MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	ATAAA	2	10	46	55	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018502	TTTTG	2	10	1522	1531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018502	CTTTG	2	10	3971	3980	0 %	60 %	20 %	20 %	402558578
4	NC_018502	GAAAC	2	10	5148	5157	60 %	0 %	20 %	20 %	402558579
5	NC_018502	TTGCT	2	10	5279	5288	0 %	60 %	20 %	20 %	402558579
6	NC_018502	CCCTT	2	10	6045	6054	0 %	40 %	0 %	60 %	402558582
7	NC_018502	TGTGG	2	10	7148	7157	0 %	40 %	60 %	0 %	402558583
8	NC_018502	CTTTT	2	10	7560	7569	0 %	80 %	0 %	20 %	402558583
9	NC_018502	ATTTA	2	10	9316	9325	40 %	60 %	0 %	0 %	402558583
10	NC_018502	ATTTC	2	10	11786	11795	20 %	60 %	0 %	20 %	402558584
11	NC_018502	ATACG	2	10	11864	11873	40 %	20 %	20 %	20 %	402558584
12	NC_018502	TGTTA	2	10	12743	12752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018502	TCCAT	2	10	13187	13196	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_018502	ACATC	2	10	13724	13733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018502	TTAGC	2	10	14489	14498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018502	TAAAA	2	10	16724	16733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018502	TAAGG	2	10	17807	17816	40 %	20 %	40 %	0 %	402558589
18	NC_018502	TGACA	2	10	18099	18108	40 %	20 %	20 %	20 %	402558589
19	NC_018502	CTCTT	2	10	18284	18293	0 %	60 %	0 %	40 %	402558590
20	NC_018502	TAGTT	2	10	18720	18729	20 %	60 %	20 %	0 %	402558591
21	NC_018502	TCTTT	2	10	18792	18801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018502	AAAAG	2	10	18942	18951	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018502	TTCAT	2	10	20170	20179	20 %	60 %	0 %	20 %	402558593
24	NC_018502	ACTTC	2	10	22012	22021	20 %	40 %	0 %	40 %	402558596
25	NC_018502	AGAAA	2	10	22853	22862	80 %	0 %	20 %	0 %	402558596
26	NC_018502	GAATC	2	10	23574	23583	40 %	20 %	20 %	20 %	402558597
27	NC_018502	CTTCA	2	10	24582	24591	20 %	40 %	0 %	40 %	402558598
28	NC_018502	GTCCT	2	10	25539	25548	0 %	40 %	20 %	40 %	402558599
29	NC_018502	ATTTC	2	10	26485	26494	20 %	60 %	0 %	20 %	402558602
30	NC_018502	GAAAT	2	10	26718	26727	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018502	TCATT	2	10	32017	32026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_018502	TCTCC	2	10	32940	32949	0 %	40 %	0 %	60 %	402558614
33	NC_018502	ACATT	2	10	36092	36101	40 %	40 %	0 %	20 %	402558621
34	NC_018502	TCAAC	2	10	37614	37623	40 %	20 %	0 %	40 %	402558624
35	NC_018502	GAGTA	2	10	38391	38400	40 %	20 %	40 %	0 %	402558628
36	NC_018502	TCATT	2	10	39243	39252	20 %	60 %	0 %	20 %	402558629
37	NC_018502	TTGTT	2	10	40254	40263	0 %	80 %	20 %	0 %	402558631
38	NC_018502	CTTTT	2	10	40524	40533	0 %	80 %	0 %	20 %	402558632
39	NC_018502	AAATA	2	10	40741	40750	80 %	20 %	0 %	0 %	402558632
40	NC_018502	TGTTT	2	10	41076	41085	0 %	80 %	20 %	0 %	402558632
41	NC_018502	TTTAT	2	10	41711	41720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018502	GGAAT	2	10	41826	41835	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018502	TACTT	2	10	42001	42010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018502	GAAGA	2	10	42842	42851	60 %	0 %	40 %	0 %	402558634
45	NC_018502	TGAAA	2	10	43932	43941	60 %	20 %	20 %	0 %	402558634
46	NC_018502	TCTTT	2	10	44071	44080	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_018502	CATAA	2	10	44793	44802	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.