MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	TTGTA	2	10	1513	1522	20 %	60 %	20 %	0 %	402558407
2	NC_018501	ATTTA	2	10	1711	1720	40 %	60 %	0 %	0 %	402558407
3	NC_018501	AAGAA	2	10	2133	2142	80 %	0 %	20 %	0 %	402558407
4	NC_018501	TTACT	2	10	4352	4361	20 %	60 %	0 %	20 %	402558409
5	NC_018501	AAGCA	2	10	4830	4839	60 %	0 %	20 %	20 %	402558409
6	NC_018501	TAAAA	2	10	6313	6322	80 %	20 %	0 %	0 %	402558411
7	NC_018501	GAAAT	2	10	10286	10295	60 %	20 %	20 %	0 %	402558416
8	NC_018501	CATTC	2	10	11150	11159	20 %	40 %	0 %	40 %	402558418
9	NC_018501	CTATA	2	10	15029	15038	40 %	40 %	0 %	20 %	402558422
10	NC_018501	ATTAT	2	10	18812	18821	40 %	60 %	0 %	0 %	402558428
11	NC_018501	ATTTC	2	10	22128	22137	20 %	60 %	0 %	20 %	402558432
12	NC_018501	AATCT	2	10	22757	22766	40 %	40 %	0 %	20 %	402558433
13	NC_018501	ATACA	2	10	25855	25864	60 %	20 %	0 %	20 %	402558435
14	NC_018501	TTGTT	2	10	25978	25987	0 %	80 %	20 %	0 %	402558435
15	NC_018501	TTTTG	2	10	26000	26009	0 %	80 %	20 %	0 %	402558435
16	NC_018501	ATTGA	2	10	27153	27162	40 %	40 %	20 %	0 %	402558436
17	NC_018501	TTTGA	2	10	29828	29837	20 %	60 %	20 %	0 %	402558438
18	NC_018501	CCGAA	2	10	31595	31604	40 %	0 %	20 %	40 %	402558440
19	NC_018501	ATGAA	2	10	32097	32106	60 %	20 %	20 %	0 %	402558442
20	NC_018501	AGGAA	2	10	33033	33042	60 %	0 %	40 %	0 %	402558442
21	NC_018501	ATGGA	2	10	35170	35179	40 %	20 %	40 %	0 %	402558444
22	NC_018501	TTGGT	2	10	35590	35599	0 %	60 %	40 %	0 %	402558444
23	NC_018501	AATGC	2	10	36133	36142	40 %	20 %	20 %	20 %	402558444
24	NC_018501	GTAAT	2	10	36272	36281	40 %	40 %	20 %	0 %	402558444
25	NC_018501	TTCTT	2	10	39600	39609	0 %	80 %	0 %	20 %	402558448
26	NC_018501	CCATA	2	10	39882	39891	40 %	20 %	0 %	40 %	402558449
27	NC_018501	TTGTT	2	10	40163	40172	0 %	80 %	20 %	0 %	402558449
28	NC_018501	ATTTT	2	10	40649	40658	20 %	80 %	0 %	0 %	402558450
29	NC_018501	AAATT	2	10	41719	41728	60 %	40 %	0 %	0 %	402558453
30	NC_018501	AATGA	2	10	47867	47876	60 %	20 %	20 %	0 %	402558455
31	NC_018501	GGTCA	2	10	49081	49090	20 %	20 %	40 %	20 %	402558456
32	NC_018501	GAAGA	2	10	49302	49311	60 %	0 %	40 %	0 %	402558456
33	NC_018501	TGAAA	2	10	50058	50067	60 %	20 %	20 %	0 %	402558457
34	NC_018501	AGAAA	2	10	50570	50579	80 %	0 %	20 %	0 %	402558459
35	NC_018501	TGTAA	2	10	51056	51065	40 %	40 %	20 %	0 %	402558460
36	NC_018501	GATTT	2	10	57390	57399	20 %	60 %	20 %	0 %	402558468
37	NC_018501	GAATC	2	10	57477	57486	40 %	20 %	20 %	20 %	402558468
38	NC_018501	CATTG	2	10	57910	57919	20 %	40 %	20 %	20 %	402558469
39	NC_018501	ATTTG	2	10	58677	58686	20 %	60 %	20 %	0 %	402558471
40	NC_018501	TTTTG	2	10	61837	61846	0 %	80 %	20 %	0 %	402558473
41	NC_018501	AGAAA	2	10	63335	63344	80 %	0 %	20 %	0 %	402558474
42	NC_018501	AGAAA	2	10	64142	64151	80 %	0 %	20 %	0 %	402558474
43	NC_018501	AGAAA	2	10	65897	65906	80 %	0 %	20 %	0 %	402558475
44	NC_018501	ATCAT	2	10	67264	67273	40 %	40 %	0 %	20 %	402558476
45	NC_018501	AGAAA	2	10	67636	67645	80 %	0 %	20 %	0 %	402558476
46	NC_018501	ATTTA	2	10	67702	67711	40 %	60 %	0 %	0 %	402558476
47	NC_018501	ATTTG	2	10	68229	68238	20 %	60 %	20 %	0 %	402558477
48	NC_018501	ATTCA	2	10	69481	69490	40 %	40 %	0 %	20 %	402558478
49	NC_018501	TAAAA	2	10	70948	70957	80 %	20 %	0 %	0 %	402558480
50	NC_018501	ATACA	2	10	71063	71072	60 %	20 %	0 %	20 %	402558480
51	NC_018501	CTTTT	2	10	72278	72287	0 %	80 %	0 %	20 %	402558481
52	NC_018501	ATCAT	2	10	73722	73731	40 %	40 %	0 %	20 %	402558483
53	NC_018501	TTCCT	2	10	74665	74674	0 %	60 %	0 %	40 %	402558484
54	NC_018501	TTTAA	2	10	75255	75264	40 %	60 %	0 %	0 %	402558485
55	NC_018501	TTTTC	2	10	77456	77465	0 %	80 %	0 %	20 %	402558486
56	NC_018501	TGCAC	2	10	78117	78126	20 %	20 %	20 %	40 %	402558487
57	NC_018501	TTACT	2	10	81292	81301	20 %	60 %	0 %	20 %	402558491
58	NC_018501	AAAAT	2	10	82933	82942	80 %	20 %	0 %	0 %	402558493
59	NC_018501	TTCTT	2	10	84978	84987	0 %	80 %	0 %	20 %	402558495
60	NC_018501	TATTT	2	10	88638	88647	20 %	80 %	0 %	0 %	402558500
61	NC_018501	TCTTT	2	10	91695	91704	0 %	80 %	0 %	20 %	402558503
62	NC_018501	ATTCT	2	10	94297	94306	20 %	60 %	0 %	20 %	402558507
63	NC_018501	TTTGT	2	10	95061	95070	0 %	80 %	20 %	0 %	402558508
64	NC_018501	AACAA	2	10	95608	95617	80 %	0 %	0 %	20 %	402558509
65	NC_018501	TTTTC	2	10	97721	97730	0 %	80 %	0 %	20 %	402558512
66	NC_018501	ACAGA	2	10	98500	98509	60 %	0 %	20 %	20 %	402558512
67	NC_018501	CTTGC	2	10	99477	99486	0 %	40 %	20 %	40 %	402558513
68	NC_018501	TTTTC	2	10	99539	99548	0 %	80 %	0 %	20 %	402558513
69	NC_018501	ATTCA	2	10	101419	101428	40 %	40 %	0 %	20 %	402558514
70	NC_018501	ATTTT	2	10	102713	102722	20 %	80 %	0 %	0 %	402558515
71	NC_018501	CTGTA	2	10	102957	102966	20 %	40 %	20 %	20 %	402558515
72	NC_018501	TAAGA	2	10	103521	103530	60 %	20 %	20 %	0 %	402558515
73	NC_018501	TGTTT	2	10	104687	104696	0 %	80 %	20 %	0 %	402558516
74	NC_018501	AAATT	2	10	105791	105800	60 %	40 %	0 %	0 %	402558518
75	NC_018501	GAAAA	2	10	105908	105917	80 %	0 %	20 %	0 %	402558518
76	NC_018501	ATAAC	2	10	107967	107976	60 %	20 %	0 %	20 %	402558520
77	NC_018501	TATAA	2	10	108439	108448	60 %	40 %	0 %	0 %	402558521
78	NC_018501	ATATA	2	10	111556	111565	60 %	40 %	0 %	0 %	402558524
79	NC_018501	CAAAA	2	10	112638	112647	80 %	0 %	0 %	20 %	402558524
80	NC_018501	ATTCT	2	10	112710	112719	20 %	60 %	0 %	20 %	402558524
81	NC_018501	TTTTC	2	10	112731	112740	0 %	80 %	0 %	20 %	402558524
82	NC_018501	TATGG	2	10	115398	115407	20 %	40 %	40 %	0 %	402558526
83	NC_018501	AAAAT	2	10	118379	118388	80 %	20 %	0 %	0 %	402558530
84	NC_018501	TCTTT	2	10	126275	126284	0 %	80 %	0 %	20 %	402558538
85	NC_018501	CTTCA	2	10	128079	128088	20 %	40 %	0 %	40 %	402558539
86	NC_018501	TAAAT	2	10	129765	129774	60 %	40 %	0 %	0 %	402558540
87	NC_018501	TACCA	2	10	131300	131309	40 %	20 %	0 %	40 %	402558542
88	NC_018501	AATCA	2	10	133203	133212	60 %	20 %	0 %	20 %	402558545
89	NC_018501	CCATA	2	10	135507	135516	40 %	20 %	0 %	40 %	402558546
90	NC_018501	TAGTT	2	10	137249	137258	20 %	60 %	20 %	0 %	402558548
91	NC_018501	CTCTT	2	10	138047	138056	0 %	60 %	0 %	40 %	402558549
92	NC_018501	AATTG	2	10	139370	139379	40 %	40 %	20 %	0 %	402558550
93	NC_018501	TGAAC	2	10	139545	139554	40 %	20 %	20 %	20 %	402558550
94	NC_018501	TTTCA	2	10	139891	139900	20 %	60 %	0 %	20 %	402558550
95	NC_018501	TAAAT	2	10	140642	140651	60 %	40 %	0 %	0 %	402558550
96	NC_018501	GATTT	2	10	142405	142414	20 %	60 %	20 %	0 %	402558552
97	NC_018501	GATCC	2	10	143861	143870	20 %	20 %	20 %	40 %	402558556
98	NC_018501	CTCAA	2	10	145596	145605	40 %	20 %	0 %	40 %	402558558
99	NC_018501	GCTTC	2	10	147078	147087	0 %	40 %	20 %	40 %	402558559
100	NC_018501	TCATT	2	10	149738	149747	20 %	60 %	0 %	20 %	402558563
101	NC_018501	CATTC	2	10	150047	150056	20 %	40 %	0 %	40 %	402558563
102	NC_018501	CTTTT	2	10	150240	150249	0 %	80 %	0 %	20 %	402558563
103	NC_018501	TTTTC	2	10	150383	150392	0 %	80 %	0 %	20 %	402558563
104	NC_018501	ATCTA	2	10	150561	150570	40 %	40 %	0 %	20 %	402558563
105	NC_018501	GTTTC	2	10	152542	152551	0 %	60 %	20 %	20 %	402558564
106	NC_018501	GTTTC	2	10	152710	152719	0 %	60 %	20 %	20 %	402558564
107	NC_018501	CTTTT	2	10	154628	154637	0 %	80 %	0 %	20 %	402558567
108	NC_018501	CATCA	2	10	155980	155989	40 %	20 %	0 %	40 %	402558567
109	NC_018501	TTTCT	2	10	156890	156899	0 %	80 %	0 %	20 %	402558568

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.