MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	AAAT	2	8	481	488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018502	TGAT	2	8	521	528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018502	TTTA	2	8	603	610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018502	AGTC	2	8	623	630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018502	AATC	2	8	786	793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018502	GTAT	2	8	848	855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018502	CCCT	2	8	1017	1024	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_018502	CACG	2	8	1106	1113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018502	TTTA	2	8	1165	1172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018502	TTAT	2	8	1812	1819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018502	TGTA	2	8	2067	2074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018502	TGAA	2	8	3617	3624	50 %	25 %	25 %	0 %	402558577
13	NC_018502	GAAA	2	8	3658	3665	75 %	0 %	25 %	0 %	402558577
14	NC_018502	CGCT	2	8	3948	3955	0 %	25 %	25 %	50 %	402558578
15	NC_018502	TGCT	2	8	4184	4191	0 %	50 %	25 %	25 %	402558578
16	NC_018502	TCTT	2	8	4256	4263	0 %	75 %	0 %	25 %	402558578
17	NC_018502	CGTC	2	8	4365	4372	0 %	25 %	25 %	50 %	402558578
18	NC_018502	TGTT	2	8	4737	4744	0 %	75 %	25 %	0 %	402558579
19	NC_018502	TACA	2	8	4976	4983	50 %	25 %	0 %	25 %	402558579
20	NC_018502	TCAT	2	8	5049	5056	25 %	50 %	0 %	25 %	402558579
21	NC_018502	TAAA	2	8	5466	5473	75 %	25 %	0 %	0 %	402558580
22	NC_018502	TGAT	2	8	5542	5549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018502	ATCT	2	8	5559	5566	25 %	50 %	0 %	25 %	402558581
24	NC_018502	CAAA	2	8	6148	6155	75 %	0 %	0 %	25 %	402558582
25	NC_018502	CTTT	2	8	6721	6728	0 %	75 %	0 %	25 %	402558582
26	NC_018502	TAAT	2	8	7193	7200	50 %	50 %	0 %	0 %	402558583
27	NC_018502	TTAT	2	8	7997	8004	25 %	75 %	0 %	0 %	402558583
28	NC_018502	ATTG	2	8	8134	8141	25 %	50 %	25 %	0 %	402558583
29	NC_018502	TGCT	2	8	8248	8255	0 %	50 %	25 %	25 %	402558583
30	NC_018502	ATCA	2	8	8323	8330	50 %	25 %	0 %	25 %	402558583
31	NC_018502	TTGT	2	8	8392	8399	0 %	75 %	25 %	0 %	402558583
32	NC_018502	TAAT	2	8	9050	9057	50 %	50 %	0 %	0 %	402558583
33	NC_018502	TGTT	2	8	9110	9117	0 %	75 %	25 %	0 %	402558583
34	NC_018502	TTGA	2	8	9146	9153	25 %	50 %	25 %	0 %	402558583
35	NC_018502	TTTC	2	8	9579	9586	0 %	75 %	0 %	25 %	402558583
36	NC_018502	TTCT	2	8	9796	9803	0 %	75 %	0 %	25 %	402558583
37	NC_018502	ATTG	2	8	10103	10110	25 %	50 %	25 %	0 %	402558583
38	NC_018502	CTTC	2	8	10419	10426	0 %	50 %	0 %	50 %	402558583
39	NC_018502	GGAA	2	8	11383	11390	50 %	0 %	50 %	0 %	402558584
40	NC_018502	TCCA	2	8	11834	11841	25 %	25 %	0 %	50 %	402558584
41	NC_018502	TCCA	2	8	12060	12067	25 %	25 %	0 %	50 %	402558584
42	NC_018502	CAAA	2	8	12115	12122	75 %	0 %	0 %	25 %	402558584
43	NC_018502	AGTA	2	8	12123	12130	50 %	25 %	25 %	0 %	402558584
44	NC_018502	ACCT	2	8	12492	12499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018502	TCTT	2	8	12513	12520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018502	AATT	2	8	12584	12591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018502	GTTT	2	8	12688	12695	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018502	CATT	2	8	12810	12817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018502	TTAA	2	8	13030	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018502	TGAA	2	8	13417	13424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018502	TTTC	2	8	13676	13683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_018502	TAAG	2	8	13749	13756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018502	CAGT	2	8	14530	14537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018502	ATCC	2	8	14764	14771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018502	TCAT	2	8	14866	14873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018502	TGTT	2	8	15039	15046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018502	CTGT	2	8	15324	15331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018502	TAAC	2	8	16359	16366	50 %	25 %	0 %	25 %	402558586
59	NC_018502	TAAG	2	8	16593	16600	50 %	25 %	25 %	0 %	402558586
60	NC_018502	AAAT	2	8	16648	16655	75 %	25 %	0 %	0 %	402558586
61	NC_018502	CTTT	2	8	16992	16999	0 %	75 %	0 %	25 %	402558587
62	NC_018502	TTCT	2	8	17585	17592	0 %	75 %	0 %	25 %	402558588
63	NC_018502	TCAT	2	8	17720	17727	25 %	50 %	0 %	25 %	402558588
64	NC_018502	CATT	2	8	18180	18187	25 %	50 %	0 %	25 %	402558590
65	NC_018502	TTTC	2	8	18555	18562	0 %	75 %	0 %	25 %	402558591
66	NC_018502	ACTC	2	8	18767	18774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018502	GTAC	2	8	20266	20273	25 %	25 %	25 %	25 %	402558593
68	NC_018502	ACAA	2	8	20704	20711	75 %	0 %	0 %	25 %	402558594
69	NC_018502	TAAC	2	8	20831	20838	50 %	25 %	0 %	25 %	402558595
70	NC_018502	CCTG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	25 %	50 %	402558595
71	NC_018502	AATG	2	8	20890	20897	50 %	25 %	25 %	0 %	402558595
72	NC_018502	CTTT	2	8	21186	21193	0 %	75 %	0 %	25 %	402558595
73	NC_018502	ATAG	2	8	21263	21270	50 %	25 %	25 %	0 %	402558595
74	NC_018502	TTGA	2	8	21319	21326	25 %	50 %	25 %	0 %	402558595
75	NC_018502	TTCA	2	8	21580	21587	25 %	50 %	0 %	25 %	402558595
76	NC_018502	GTTT	2	8	22236	22243	0 %	75 %	25 %	0 %	402558596
77	NC_018502	TCTT	2	8	23217	23224	0 %	75 %	0 %	25 %	402558597
78	NC_018502	AAAC	2	8	23408	23415	75 %	0 %	0 %	25 %	402558597
79	NC_018502	GTTT	2	8	23416	23423	0 %	75 %	25 %	0 %	402558597
80	NC_018502	TGTT	2	8	23737	23744	0 %	75 %	25 %	0 %	402558597
81	NC_018502	CATT	2	8	24291	24298	25 %	50 %	0 %	25 %	402558597
82	NC_018502	TCTT	2	8	24702	24709	0 %	75 %	0 %	25 %	402558598
83	NC_018502	TAGT	2	8	24748	24755	25 %	50 %	25 %	0 %	402558598
84	NC_018502	CATC	2	8	24794	24801	25 %	25 %	0 %	50 %	402558598
85	NC_018502	CAAA	2	8	24963	24970	75 %	0 %	0 %	25 %	402558598
86	NC_018502	TTTC	2	8	25022	25029	0 %	75 %	0 %	25 %	402558598
87	NC_018502	CATT	2	8	25082	25089	25 %	50 %	0 %	25 %	402558598
88	NC_018502	TCTG	2	8	25215	25222	0 %	50 %	25 %	25 %	402558598
89	NC_018502	ATTT	2	8	25267	25274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018502	AATG	2	8	25557	25564	50 %	25 %	25 %	0 %	402558599
91	NC_018502	TTGA	2	8	25634	25641	25 %	50 %	25 %	0 %	402558600
92	NC_018502	TGTT	2	8	25867	25874	0 %	75 %	25 %	0 %	402558600
93	NC_018502	TTTC	2	8	25997	26004	0 %	75 %	0 %	25 %	402558601
94	NC_018502	GAAG	2	8	26067	26074	50 %	0 %	50 %	0 %	402558601
95	NC_018502	CCCG	2	8	26243	26250	0 %	0 %	25 %	75 %	402558601
96	NC_018502	TGCA	2	8	26275	26282	25 %	25 %	25 %	25 %	402558601
97	NC_018502	ATTA	2	8	26468	26475	50 %	50 %	0 %	0 %	402558602
98	NC_018502	GAAC	2	8	26534	26541	50 %	0 %	25 %	25 %	402558602
99	NC_018502	CTAT	2	8	26912	26919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018502	AAGC	2	8	27172	27179	50 %	0 %	25 %	25 %	402558603
101	NC_018502	TCGT	2	8	27309	27316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018502	GTTT	2	8	27324	27331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018502	TTAA	2	8	27424	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	402558604
104	NC_018502	ATTT	2	8	27670	27677	25 %	75 %	0 %	0 %	402558604
105	NC_018502	ACAT	2	8	27800	27807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018502	AATC	2	8	28163	28170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018502	GATA	2	8	28534	28541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018502	GCCC	2	8	28653	28660	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
109	NC_018502	CAAA	2	8	28991	28998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_018502	TTTC	2	8	29036	29043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018502	CAAT	2	8	29106	29113	50 %	25 %	0 %	25 %	402558605
112	NC_018502	TTGT	2	8	29774	29781	0 %	75 %	25 %	0 %	402558606
113	NC_018502	GGAT	2	8	29978	29985	25 %	25 %	50 %	0 %	402558606
114	NC_018502	TTTG	2	8	30085	30092	0 %	75 %	25 %	0 %	402558606
115	NC_018502	CTTT	2	8	30103	30110	0 %	75 %	0 %	25 %	402558606
116	NC_018502	TTTA	2	8	30157	30164	25 %	75 %	0 %	0 %	402558607
117	NC_018502	ATCA	2	8	30402	30409	50 %	25 %	0 %	25 %	402558608
118	NC_018502	AACC	2	8	30490	30497	50 %	0 %	0 %	50 %	402558608
119	NC_018502	CAAC	2	8	30870	30877	50 %	0 %	0 %	50 %	402558609
120	NC_018502	AACT	2	8	30963	30970	50 %	25 %	0 %	25 %	402558609
121	NC_018502	CAAT	2	8	31064	31071	50 %	25 %	0 %	25 %	402558609
122	NC_018502	TCAT	2	8	31073	31080	25 %	50 %	0 %	25 %	402558609
123	NC_018502	TGCT	2	8	31365	31372	0 %	50 %	25 %	25 %	402558610
124	NC_018502	TTGA	2	8	31763	31770	25 %	50 %	25 %	0 %	402558610
125	NC_018502	TATT	2	8	32178	32185	25 %	75 %	0 %	0 %	402558611
126	NC_018502	TTAG	2	8	32312	32319	25 %	50 %	25 %	0 %	402558612
127	NC_018502	ATAA	2	8	32544	32551	75 %	25 %	0 %	0 %	402558613
128	NC_018502	ATAG	2	8	32572	32579	50 %	25 %	25 %	0 %	402558613
129	NC_018502	TCAA	2	8	32715	32722	50 %	25 %	0 %	25 %	402558613
130	NC_018502	TCCA	2	8	33318	33325	25 %	25 %	0 %	50 %	402558615
131	NC_018502	AATT	2	8	33438	33445	50 %	50 %	0 %	0 %	402558615
132	NC_018502	TCGT	2	8	33572	33579	0 %	50 %	25 %	25 %	402558616
133	NC_018502	ATCT	2	8	33672	33679	25 %	50 %	0 %	25 %	402558616
134	NC_018502	TCTA	2	8	34167	34174	25 %	50 %	0 %	25 %	402558618
135	NC_018502	TACC	2	8	34548	34555	25 %	25 %	0 %	50 %	402558619
136	NC_018502	TTCG	2	8	34837	34844	0 %	50 %	25 %	25 %	402558620
137	NC_018502	TAAG	2	8	35720	35727	50 %	25 %	25 %	0 %	402558621
138	NC_018502	AACC	2	8	36388	36395	50 %	0 %	0 %	50 %	402558621
139	NC_018502	TTCA	2	8	36451	36458	25 %	50 %	0 %	25 %	402558621
140	NC_018502	GATT	2	8	36630	36637	25 %	50 %	25 %	0 %	402558622
141	NC_018502	GTTT	3	12	36665	36676	0 %	75 %	25 %	0 %	402558623
142	NC_018502	CTTT	2	8	36906	36913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018502	TCCT	2	8	37144	37151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018502	TTAG	2	8	37162	37169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018502	AACT	2	8	37252	37259	50 %	25 %	0 %	25 %	402558624
146	NC_018502	GATA	2	8	37601	37608	50 %	25 %	25 %	0 %	402558624
147	NC_018502	TCAT	2	8	37826	37833	25 %	50 %	0 %	25 %	402558625
148	NC_018502	TCTA	2	8	38126	38133	25 %	50 %	0 %	25 %	402558627
149	NC_018502	AAAC	2	8	38279	38286	75 %	0 %	0 %	25 %	402558628
150	NC_018502	ATTG	2	8	38404	38411	25 %	50 %	25 %	0 %	402558628
151	NC_018502	CTTG	2	8	38604	38611	0 %	50 %	25 %	25 %	402558628
152	NC_018502	TTGC	2	8	38766	38773	0 %	50 %	25 %	25 %	402558628
153	NC_018502	AGCT	2	8	38780	38787	25 %	25 %	25 %	25 %	402558628
154	NC_018502	TTAT	2	8	39482	39489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018502	ATTA	2	8	39529	39536	50 %	50 %	0 %	0 %	402558630
156	NC_018502	GAAA	2	8	39565	39572	75 %	0 %	25 %	0 %	402558630
157	NC_018502	ATGT	2	8	39848	39855	25 %	50 %	25 %	0 %	402558630
158	NC_018502	TGAT	2	8	39880	39887	25 %	50 %	25 %	0 %	402558630
159	NC_018502	TATT	2	8	40177	40184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_018502	AATA	2	8	40438	40445	75 %	25 %	0 %	0 %	402558632
161	NC_018502	AATT	2	8	40719	40726	50 %	50 %	0 %	0 %	402558632
162	NC_018502	ATTT	2	8	41450	41457	25 %	75 %	0 %	0 %	402558632
163	NC_018502	TTCG	2	8	41527	41534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_018502	TTTA	2	8	41916	41923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_018502	AGAA	2	8	42288	42295	75 %	0 %	25 %	0 %	402558633
166	NC_018502	AAGC	2	8	42875	42882	50 %	0 %	25 %	25 %	402558634
167	NC_018502	AAAT	2	8	42949	42956	75 %	25 %	0 %	0 %	402558634
168	NC_018502	AATC	2	8	43089	43096	50 %	25 %	0 %	25 %	402558634
169	NC_018502	TTCA	2	8	43166	43173	25 %	50 %	0 %	25 %	402558634
170	NC_018502	AATA	2	8	43484	43491	75 %	25 %	0 %	0 %	402558634
171	NC_018502	AACT	2	8	43973	43980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_018502	TGGA	2	8	44001	44008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
173	NC_018502	GAAG	2	8	44050	44057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_018502	CCGT	2	8	44505	44512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
175	NC_018502	ATTT	2	8	44550	44557	25 %	75 %	0 %	0 %	402558635
176	NC_018502	CCAC	2	8	44764	44771	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.