MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018507	CTGTTG	4	24	3792	3815	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_018507	TGTAGT	2	12	20457	20468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018507	TATGTT	2	12	21077	21088	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018507	ACATGA	2	12	21737	21748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018507	AGGAAC	4	24	25450	25473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018507	AGGAAT	2	12	25480	25491	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018507	TGTAAG	2	12	25584	25595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018507	ATTTAC	2	12	26931	26942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_018507	TGCTCT	2	12	28750	28761	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018507	TGCTCT	5	30	28768	28797	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018507	TGTTAT	2	12	28798	28809	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018507	TAAAAT	2	12	30780	30791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018507	AACTTT	2	12	33641	33652	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018507	ATTTTG	2	12	37977	37988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018507	TAACAT	2	12	38839	38850	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_018507	AAAACA	2	12	40769	40780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018507	GTTAAG	3	18	42090	42107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018507	AAAAAG	2	12	49432	49443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018507	CAATAC	2	12	60926	60937	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018507	AACAAA	2	12	61853	61864	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018507	TCTACA	2	12	67094	67105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018507	AAATAG	2	12	68364	68375	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018507	AAATAA	2	12	85827	85838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018507	ATTGGT	2	12	105470	105481	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018507	ACTAAT	3	18	112607	112624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_018507	ATAGTA	3	18	118665	118682	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018507	TAGTGG	3	18	118684	118701	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018507	TGTTAA	2	12	123577	123588	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018507	GTTAAT	2	12	123891	123902	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018507	AAAACA	9	54	124437	124490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018507	TAAAAA	3	18	124502	124519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018507	CTAAAA	3	18	124520	124537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018507	TAAAAA	2	12	124538	124549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018507	TAAAAC	3	18	124557	124574	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018507	TAATAC	4	24	124575	124598	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018507	AAAAAG	2	12	125171	125182	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018507	CTGACA	2	12	126365	126376	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018507	TGAAAT	2	12	129292	129303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018507	TAATTT	2	12	129461	129472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018507	ATGTAT	2	12	130837	130848	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018507	AAAAAC	2	12	133897	133908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_018507	TAGGAG	2	12	154141	154152	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018507	TTTTTG	2	12	154288	154299	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018507	AACCAC	2	12	154415	154426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018507	AAACCC	2	12	154463	154474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018507	ATTACT	2	12	155177	155188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_018507	GTGGTT	5	30	158536	158565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018507	GTTAGT	3	18	158581	158598	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018507	TTAAAG	2	12	163621	163632	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018507	TACTGT	2	12	164022	164033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018507	CTGTTG	3	18	164133	164150	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_018507	TAGCAG	3	18	164418	164435	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_018507	AAAGAA	2	12	172690	172701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018507	ATTTGT	2	12	179733	179744	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018507	TATTAG	3	18	179982	179999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018507	TTTAGT	2	12	188723	188734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018507	CTGTTT	2	12	189047	189058	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_018507	TTTGTT	2	12	189413	189424	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018507	ATTTTT	2	12	192207	192218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018507	TTACTG	3	18	192219	192236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_018507	TGTTTA	2	12	192663	192674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018507	CATTAG	2	12	228886	228897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_018507	TAAAAA	2	12	230082	230093	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018507	TTTAAA	2	12	233609	233620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018507	TTATTT	2	12	244044	244055	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018507	TTTTAT	2	12	244172	244183	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018507	TTATAT	2	12	246955	246966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018507	TGTTAT	2	12	246967	246978	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018507	TGTAGT	3	18	246985	247002	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018507	TTTTTA	2	12	247262	247273	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018507	GTTTTT	2	12	248812	248823	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018507	AAACTC	2	12	249572	249583	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018507	GCTAAT	2	12	251309	251320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_018507	TTTTAG	2	12	252801	252812	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018507	TTTTGT	2	12	252825	252836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018507	AGTTGT	2	12	258611	258622	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018507	GATGTT	2	12	259138	259149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018507	ATTTAA	2	12	263505	263516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018507	TATTTG	2	12	265717	265728	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018507	GAATTT	2	12	266252	266263	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018507	ATTAAA	2	12	275023	275034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018507	ATTTAT	2	12	275277	275288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018507	AACAAA	2	12	276195	276206	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_018507	TTTTCT	2	12	276485	276496	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_018507	TAATTA	2	12	277004	277015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018507	AAAAAG	2	12	277371	277382	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018507	TTATTT	2	12	279000	279011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018507	TATCTT	2	12	279098	279109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_018507	GTTATT	2	12	279467	279478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018507	GATTTT	2	12	280254	280265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018507	ATCTTT	2	12	280266	280277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_018507	ATTGTT	3	18	280278	280295	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018507	TTTTTA	2	12	280373	280384	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018507	TAAATG	2	12	280516	280527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018507	TTTTAT	2	12	284065	284076	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018507	GAATTA	2	12	288743	288754	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018507	TTTTTA	2	12	289745	289756	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018507	ATGTTA	2	12	290165	290176	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018507	AGGTTT	2	12	326394	326405	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018507	ACAGAA	2	12	326727	326738	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_018507	GTAAAC	2	12	326751	326762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_018507	TTTTCC	2	12	329854	329865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018507	CTTTCC	7	42	329866	329907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_018507	CTTCCC	2	12	329908	329919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_018507	ATAACA	2	12	331069	331080	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_018507	TACAAA	2	12	331175	331186	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_018507	TTTTAA	2	12	331974	331985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018507	TACTTT	2	12	332291	332302	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_018507	ACCTAT	2	12	337513	337524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018507	TGAATT	2	12	341183	341194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018507	TCTTGT	2	12	344889	344900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_018507	GTAAGA	2	12	353650	353661	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018507	AGTGTT	2	12	356011	356022	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018507	TAGCAG	2	12	357610	357621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_018507	TAGGAG	3	18	357622	357639	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018507	TAGGTG	2	12	357640	357651	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.