MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018507	CTGTTG	4	24	3792	3815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018507	AGATAA	2	12	4442	4453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575005
3	NC_018507	CCTATA	2	12	4563	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575005
4	NC_018507	TGCATT	2	12	4842	4853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402575005
5	NC_018507	ATTAAA	2	12	5544	5555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
6	NC_018507	TTCCTG	2	12	6072	6083	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402575006
7	NC_018507	TAAAAA	2	12	6844	6855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575006
8	NC_018507	TAAATA	2	12	7416	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575007
9	NC_018507	AAAATA	2	12	7541	7552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575007
10	NC_018507	AGATAA	2	12	7992	8003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575007
11	NC_018507	CATAAA	2	12	8442	8453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575007
12	NC_018507	AAATTA	2	12	9101	9112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575007
13	NC_018507	AACATA	2	12	9284	9295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575008
14	NC_018507	ACCTAT	2	12	13149	13160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575012
15	NC_018507	CGATTA	2	12	13249	13260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402575012
16	NC_018507	TTTTAT	2	12	19564	19575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402575019
17	NC_018507	TGTAGT	2	12	20457	20468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018507	TATGTT	2	12	21077	21088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018507	ACATGA	2	12	21737	21748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018507	AATTAT	2	12	24291	24302	50 %	50 %	0 %	0 %	402575021
21	NC_018507	CAGATG	2	12	24305	24316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402575021
22	NC_018507	AGGAAC	4	24	25450	25473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018507	AGGAAT	2	12	25480	25491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018507	TGTAAG	2	12	25584	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018507	ATTTAC	2	12	26931	26942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018507	TGCTCT	2	12	28750	28761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018507	TGCTCT	5	30	28768	28797	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018507	TGTTAT	2	12	28798	28809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018507	TAAAAT	2	12	30780	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018507	ATAAAA	2	12	31352	31363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575023
31	NC_018507	AACTTT	2	12	33641	33652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_018507	AGGCAT	2	12	34910	34921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402575026
33	NC_018507	AAATTT	2	12	37113	37124	50 %	50 %	0 %	0 %	402575027
34	NC_018507	AATAAA	2	12	37684	37695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575027
35	NC_018507	ATTTTG	2	12	37977	37988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018507	TAACAT	2	12	38839	38850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018507	AAAACA	2	12	40769	40780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018507	CTTTAT	2	12	41598	41609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402575028
39	NC_018507	TTTTAT	2	12	41743	41754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402575028
40	NC_018507	GTTAAG	3	18	42090	42107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018507	AAATAT	2	12	43036	43047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575031
42	NC_018507	TCCATC	2	12	46452	46463	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402575034
43	NC_018507	TAAAGT	2	12	48418	48429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575036
44	NC_018507	AAAAAG	2	12	49432	49443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018507	ACAGCA	2	12	53753	53764	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402575040
46	NC_018507	AGTAAA	2	12	53895	53906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575041
47	NC_018507	TTATAG	2	12	54601	54612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402575042
48	NC_018507	GTAAAA	2	12	55381	55392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575043
49	NC_018507	ATTTAT	2	12	57224	57235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575044
50	NC_018507	ATTTTA	2	12	59860	59871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575045
51	NC_018507	CAATAC	2	12	60926	60937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018507	AACAAA	2	12	61853	61864	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018507	TAGAAA	2	12	64786	64797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575047
54	NC_018507	CAAATA	2	12	65185	65196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575047
55	NC_018507	TCTACA	2	12	67094	67105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018507	AAATAG	2	12	68364	68375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018507	ATAAAA	2	12	75152	75163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575053
58	NC_018507	TTAATA	2	12	76585	76596	50 %	50 %	0 %	0 %	402575054
59	NC_018507	AAAAAT	2	12	78933	78944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575057
60	NC_018507	AATAGT	2	12	80114	80125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575058
61	NC_018507	TATATT	2	12	80390	80401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575058
62	NC_018507	TTAAAA	2	12	85256	85267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575064
63	NC_018507	AAATAA	2	12	85827	85838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018507	TAAAAA	2	12	86746	86757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575066
65	NC_018507	TATAAC	2	12	95239	95250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402575070
66	NC_018507	AAACGG	2	12	95424	95435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402575070
67	NC_018507	CAGTTC	2	12	95556	95567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402575070
68	NC_018507	ATGCTA	2	12	96168	96179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402575070
69	NC_018507	ACAAAC	2	12	103245	103256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402575083
70	NC_018507	TAAAAT	2	12	104949	104960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575087
71	NC_018507	AATAGT	2	12	105067	105078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575087
72	NC_018507	ATTGGT	2	12	105470	105481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018507	AGGTAA	2	12	106851	106862	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402575090
74	NC_018507	CAGGAA	2	12	107407	107418	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402575091
75	NC_018507	ATAGAT	2	12	107601	107612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575091
76	NC_018507	TAAAAA	2	12	107681	107692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575091
77	NC_018507	TTGCTA	2	12	110421	110432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402575096
78	NC_018507	ACTAAT	3	18	112607	112624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_018507	AAATTA	2	12	113825	113836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575099
80	NC_018507	CGTAAA	2	12	114089	114100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402575100
81	NC_018507	ACAGGA	2	12	116342	116353	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402575103
82	NC_018507	ATTAAA	2	12	116891	116902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575103
83	NC_018507	ATAGTA	3	18	118665	118682	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018507	TAGTGG	3	18	118684	118701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018507	AAACAG	2	12	119126	119137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402575105
86	NC_018507	ATTTTG	2	12	122491	122502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402575108
87	NC_018507	TGTTAA	2	12	123577	123588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018507	GTTAAT	2	12	123891	123902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018507	AAAACA	9	54	124437	124490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_018507	TAAAAA	3	18	124502	124519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018507	CTAAAA	3	18	124520	124537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018507	TAAAAA	2	12	124538	124549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018507	TAAAAC	3	18	124557	124574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_018507	TAATAC	4	24	124575	124598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_018507	AAAAAG	2	12	125171	125182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018507	AAAAGT	2	12	125497	125508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575111
97	NC_018507	CTGACA	2	12	126365	126376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018507	TGAAAT	2	12	129292	129303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018507	TAATTT	2	12	129461	129472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018507	ATGTAT	2	12	130837	130848	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018507	AAAAAC	2	12	133897	133908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018507	AAAAGA	2	12	134765	134776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402575112
103	NC_018507	AAATGA	2	12	135649	135660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575112
104	NC_018507	AAGGTC	2	12	137878	137889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402575113
105	NC_018507	AGCACA	2	12	138807	138818	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402575114
106	NC_018507	ATAAAA	2	12	140043	140054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575115
107	NC_018507	AAGGAA	2	12	142420	142431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575116
108	NC_018507	GTTGGG	4	24	142449	142472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402575116
109	NC_018507	AATTTA	2	12	143106	143117	50 %	50 %	0 %	0 %	402575117
110	NC_018507	TTAAAT	2	12	144464	144475	50 %	50 %	0 %	0 %	402575120
111	NC_018507	GAAGAT	2	12	149327	149338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402575123
112	NC_018507	TTTTAA	2	12	150568	150579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575125
113	NC_018507	ATTTTA	2	12	151347	151358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575125
114	NC_018507	GTGCAG	2	12	151498	151509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	402575125
115	NC_018507	TATAAA	2	12	153167	153178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575127
116	NC_018507	ATTAAA	2	12	153825	153836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575128
117	NC_018507	TAGGAG	2	12	154141	154152	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018507	TTTTTG	2	12	154288	154299	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018507	AACCAC	2	12	154415	154426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_018507	AAACCC	2	12	154463	154474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_018507	ATTACT	2	12	155177	155188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_018507	GTGGTT	5	30	158536	158565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018507	GTTAGT	3	18	158581	158598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018507	TTAAAG	2	12	163621	163632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018507	TACTGT	2	12	164022	164033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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246	NC_018507	AATTAA	2	12	313912	313923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575226
247	NC_018507	AAATTT	2	12	314761	314772	50 %	50 %	0 %	0 %	402575227
248	NC_018507	AGAATT	2	12	315425	315436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575228
249	NC_018507	TTTATC	2	12	315791	315802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402575228
250	NC_018507	TAAAAT	2	12	316418	316429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575228
251	NC_018507	TAAAAT	2	12	317100	317111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575229
252	NC_018507	ATTTAA	2	12	322100	322111	50 %	50 %	0 %	0 %	402575234
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257	NC_018507	ACAGAA	2	12	326727	326738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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259	NC_018507	GATATG	2	12	328204	328215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402575238
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261	NC_018507	CTTTCC	7	42	329866	329907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
262	NC_018507	CTTCCC	2	12	329908	329919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_018507	ATAACA	2	12	331069	331080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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266	NC_018507	TACTTT	2	12	332291	332302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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268	NC_018507	AATTTA	2	12	334139	334150	50 %	50 %	0 %	0 %	402575240
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281	NC_018507	AGTGTT	2	12	356011	356022	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_018507	TAGCAG	2	12	357610	357621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
283	NC_018507	TAGGAG	3	18	357622	357639	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_018507	TAGGTG	2	12	357640	357651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.