MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	CTTTG	2	10	3971	3980	0 %	60 %	20 %	20 %	402558578
2	NC_018502	GAAAC	2	10	5148	5157	60 %	0 %	20 %	20 %	402558579
3	NC_018502	TTGCT	2	10	5279	5288	0 %	60 %	20 %	20 %	402558579
4	NC_018502	CCCTT	2	10	6045	6054	0 %	40 %	0 %	60 %	402558582
5	NC_018502	TGTGG	2	10	7148	7157	0 %	40 %	60 %	0 %	402558583
6	NC_018502	CTTTT	2	10	7560	7569	0 %	80 %	0 %	20 %	402558583
7	NC_018502	ATTTA	2	10	9316	9325	40 %	60 %	0 %	0 %	402558583
8	NC_018502	ATTTC	2	10	11786	11795	20 %	60 %	0 %	20 %	402558584
9	NC_018502	ATACG	2	10	11864	11873	40 %	20 %	20 %	20 %	402558584
10	NC_018502	TAAGG	2	10	17807	17816	40 %	20 %	40 %	0 %	402558589
11	NC_018502	TGACA	2	10	18099	18108	40 %	20 %	20 %	20 %	402558589
12	NC_018502	CTCTT	2	10	18284	18293	0 %	60 %	0 %	40 %	402558590
13	NC_018502	TAGTT	2	10	18720	18729	20 %	60 %	20 %	0 %	402558591
14	NC_018502	TTCAT	2	10	20170	20179	20 %	60 %	0 %	20 %	402558593
15	NC_018502	ACTTC	2	10	22012	22021	20 %	40 %	0 %	40 %	402558596
16	NC_018502	AGAAA	2	10	22853	22862	80 %	0 %	20 %	0 %	402558596
17	NC_018502	GAATC	2	10	23574	23583	40 %	20 %	20 %	20 %	402558597
18	NC_018502	CTTCA	2	10	24582	24591	20 %	40 %	0 %	40 %	402558598
19	NC_018502	GTCCT	2	10	25539	25548	0 %	40 %	20 %	40 %	402558599
20	NC_018502	ATTTC	2	10	26485	26494	20 %	60 %	0 %	20 %	402558602
21	NC_018502	TCTCC	2	10	32940	32949	0 %	40 %	0 %	60 %	402558614
22	NC_018502	ACATT	2	10	36092	36101	40 %	40 %	0 %	20 %	402558621
23	NC_018502	TCAAC	2	10	37614	37623	40 %	20 %	0 %	40 %	402558624
24	NC_018502	GAGTA	2	10	38391	38400	40 %	20 %	40 %	0 %	402558628
25	NC_018502	TCATT	2	10	39243	39252	20 %	60 %	0 %	20 %	402558629
26	NC_018502	TTGTT	2	10	40254	40263	0 %	80 %	20 %	0 %	402558631
27	NC_018502	CTTTT	2	10	40524	40533	0 %	80 %	0 %	20 %	402558632
28	NC_018502	AAATA	2	10	40741	40750	80 %	20 %	0 %	0 %	402558632
29	NC_018502	TGTTT	2	10	41076	41085	0 %	80 %	20 %	0 %	402558632
30	NC_018502	GAAGA	2	10	42842	42851	60 %	0 %	40 %	0 %	402558634
31	NC_018502	TGAAA	2	10	43932	43941	60 %	20 %	20 %	0 %	402558634

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.