAAA	3	12	219120	219131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018509	TAAT	2	8	219308	219315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018509	GAAT	2	8	221235	221242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018509	AAAG	2	8	229058	229065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018509	AGCA	2	8	229162	229169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018509	TAAA	2	8	229190	229197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018509	TAAT	2	8	231573	231580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018509	GTTA	2	8	232006	232013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018509	ATTT	2	8	232339	232346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018509	TTAA	2	8	232678	232685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.