MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018507	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018507	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018507	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018507	TAAAA	2	10	3759	3768	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018507	TAAAG	2	10	3929	3938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018507	ACAAA	2	10	4038	4047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_018507	AATTA	2	10	4364	4373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018507	TCCAT	3	15	15903	15917	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_018507	TCTAT	2	10	15918	15927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018507	TGTAT	2	10	15928	15937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018507	TTTCT	2	10	19686	19695	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018507	TGTTT	2	10	20645	20654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018507	TTTTG	2	10	21093	21102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018507	ATTAT	2	10	21327	21336	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018507	TTTTA	2	10	21452	21461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018507	TGTAA	2	10	21500	21509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018507	CTTTT	2	10	21527	21536	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018507	TGTGT	2	10	21888	21897	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018507	ACTAA	2	10	22561	22570	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_018507	TATAA	2	10	22608	22617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018507	TTGTG	2	10	25418	25427	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018507	TATTT	2	10	26481	26490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018507	TTCAT	2	10	26890	26899	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_018507	TAATT	2	10	27193	27202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018507	TACTT	2	10	27223	27232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_018507	TAAAA	2	10	27554	27563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018507	TTGTT	2	10	29110	29119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018507	TTGTT	2	10	29271	29280	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018507	GAATT	2	10	29725	29734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018507	GTAAA	2	10	30475	30484	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018507	ATAAA	2	10	30793	30802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018507	ATAAC	2	10	33251	33260	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018507	CATAT	2	10	33748	33757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018507	TATAA	2	10	38438	38447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018507	TTTTC	2	10	38463	38472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018507	GTATA	2	10	38605	38614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018507	CATTA	2	10	39218	39227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018507	TTAAT	2	10	39936	39945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018507	ACAAA	2	10	40827	40836	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018507	CATAA	2	10	40910	40919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018507	ACCTC	2	10	48887	48896	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_018507	ACCTC	2	10	48927	48936	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_018507	CTAAC	2	10	49174	49183	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_018507	ATTTT	2	10	49275	49284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018507	AAAAC	2	10	56819	56828	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018507	TTGTT	2	10	59966	59975	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018507	TTAAT	2	10	60136	60145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018507	CTTTC	2	10	60147	60156	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_018507	TTTTC	2	10	60215	60224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_018507	TTTTC	2	10	60322	60331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018507	ACATA	2	10	60398	60407	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018507	AAACT	2	10	60580	60589	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_018507	AATAT	2	10	60590	60599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018507	AACAT	3	15	60600	60614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018507	ACAAA	2	10	60715	60724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018507	AAAAT	2	10	61372	61381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018507	ATAAA	2	10	61615	61624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018507	CAAAA	2	10	61749	61758	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018507	ACATT	2	10	66118	66127	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018507	AAACA	2	10	66138	66147	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_018507	ACAAA	2	10	66262	66271	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018507	AAACA	2	10	66440	66449	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_018507	ATTTG	2	10	66488	66497	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018507	TACAA	2	10	66910	66919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_018507	TTAAC	2	10	66989	66998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018507	CAAAA	2	10	67695	67704	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018507	AAATG	2	10	68044	68053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018507	TATAT	2	10	68431	68440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018507	AAAAT	2	10	69781	69790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018507	TTTTA	2	10	70083	70092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018507	TTTTA	2	10	72320	72329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018507	AGTGG	2	10	72931	72940	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018507	TTAAA	2	10	73026	73035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018507	GTATG	2	10	73086	73095	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018507	GTATT	2	10	73415	73424	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018507	TTAAA	2	10	74041	74050	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018507	AATAA	2	10	80577	80586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018507	TAAAT	2	10	94157	94166	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018507	ATAAA	3	15	112081	112095	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018507	CGTCT	2	10	112407	112416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_018507	ATGCT	2	10	112789	112798	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018507	AACAA	2	10	112951	112960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018507	AAAAC	2	10	113378	113387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018507	TTTCT	2	10	123192	123201	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018507	ATTGT	2	10	123981	123990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018507	AAAGT	2	10	125151	125160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018507	ATTAG	2	10	127664	127673	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018507	CCATA	2	10	128697	128706	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_018507	TATAT	2	10	130429	130438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018507	GTTTT	2	10	132422	132431	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018507	CAAAA	2	10	132612	132621	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018507	CTAAC	2	10	132708	132717	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_018507	TAACT	2	10	133052	133061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018507	AAAGA	2	10	133807	133816	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018507	ATAGT	2	10	134106	134115	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018507	GAAAA	2	10	134116	134125	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018507	GAAGT	2	10	134140	134149	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018507	ATTTT	2	10	141280	141289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018507	TGTTT	2	10	141574	141583	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018507	GTTTT	2	10	141766	141775	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018507	ATTGT	2	10	142204	142213	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018507	ACAGA	2	10	145523	145532	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_018507	AGTTA	2	10	145872	145881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018507	AAAAT	2	10	147633	147642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018507	TCTAA	2	10	154565	154574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_018507	ATCTA	2	10	154601	154610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_018507	ATCTA	2	10	154638	154647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_018507	GTTAA	2	10	158168	158177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018507	TGTTA	2	10	158714	158723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018507	TGTTA	2	10	158860	158869	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018507	AGGTA	2	10	158893	158902	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018507	TTTAT	2	10	161771	161780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018507	TTTTA	2	10	161854	161863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018507	CTTTT	2	10	162078	162087	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018507	ATAAA	2	10	162157	162166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018507	ACAAA	2	10	163103	163112	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_018507	AACAA	2	10	163173	163182	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018507	AGTTA	2	10	163386	163395	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018507	AACTA	2	10	163529	163538	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_018507	TTTGT	2	10	164285	164294	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018507	CTTTT	2	10	170025	170034	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018507	GCTTT	2	10	170751	170760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018507	GAATA	2	10	172018	172027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018507	TTTTA	2	10	172871	172880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018507	CCAAT	2	10	172958	172967	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_018507	ATATT	2	10	174624	174633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018507	ATTTT	2	10	185364	185373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018507	AACTA	2	10	185660	185669	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018507	ATTAC	2	10	187400	187409	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018507	AAAAG	2	10	188407	188416	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018507	AAAAC	2	10	188816	188825	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018507	CTTAG	2	10	188992	189001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_018507	TTTTA	2	10	189342	189351	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018507	ATTTT	2	10	189453	189462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018507	TGTTA	2	10	189658	189667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018507	GATAT	2	10	189694	189703	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018507	TAAAA	2	10	190372	190381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018507	ATTTT	2	10	192119	192128	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018507	AGTTA	2	10	192332	192341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018507	TTAAT	2	10	192480	192489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018507	TTGTT	2	10	192716	192725	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018507	TTTTG	2	10	192964	192973	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018507	TGTTT	2	10	192984	192993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018507	ATTTG	2	10	193236	193245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018507	TTTGT	2	10	193312	193321	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018507	ATTTT	2	10	193338	193347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018507	TTTTG	2	10	193770	193779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018507	TAAAG	2	10	194036	194045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018507	ATTTT	2	10	194347	194356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018507	CTTTT	2	10	212463	212472	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_018507	TTTTA	2	10	213016	213025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018507	TTGTT	2	10	213026	213035	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018507	TGTTT	2	10	213136	213145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018507	TGTTT	2	10	213249	213258	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018507	TATGT	2	10	213587	213596	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_018507	ACTTT	2	10	228221	228230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_018507	ATATT	2	10	240822	240831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_018507	TTTTA	2	10	251893	251902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018507	ATACA	5	25	252379	252403	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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186	NC_018507	AGTTT	2	10	252733	252742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018507	TTTTG	2	10	252897	252906	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018507	TATAA	2	10	252971	252980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018507	TCTTT	2	10	258299	258308	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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193	NC_018507	CGAGA	2	10	261702	261711	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_018507	GTTTA	2	10	262290	262299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_018507	TACAA	2	10	337533	337542	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_018507	CAAAT	2	10	338915	338924	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
257	NC_018507	AATAG	2	10	339175	339184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
258	NC_018507	CTATT	2	10	340635	340644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_018507	AGAAA	2	10	341467	341476	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_018507	ATTTT	2	10	353108	353117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_018507	TTAAG	2	10	353199	353208	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_018507	GTTAG	2	10	356639	356648	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_018507	GTTAG	2	10	356686	356695	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
276	NC_018507	AGGTT	2	10	357700	357709	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
277	NC_018507	GATTA	2	10	358219	358228	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.