MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	CAAAA	2	10	84	93	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018501	AGGAC	2	10	1240	1249	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_018501	TTATA	2	10	7918	7927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018501	AAAAT	2	10	8673	8682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018501	TTTTA	2	10	20372	20381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018501	TTATG	2	10	29466	29475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018501	GTATT	2	10	30916	30925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018501	CATAT	2	10	37599	37608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018501	TATCA	2	10	40248	40257	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018501	TATGA	2	10	48848	48857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018501	AAAAG	2	10	50458	50467	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018501	AAAAT	2	10	50898	50907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018501	ATTTT	2	10	53941	53950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018501	TTCAT	2	10	55033	55042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_018501	TGAAG	2	10	55660	55669	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018501	AAAAT	2	10	57608	57617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018501	TCAAA	2	10	72312	72321	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018501	TATAA	2	10	73516	73525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018501	AAATT	2	10	75040	75049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018501	AATTT	2	10	75056	75065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018501	TTAAC	2	10	78055	78064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_018501	TTAGT	2	10	80523	80532	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018501	TGTAT	2	10	82311	82320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018501	AAATG	2	10	85864	85873	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018501	TTGAA	2	10	86360	86369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018501	TTTAG	2	10	88001	88010	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018501	AATAA	2	10	90395	90404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018501	AGTAA	2	10	93156	93165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018501	TTTAA	2	10	96577	96586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018501	TCTAA	2	10	98775	98784	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_018501	AAAAG	2	10	106598	106607	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018501	TCTTT	2	10	106752	106761	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018501	TAATA	2	10	108639	108648	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018501	ATTTG	2	10	111175	111184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018501	ATACA	2	10	114294	114303	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_018501	ATTAA	3	15	119497	119511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018501	CACAA	2	10	136831	136840	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018501	TAATG	2	10	138606	138615	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018501	CATGT	2	10	149219	149228	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_018501	TAAGT	2	10	159391	159400	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018501	AAATA	2	10	159803	159812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018501	AATAC	2	10	160212	160221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018501	TAGGT	2	10	161471	161480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018501	AATCA	2	10	165133	165142	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018501	TTTAC	2	10	167396	167405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018501	GATGA	2	10	167867	167876	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.