MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789

Total Repeats: 2565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018508	AGTGGC	2	12	506	517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018508	CGATTT	2	12	2272	2283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434373510
3	NC_018508	AGGTGA	3	18	3071	3088	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	434373511
4	NC_018508	ATTGGA	2	12	3720	3731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373512
5	NC_018508	AAAGAT	2	12	14089	14100	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434373521
6	NC_018508	AGCATT	2	12	14156	14167	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373521
7	NC_018508	CATTTA	2	12	15359	15370	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434373522
8	NC_018508	ATTGCA	2	12	16664	16675	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373524
9	NC_018508	AGCTTG	2	12	17769	17780	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	434373525
10	NC_018508	ATTTTT	2	12	20145	20156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018508	AAAGAA	2	12	21018	21029	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434373526
12	NC_018508	CTTCAA	2	12	22166	22177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373529
13	NC_018508	AAGATA	2	12	25912	25923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434373533
14	NC_018508	GAATTA	2	12	26037	26048	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434373533
15	NC_018508	CCAATT	2	12	26095	26106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018508	ATGACA	2	12	27414	27425	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434373534
17	NC_018508	AGGTTG	2	12	31957	31968	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434373538
18	NC_018508	GAAATT	2	12	32409	32420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434373539
19	NC_018508	TTACAT	2	12	33700	33711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434373541
20	NC_018508	TATTTT	2	12	34540	34551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434373541
21	NC_018508	GCAAGG	2	12	37483	37494	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	434373544
22	NC_018508	AGTAGA	2	12	38122	38133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434373544
23	NC_018508	AATCGA	2	12	38635	38646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434373545
24	NC_018508	GGAAGA	2	12	39908	39919	50 %	0 %	50 %	0 %	434373547
25	NC_018508	AGGGCA	2	12	41195	41206	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	434373549
26	NC_018508	TTTTCT	2	12	43343	43354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018508	AACAAA	2	12	43710	43721	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	434373551
28	NC_018508	ATTTAT	2	12	44454	44465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373551
29	NC_018508	GCGATG	2	12	46032	46043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	434373554
30	NC_018508	ATTTTA	2	12	48199	48210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373555
31	NC_018508	ATTTAA	2	12	51739	51750	50 %	50 %	0 %	0 %	434373558
32	NC_018508	GGTAAA	2	12	53592	53603	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434373559
33	NC_018508	ATATTT	2	12	54769	54780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434373560
34	NC_018508	GAAAAT	2	12	55520	55531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434373560
35	NC_018508	AATGAA	2	12	56091	56102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018508	GGTGCT	2	12	58671	58682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	434373564
37	NC_018508	ATGATC	2	12	61579	61590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373570
38	NC_018508	ATGATA	2	12	61771	61782	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434373570
39	NC_018508	ACAATC	2	12	64277	64288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	434373573
40	NC_018508	AAAGGA	2	12	64418	64429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018508	AGATGA	2	12	65464	65475	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434373575
42	NC_018508	GCTATC	2	12	66143	66154	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434373576
43	NC_018508	TTTAGA	2	12	67216	67227	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434373576
44	NC_018508	TCACGG	2	12	71809	71820	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434373578
45	NC_018508	CGAAAG	2	12	75812	75823	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434373580
46	NC_018508	CGTTTG	2	12	77401	77412	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	434373582
47	NC_018508	ATTGCA	2	12	77958	77969	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373583
48	NC_018508	CTTTTG	2	12	77995	78006	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434373583
49	NC_018508	AAAGTG	2	12	78488	78499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434373584
50	NC_018508	ATTTTT	2	12	80692	80703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018508	ATTTTT	2	12	86540	86551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018508	ATCAAA	2	12	91051	91062	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434373592
53	NC_018508	TTAGCA	2	12	92623	92634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373593
54	NC_018508	AAAAGG	2	12	95710	95721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373596
55	NC_018508	CAAAAA	2	12	99569	99580	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	434373599
56	NC_018508	AGTGAT	2	12	100834	100845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373600
57	NC_018508	TACATT	2	12	107657	107668	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434373602
58	NC_018508	GCAGAA	2	12	109027	109038	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	434373603
59	NC_018508	GCTGAA	2	12	110026	110037	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373604
60	NC_018508	GCAGAT	2	12	110092	110103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373604
61	NC_018508	GCAGAT	2	12	110257	110268	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373604
62	NC_018508	GCAGAT	2	12	110323	110334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373604
63	NC_018508	GAAGCG	2	12	110497	110508	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	434373604
64	NC_018508	ACCATC	2	12	116551	116562	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	434373608
65	NC_018508	ATTAAT	2	12	116801	116812	50 %	50 %	0 %	0 %	434373608
66	NC_018508	TATGTT	2	12	117565	117576	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434373610
67	NC_018508	TAAAAA	2	12	117896	117907	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434373610
68	NC_018508	AAAACT	2	12	120137	120148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434373612
69	NC_018508	GTAACA	2	12	122856	122867	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434373615
70	NC_018508	TCTGAA	2	12	126321	126332	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373618
71	NC_018508	ATGAAT	2	12	129597	129608	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434373621
72	NC_018508	AGATGA	2	12	130269	130280	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434373622
73	NC_018508	AAGAAA	2	12	134239	134250	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434373624
74	NC_018508	AAGAAA	2	12	134640	134651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434373625
75	NC_018508	TTGAAA	2	12	137092	137103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434373627
76	NC_018508	ACCTTC	2	12	142285	142296	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	434373631
77	NC_018508	CTTTTG	2	12	148298	148309	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	434373636
78	NC_018508	TAATAG	2	12	148568	148579	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	434373636
79	NC_018508	AAAACA	2	12	149754	149765	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	434373637
80	NC_018508	CAAATT	2	12	153023	153034	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	434373639
81	NC_018508	TGAAGC	2	12	153783	153794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373639
82	NC_018508	TGCCAA	2	12	153799	153810	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434373639
83	NC_018508	TGTATA	2	12	154489	154500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018508	CATTAC	2	12	155169	155180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373640
85	NC_018508	AAAGTA	2	12	156079	156090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434373641
86	NC_018508	TGAAGT	2	12	159186	159197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434373643
87	NC_018508	TTTGTA	2	12	161332	161343	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434373644
88	NC_018508	ATTTAT	2	12	162309	162320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018508	AAAAAT	2	12	164393	164404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434373647
90	NC_018508	GCAGAT	2	12	164873	164884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373647
91	NC_018508	GATGGT	2	12	165077	165088	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	434373647
92	NC_018508	GTAACT	2	12	165464	165475	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434373647
93	NC_018508	ACTGTT	2	12	167112	167123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434373649
94	NC_018508	GCCAGT	2	12	169370	169381	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	434373652
95	NC_018508	TTTTCA	2	12	176581	176592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	434373657
96	NC_018508	CGTCTA	2	12	177718	177729	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434373658
97	NC_018508	TTAAAA	2	12	178953	178964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434373660
98	NC_018508	TCCTAA	2	12	179317	179328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434373660
99	NC_018508	AACTGC	2	12	179494	179505	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434373660
100	NC_018508	AAATAC	2	12	180996	181007	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434373661
101	NC_018508	TATTTG	2	12	181272	181283	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434373662
102	NC_018508	CAACGT	2	12	183714	183725	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	434373664
103	NC_018508	GGAAGA	2	12	184056	184067	50 %	0 %	50 %	0 %	434373664
104	NC_018508	TAAAGG	2	12	184434	184445	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	434373665
105	NC_018508	AAAAGG	2	12	186159	186170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434373666
106	NC_018508	TTATTT	2	12	188866	188877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434373669
107	NC_018508	ATGAAA	2	12	192416	192427	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018508	TACTTC	2	12	200890	200901	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434373678
109	NC_018508	TTTGAT	2	12	205382	205393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018508	ATGAGC	2	12	205524	205535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_018508	CCAGGA	2	12	206879	206890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434373682
112	NC_018508	TCAGGA	2	12	207574	207585	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	434373684
113	NC_018508	GATGTT	2	12	208435	208446	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434373685
114	NC_018508	GACAAT	2	12	208563	208574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434373685
115	NC_018508	AATCTA	2	12	210486	210497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_018508	ACTTTC	2	12	215687	215698	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	434373693
117	NC_018508	TTTAAC	2	12	216609	216620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	434373694
118	NC_018508	TATTTG	2	12	217980	217991	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434373695
119	NC_018508	AAATGA	2	12	219221	219232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	434373697
120	NC_018508	AGAAAA	2	12	219492	219503	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	434373697
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133	NC_018508	ATTTTT	2	12	248977	248988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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228	NC_018508	TATGAA	2	12	438462	438473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_018508	TTAGGT	2	12	447216	447227	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	434373921
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234	NC_018508	TGGGAG	2	12	450716	450727	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_018508	AACTAA	2	12	462900	462911	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	434373931
237	NC_018508	ATTTTT	2	12	467242	467253	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	434373934
238	NC_018508	CTTTTT	2	12	470215	470226	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434373940
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240	NC_018508	AATATT	2	12	472165	472176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_018508	TTTGCA	2	12	474513	474524	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434373947
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345	NC_018508	AAAAAG	3	18	717188	717205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
346	NC_018508	CTTTTT	2	12	720317	720328	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	434374211
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350	NC_018508	TGTTTC	2	12	727793	727804	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
351	NC_018508	AGTATT	2	12	730111	730122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	434374222
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