MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	TTTAAA	2	12	10111	10122	50 %	50 %	0 %	0 %	402558416
2	NC_018501	AAAACA	2	12	27975	27986	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558437
3	NC_018501	ATGAAA	2	12	31696	31707	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558441
4	NC_018501	CAGACG	2	12	34358	34369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558444
5	NC_018501	AATGAA	2	12	38169	38180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558446
6	NC_018501	TAAATT	2	12	41706	41717	50 %	50 %	0 %	0 %	402558453
7	NC_018501	TTAATT	2	12	42709	42720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558453
8	NC_018501	ATTGCA	2	12	49160	49171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558456
9	NC_018501	ATCAAA	2	12	49496	49507	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558456
10	NC_018501	TTTTAA	2	12	52176	52187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558461
11	NC_018501	AAAAAC	2	12	61732	61743	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	402558473
12	NC_018501	TTGAAG	2	12	62082	62093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558473
13	NC_018501	ACTGCT	2	12	63390	63401	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	402558474
14	NC_018501	TAAAAG	2	12	64216	64227	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558474
15	NC_018501	TAAAAG	2	12	65971	65982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558475
16	NC_018501	TAAAAG	2	12	68597	68608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	402558477
17	NC_018501	AAATAT	2	12	70397	70408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558479
18	NC_018501	ATCTAA	2	12	74920	74931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558484
19	NC_018501	TTCTGC	2	12	75913	75924	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402558485
20	NC_018501	CTTTAT	2	12	79789	79800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558490
21	NC_018501	GGAGAA	2	12	84832	84843	50 %	0 %	50 %	0 %	402558495
22	NC_018501	GTGTTA	2	12	88687	88698	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	402558500
23	NC_018501	TCATTT	2	12	89500	89511	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	402558501
24	NC_018501	AAAATC	2	12	95455	95466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558509
25	NC_018501	ATTTAT	2	12	103636	103647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558516
26	NC_018501	TATTGA	2	12	108366	108377	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558521
27	NC_018501	ATAAGC	2	12	110095	110106	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558523
28	NC_018501	CAAGAG	2	12	117133	117144	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	402558528
29	NC_018501	TTTCCC	2	12	117720	117731	0 %	50 %	0 %	50 %	402558529
30	NC_018501	TATCAA	2	12	118994	119005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558532
31	NC_018501	TTTTTC	2	12	119255	119266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558533
32	NC_018501	TGTTTT	2	12	120786	120797	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402558536
33	NC_018501	TCTCCA	2	12	121889	121900	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	402558537
34	NC_018501	CTTTTT	2	12	122725	122736	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558537
35	NC_018501	TTTCTC	2	12	125574	125585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558538
36	NC_018501	ACCCAT	2	12	126369	126380	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	402558538
37	NC_018501	CATTAA	2	12	126645	126656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558538
38	NC_018501	CCCGAA	2	12	128542	128553	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	402558539
39	NC_018501	CTTTTT	2	12	129387	129398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	402558539
40	NC_018501	TTTGAA	2	12	131310	131321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558542
41	NC_018501	GTTTTT	2	12	144687	144698	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402558557
42	NC_018501	TACTTG	2	12	146370	146381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	402558558
43	NC_018501	ATCTTC	2	12	147031	147042	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402558559
44	NC_018501	TTCCTT	2	12	150347	150358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558563
45	NC_018501	CTGGGT	2	12	150881	150892	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	402558563
46	NC_018501	AAAATC	2	12	152453	152464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	402558564
47	NC_018501	TTTAAA	2	12	152987	152998	50 %	50 %	0 %	0 %	402558564
48	NC_018501	GCTCCT	2	12	153369	153380	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	402558564
49	NC_018501	TGCTGT	2	12	153407	153418	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	402558564
50	NC_018501	CGAAAT	2	12	154601	154612	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558567
51	NC_018501	TTTTGT	2	12	157985	157996	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	402558569
52	NC_018501	ACGATA	2	12	158535	158546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558569

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.