MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 168

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018507	AGATAA	2	12	4442	4453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575005
2	NC_018507	CCTATA	2	12	4563	4574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575005
3	NC_018507	TGCATT	2	12	4842	4853	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402575005
4	NC_018507	ATTAAA	2	12	5544	5555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575005
5	NC_018507	TTCCTG	2	12	6072	6083	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402575006
6	NC_018507	TAAAAA	2	12	6844	6855	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575006
7	NC_018507	TAAATA	2	12	7416	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575007
8	NC_018507	AAAATA	2	12	7541	7552	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575007
9	NC_018507	AGATAA	2	12	7992	8003	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575007
10	NC_018507	CATAAA	2	12	8442	8453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575007
11	NC_018507	AAATTA	2	12	9101	9112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575007
12	NC_018507	AACATA	2	12	9284	9295	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575008
13	NC_018507	ACCTAT	2	12	13149	13160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575012
14	NC_018507	CGATTA	2	12	13249	13260	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402575012
15	NC_018507	TTTTAT	2	12	19564	19575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402575019
16	NC_018507	AATTAT	2	12	24291	24302	50 %	50 %	0 %	0 %	402575021
17	NC_018507	CAGATG	2	12	24305	24316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402575021
18	NC_018507	ATAAAA	2	12	31352	31363	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575023
19	NC_018507	AGGCAT	2	12	34910	34921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402575026
20	NC_018507	AAATTT	2	12	37113	37124	50 %	50 %	0 %	0 %	402575027
21	NC_018507	AATAAA	2	12	37684	37695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575027
22	NC_018507	CTTTAT	2	12	41598	41609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402575028
23	NC_018507	TTTTAT	2	12	41743	41754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402575028
24	NC_018507	AAATAT	2	12	43036	43047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575031
25	NC_018507	TCCATC	2	12	46452	46463	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402575034
26	NC_018507	TAAAGT	2	12	48418	48429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575036
27	NC_018507	ACAGCA	2	12	53753	53764	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402575040
28	NC_018507	AGTAAA	2	12	53895	53906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575041
29	NC_018507	TTATAG	2	12	54601	54612	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402575042
30	NC_018507	GTAAAA	2	12	55381	55392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575043
31	NC_018507	ATTTAT	2	12	57224	57235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575044
32	NC_018507	ATTTTA	2	12	59860	59871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575045
33	NC_018507	TAGAAA	2	12	64786	64797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575047
34	NC_018507	CAAATA	2	12	65185	65196	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575047
35	NC_018507	ATAAAA	2	12	75152	75163	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575053
36	NC_018507	TTAATA	2	12	76585	76596	50 %	50 %	0 %	0 %	402575054
37	NC_018507	AAAAAT	2	12	78933	78944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575057
38	NC_018507	AATAGT	2	12	80114	80125	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575058
39	NC_018507	TATATT	2	12	80390	80401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575058
40	NC_018507	TTAAAA	2	12	85256	85267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575064
41	NC_018507	TAAAAA	2	12	86746	86757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575066
42	NC_018507	TATAAC	2	12	95239	95250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402575070
43	NC_018507	AAACGG	2	12	95424	95435	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402575070
44	NC_018507	CAGTTC	2	12	95556	95567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402575070
45	NC_018507	ATGCTA	2	12	96168	96179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402575070
46	NC_018507	ACAAAC	2	12	103245	103256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402575083
47	NC_018507	TAAAAT	2	12	104949	104960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575087
48	NC_018507	AATAGT	2	12	105067	105078	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575087
49	NC_018507	AGGTAA	2	12	106851	106862	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402575090
50	NC_018507	CAGGAA	2	12	107407	107418	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402575091
51	NC_018507	ATAGAT	2	12	107601	107612	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	402575091
52	NC_018507	TAAAAA	2	12	107681	107692	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575091
53	NC_018507	TTGCTA	2	12	110421	110432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402575096
54	NC_018507	AAATTA	2	12	113825	113836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575099
55	NC_018507	CGTAAA	2	12	114089	114100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402575100
56	NC_018507	ACAGGA	2	12	116342	116353	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402575103
57	NC_018507	ATTAAA	2	12	116891	116902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575103
58	NC_018507	AAACAG	2	12	119126	119137	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	402575105
59	NC_018507	ATTTTG	2	12	122491	122502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	402575108
60	NC_018507	AAAAGT	2	12	125497	125508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575111
61	NC_018507	AAAAGA	2	12	134765	134776	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402575112
62	NC_018507	AAATGA	2	12	135649	135660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575112
63	NC_018507	AAGGTC	2	12	137878	137889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402575113
64	NC_018507	AGCACA	2	12	138807	138818	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402575114
65	NC_018507	ATAAAA	2	12	140043	140054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575115
66	NC_018507	AAGGAA	2	12	142420	142431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575116
67	NC_018507	GTTGGG	4	24	142449	142472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402575116
68	NC_018507	AATTTA	2	12	143106	143117	50 %	50 %	0 %	0 %	402575117
69	NC_018507	TTAAAT	2	12	144464	144475	50 %	50 %	0 %	0 %	402575120
70	NC_018507	GAAGAT	2	12	149327	149338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402575123
71	NC_018507	TTTTAA	2	12	150568	150579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575125
72	NC_018507	ATTTTA	2	12	151347	151358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575125
73	NC_018507	GTGCAG	2	12	151498	151509	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	402575125
74	NC_018507	TATAAA	2	12	153167	153178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575127
75	NC_018507	ATTAAA	2	12	153825	153836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575128
76	NC_018507	TAAAAA	2	12	165075	165086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575135
77	NC_018507	CACTTA	2	12	165889	165900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575136
78	NC_018507	TATTTT	2	12	167569	167580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402575137
79	NC_018507	CTTTTA	2	12	173717	173728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402575139
80	NC_018507	ATAACA	2	12	174760	174771	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575140
81	NC_018507	TTTATA	2	12	175090	175101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575140
82	NC_018507	ATTTTA	2	12	175288	175299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575140
83	NC_018507	CTTTTA	2	12	177269	177280	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402575142
84	NC_018507	CATCTT	2	12	177935	177946	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402575142
85	NC_018507	TAACTT	2	12	178350	178361	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402575142
86	NC_018507	TGTTTT	2	12	178477	178488	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402575142
87	NC_018507	ACAGTT	3	18	180080	180097	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402575143
88	NC_018507	GCCGTT	3	18	180098	180115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575143
89	NC_018507	GTTGCC	2	12	180119	180130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575143
90	NC_018507	CAGTTG	4	24	180135	180158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402575143
91	NC_018507	GTTGCA	2	12	180161	180172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402575143
92	NC_018507	GTTGCC	4	24	180173	180196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402575143
93	NC_018507	ATTTAA	2	12	180587	180598	50 %	50 %	0 %	0 %	402575144
94	NC_018507	TTGTTT	2	12	181847	181858	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402575144
95	NC_018507	TTTACA	2	12	184276	184287	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402575146
96	NC_018507	TTAATG	2	12	184325	184336	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402575146
97	NC_018507	TTTTGT	2	12	190993	191004	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402575148
98	NC_018507	CAAAAT	2	12	191798	191809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575148
99	NC_018507	AGAAGT	2	12	194543	194554	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402575149
100	NC_018507	ATTTAT	2	12	195527	195538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575151
101	NC_018507	TTTGTT	2	12	204294	204305	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402575160
102	NC_018507	ATAAAC	2	12	209128	209139	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402575163
103	NC_018507	TTATAT	2	12	209690	209701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575164
104	NC_018507	ATTTAT	2	12	216123	216134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575168
105	NC_018507	TTTAAT	2	12	218999	219010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575170
106	NC_018507	GTTTTG	2	12	219103	219114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575170
107	NC_018507	ATGTTA	2	12	220013	220024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402575171
108	NC_018507	TTTATA	2	12	220451	220462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575171
109	NC_018507	CAAAAA	2	12	222187	222198	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402575172
110	NC_018507	ATTTAT	2	12	223947	223958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575173
111	NC_018507	AATAGA	2	12	224761	224772	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402575173
112	NC_018507	GCAAAT	2	12	226607	226618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402575175
113	NC_018507	AGGCGG	2	12	227048	227059	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	402575175
114	NC_018507	GAAAAA	2	12	227472	227483	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402575175
115	NC_018507	AAATTA	2	12	229490	229501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575176
116	NC_018507	TTGTTT	2	12	237678	237689	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402575179
117	NC_018507	TTTTTA	2	12	239851	239862	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	402575183
118	NC_018507	TTTACC	2	12	243040	243051	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402575187
119	NC_018507	TAAAAA	2	12	243547	243558	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	402575187
120	NC_018507	TATAAA	2	12	245871	245882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575189
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168	NC_018507	CATGCT	2	12	348067	348078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402575251

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.