MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018508	AGTGGC	2	12	506	517	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018508	ATTTTT	2	12	20145	20156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018508	CCAATT	2	12	26095	26106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018508	TTTTCT	2	12	43343	43354	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018508	AATGAA	2	12	56091	56102	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018508	AAAGGA	2	12	64418	64429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018508	ATTTTT	2	12	80692	80703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018508	ATTTTT	2	12	86540	86551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018508	TGTATA	2	12	154489	154500	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018508	ATTTAT	2	12	162309	162320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018508	ATGAAA	2	12	192416	192427	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018508	TTTGAT	2	12	205382	205393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018508	ATGAGC	2	12	205524	205535	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018508	AATCTA	2	12	210486	210497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018508	GAAATA	2	12	247149	247160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018508	ATTATG	2	12	247209	247220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018508	ATTTTT	2	12	248977	248988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018508	ACTTAA	2	12	262160	262171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_018508	CTTTTT	2	12	273861	273872	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018508	TGTTAG	2	12	283254	283265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018508	TTAAAA	2	12	283632	283643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018508	ATTTTT	2	12	290905	290916	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018508	ATCAAT	2	12	330626	330637	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018508	ATGTAA	2	12	359677	359688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018508	TTAAAG	2	12	374715	374726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018508	AAATTC	2	12	385430	385441	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_018508	AAATGT	2	12	399306	399317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018508	ACGAGA	2	12	399355	399366	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018508	GTTTTT	2	12	404932	404943	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018508	GTATAT	2	12	416210	416221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018508	ATTATA	2	12	431513	431524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018508	TATGAA	2	12	438462	438473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018508	CTTTTG	2	12	441473	441484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018508	TGGGAG	2	12	450716	450727	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018508	AGATAA	2	12	471313	471324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018508	AATATT	2	12	472165	472176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018508	TTGTTA	2	12	492268	492279	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018508	GTATTT	2	12	538493	538504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018508	TTTTAA	2	12	540998	541009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018508	GAAATA	2	12	541841	541852	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018508	CACTTT	2	12	543143	543154	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018508	AAGTAT	2	12	548855	548866	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018508	GCAATA	2	12	550536	550547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018508	TACTTT	2	12	561562	561573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018508	GTAAAA	2	12	563194	563205	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018508	TAGAAA	2	12	568701	568712	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018508	CATTTT	2	12	568774	568785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018508	AAAAAG	2	12	575428	575439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018508	TCTTTT	2	12	589617	589628	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018508	ATACAT	2	12	602343	602354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018508	CCTTTT	2	12	637099	637110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018508	ATTATA	2	12	637931	637942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018508	TTTTAT	2	12	641635	641646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018508	AAAAAG	2	12	641730	641741	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018508	TAATAT	2	12	642357	642368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018508	TCCATT	2	12	643654	643665	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018508	AAATTT	2	12	678690	678701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018508	AAAAAG	3	18	717188	717205	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018508	TGTTTC	2	12	727793	727804	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_018508	GAAATA	2	12	741739	741750	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018508	TTGAAA	2	12	763242	763253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018508	TTTTTC	2	12	764458	764469	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018508	AAGTAT	2	12	770857	770868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018508	AGAAAT	2	12	819041	819052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018508	TTACGT	2	12	819268	819279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_018508	GGAGAG	2	12	821254	821265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018508	AAATAA	2	12	823601	823612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018508	AAAGAA	2	12	824406	824417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018508	GGAGAG	2	12	848011	848022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018508	AAAAAG	2	12	853206	853217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018508	AATGAT	2	12	872092	872103	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018508	AGGATA	2	12	877860	877871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018508	AAAAGT	2	12	889945	889956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018508	AATAAA	2	12	898887	898898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018508	TCTTTT	2	12	921124	921135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_018508	ATACAA	2	12	946827	946838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_018508	GTATAT	2	12	973573	973584	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018508	TTTTAT	2	12	1026198	1026209	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018508	AGGTAG	2	12	1079236	1079247	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018508	AAAAGG	2	12	1174321	1174332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018508	CTTTTT	2	12	1174557	1174568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_018508	AATGAT	2	12	1189820	1189831	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018508	TTAAAA	2	12	1191276	1191287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018508	TATAAC	2	12	1191338	1191349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018508	TTTATT	2	12	1213882	1213893	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018508	GAAAAA	2	12	1222810	1222821	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018508	AATAGA	2	12	1222854	1222865	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018508	ATTTAT	2	12	1234795	1234806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018508	GAAAAT	2	12	1265249	1265260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018508	ATTTTT	2	12	1281328	1281339	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018508	TTCTTT	2	12	1313302	1313313	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018508	TTATAT	2	12	1328950	1328961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018508	TTTATT	2	12	1333078	1333089	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018508	ATTTAA	2	12	1350865	1350876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018508	AAAATC	2	12	1358213	1358224	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_018508	ATAAAT	2	12	1376168	1376179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018508	GAGGGA	2	12	1386241	1386252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018508	TTTTTA	2	12	1398279	1398290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018508	AAAGAG	2	12	1422599	1422610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018508	AAATAA	2	12	1424134	1424145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018508	ATGTAA	2	12	1440293	1440304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018508	TATGAA	2	12	1444146	1444157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018508	TCATAT	2	12	1447833	1447844	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_018508	TTTGTT	2	12	1467160	1467171	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018508	ATTCTT	2	12	1488867	1488878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018508	TACAAA	2	12	1489006	1489017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018508	AAAATT	2	12	1500750	1500761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018508	CATATA	2	12	1500927	1500938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018508	GATAAA	2	12	1511524	1511535	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018508	ATTATA	2	12	1518239	1518250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018508	TCGCAG	2	12	1521416	1521427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018508	CTTATG	2	12	1551339	1551350	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_018508	ATGAGT	2	12	1552029	1552040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018508	TTTCAT	2	12	1599636	1599647	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018508	AAATTT	2	12	1600084	1600095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018508	TATAAA	2	12	1615269	1615280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018508	TGGAAA	2	12	1639320	1639331	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018508	TAAAGA	2	12	1649711	1649722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018508	TTGTAT	2	12	1655939	1655950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018508	AAAAAT	2	12	1675141	1675152	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018508	GATATT	2	12	1682406	1682417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018508	AAACTT	2	12	1698460	1698471	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_018508	GTGCTT	2	12	1701222	1701233	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_018508	GGGATA	2	12	1701455	1701466	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018508	TTTTTA	2	12	1742857	1742868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018508	ATGAGG	2	12	1768159	1768170	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018508	TTATAA	2	12	1773408	1773419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018508	CCATAT	2	12	1796099	1796110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018508	CAAAGA	2	12	1797803	1797814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_018508	TTTTAC	2	12	1799604	1799615	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_018508	TATAAA	2	12	1805369	1805380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018508	AAAGAA	2	12	1805433	1805444	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018508	TTATAA	2	12	1818504	1818515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018508	AGTAAA	2	12	1820069	1820080	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_018508	ATTTTT	2	12	1934604	1934615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_018508	TAAAAA	2	12	5489803	5489814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
380	NC_018508	AAAAAT	2	12	5491170	5491181	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.