MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	AT	3	6	8	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018509	CT	3	6	1628	1633	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
3	NC_018509	CT	3	6	1862	1867	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
4	NC_018509	TC	3	6	2627	2632	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
5	NC_018509	CT	3	6	3806	3811	0 %	50 %	0 %	50 %	434379282
6	NC_018509	GT	3	6	4050	4055	0 %	50 %	50 %	0 %	434379282
7	NC_018509	CT	3	6	4492	4497	0 %	50 %	0 %	50 %	434379282
8	NC_018509	CT	3	6	4997	5002	0 %	50 %	0 %	50 %	434379283
9	NC_018509	CT	4	8	5223	5230	0 %	50 %	0 %	50 %	434379283
10	NC_018509	GA	3	6	6104	6109	50 %	0 %	50 %	0 %	434379284
11	NC_018509	TA	3	6	7936	7941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018509	AT	3	6	7950	7955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018509	TC	3	6	11259	11264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018509	AT	3	6	11723	11728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018509	AT	3	6	13158	13163	50 %	50 %	0 %	0 %	434379289
16	NC_018509	CT	3	6	13662	13667	0 %	50 %	0 %	50 %	434379289
17	NC_018509	GT	3	6	14564	14569	0 %	50 %	50 %	0 %	434379289
18	NC_018509	GT	3	6	15107	15112	0 %	50 %	50 %	0 %	434379289
19	NC_018509	TA	3	6	15965	15970	50 %	50 %	0 %	0 %	434379289
20	NC_018509	TC	3	6	16912	16917	0 %	50 %	0 %	50 %	434379289
21	NC_018509	AT	3	6	18702	18707	50 %	50 %	0 %	0 %	434379290
22	NC_018509	CT	3	6	19219	19224	0 %	50 %	0 %	50 %	434379290
23	NC_018509	AC	3	6	19446	19451	50 %	0 %	0 %	50 %	434379290
24	NC_018509	CT	3	6	22140	22145	0 %	50 %	0 %	50 %	434379292
25	NC_018509	CT	3	6	22234	22239	0 %	50 %	0 %	50 %	434379292
26	NC_018509	CT	3	6	23681	23686	0 %	50 %	0 %	50 %	434379292
27	NC_018509	AG	3	6	24024	24029	50 %	0 %	50 %	0 %	434379292
28	NC_018509	CA	3	6	24305	24310	50 %	0 %	0 %	50 %	434379292
29	NC_018509	GT	3	6	24436	24441	0 %	50 %	50 %	0 %	434379292
30	NC_018509	CT	3	6	24866	24871	0 %	50 %	0 %	50 %	434379292
31	NC_018509	AT	3	6	25088	25093	50 %	50 %	0 %	0 %	434379292
32	NC_018509	TC	4	8	26674	26681	0 %	50 %	0 %	50 %	434379293
33	NC_018509	AT	3	6	26811	26816	50 %	50 %	0 %	0 %	434379293
34	NC_018509	AT	3	6	27057	27062	50 %	50 %	0 %	0 %	434379293
35	NC_018509	TG	3	6	27296	27301	0 %	50 %	50 %	0 %	434379293
36	NC_018509	GA	3	6	28216	28221	50 %	0 %	50 %	0 %	434379293
37	NC_018509	AG	3	6	28338	28343	50 %	0 %	50 %	0 %	434379293
38	NC_018509	GA	3	6	28351	28356	50 %	0 %	50 %	0 %	434379293
39	NC_018509	TA	3	6	28391	28396	50 %	50 %	0 %	0 %	434379293
40	NC_018509	TG	3	6	31241	31246	0 %	50 %	50 %	0 %	434379294
41	NC_018509	AT	3	6	31395	31400	50 %	50 %	0 %	0 %	434379294
42	NC_018509	CT	3	6	32357	32362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_018509	AG	3	6	32504	32509	50 %	0 %	50 %	0 %	434379295
44	NC_018509	CA	3	6	32624	32629	50 %	0 %	0 %	50 %	434379295
45	NC_018509	TA	3	6	33250	33255	50 %	50 %	0 %	0 %	434379295
46	NC_018509	TA	3	6	33912	33917	50 %	50 %	0 %	0 %	434379295
47	NC_018509	TA	3	6	34407	34412	50 %	50 %	0 %	0 %	434379295
48	NC_018509	TA	3	6	34550	34555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018509	CT	3	6	34986	34991	0 %	50 %	0 %	50 %	434379296
50	NC_018509	AT	3	6	36558	36563	50 %	50 %	0 %	0 %	434379297
51	NC_018509	AT	3	6	36825	36830	50 %	50 %	0 %	0 %	434379297
52	NC_018509	AT	3	6	36912	36917	50 %	50 %	0 %	0 %	434379297
53	NC_018509	TA	3	6	38189	38194	50 %	50 %	0 %	0 %	434379299
54	NC_018509	AT	3	6	39261	39266	50 %	50 %	0 %	0 %	434379301
55	NC_018509	CT	3	6	40223	40228	0 %	50 %	0 %	50 %	434379303
56	NC_018509	TA	3	6	40648	40653	50 %	50 %	0 %	0 %	434379303
57	NC_018509	GT	3	6	40765	40770	0 %	50 %	50 %	0 %	434379303
58	NC_018509	TA	3	6	41244	41249	50 %	50 %	0 %	0 %	434379304
59	NC_018509	CT	3	6	41548	41553	0 %	50 %	0 %	50 %	434379304
60	NC_018509	TA	3	6	42476	42481	50 %	50 %	0 %	0 %	434379304
61	NC_018509	TA	3	6	43077	43082	50 %	50 %	0 %	0 %	434379304
62	NC_018509	AC	3	6	43287	43292	50 %	0 %	0 %	50 %	434379305
63	NC_018509	AC	3	6	43499	43504	50 %	0 %	0 %	50 %	434379305
64	NC_018509	AT	3	6	44667	44672	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
65	NC_018509	TA	3	6	46176	46181	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
66	NC_018509	TA	3	6	46904	46909	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
67	NC_018509	AT	3	6	47744	47749	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
68	NC_018509	AT	3	6	47876	47881	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
69	NC_018509	TC	3	6	47984	47989	0 %	50 %	0 %	50 %	434379305
70	NC_018509	CT	3	6	49505	49510	0 %	50 %	0 %	50 %	434379305
71	NC_018509	AT	3	6	49775	49780	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
72	NC_018509	CT	3	6	50201	50206	0 %	50 %	0 %	50 %	434379305
73	NC_018509	TC	3	6	50349	50354	0 %	50 %	0 %	50 %	434379305
74	NC_018509	TA	3	6	50501	50506	50 %	50 %	0 %	0 %	434379305
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76	NC_018509	AT	3	6	50828	50833	50 %	50 %	0 %	0 %	434379306
77	NC_018509	TC	3	6	51070	51075	0 %	50 %	0 %	50 %	434379306
78	NC_018509	TC	3	6	53363	53368	0 %	50 %	0 %	50 %	434379306
79	NC_018509	TA	3	6	53375	53380	50 %	50 %	0 %	0 %	434379306
80	NC_018509	TG	3	6	54617	54622	0 %	50 %	50 %	0 %	434379306
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82	NC_018509	CT	3	6	55560	55565	0 %	50 %	0 %	50 %	434379306
83	NC_018509	CT	3	6	57227	57232	0 %	50 %	0 %	50 %	434379306
84	NC_018509	TA	3	6	58547	58552	50 %	50 %	0 %	0 %	434379307
85	NC_018509	AG	3	6	58650	58655	50 %	0 %	50 %	0 %	434379307
86	NC_018509	TC	3	6	59185	59190	0 %	50 %	0 %	50 %	434379307
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88	NC_018509	AT	3	6	60781	60786	50 %	50 %	0 %	0 %	434379307
89	NC_018509	CT	3	6	61188	61193	0 %	50 %	0 %	50 %	434379307
90	NC_018509	AG	3	6	62118	62123	50 %	0 %	50 %	0 %	434379307
91	NC_018509	TC	3	6	65546	65551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018509	TA	3	6	65657	65662	50 %	50 %	0 %	0 %	434379310
93	NC_018509	CT	3	6	65693	65698	0 %	50 %	0 %	50 %	434379310
94	NC_018509	GT	3	6	66305	66310	0 %	50 %	50 %	0 %	434379310
95	NC_018509	TC	3	6	66573	66578	0 %	50 %	0 %	50 %	434379311
96	NC_018509	GA	3	6	67363	67368	50 %	0 %	50 %	0 %	434379312
97	NC_018509	AG	3	6	67570	67575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018509	AG	3	6	68057	68062	50 %	0 %	50 %	0 %	434379313
99	NC_018509	GA	3	6	68232	68237	50 %	0 %	50 %	0 %	434379313
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103	NC_018509	AT	3	6	70362	70367	50 %	50 %	0 %	0 %	434379315
104	NC_018509	TA	3	6	70429	70434	50 %	50 %	0 %	0 %	434379315
105	NC_018509	TC	3	6	71364	71369	0 %	50 %	0 %	50 %	434379315
106	NC_018509	TG	3	6	72324	72329	0 %	50 %	50 %	0 %	434379317
107	NC_018509	AT	3	6	72406	72411	50 %	50 %	0 %	0 %	434379317
108	NC_018509	CT	3	6	72491	72496	0 %	50 %	0 %	50 %	434379317
109	NC_018509	GA	3	6	74483	74488	50 %	0 %	50 %	0 %	434379319
110	NC_018509	AT	3	6	75280	75285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018509	GT	3	6	75587	75592	0 %	50 %	50 %	0 %	434379320
112	NC_018509	GA	3	6	76626	76631	50 %	0 %	50 %	0 %	434379320
113	NC_018509	CT	3	6	78330	78335	0 %	50 %	0 %	50 %	434379322
114	NC_018509	CT	3	6	80282	80287	0 %	50 %	0 %	50 %	434379323
115	NC_018509	TA	3	6	81269	81274	50 %	50 %	0 %	0 %	434379323
116	NC_018509	CT	3	6	82164	82169	0 %	50 %	0 %	50 %	434379324
117	NC_018509	TG	3	6	82172	82177	0 %	50 %	50 %	0 %	434379324
118	NC_018509	CA	3	6	83237	83242	50 %	0 %	0 %	50 %	434379324
119	NC_018509	TC	3	6	84005	84010	0 %	50 %	0 %	50 %	434379324
120	NC_018509	GC	3	6	84024	84029	0 %	0 %	50 %	50 %	434379324
121	NC_018509	GC	3	6	85171	85176	0 %	0 %	50 %	50 %	434379326
122	NC_018509	AC	3	6	85601	85606	50 %	0 %	0 %	50 %	434379327
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124	NC_018509	TC	3	6	86015	86020	0 %	50 %	0 %	50 %	434379327
125	NC_018509	CT	4	8	86524	86531	0 %	50 %	0 %	50 %	434379328
126	NC_018509	TA	3	6	87935	87940	50 %	50 %	0 %	0 %	434379330
127	NC_018509	TA	3	6	88707	88712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018509	AT	3	6	88751	88756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018509	GA	3	6	88912	88917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018509	GA	3	6	88969	88974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018509	CT	3	6	89567	89572	0 %	50 %	0 %	50 %	434379332
132	NC_018509	GC	3	6	89984	89989	0 %	0 %	50 %	50 %	434379332
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135	NC_018509	GA	3	6	93098	93103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018509	CA	3	6	93336	93341	50 %	0 %	0 %	50 %	434379333
137	NC_018509	AT	3	6	93416	93421	50 %	50 %	0 %	0 %	434379333
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139	NC_018509	TA	3	6	93987	93992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018509	GA	3	6	94038	94043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018509	TG	3	6	94403	94408	0 %	50 %	50 %	0 %	434379334
142	NC_018509	GA	3	6	95188	95193	50 %	0 %	50 %	0 %	434379334
143	NC_018509	GA	3	6	95895	95900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018509	AG	3	6	96654	96659	50 %	0 %	50 %	0 %	434379335
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.