MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p05

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018502	AAAT	2	8	481	488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018502	TGAT	2	8	521	528	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018502	TTTA	2	8	603	610	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018502	AGTC	2	8	623	630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018502	AATC	2	8	786	793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018502	GTAT	2	8	848	855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018502	CCCT	2	8	1017	1024	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_018502	CACG	2	8	1106	1113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018502	TTTA	2	8	1165	1172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018502	TTAT	2	8	1812	1819	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018502	TGTA	2	8	2067	2074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018502	TGAT	2	8	5542	5549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018502	ACCT	2	8	12492	12499	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_018502	TCTT	2	8	12513	12520	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018502	AATT	2	8	12584	12591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018502	GTTT	2	8	12688	12695	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018502	CATT	2	8	12810	12817	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018502	TTAA	2	8	13030	13037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018502	TGAA	2	8	13417	13424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018502	TTTC	2	8	13676	13683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018502	TAAG	2	8	13749	13756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018502	CAGT	2	8	14530	14537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018502	ATCC	2	8	14764	14771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_018502	TCAT	2	8	14866	14873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018502	TGTT	2	8	15039	15046	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018502	CTGT	2	8	15324	15331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018502	ACTC	2	8	18767	18774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018502	ATTT	2	8	25267	25274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018502	CTAT	2	8	26912	26919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018502	TCGT	2	8	27309	27316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018502	GTTT	2	8	27324	27331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018502	ACAT	2	8	27800	27807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018502	AATC	2	8	28163	28170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018502	GATA	2	8	28534	28541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018502	GCCC	2	8	28653	28660	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_018502	CAAA	2	8	28991	28998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018502	TTTC	2	8	29036	29043	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018502	CTTT	2	8	36906	36913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018502	TCCT	2	8	37144	37151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018502	TTAG	2	8	37162	37169	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018502	TTAT	2	8	39482	39489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018502	TATT	2	8	40177	40184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018502	TTCG	2	8	41527	41534	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018502	TTTA	2	8	41916	41923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018502	AACT	2	8	43973	43980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018502	TGGA	2	8	44001	44008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018502	GAAG	2	8	44050	44057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018502	CCGT	2	8	44505	44512	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018502	CCAC	2	8	44764	44771	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.