MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018507	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	402575003
2	NC_018507	ATAAA	2	10	5597	5606	80 %	20 %	0 %	0 %	402575005
3	NC_018507	AAAAT	2	10	5865	5874	80 %	20 %	0 %	0 %	402575006
4	NC_018507	TAAAA	2	10	6909	6918	80 %	20 %	0 %	0 %	402575006
5	NC_018507	AACAA	2	10	7956	7965	80 %	0 %	0 %	20 %	402575007
6	NC_018507	CATGC	2	10	8123	8132	20 %	20 %	20 %	40 %	402575007
7	NC_018507	AAATT	2	10	8699	8708	60 %	40 %	0 %	0 %	402575007
8	NC_018507	AATAC	2	10	10324	10333	60 %	20 %	0 %	20 %	402575010
9	NC_018507	GTAAC	2	10	10379	10388	40 %	20 %	20 %	20 %	402575010
10	NC_018507	TAATA	2	10	11152	11161	60 %	40 %	0 %	0 %	402575011
11	NC_018507	ATCTA	2	10	12786	12795	40 %	40 %	0 %	20 %	402575012
12	NC_018507	TTGTT	2	10	14211	14220	0 %	80 %	20 %	0 %	402575013
13	NC_018507	CAAAA	2	10	14885	14894	80 %	0 %	0 %	20 %	402575013
14	NC_018507	TGCAT	2	10	15114	15123	20 %	40 %	20 %	20 %	402575013
15	NC_018507	ATATT	2	10	15639	15648	40 %	60 %	0 %	0 %	402575014
16	NC_018507	TAAAT	2	10	15668	15677	60 %	40 %	0 %	0 %	402575014
17	NC_018507	ATTTT	2	10	17570	17579	20 %	80 %	0 %	0 %	402575015
18	NC_018507	CATAT	2	10	17771	17780	40 %	40 %	0 %	20 %	402575016
19	NC_018507	TGGGG	3	15	22252	22266	0 %	20 %	80 %	0 %	402575020
20	NC_018507	ACTTA	2	10	22344	22353	40 %	40 %	0 %	20 %	402575020
21	NC_018507	AAACA	2	10	23874	23883	80 %	0 %	0 %	20 %	402575021
22	NC_018507	AACAA	2	10	28372	28381	80 %	0 %	0 %	20 %	402575022
23	NC_018507	AAAAC	2	10	31728	31737	80 %	0 %	0 %	20 %	402575023
24	NC_018507	AATTT	2	10	31750	31759	40 %	60 %	0 %	0 %	402575023
25	NC_018507	TAATA	2	10	31893	31902	60 %	40 %	0 %	0 %	402575023
26	NC_018507	AATTA	2	10	31925	31934	60 %	40 %	0 %	0 %	402575023
27	NC_018507	ATAAA	2	10	36055	36064	80 %	20 %	0 %	0 %	402575026
28	NC_018507	TTGTT	2	10	36936	36945	0 %	80 %	20 %	0 %	402575027
29	NC_018507	GAAAA	2	10	37621	37630	80 %	0 %	20 %	0 %	402575027
30	NC_018507	ATTTA	2	10	40983	40992	40 %	60 %	0 %	0 %	402575028
31	NC_018507	AACAA	2	10	43908	43917	80 %	0 %	0 %	20 %	402575032
32	NC_018507	AATGA	2	10	46108	46117	60 %	20 %	20 %	0 %	402575034
33	NC_018507	GCTTT	2	10	47762	47771	0 %	60 %	20 %	20 %	402575036
34	NC_018507	ATTAT	2	10	51517	51526	40 %	60 %	0 %	0 %	402575038
35	NC_018507	ACAAA	2	10	51865	51874	80 %	0 %	0 %	20 %	402575038
36	NC_018507	GGAAA	2	10	52647	52656	60 %	0 %	40 %	0 %	402575039
37	NC_018507	AATAC	2	10	53138	53147	60 %	20 %	0 %	20 %	402575040
38	NC_018507	TAAAA	2	10	54315	54324	80 %	20 %	0 %	0 %	402575041
39	NC_018507	ATTAC	2	10	54903	54912	40 %	40 %	0 %	20 %	402575042
40	NC_018507	ATTAA	2	10	55174	55183	60 %	40 %	0 %	0 %	402575043
41	NC_018507	AATTA	2	10	55905	55914	60 %	40 %	0 %	0 %	402575043
42	NC_018507	CAAAG	2	10	56271	56280	60 %	0 %	20 %	20 %	402575043
43	NC_018507	AAAAT	2	10	57538	57547	80 %	20 %	0 %	0 %	402575044
44	NC_018507	GTTTT	2	10	58050	58059	0 %	80 %	20 %	0 %	402575044
45	NC_018507	GTGTT	2	10	58132	58141	0 %	60 %	40 %	0 %	402575044
46	NC_018507	AAGAA	2	10	58474	58483	80 %	0 %	20 %	0 %	402575044
47	NC_018507	CTTTA	2	10	59316	59325	20 %	60 %	0 %	20 %	402575045
48	NC_018507	AAGAA	2	10	62492	62501	80 %	0 %	20 %	0 %	402575046
49	NC_018507	AACAA	2	10	63235	63244	80 %	0 %	0 %	20 %	402575046
50	NC_018507	CAAAT	2	10	63310	63319	60 %	20 %	0 %	20 %	402575046
51	NC_018507	AGGTA	2	10	64022	64031	40 %	20 %	40 %	0 %	402575046
52	NC_018507	TTAAA	2	10	65125	65134	60 %	40 %	0 %	0 %	402575047
53	NC_018507	ATATT	2	10	65198	65207	40 %	60 %	0 %	0 %	402575047
54	NC_018507	AATAA	2	10	65640	65649	80 %	20 %	0 %	0 %	402575047
55	NC_018507	TTTAA	2	10	67834	67843	40 %	60 %	0 %	0 %	402575048
56	NC_018507	ATTAA	2	10	67885	67894	60 %	40 %	0 %	0 %	402575048
57	NC_018507	AAGAT	2	10	68267	68276	60 %	20 %	20 %	0 %	402575049
58	NC_018507	AGTTA	2	10	68652	68661	40 %	40 %	20 %	0 %	402575050
59	NC_018507	TAAAA	2	10	68988	68997	80 %	20 %	0 %	0 %	402575050
60	NC_018507	ATAAA	2	10	69068	69077	80 %	20 %	0 %	0 %	402575050
61	NC_018507	GATAT	2	10	69353	69362	40 %	40 %	20 %	0 %	402575050
62	NC_018507	ATAAA	2	10	72117	72126	80 %	20 %	0 %	0 %	402575051
63	NC_018507	ATAAA	2	10	75093	75102	80 %	20 %	0 %	0 %	402575053
64	NC_018507	CAAAA	2	10	75189	75198	80 %	0 %	0 %	20 %	402575053
65	NC_018507	TATAA	2	10	75437	75446	60 %	40 %	0 %	0 %	402575053
66	NC_018507	ATGTG	2	10	75508	75517	20 %	40 %	40 %	0 %	402575053
67	NC_018507	AAAAT	2	10	75749	75758	80 %	20 %	0 %	0 %	402575053
68	NC_018507	AAGAG	2	10	76023	76032	60 %	0 %	40 %	0 %	402575054
69	NC_018507	TAATA	2	10	76296	76305	60 %	40 %	0 %	0 %	402575054
70	NC_018507	TTAAA	2	10	76415	76424	60 %	40 %	0 %	0 %	402575054
71	NC_018507	ATTTT	2	10	77484	77493	20 %	80 %	0 %	0 %	402575055
72	NC_018507	AAAAG	2	10	77605	77614	80 %	0 %	20 %	0 %	402575055
73	NC_018507	ACAAA	2	10	77715	77724	80 %	0 %	0 %	20 %	402575055
74	NC_018507	ATTTA	2	10	77747	77756	40 %	60 %	0 %	0 %	402575055
75	NC_018507	AATAT	2	10	77828	77837	60 %	40 %	0 %	0 %	402575055
76	NC_018507	AAAAG	2	10	79305	79314	80 %	0 %	20 %	0 %	402575057
77	NC_018507	AAACA	2	10	79460	79469	80 %	0 %	0 %	20 %	402575057
78	NC_018507	TTACA	2	10	79488	79497	40 %	40 %	0 %	20 %	402575057
79	NC_018507	TTTTA	2	10	80012	80021	20 %	80 %	0 %	0 %	402575058
80	NC_018507	GTTTT	2	10	80212	80221	0 %	80 %	20 %	0 %	402575058
81	NC_018507	GATTT	2	10	81279	81288	20 %	60 %	20 %	0 %	402575059
82	NC_018507	AAGCA	2	10	82871	82880	60 %	0 %	20 %	20 %	402575060
83	NC_018507	AGTGT	2	10	83063	83072	20 %	40 %	40 %	0 %	402575060
84	NC_018507	ATTTA	2	10	83906	83915	40 %	60 %	0 %	0 %	402575062
85	NC_018507	ATTTG	2	10	85620	85629	20 %	60 %	20 %	0 %	402575065
86	NC_018507	TAAAA	2	10	85779	85788	80 %	20 %	0 %	0 %	402575065
87	NC_018507	TCAAA	2	10	88185	88194	60 %	20 %	0 %	20 %	402575066
88	NC_018507	AATAG	2	10	89397	89406	60 %	20 %	20 %	0 %	402575066
89	NC_018507	ATTAG	2	10	89454	89463	40 %	40 %	20 %	0 %	402575066
90	NC_018507	TAAAT	2	10	89645	89654	60 %	40 %	0 %	0 %	402575066
91	NC_018507	AAAAT	2	10	90029	90038	80 %	20 %	0 %	0 %	402575067
92	NC_018507	GGTGA	2	10	90116	90125	20 %	20 %	60 %	0 %	402575067
93	NC_018507	AAAAT	2	10	90642	90651	80 %	20 %	0 %	0 %	402575067
94	NC_018507	TATAT	2	10	91539	91548	40 %	60 %	0 %	0 %	402575067
95	NC_018507	TGAAA	2	10	95617	95626	60 %	20 %	20 %	0 %	402575070
96	NC_018507	ACAAT	2	10	95707	95716	60 %	20 %	0 %	20 %	402575070
97	NC_018507	AAAAT	2	10	96092	96101	80 %	20 %	0 %	0 %	402575070
98	NC_018507	GTAGA	2	10	97914	97923	40 %	20 %	40 %	0 %	402575071
99	NC_018507	ATTTT	2	10	98215	98224	20 %	80 %	0 %	0 %	402575071
100	NC_018507	TTAAT	2	10	98307	98316	40 %	60 %	0 %	0 %	402575071
101	NC_018507	CAAGG	2	10	99454	99463	40 %	0 %	40 %	20 %	402575074
102	NC_018507	AAAAT	2	10	99805	99814	80 %	20 %	0 %	0 %	402575074
103	NC_018507	CAGAA	2	10	101755	101764	60 %	0 %	20 %	20 %	402575079
104	NC_018507	TAAAA	2	10	102137	102146	80 %	20 %	0 %	0 %	402575079
105	NC_018507	GTAAA	2	10	103388	103397	60 %	20 %	20 %	0 %	402575083
106	NC_018507	TTAAT	2	10	106066	106075	40 %	60 %	0 %	0 %	402575088
107	NC_018507	AGGCA	2	10	110912	110921	40 %	0 %	40 %	20 %	402575097
108	NC_018507	AAAAC	2	10	114487	114496	80 %	0 %	0 %	20 %	402575101
109	NC_018507	TTAGG	2	10	115770	115779	20 %	40 %	40 %	0 %	402575103
110	NC_018507	GTTTG	2	10	116963	116972	0 %	60 %	40 %	0 %	402575103
111	NC_018507	ATTTT	2	10	117012	117021	20 %	80 %	0 %	0 %	402575103
112	NC_018507	GTTAT	2	10	118731	118740	20 %	60 %	20 %	0 %	402575104
113	NC_018507	AAGTA	2	10	119322	119331	60 %	20 %	20 %	0 %	402575105
114	NC_018507	ATCAA	2	10	121670	121679	60 %	20 %	0 %	20 %	402575107
115	NC_018507	TAATC	2	10	121783	121792	40 %	40 %	0 %	20 %	402575107
116	NC_018507	TAAAG	2	10	125225	125234	60 %	20 %	20 %	0 %	402575111
117	NC_018507	TAAAA	2	10	125447	125456	80 %	20 %	0 %	0 %	402575111
118	NC_018507	TAAAG	2	10	136097	136106	60 %	20 %	20 %	0 %	402575113
119	NC_018507	GATAT	2	10	137082	137091	40 %	40 %	20 %	0 %	402575113
120	NC_018507	AAAGT	2	10	137419	137428	60 %	20 %	20 %	0 %	402575113
121	NC_018507	ACAGG	2	10	137550	137559	40 %	0 %	40 %	20 %	402575113
122	NC_018507	AAATA	2	10	138361	138370	80 %	20 %	0 %	0 %	402575113
123	NC_018507	TAAGA	2	10	138389	138398	60 %	20 %	20 %	0 %	402575113
124	NC_018507	AGAAA	2	10	139014	139023	80 %	0 %	20 %	0 %	402575114
125	NC_018507	TTGCT	2	10	141100	141109	0 %	60 %	20 %	20 %	402575115
126	NC_018507	ATATT	2	10	143149	143158	40 %	60 %	0 %	0 %	402575117
127	NC_018507	TATAG	2	10	144104	144113	40 %	40 %	20 %	0 %	402575120
128	NC_018507	GTTTT	2	10	146507	146516	0 %	80 %	20 %	0 %	402575121
129	NC_018507	AAAAT	2	10	148565	148574	80 %	20 %	0 %	0 %	402575123
130	NC_018507	AAAAT	2	10	149262	149271	80 %	20 %	0 %	0 %	402575123
131	NC_018507	GTGAT	2	10	149349	149358	20 %	40 %	40 %	0 %	402575123
132	NC_018507	GTTGA	2	10	149905	149914	20 %	40 %	40 %	0 %	402575124
133	NC_018507	TATAT	2	10	150663	150672	40 %	60 %	0 %	0 %	402575125
134	NC_018507	GGAAT	2	10	151137	151146	40 %	20 %	40 %	0 %	402575125
135	NC_018507	TAAAT	2	10	151820	151829	60 %	40 %	0 %	0 %	402575125
136	NC_018507	TGGAA	2	10	152082	152091	40 %	20 %	40 %	0 %	402575125
137	NC_018507	ATTTA	2	10	152677	152686	40 %	60 %	0 %	0 %	402575126
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.