MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p02

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018501	TCAA	2	8	263	270	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018501	TAAA	2	8	426	433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018501	TAAA	2	8	1327	1334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018501	TATT	2	8	5772	5779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018501	AATA	2	8	6373	6380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018501	TCTT	2	8	7592	7599	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018501	AAAT	2	8	7738	7745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018501	TACA	2	8	11635	11642	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018501	AATT	2	8	11860	11867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018501	GTAT	2	8	11976	11983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018501	TTTC	2	8	12259	12266	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018501	TCTA	2	8	17767	17774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018501	AAAG	2	8	19592	19599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018501	CTTT	2	8	19617	19624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018501	AGAT	2	8	21401	21408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018501	AAAT	2	8	22470	22477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018501	ATTT	2	8	22533	22540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018501	ACAA	2	8	22637	22644	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018501	AGAA	2	8	23194	23201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018501	TAAA	2	8	23269	23276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018501	AACA	2	8	23700	23707	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018501	AATT	2	8	26161	26168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018501	TTTA	2	8	29426	29433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018501	GAAT	2	8	30587	30594	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018501	TTAT	2	8	31217	31224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018501	TTAA	2	8	37565	37572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018501	TTAT	2	8	40300	40307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018501	TGTT	2	8	40319	40326	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018501	TACT	2	8	41636	41643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_018501	TCTT	2	8	43598	43605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_018501	CATA	2	8	48908	48915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018501	AGTA	2	8	50831	50838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018501	ACAA	2	8	50882	50889	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018501	AGTT	2	8	51335	51342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018501	GAGT	2	8	53619	53626	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018501	TTCG	2	8	55167	55174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_018501	TTTA	2	8	55203	55210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018501	TTTA	2	8	55677	55684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018501	ATTT	2	8	57055	57062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018501	TTAG	2	8	57109	57116	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018501	TTTC	2	8	60233	60240	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018501	TAAA	2	8	60242	60249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018501	TTAT	2	8	61041	61048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018501	TTTA	2	8	62232	62239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018501	TTAA	2	8	62282	62289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018501	TGAT	2	8	66259	66266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018501	TTTA	2	8	68736	68743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018501	TAAT	2	8	68783	68790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018501	AATT	2	8	72329	72336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018501	ACTA	2	8	72366	72373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018501	AGTA	2	8	74100	74107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018501	GTTT	2	8	74310	74317	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018501	CAAA	2	8	74391	74398	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_018501	TATG	2	8	75150	75157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018501	CCTC	2	8	77579	77586	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
56	NC_018501	AATT	2	8	77777	77784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018501	TTAA	2	8	78690	78697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018501	TAAA	2	8	79609	79616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018501	ACTT	2	8	79670	79677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018501	ATAA	2	8	79745	79752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018501	TCTA	2	8	81800	81807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018501	AAAC	2	8	83358	83365	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018501	CATC	2	8	88069	88076	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018501	TTTA	2	8	88630	88637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018501	TTTA	2	8	89277	89284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018501	ATTT	2	8	89964	89971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018501	AATG	2	8	90246	90253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018501	AGAA	2	8	92298	92305	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018501	ACTA	2	8	92338	92345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018501	TTTA	2	8	92394	92401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018501	TAAA	2	8	92434	92441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018501	TTAG	2	8	93437	93444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018501	ATTT	2	8	95291	95298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018501	ATAA	2	8	95321	95328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018501	AGTT	2	8	97006	97013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018501	GTAT	2	8	98833	98840	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018501	TATT	2	8	103596	103603	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018501	CTTA	2	8	104843	104850	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_018501	ATTT	2	8	105021	105028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018501	TCTT	2	8	106064	106071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018501	TCCT	2	8	106638	106645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018501	TTTA	2	8	106838	106845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018501	TATT	2	8	108539	108546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018501	TAAT	2	8	109427	109434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018501	TTGT	2	8	109607	109614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018501	AAAT	2	8	114014	114021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018501	TACT	2	8	114099	114106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_018501	CCAA	2	8	117892	117899	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018501	TATT	2	8	117926	117933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018501	TAAA	2	8	118051	118058	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018501	CTAC	2	8	119585	119592	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018501	ATTT	2	8	120292	120299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018501	CCTT	2	8	127291	127298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018501	AATA	2	8	131500	131507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018501	ACTT	2	8	131588	131595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018501	TTTA	2	8	132591	132598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018501	CTTT	2	8	132845	132852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018501	CTGT	2	8	136041	136048	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_018501	ATTA	2	8	136928	136935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018501	TACA	2	8	136962	136969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018501	ATGT	2	8	136970	136977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018501	AAAT	2	8	138329	138336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018501	TCTT	2	8	138472	138479	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018501	TAAT	2	8	138554	138561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018501	TACA	2	8	138900	138907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018501	ATTT	2	8	143288	143295	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018501	TAAT	2	8	148810	148817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018501	AATT	2	8	157314	157321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018501	ATAA	2	8	157326	157333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018501	TACA	2	8	157431	157438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018501	ACAA	2	8	157482	157489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_018501	AAAC	2	8	157599	157606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018501	TAAA	2	8	157676	157683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018501	TATT	2	8	157757	157764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018501	TCAA	2	8	159158	159165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018501	CAAA	2	8	159622	159629	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018501	AGAT	2	8	160053	160060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018501	TTCA	2	8	160096	160103	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018501	ATTT	2	8	160192	160199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018501	GAAT	2	8	160390	160397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018501	TAAA	2	8	161330	161337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018501	AATT	2	8	161500	161507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018501	TCCG	2	8	163529	163536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018501	AAAT	2	8	163726	163733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018501	GAAA	2	8	165483	165490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018501	AAAC	2	8	165510	165517	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018501	AGGT	2	8	165622	165629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018501	ATAA	2	8	166388	166395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018501	TATT	2	8	166709	166716	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018501	GTTC	2	8	167188	167195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018501	GAAG	2	8	168532	168539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.